Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A372QPA9

Protein Details
Accession A0A372QPA9    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
185-214INNNRRSRGGRGGRRGRRRRATNHGDQINRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
189-205RRSRGGRGGRRGRRRRA
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR038664  Gar1/Naf1_Cbf5-bd_sf  
IPR007504  H/ACA_rnp_Gar1/Naf1  
IPR040309  Naf1  
IPR009000  Transl_B-barrel_sf  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0005732  C:sno(s)RNA-containing ribonucleoprotein complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000493  P:box H/ACA snoRNP assembly  
GO:0001522  P:pseudouridine synthesis  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF04410  Gar1  
Amino Acid Sequences MTDTSSSESDSSSEDSSVSELEMADVDDFEQAMISVDKTFYEVEMGLSSGGPLRTKNEIIDITITKPTIEIKPDMHLTEIGSILHVVEDQIVIKVNATGEYKILDVGTVLVLEDKEVLGEIFETIGPVAHPMYVVRFNDINKEKVVRDAKEIEFSDDEKEKAFNEMQRNKTNDPASPATTSTQNINNNRRSRGGRGGRRGRRRRATNHGDQINREVHPPQNDQGYDFDYNILPRPDSLSN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.13
3 0.14
4 0.13
5 0.11
6 0.09
7 0.07
8 0.07
9 0.08
10 0.08
11 0.07
12 0.07
13 0.07
14 0.06
15 0.06
16 0.06
17 0.05
18 0.05
19 0.06
20 0.06
21 0.07
22 0.07
23 0.08
24 0.08
25 0.09
26 0.09
27 0.08
28 0.09
29 0.09
30 0.09
31 0.09
32 0.1
33 0.08
34 0.08
35 0.08
36 0.09
37 0.09
38 0.09
39 0.1
40 0.13
41 0.16
42 0.18
43 0.18
44 0.21
45 0.2
46 0.21
47 0.24
48 0.22
49 0.2
50 0.21
51 0.21
52 0.16
53 0.16
54 0.17
55 0.15
56 0.17
57 0.17
58 0.16
59 0.2
60 0.22
61 0.22
62 0.2
63 0.18
64 0.16
65 0.15
66 0.14
67 0.11
68 0.09
69 0.08
70 0.07
71 0.06
72 0.05
73 0.04
74 0.03
75 0.04
76 0.04
77 0.04
78 0.05
79 0.05
80 0.05
81 0.06
82 0.06
83 0.08
84 0.09
85 0.09
86 0.08
87 0.09
88 0.09
89 0.09
90 0.08
91 0.06
92 0.05
93 0.05
94 0.04
95 0.04
96 0.03
97 0.04
98 0.03
99 0.04
100 0.04
101 0.03
102 0.03
103 0.03
104 0.03
105 0.03
106 0.03
107 0.03
108 0.03
109 0.03
110 0.03
111 0.03
112 0.03
113 0.03
114 0.04
115 0.04
116 0.03
117 0.04
118 0.04
119 0.06
120 0.1
121 0.1
122 0.12
123 0.14
124 0.14
125 0.22
126 0.25
127 0.24
128 0.22
129 0.24
130 0.22
131 0.28
132 0.33
133 0.26
134 0.28
135 0.31
136 0.31
137 0.35
138 0.35
139 0.3
140 0.27
141 0.26
142 0.26
143 0.22
144 0.21
145 0.16
146 0.16
147 0.13
148 0.15
149 0.17
150 0.19
151 0.27
152 0.35
153 0.41
154 0.47
155 0.52
156 0.5
157 0.54
158 0.51
159 0.43
160 0.42
161 0.39
162 0.35
163 0.32
164 0.32
165 0.27
166 0.27
167 0.26
168 0.22
169 0.25
170 0.3
171 0.37
172 0.43
173 0.5
174 0.53
175 0.55
176 0.58
177 0.55
178 0.54
179 0.56
180 0.59
181 0.59
182 0.65
183 0.73
184 0.77
185 0.84
186 0.88
187 0.88
188 0.88
189 0.88
190 0.86
191 0.86
192 0.85
193 0.85
194 0.85
195 0.82
196 0.76
197 0.69
198 0.66
199 0.59
200 0.51
201 0.42
202 0.36
203 0.33
204 0.36
205 0.38
206 0.36
207 0.39
208 0.39
209 0.38
210 0.38
211 0.37
212 0.33
213 0.29
214 0.27
215 0.21
216 0.22
217 0.25
218 0.24
219 0.2
220 0.18