FuNGI

A0A376B8N0

Protein Details

Accession

A0A376B8N0

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
100-120	GVAPRAKMNQQRARRFRSAKD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 18.5, mito_nucl 13, mito 6.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027073 5_3_exoribonuclease IPR041412 Xrn1_helical IPR004859 Xrn1_N IPR017151 Xrn2/3/4
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0004534 F:5'-3' RNA exonuclease activity GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0006353 P:DNA-templated transcription termination GO:0006397 P:mRNA processing GO:0006364 P:rRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF17846 XRN_M PF03159 XRN_N
CDD	cd18673 PIN_XRN1-2-like

Amino Acid Sequences

MGVPSFFRWLSRKYPKIISPVIEQDSTTVDDGNVYSSENPNGELDNLYLDMNGIVHPCSHPENKPPPENEDEMLVAVFEYTNRVLNMARPRRILMIAVDGVAPRAKMNQQRARRFRSAKDAALEREKLEMDYIKEGKNLDDALLKKKSWDSNAITPGTPFMDKLAQGLRYWISFKLSTDPGWENLQVIISDATVPGEGEHKIMNFIRSQRQDPEYNPNTTHCIYGLDADLIFLGLATHEPHFKILREDVFEQTINRKHGSNNSRYDKRRELTEEEKKELQEKDKKKPFLWLHISVLREYLKEELFVPGLSIEFDLERSIDDWVFMCFFCGNDFLPHLPSLDVRESSIDLLVEIWKTVLPQTKGYMSLDGRLNLSGVELLLKGLGTREPGIFVEKRQQELRKLENEQRRKLLNLRRQEQNNLSSFADNGAVNHVRSETPISSAGSIHLTEEKEEEKKKEEEEEEGKEGEEEEEEEEGKEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEDSYDPTPSSNINDINKTNLTVASKFKEKLLLKRKRLVIEKESINTTTAGNSHKIIKLDKSQEVSLNTSSSGPTSGTYDSNLAVKLYEPGYHDRYYITKFGCPNNKEEIAALSKKVVKAYVEGISWVLLYYYQGCASWNWYYPYHYAPFASDFMNIAGLDIKFEKGEPFAPFEQLMSVLPASSGHTLPKIFRPLMSELTSPIIDFYPTEFPIDMNGKKMSWQGIALLPFIEEKRLLETVRKKYAELSKEDLARNSRKNDILLISHKNINYKKFVKTLYQTESSDNVRLKVTAYKNRISGEVSVVANDGDDVGRFDLKGELTCPVSGGYPNLNNSKYLKLTYKMLNIYDDKNKAVILNGYIPHKQVLNIQDKNNIRYGQGHSQGNNNKRNNGYYNFQRNFHFTMQNNFVETGPFGSTQYKPRFGGYKSFVSSELEKKSNQANFQNYYYNDNYDNYGNNNDTYYGRNYNNNYNSHGARNYGYNNYGSNNYNNGYNNSKGGNRGIRPNRQGTL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.62
2	0.64
3	0.68
4	0.69
5	0.62
6	0.59
7	0.6
8	0.58
9	0.5
10	0.44
11	0.36
12	0.33
13	0.31
14	0.25
15	0.17
16	0.13
17	0.14
18	0.14
19	0.15
20	0.12
21	0.11
22	0.13
23	0.15
24	0.19
25	0.18
26	0.19
27	0.18
28	0.19
29	0.18
30	0.17
31	0.15
32	0.14
33	0.14
34	0.13
35	0.12
36	0.11
37	0.1
38	0.09
39	0.09
40	0.08
41	0.08
42	0.09
43	0.1
44	0.13
45	0.19
46	0.24
47	0.27
48	0.36
49	0.46
50	0.53
51	0.61
52	0.61
53	0.62
54	0.62
55	0.62
56	0.53
57	0.45
58	0.37
59	0.3
60	0.26
61	0.2
62	0.13
63	0.1
64	0.09
65	0.06
66	0.08
67	0.08
68	0.11
69	0.12
70	0.13
71	0.14
72	0.2
73	0.31
74	0.37
75	0.42
76	0.41
77	0.43
78	0.46
79	0.46
80	0.42
81	0.33
82	0.3
83	0.26
84	0.24
85	0.23
86	0.19
87	0.19
88	0.18
89	0.16
90	0.1
91	0.13
92	0.19
93	0.26
94	0.37
95	0.45
96	0.54
97	0.65
98	0.74
99	0.79
100	0.82
101	0.8
102	0.76
103	0.77
104	0.74
105	0.68
106	0.66
107	0.63
108	0.58
109	0.6
110	0.56
111	0.46
112	0.42
113	0.37
114	0.31
115	0.28
116	0.25
117	0.2
118	0.27
119	0.29
120	0.27
121	0.29
122	0.29
123	0.27
124	0.27
125	0.24
126	0.18
127	0.21
128	0.22
129	0.27
130	0.31
131	0.3
132	0.3
133	0.35
134	0.39
135	0.38
136	0.44
137	0.43
138	0.47
139	0.54
140	0.53
141	0.48
142	0.42
143	0.39
144	0.34
145	0.27
146	0.19
147	0.15
148	0.16
149	0.15
150	0.18
151	0.21
152	0.2
153	0.2
154	0.23
155	0.22
156	0.2
157	0.22
158	0.2
159	0.2
160	0.19
161	0.2
162	0.23
163	0.24
164	0.23
165	0.27
166	0.28
167	0.26
168	0.28
169	0.27
170	0.22
171	0.2
172	0.2
173	0.15
174	0.14
175	0.11
176	0.08
177	0.08
178	0.08
179	0.08
180	0.07
181	0.07
182	0.06
183	0.08
184	0.08
185	0.08
186	0.1
187	0.09
188	0.13
189	0.15
190	0.16
191	0.18
192	0.22
193	0.3
194	0.34
195	0.37
196	0.4
197	0.43
198	0.46
199	0.46
200	0.52
201	0.48
202	0.47
203	0.45
204	0.41
205	0.41
206	0.37
207	0.34
208	0.24
209	0.21
210	0.17
211	0.18
212	0.17
213	0.12
214	0.11
215	0.11
216	0.1
217	0.08
218	0.07
219	0.05
220	0.04
221	0.03
222	0.04
223	0.05
224	0.07
225	0.08
226	0.09
227	0.12
228	0.14
229	0.15
230	0.18
231	0.22
232	0.24
233	0.27
234	0.29
235	0.29
236	0.3
237	0.3
238	0.27
239	0.29
240	0.31
241	0.3
242	0.28
243	0.27
244	0.27
245	0.36
246	0.43
247	0.45
248	0.49
249	0.55
250	0.63
251	0.66
252	0.71
253	0.7
254	0.64
255	0.63
256	0.58
257	0.57
258	0.58
259	0.64
260	0.62
261	0.58
262	0.59
263	0.52
264	0.52
265	0.48
266	0.47
267	0.46
268	0.48
269	0.54
270	0.6
271	0.64
272	0.59
273	0.66
274	0.61
275	0.62
276	0.62
277	0.56
278	0.52
279	0.52
280	0.52
281	0.42
282	0.41
283	0.31
284	0.24
285	0.2
286	0.17
287	0.14
288	0.13
289	0.14
290	0.13
291	0.12
292	0.12
293	0.11
294	0.08
295	0.08
296	0.08
297	0.07
298	0.06
299	0.05
300	0.06
301	0.06
302	0.05
303	0.06
304	0.06
305	0.07
306	0.07
307	0.07
308	0.07
309	0.08
310	0.09
311	0.08
312	0.08
313	0.07
314	0.07
315	0.08
316	0.09
317	0.09
318	0.09
319	0.11
320	0.11
321	0.13
322	0.13
323	0.13
324	0.12
325	0.11
326	0.14
327	0.15
328	0.15
329	0.13
330	0.14
331	0.14
332	0.14
333	0.14
334	0.1
335	0.07
336	0.07
337	0.08
338	0.07
339	0.06
340	0.06
341	0.06
342	0.06
343	0.09
344	0.14
345	0.15
346	0.17
347	0.19
348	0.2
349	0.22
350	0.23
351	0.24
352	0.19
353	0.22
354	0.22
355	0.21
356	0.2
357	0.18
358	0.18
359	0.13
360	0.12
361	0.08
362	0.05
363	0.05
364	0.04
365	0.04
366	0.04
367	0.04
368	0.04
369	0.05
370	0.05
371	0.06
372	0.07
373	0.07
374	0.09
375	0.09
376	0.14
377	0.14
378	0.14
379	0.22
380	0.22
381	0.25
382	0.29
383	0.32
384	0.35
385	0.4
386	0.45
387	0.42
388	0.45
389	0.5
390	0.55
391	0.6
392	0.57
393	0.56
394	0.52
395	0.48
396	0.51
397	0.52
398	0.51
399	0.52
400	0.53
401	0.56
402	0.57
403	0.6
404	0.56
405	0.53
406	0.47
407	0.41
408	0.36
409	0.29
410	0.26
411	0.21
412	0.18
413	0.12
414	0.1
415	0.11
416	0.12
417	0.11
418	0.12
419	0.12
420	0.1
421	0.11
422	0.14
423	0.1
424	0.11
425	0.13
426	0.13
427	0.12
428	0.13
429	0.13
430	0.11
431	0.1
432	0.09
433	0.1
434	0.1
435	0.1
436	0.11
437	0.12
438	0.15
439	0.18
440	0.19
441	0.2
442	0.22
443	0.22
444	0.26
445	0.25
446	0.26
447	0.27
448	0.29
449	0.27
450	0.25
451	0.24
452	0.19
453	0.19
454	0.13
455	0.09
456	0.06
457	0.05
458	0.05
459	0.06
460	0.06
461	0.06
462	0.06
463	0.06
464	0.05
465	0.05
466	0.04
467	0.05
468	0.05
469	0.05
470	0.06
471	0.06
472	0.06
473	0.06
474	0.06
475	0.05
476	0.05
477	0.05
478	0.04
479	0.04
480	0.04
481	0.04
482	0.04
483	0.04
484	0.04
485	0.05
486	0.05
487	0.05
488	0.05
489	0.05
490	0.05
491	0.05
492	0.06
493	0.06
494	0.07
495	0.1
496	0.13
497	0.14
498	0.17
499	0.17
500	0.2
501	0.19
502	0.18
503	0.16
504	0.14
505	0.14
506	0.14
507	0.16
508	0.16
509	0.19
510	0.18
511	0.18
512	0.25
513	0.25
514	0.33
515	0.41
516	0.49
517	0.5
518	0.57
519	0.61
520	0.59
521	0.63
522	0.59
523	0.54
524	0.5
525	0.48
526	0.43
527	0.4
528	0.34
529	0.29
530	0.23
531	0.19
532	0.13
533	0.12
534	0.12
535	0.12
536	0.12
537	0.14
538	0.16
539	0.17
540	0.18
541	0.19
542	0.24
543	0.27
544	0.3
545	0.29
546	0.28
547	0.3
548	0.3
549	0.3
550	0.24
551	0.2
552	0.17
553	0.14
554	0.13
555	0.1
556	0.09
557	0.07
558	0.07
559	0.08
560	0.09
561	0.09
562	0.1
563	0.11
564	0.1
565	0.11
566	0.11
567	0.09
568	0.07
569	0.07
570	0.08
571	0.08
572	0.1
573	0.11
574	0.15
575	0.19
576	0.2
577	0.2
578	0.19
579	0.21
580	0.21
581	0.24
582	0.21
583	0.2
584	0.23
585	0.29
586	0.36
587	0.35
588	0.36
589	0.38
590	0.38
591	0.34
592	0.32
593	0.28
594	0.24
595	0.24
596	0.2
597	0.17
598	0.18
599	0.19
600	0.19
601	0.18
602	0.13
603	0.14
604	0.17
605	0.17
606	0.14
607	0.14
608	0.14
609	0.12
610	0.12
611	0.1
612	0.07
613	0.04
614	0.04
615	0.05
616	0.06
617	0.06
618	0.06
619	0.07
620	0.07
621	0.11
622	0.13
623	0.14
624	0.16
625	0.17
626	0.2
627	0.21
628	0.24
629	0.22
630	0.21
631	0.18
632	0.17
633	0.18
634	0.17
635	0.16
636	0.13
637	0.12
638	0.11
639	0.12
640	0.1
641	0.08
642	0.09
643	0.08
644	0.09
645	0.09
646	0.09
647	0.08
648	0.08
649	0.09
650	0.08
651	0.12
652	0.12
653	0.16
654	0.17
655	0.18
656	0.18
657	0.17
658	0.16
659	0.14
660	0.12
661	0.09
662	0.08
663	0.06
664	0.06
665	0.07
666	0.08
667	0.09
668	0.1
669	0.09
670	0.11
671	0.12
672	0.14
673	0.19
674	0.22
675	0.21
676	0.21
677	0.25
678	0.26
679	0.3
680	0.31
681	0.26
682	0.22
683	0.24
684	0.23
685	0.19
686	0.16
687	0.12
688	0.09
689	0.09
690	0.11
691	0.12
692	0.13
693	0.14
694	0.14
695	0.13
696	0.17
697	0.22
698	0.2
699	0.19
700	0.2
701	0.19
702	0.2
703	0.22
704	0.21
705	0.16
706	0.16
707	0.15
708	0.17
709	0.18
710	0.17
711	0.15
712	0.13
713	0.13
714	0.13
715	0.12
716	0.09
717	0.08
718	0.12
719	0.14
720	0.14
721	0.21
722	0.29
723	0.36
724	0.45
725	0.45
726	0.42
727	0.47
728	0.54
729	0.52
730	0.48
731	0.46
732	0.42
733	0.46
734	0.47
735	0.44
736	0.43
737	0.45
738	0.45
739	0.43
740	0.43
741	0.4
742	0.4
743	0.39
744	0.35
745	0.33
746	0.33
747	0.36
748	0.34
749	0.36
750	0.36
751	0.4
752	0.41
753	0.4
754	0.43
755	0.41
756	0.43
757	0.44
758	0.45
759	0.45
760	0.48
761	0.51
762	0.49
763	0.5
764	0.46
765	0.44
766	0.45
767	0.4
768	0.4
769	0.33
770	0.29
771	0.24
772	0.23
773	0.22
774	0.26
775	0.31
776	0.35
777	0.4
778	0.42
779	0.45
780	0.46
781	0.46
782	0.4
783	0.33
784	0.28
785	0.27
786	0.23
787	0.2
788	0.19
789	0.17
790	0.14
791	0.13
792	0.09
793	0.05
794	0.05
795	0.06
796	0.07
797	0.08
798	0.08
799	0.09
800	0.11
801	0.11
802	0.12
803	0.12
804	0.13
805	0.15
806	0.15
807	0.14
808	0.12
809	0.13
810	0.12
811	0.13
812	0.16
813	0.18
814	0.22
815	0.27
816	0.27
817	0.28
818	0.3
819	0.33
820	0.3
821	0.31
822	0.32
823	0.29
824	0.34
825	0.37
826	0.42
827	0.4
828	0.4
829	0.41
830	0.39
831	0.42
832	0.44
833	0.41
834	0.35
835	0.32
836	0.31
837	0.26
838	0.25
839	0.22
840	0.17
841	0.2
842	0.22
843	0.25
844	0.26
845	0.27
846	0.26
847	0.24
848	0.22
849	0.23
850	0.29
851	0.35
852	0.39
853	0.4
854	0.47
855	0.5
856	0.52
857	0.52
858	0.45
859	0.36
860	0.36
861	0.4
862	0.41
863	0.44
864	0.46
865	0.41
866	0.49
867	0.56
868	0.6
869	0.63
870	0.58
871	0.57
872	0.56
873	0.6
874	0.57
875	0.53
876	0.52
877	0.53
878	0.6
879	0.57
880	0.57
881	0.54
882	0.53
883	0.54
884	0.51
885	0.48
886	0.4
887	0.44
888	0.48
889	0.47
890	0.44
891	0.4
892	0.35
893	0.28
894	0.26
895	0.21
896	0.16
897	0.15
898	0.14
899	0.17
900	0.21
901	0.29
902	0.36
903	0.39
904	0.38
905	0.42
906	0.47
907	0.45
908	0.52
909	0.48
910	0.49
911	0.46
912	0.46
913	0.43
914	0.41
915	0.43
916	0.41
917	0.42
918	0.37
919	0.35
920	0.36
921	0.43
922	0.44
923	0.46
924	0.47
925	0.48
926	0.5
927	0.53
928	0.57
929	0.5
930	0.51
931	0.47
932	0.42
933	0.37
934	0.33
935	0.33
936	0.28
937	0.29
938	0.25
939	0.28
940	0.26
941	0.24
942	0.24
943	0.24
944	0.23
945	0.24
946	0.27
947	0.28
948	0.3
949	0.36
950	0.4
951	0.48
952	0.53
953	0.52
954	0.52
955	0.51
956	0.51
957	0.49
958	0.47
959	0.39
960	0.34
961	0.37
962	0.36
963	0.35
964	0.35
965	0.31
966	0.31
967	0.31
968	0.34
969	0.31
970	0.31
971	0.3
972	0.28
973	0.31
974	0.32
975	0.34
976	0.35
977	0.34
978	0.33
979	0.33
980	0.34
981	0.33
982	0.38
983	0.42
984	0.41
985	0.5
986	0.56
987	0.63
988	0.68

A0A376B8N0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer