Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A372RL09

Protein Details
Accession A0A372RL09    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
65-97GAEDKDTPRNQSKKKNLRKRKINNNSNNEKDEKHydrophilic
103-123RDSKSKKARVKDVIKLKKPKNBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
75-122QSKKKNLRKRKINNNSNNEKDEKEKAEERDSKSKKARVKDVIKLKKPK
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 14.333, mito_nucl 12.666
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
IPR044661  MED15a/b/c-like  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0031490  F:chromatin DNA binding  
GO:0003713  F:transcription coactivator activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
CDD cd00084  HMG-box_SF  
Amino Acid Sequences MEPLTHTQMQNQQQRQKTPPPSSTTIMQPPPTPPSTTNNTPAPNGLTSRGKIIPIEKRGDIACNGAEDKDTPRNQSKKKNLRKRKINNNSNNEKDEKEKAEERDSKSKKARVKDVIKLKKPKNPYLCFAKANRDEFKIKYPDALSREISSLLGKAWKELSDEEKKEKNIDNEEKEDLKFSHGIPSEQFVDFKSLLGSPISFGPFEANLEAQHETLSQGRDYVPSEIKSSKSPLGIYQAKESTTRAAVDNIDASQQPQRPQQPQQPQPVHDIPFPCEEQNNYMPMQHSSQSLQQSQLNSQSNDIQFDLQTQHHQNKPHCQYNTNMINSQCLNQQKNQLMNSQEGLQVQEVMPLSQQNQICQQPFQQPMPYASSHVQPFDHKLYPNNCNSSHDMKIQMPEISNCPPAQPYMPPPTSQIHQMQQMSYQHHQQQMMSQHHMMQPTWQIPSFIPTQTNHQIMPLQPSTRYNQMQYNQMQYNQMQYSQPMNSYREMLPLHSTGIGMPQFMSSHQMQHDQMPQCQAFSHN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.71
2 0.73
3 0.75
4 0.75
5 0.75
6 0.73
7 0.72
8 0.7
9 0.67
10 0.63
11 0.6
12 0.59
13 0.56
14 0.51
15 0.46
16 0.45
17 0.48
18 0.46
19 0.43
20 0.37
21 0.37
22 0.43
23 0.46
24 0.48
25 0.48
26 0.48
27 0.46
28 0.45
29 0.43
30 0.37
31 0.34
32 0.33
33 0.31
34 0.29
35 0.34
36 0.33
37 0.31
38 0.3
39 0.36
40 0.4
41 0.41
42 0.45
43 0.4
44 0.41
45 0.41
46 0.42
47 0.35
48 0.29
49 0.24
50 0.21
51 0.22
52 0.19
53 0.19
54 0.17
55 0.21
56 0.27
57 0.29
58 0.32
59 0.41
60 0.5
61 0.58
62 0.67
63 0.73
64 0.75
65 0.83
66 0.88
67 0.9
68 0.91
69 0.95
70 0.94
71 0.95
72 0.95
73 0.95
74 0.94
75 0.93
76 0.92
77 0.87
78 0.82
79 0.73
80 0.64
81 0.57
82 0.54
83 0.47
84 0.44
85 0.43
86 0.43
87 0.5
88 0.55
89 0.57
90 0.62
91 0.61
92 0.64
93 0.66
94 0.69
95 0.66
96 0.66
97 0.69
98 0.68
99 0.72
100 0.72
101 0.75
102 0.79
103 0.81
104 0.83
105 0.8
106 0.77
107 0.77
108 0.78
109 0.77
110 0.71
111 0.69
112 0.68
113 0.68
114 0.66
115 0.61
116 0.62
117 0.58
118 0.59
119 0.56
120 0.51
121 0.49
122 0.46
123 0.5
124 0.46
125 0.39
126 0.38
127 0.36
128 0.38
129 0.37
130 0.39
131 0.33
132 0.29
133 0.29
134 0.25
135 0.24
136 0.18
137 0.15
138 0.12
139 0.14
140 0.12
141 0.13
142 0.14
143 0.14
144 0.15
145 0.17
146 0.23
147 0.28
148 0.32
149 0.36
150 0.4
151 0.4
152 0.42
153 0.45
154 0.43
155 0.43
156 0.48
157 0.47
158 0.46
159 0.48
160 0.46
161 0.42
162 0.39
163 0.3
164 0.24
165 0.21
166 0.18
167 0.22
168 0.21
169 0.21
170 0.19
171 0.22
172 0.22
173 0.21
174 0.21
175 0.14
176 0.17
177 0.16
178 0.15
179 0.13
180 0.11
181 0.11
182 0.11
183 0.11
184 0.07
185 0.09
186 0.1
187 0.09
188 0.09
189 0.09
190 0.09
191 0.1
192 0.1
193 0.08
194 0.07
195 0.09
196 0.1
197 0.08
198 0.08
199 0.08
200 0.08
201 0.1
202 0.11
203 0.09
204 0.09
205 0.1
206 0.11
207 0.12
208 0.15
209 0.15
210 0.15
211 0.18
212 0.19
213 0.2
214 0.2
215 0.22
216 0.21
217 0.2
218 0.19
219 0.18
220 0.24
221 0.27
222 0.26
223 0.27
224 0.26
225 0.25
226 0.26
227 0.25
228 0.19
229 0.15
230 0.15
231 0.12
232 0.12
233 0.12
234 0.11
235 0.11
236 0.1
237 0.1
238 0.09
239 0.09
240 0.12
241 0.14
242 0.16
243 0.2
244 0.25
245 0.29
246 0.34
247 0.42
248 0.47
249 0.51
250 0.59
251 0.58
252 0.55
253 0.57
254 0.55
255 0.49
256 0.41
257 0.36
258 0.28
259 0.27
260 0.26
261 0.2
262 0.17
263 0.16
264 0.18
265 0.18
266 0.18
267 0.15
268 0.15
269 0.16
270 0.16
271 0.17
272 0.14
273 0.14
274 0.13
275 0.17
276 0.2
277 0.2
278 0.21
279 0.21
280 0.21
281 0.22
282 0.27
283 0.27
284 0.23
285 0.23
286 0.26
287 0.25
288 0.25
289 0.24
290 0.17
291 0.13
292 0.14
293 0.16
294 0.12
295 0.16
296 0.18
297 0.23
298 0.26
299 0.32
300 0.34
301 0.42
302 0.49
303 0.52
304 0.5
305 0.46
306 0.45
307 0.48
308 0.52
309 0.45
310 0.41
311 0.33
312 0.34
313 0.33
314 0.32
315 0.27
316 0.25
317 0.25
318 0.25
319 0.31
320 0.33
321 0.37
322 0.37
323 0.37
324 0.33
325 0.32
326 0.3
327 0.25
328 0.22
329 0.18
330 0.18
331 0.14
332 0.13
333 0.11
334 0.13
335 0.11
336 0.1
337 0.1
338 0.1
339 0.11
340 0.15
341 0.16
342 0.14
343 0.2
344 0.24
345 0.25
346 0.25
347 0.28
348 0.3
349 0.34
350 0.34
351 0.33
352 0.3
353 0.31
354 0.34
355 0.31
356 0.27
357 0.24
358 0.27
359 0.24
360 0.24
361 0.23
362 0.21
363 0.25
364 0.27
365 0.3
366 0.26
367 0.32
368 0.36
369 0.42
370 0.47
371 0.47
372 0.42
373 0.43
374 0.47
375 0.45
376 0.42
377 0.38
378 0.36
379 0.33
380 0.34
381 0.32
382 0.29
383 0.25
384 0.24
385 0.25
386 0.24
387 0.25
388 0.22
389 0.21
390 0.2
391 0.2
392 0.2
393 0.2
394 0.23
395 0.29
396 0.31
397 0.31
398 0.33
399 0.35
400 0.35
401 0.37
402 0.36
403 0.31
404 0.36
405 0.37
406 0.34
407 0.37
408 0.4
409 0.4
410 0.37
411 0.4
412 0.39
413 0.42
414 0.42
415 0.37
416 0.38
417 0.41
418 0.44
419 0.42
420 0.37
421 0.37
422 0.38
423 0.4
424 0.34
425 0.29
426 0.29
427 0.27
428 0.3
429 0.26
430 0.25
431 0.23
432 0.27
433 0.26
434 0.22
435 0.23
436 0.21
437 0.28
438 0.33
439 0.36
440 0.32
441 0.31
442 0.32
443 0.3
444 0.37
445 0.34
446 0.29
447 0.29
448 0.32
449 0.35
450 0.4
451 0.41
452 0.37
453 0.4
454 0.42
455 0.48
456 0.49
457 0.52
458 0.47
459 0.46
460 0.47
461 0.4
462 0.43
463 0.37
464 0.35
465 0.29
466 0.28
467 0.3
468 0.28
469 0.32
470 0.3
471 0.31
472 0.3
473 0.33
474 0.32
475 0.33
476 0.32
477 0.29
478 0.29
479 0.27
480 0.27
481 0.23
482 0.23
483 0.17
484 0.22
485 0.2
486 0.16
487 0.15
488 0.15
489 0.15
490 0.15
491 0.2
492 0.15
493 0.2
494 0.22
495 0.27
496 0.27
497 0.33
498 0.41
499 0.4
500 0.43
501 0.46
502 0.43
503 0.38