Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A376B349

Protein Details
Accession A0A376B349    Localization Confidence High Confidence Score 16.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
321-349DLPTFKGNTKSQKKKQRRKKGAMSDSTGFHydrophilic
436-461ADSVSKGKVSIKRNKLRQKNSGDVTGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
330-341KSQKKKQRRKKG
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007307  Ltv1  
Gene Ontology GO:0042274  P:ribosomal small subunit biogenesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF04180  LTV  
Amino Acid Sequences MSSNNKFNNKSAKKFAIVHRPHDDPKYYDSEASQNILIPVENPNKAQKVYQNPLRKIKKTQQVTNWRVGEAALYGIGFDDSSYDYTQHLKPIGVDPEHSIFIAKDDQKQQTTNKNIEDLFVEPQYKSMSSANNTSVFDFGKAKPEYLEHQVEIADELRGFKPDMDPALREVLEALEDEAYVINDDIVVTEHIGKAKKDGNAPMEGEKEGEEFENSDELLGSDDDIFAELLGSGETNEMERQEILDEWDMDNYDEYGDQNIDLSKIDGNLSNFNEAVDWSADVSQFKREQKILNKNEVTKINDDLESQNDFVEDEEEDQLGDLPTFKGNTKSQKKKQRRKKGAMSDSTGFSMSSSALARTEVMTVLDDKYDQIIDGYENYEDELEETADEIQEFDMKMERPDLESLVDEFLDTYELESGGRKLVKKNREKDILVEAADSVSKGKVSIKRNKLRQKNSGDVTGITTGLSSLKF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.69
2 0.71
3 0.71
4 0.69
5 0.69
6 0.66
7 0.66
8 0.65
9 0.65
10 0.61
11 0.53
12 0.53
13 0.52
14 0.48
15 0.43
16 0.4
17 0.39
18 0.36
19 0.36
20 0.3
21 0.24
22 0.23
23 0.22
24 0.19
25 0.14
26 0.2
27 0.24
28 0.25
29 0.26
30 0.31
31 0.34
32 0.36
33 0.39
34 0.39
35 0.43
36 0.5
37 0.57
38 0.61
39 0.65
40 0.75
41 0.8
42 0.77
43 0.76
44 0.77
45 0.78
46 0.76
47 0.78
48 0.78
49 0.8
50 0.8
51 0.8
52 0.72
53 0.62
54 0.53
55 0.44
56 0.34
57 0.23
58 0.18
59 0.09
60 0.07
61 0.06
62 0.06
63 0.07
64 0.05
65 0.05
66 0.05
67 0.06
68 0.08
69 0.09
70 0.1
71 0.11
72 0.15
73 0.17
74 0.2
75 0.2
76 0.18
77 0.19
78 0.24
79 0.3
80 0.26
81 0.26
82 0.26
83 0.27
84 0.27
85 0.25
86 0.2
87 0.14
88 0.15
89 0.22
90 0.2
91 0.24
92 0.3
93 0.35
94 0.37
95 0.41
96 0.45
97 0.47
98 0.52
99 0.51
100 0.46
101 0.45
102 0.42
103 0.39
104 0.35
105 0.28
106 0.23
107 0.2
108 0.2
109 0.16
110 0.17
111 0.18
112 0.16
113 0.17
114 0.17
115 0.19
116 0.2
117 0.24
118 0.26
119 0.28
120 0.28
121 0.27
122 0.25
123 0.21
124 0.21
125 0.2
126 0.17
127 0.23
128 0.22
129 0.22
130 0.22
131 0.23
132 0.25
133 0.28
134 0.3
135 0.22
136 0.22
137 0.21
138 0.21
139 0.2
140 0.16
141 0.1
142 0.07
143 0.1
144 0.09
145 0.1
146 0.11
147 0.1
148 0.11
149 0.12
150 0.16
151 0.15
152 0.16
153 0.16
154 0.2
155 0.19
156 0.17
157 0.16
158 0.12
159 0.11
160 0.1
161 0.09
162 0.05
163 0.05
164 0.05
165 0.05
166 0.05
167 0.05
168 0.04
169 0.04
170 0.03
171 0.03
172 0.03
173 0.04
174 0.04
175 0.05
176 0.06
177 0.07
178 0.09
179 0.11
180 0.11
181 0.14
182 0.18
183 0.2
184 0.23
185 0.26
186 0.27
187 0.28
188 0.29
189 0.28
190 0.25
191 0.22
192 0.19
193 0.15
194 0.13
195 0.1
196 0.09
197 0.07
198 0.06
199 0.06
200 0.07
201 0.06
202 0.06
203 0.05
204 0.05
205 0.06
206 0.05
207 0.05
208 0.04
209 0.05
210 0.04
211 0.05
212 0.05
213 0.03
214 0.03
215 0.03
216 0.03
217 0.03
218 0.03
219 0.03
220 0.03
221 0.03
222 0.04
223 0.04
224 0.04
225 0.05
226 0.05
227 0.05
228 0.05
229 0.06
230 0.07
231 0.08
232 0.08
233 0.08
234 0.09
235 0.09
236 0.08
237 0.08
238 0.07
239 0.06
240 0.05
241 0.05
242 0.05
243 0.05
244 0.05
245 0.05
246 0.05
247 0.06
248 0.05
249 0.06
250 0.06
251 0.06
252 0.07
253 0.09
254 0.1
255 0.13
256 0.14
257 0.15
258 0.14
259 0.13
260 0.13
261 0.11
262 0.11
263 0.07
264 0.06
265 0.06
266 0.07
267 0.08
268 0.08
269 0.09
270 0.12
271 0.17
272 0.19
273 0.22
274 0.23
275 0.29
276 0.38
277 0.48
278 0.5
279 0.54
280 0.56
281 0.55
282 0.58
283 0.57
284 0.5
285 0.41
286 0.38
287 0.31
288 0.28
289 0.27
290 0.22
291 0.2
292 0.19
293 0.17
294 0.14
295 0.12
296 0.11
297 0.1
298 0.1
299 0.07
300 0.07
301 0.08
302 0.08
303 0.07
304 0.07
305 0.08
306 0.07
307 0.07
308 0.06
309 0.06
310 0.07
311 0.08
312 0.09
313 0.14
314 0.19
315 0.29
316 0.39
317 0.49
318 0.58
319 0.68
320 0.79
321 0.84
322 0.91
323 0.92
324 0.92
325 0.92
326 0.93
327 0.93
328 0.92
329 0.89
330 0.84
331 0.75
332 0.65
333 0.56
334 0.46
335 0.34
336 0.24
337 0.17
338 0.11
339 0.1
340 0.09
341 0.08
342 0.08
343 0.09
344 0.09
345 0.09
346 0.1
347 0.09
348 0.08
349 0.09
350 0.1
351 0.1
352 0.1
353 0.1
354 0.09
355 0.1
356 0.09
357 0.08
358 0.07
359 0.07
360 0.08
361 0.09
362 0.1
363 0.09
364 0.09
365 0.09
366 0.09
367 0.08
368 0.08
369 0.08
370 0.07
371 0.07
372 0.07
373 0.07
374 0.07
375 0.07
376 0.07
377 0.06
378 0.08
379 0.08
380 0.08
381 0.12
382 0.12
383 0.14
384 0.16
385 0.17
386 0.17
387 0.19
388 0.19
389 0.17
390 0.18
391 0.18
392 0.16
393 0.15
394 0.12
395 0.11
396 0.1
397 0.1
398 0.08
399 0.08
400 0.07
401 0.07
402 0.08
403 0.09
404 0.1
405 0.14
406 0.18
407 0.2
408 0.28
409 0.37
410 0.47
411 0.55
412 0.63
413 0.68
414 0.73
415 0.72
416 0.67
417 0.67
418 0.61
419 0.52
420 0.44
421 0.35
422 0.27
423 0.25
424 0.21
425 0.14
426 0.1
427 0.09
428 0.09
429 0.16
430 0.23
431 0.32
432 0.43
433 0.52
434 0.62
435 0.72
436 0.82
437 0.86
438 0.88
439 0.89
440 0.88
441 0.87
442 0.82
443 0.78
444 0.69
445 0.59
446 0.54
447 0.45
448 0.36
449 0.26
450 0.2
451 0.14