Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A376B8J0

Protein Details
Accession A0A376B8J0    Localization Confidence High Confidence Score 22.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
335-368EERMNKQKERNNHNNTNNKKRKKHESNSSKIIKDHydrophilic
391-416EGERDSNAYNKKRRKRLFDGPDNAVNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
340-344KQKER
350-358TNNKKRKKH
403-404RR
Subcellular Location(s) nucl 21, mito 3, plas 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009072  Histone-fold  
IPR003195  TFIID_TAF13  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0046982  F:protein heterodimerization activity  
GO:0006366  P:transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF02269  TFIID-18kDa  
CDD cd07978  TAF13  
Amino Acid Sequences MKLNHTTVNNNNNNNNNNNNTSAKSNACSTVIVTPTYANNNSTTTLKTIAATKITQMTSNNNPISTTATSSSGPNDSKYKYRVEIQQMMFVSGETNDPPISTTSLIEDIVRGQVIEILMRANQTAHCRGSKNILPEDVIFLMRHDKAKVNRLRTYLSWKDLRKNAKDQDNNVSLGGTSGGPGGSSNDTHNPNNGAGDDVLLEDGKDKNAPTKLKKSTIKLPWELQFMFNEQPLNNNNDADDEDEDEREAHLETMKRLKIADDRTKNMTKEEYVHWSDCRQASFTFRKAKRFRDWSGLNHLTEGKPHDDVIDILGFLTFEIVCSLTETALKVKAKEERMNKQKERNNHNNTNNKKRKKHESNSSKIIKDEKQAADQDDSDVDDGYYDYDNEEGERDSNAYNKKRRKRLFDGPDNAVNPIKPKHIEESWRILQIVDLKHRALTNFKGGRLKTRPIIM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.64
2 0.62
3 0.57
4 0.53
5 0.51
6 0.48
7 0.43
8 0.4
9 0.39
10 0.36
11 0.33
12 0.32
13 0.3
14 0.29
15 0.27
16 0.25
17 0.27
18 0.26
19 0.24
20 0.21
21 0.2
22 0.22
23 0.27
24 0.27
25 0.23
26 0.23
27 0.24
28 0.25
29 0.25
30 0.24
31 0.21
32 0.22
33 0.21
34 0.2
35 0.23
36 0.24
37 0.26
38 0.24
39 0.25
40 0.28
41 0.28
42 0.3
43 0.27
44 0.3
45 0.34
46 0.42
47 0.41
48 0.35
49 0.35
50 0.33
51 0.36
52 0.31
53 0.27
54 0.2
55 0.21
56 0.21
57 0.22
58 0.23
59 0.24
60 0.24
61 0.23
62 0.27
63 0.27
64 0.33
65 0.35
66 0.38
67 0.36
68 0.41
69 0.46
70 0.49
71 0.55
72 0.51
73 0.54
74 0.49
75 0.47
76 0.4
77 0.32
78 0.24
79 0.15
80 0.15
81 0.09
82 0.1
83 0.09
84 0.09
85 0.1
86 0.11
87 0.12
88 0.12
89 0.12
90 0.12
91 0.13
92 0.14
93 0.13
94 0.12
95 0.11
96 0.11
97 0.1
98 0.08
99 0.07
100 0.08
101 0.08
102 0.08
103 0.07
104 0.07
105 0.08
106 0.08
107 0.08
108 0.07
109 0.1
110 0.15
111 0.19
112 0.21
113 0.24
114 0.25
115 0.26
116 0.33
117 0.34
118 0.35
119 0.33
120 0.32
121 0.3
122 0.28
123 0.3
124 0.24
125 0.21
126 0.15
127 0.13
128 0.16
129 0.16
130 0.17
131 0.16
132 0.21
133 0.25
134 0.35
135 0.41
136 0.44
137 0.47
138 0.48
139 0.5
140 0.46
141 0.51
142 0.46
143 0.45
144 0.45
145 0.44
146 0.48
147 0.51
148 0.57
149 0.53
150 0.57
151 0.58
152 0.61
153 0.63
154 0.59
155 0.61
156 0.56
157 0.51
158 0.42
159 0.35
160 0.25
161 0.2
162 0.17
163 0.09
164 0.06
165 0.05
166 0.05
167 0.05
168 0.05
169 0.06
170 0.07
171 0.08
172 0.09
173 0.14
174 0.18
175 0.18
176 0.2
177 0.2
178 0.19
179 0.19
180 0.17
181 0.13
182 0.09
183 0.09
184 0.08
185 0.06
186 0.06
187 0.05
188 0.05
189 0.05
190 0.06
191 0.06
192 0.07
193 0.07
194 0.11
195 0.16
196 0.22
197 0.26
198 0.35
199 0.39
200 0.47
201 0.52
202 0.52
203 0.56
204 0.59
205 0.59
206 0.54
207 0.52
208 0.47
209 0.46
210 0.42
211 0.34
212 0.27
213 0.23
214 0.2
215 0.17
216 0.16
217 0.12
218 0.14
219 0.15
220 0.18
221 0.17
222 0.16
223 0.15
224 0.14
225 0.15
226 0.13
227 0.12
228 0.1
229 0.1
230 0.1
231 0.1
232 0.09
233 0.09
234 0.08
235 0.07
236 0.05
237 0.07
238 0.09
239 0.1
240 0.17
241 0.17
242 0.17
243 0.17
244 0.19
245 0.22
246 0.3
247 0.38
248 0.37
249 0.4
250 0.46
251 0.5
252 0.49
253 0.44
254 0.38
255 0.29
256 0.27
257 0.27
258 0.27
259 0.26
260 0.28
261 0.27
262 0.25
263 0.28
264 0.27
265 0.25
266 0.2
267 0.18
268 0.23
269 0.28
270 0.34
271 0.4
272 0.41
273 0.5
274 0.54
275 0.61
276 0.63
277 0.65
278 0.62
279 0.62
280 0.63
281 0.58
282 0.62
283 0.59
284 0.49
285 0.43
286 0.41
287 0.32
288 0.3
289 0.28
290 0.2
291 0.16
292 0.16
293 0.15
294 0.14
295 0.14
296 0.13
297 0.11
298 0.08
299 0.07
300 0.07
301 0.07
302 0.06
303 0.07
304 0.04
305 0.04
306 0.05
307 0.05
308 0.05
309 0.07
310 0.07
311 0.07
312 0.08
313 0.09
314 0.1
315 0.16
316 0.17
317 0.16
318 0.2
319 0.27
320 0.32
321 0.39
322 0.45
323 0.5
324 0.59
325 0.68
326 0.71
327 0.74
328 0.73
329 0.75
330 0.77
331 0.77
332 0.77
333 0.77
334 0.8
335 0.8
336 0.84
337 0.86
338 0.86
339 0.85
340 0.84
341 0.82
342 0.85
343 0.86
344 0.87
345 0.87
346 0.87
347 0.86
348 0.88
349 0.87
350 0.77
351 0.69
352 0.65
353 0.58
354 0.52
355 0.52
356 0.45
357 0.43
358 0.45
359 0.45
360 0.42
361 0.38
362 0.34
363 0.26
364 0.24
365 0.18
366 0.15
367 0.12
368 0.09
369 0.08
370 0.09
371 0.09
372 0.07
373 0.07
374 0.07
375 0.08
376 0.08
377 0.09
378 0.09
379 0.09
380 0.1
381 0.11
382 0.12
383 0.18
384 0.26
385 0.34
386 0.42
387 0.52
388 0.61
389 0.7
390 0.79
391 0.82
392 0.83
393 0.85
394 0.87
395 0.87
396 0.85
397 0.81
398 0.79
399 0.7
400 0.64
401 0.54
402 0.44
403 0.38
404 0.33
405 0.33
406 0.29
407 0.31
408 0.35
409 0.4
410 0.47
411 0.49
412 0.55
413 0.53
414 0.54
415 0.51
416 0.43
417 0.39
418 0.39
419 0.4
420 0.38
421 0.37
422 0.34
423 0.37
424 0.39
425 0.39
426 0.38
427 0.36
428 0.38
429 0.4
430 0.44
431 0.49
432 0.49
433 0.57
434 0.58
435 0.6