FuNGI

A0A376B4Y7

Protein Details

Accession

A0A376B4Y7

Localization Confidence

High

Confidence Score

16.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
4-42	KNNHTFTKHSKSFNNKTKNSNRRHNKKFTIQKPQYPGNV	Hydrophilic
93-113	INNNKHSYKHIRQLKNNENAG	Hydrophilic
148-186	NAPFTTLKKKKQPLKVRSKTKQQQKKEFKKIRNSNVFFL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
155-178	KKKKQPLKVRSKTKQQQKKEFKKI

Subcellular Location(s)

nucl 13, mito 10, cyto_nucl 9.5, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043954 Snu56_snRNP
Gene Ontology	GO:0003729 F:mRNA binding GO:0000398 P:mRNA splicing, via spliceosome
Pfam	View protein in Pfam PF19097 Snu56_snRNP

Amino Acid Sequences

MAIKNNHTFTKHSKSFNNKTKNSNRRHNKKFTIQKPQYPGNVIISPGSRFIDSASNKKDKNVKNYSDKMGESSNNYKMFTSNQTNSKRNYKLINNNKHSYKHIRQLKNNENAGNNRNILSTNIDKSAKIPTDLTQQLLYLRQIKFKLNAPFTTLKKKKQPLKVRSKTKQQQKKEFKKIRNSNVFFLIKSEEEFKLLYNKFNSNKTLNFKNCKIDFIRLHNNDIDCFIIQLFEFNSMDFAMIMIFLFYTLARKTNENLNLHMVVHQSTKLPQIDINSNTGTDAKLIIKKQLINSGMYPGFIGYRIISHGINFFMLKMIKLVSKHWKFDGKTDLIRNKLKKNLYEQMKLNRNNALQFKMGQNSFLKGVNSLKNPNSSNKLLKYFEKLSKYNIGVIAGGSGLSSSKKKDQYITTNISLKSNDITSEKKPTKTSIIKNMIISNNNNNNSNNNNNNNSTSNIDINSNSNNNNTKITTSKYNSSKATNTSTNYNADNINKKPDEDIVSLCLQIIDKSIRQLEFLENSSSPYQIVKVFVKLPRPIYSLPNDKLTSTLLKPIGDKTNCNIVILSYINVHQSLDWFNDLQLPFINDLKEQHCKIINIGGVVGSCKQALNMLKEDIKSKIKK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.66
2	0.74
3	0.79
4	0.82
5	0.77
6	0.81
7	0.85
8	0.86
9	0.86
10	0.86
11	0.87
12	0.87
13	0.91
14	0.91
15	0.9
16	0.9
17	0.91
18	0.9
19	0.9
20	0.88
21	0.86
22	0.84
23	0.81
24	0.76
25	0.7
26	0.63
27	0.58
28	0.51
29	0.43
30	0.38
31	0.33
32	0.28
33	0.26
34	0.25
35	0.19
36	0.17
37	0.18
38	0.24
39	0.26
40	0.34
41	0.39
42	0.45
43	0.46
44	0.52
45	0.6
46	0.58
47	0.65
48	0.66
49	0.67
50	0.69
51	0.75
52	0.76
53	0.71
54	0.64
55	0.57
56	0.52
57	0.46
58	0.42
59	0.42
60	0.42
61	0.39
62	0.39
63	0.37
64	0.33
65	0.34
66	0.36
67	0.38
68	0.37
69	0.44
70	0.51
71	0.56
72	0.6
73	0.66
74	0.63
75	0.59
76	0.61
77	0.61
78	0.64
79	0.7
80	0.75
81	0.74
82	0.77
83	0.77
84	0.72
85	0.7
86	0.69
87	0.66
88	0.65
89	0.67
90	0.69
91	0.72
92	0.8
93	0.83
94	0.82
95	0.79
96	0.73
97	0.69
98	0.65
99	0.61
100	0.55
101	0.46
102	0.37
103	0.33
104	0.29
105	0.25
106	0.25
107	0.25
108	0.22
109	0.26
110	0.27
111	0.26
112	0.26
113	0.33
114	0.29
115	0.26
116	0.25
117	0.22
118	0.3
119	0.31
120	0.32
121	0.25
122	0.23
123	0.23
124	0.24
125	0.25
126	0.24
127	0.23
128	0.27
129	0.29
130	0.31
131	0.33
132	0.37
133	0.43
134	0.41
135	0.41
136	0.42
137	0.46
138	0.47
139	0.55
140	0.54
141	0.53
142	0.58
143	0.66
144	0.68
145	0.72
146	0.79
147	0.79
148	0.84
149	0.86
150	0.88
151	0.87
152	0.9
153	0.88
154	0.88
155	0.88
156	0.86
157	0.87
158	0.87
159	0.9
160	0.9
161	0.91
162	0.89
163	0.9
164	0.89
165	0.89
166	0.88
167	0.81
168	0.73
169	0.72
170	0.64
171	0.53
172	0.45
173	0.37
174	0.26
175	0.23
176	0.24
177	0.16
178	0.15
179	0.16
180	0.14
181	0.21
182	0.21
183	0.24
184	0.24
185	0.3
186	0.32
187	0.36
188	0.4
189	0.35
190	0.4
191	0.41
192	0.47
193	0.49
194	0.52
195	0.51
196	0.56
197	0.53
198	0.52
199	0.49
200	0.47
201	0.44
202	0.45
203	0.52
204	0.45
205	0.47
206	0.45
207	0.43
208	0.36
209	0.32
210	0.26
211	0.15
212	0.13
213	0.1
214	0.08
215	0.07
216	0.07
217	0.07
218	0.08
219	0.08
220	0.08
221	0.08
222	0.08
223	0.08
224	0.07
225	0.06
226	0.04
227	0.04
228	0.04
229	0.03
230	0.03
231	0.02
232	0.03
233	0.03
234	0.05
235	0.06
236	0.09
237	0.1
238	0.12
239	0.13
240	0.21
241	0.28
242	0.27
243	0.29
244	0.29
245	0.29
246	0.28
247	0.27
248	0.21
249	0.15
250	0.14
251	0.13
252	0.1
253	0.11
254	0.15
255	0.14
256	0.14
257	0.14
258	0.16
259	0.21
260	0.22
261	0.23
262	0.19
263	0.18
264	0.18
265	0.17
266	0.14
267	0.09
268	0.09
269	0.09
270	0.12
271	0.13
272	0.16
273	0.18
274	0.2
275	0.21
276	0.25
277	0.24
278	0.22
279	0.22
280	0.23
281	0.21
282	0.19
283	0.17
284	0.11
285	0.1
286	0.09
287	0.09
288	0.05
289	0.05
290	0.06
291	0.07
292	0.07
293	0.07
294	0.08
295	0.08
296	0.08
297	0.08
298	0.07
299	0.07
300	0.07
301	0.07
302	0.07
303	0.07
304	0.08
305	0.09
306	0.13
307	0.22
308	0.25
309	0.27
310	0.29
311	0.35
312	0.34
313	0.38
314	0.42
315	0.35
316	0.36
317	0.41
318	0.42
319	0.41
320	0.47
321	0.47
322	0.44
323	0.47
324	0.46
325	0.43
326	0.46
327	0.48
328	0.49
329	0.5
330	0.5
331	0.52
332	0.57
333	0.57
334	0.52
335	0.48
336	0.42
337	0.41
338	0.39
339	0.33
340	0.25
341	0.24
342	0.24
343	0.24
344	0.23
345	0.21
346	0.19
347	0.18
348	0.18
349	0.19
350	0.17
351	0.14
352	0.18
353	0.2
354	0.22
355	0.25
356	0.26
357	0.29
358	0.31
359	0.34
360	0.35
361	0.34
362	0.37
363	0.37
364	0.4
365	0.37
366	0.37
367	0.39
368	0.4
369	0.42
370	0.42
371	0.39
372	0.38
373	0.42
374	0.41
375	0.37
376	0.32
377	0.26
378	0.2
379	0.19
380	0.15
381	0.09
382	0.08
383	0.05
384	0.04
385	0.04
386	0.05
387	0.07
388	0.09
389	0.16
390	0.2
391	0.22
392	0.27
393	0.34
394	0.4
395	0.47
396	0.51
397	0.49
398	0.5
399	0.49
400	0.46
401	0.39
402	0.32
403	0.25
404	0.2
405	0.17
406	0.14
407	0.17
408	0.18
409	0.28
410	0.32
411	0.34
412	0.35
413	0.36
414	0.43
415	0.48
416	0.52
417	0.53
418	0.57
419	0.56
420	0.56
421	0.58
422	0.53
423	0.48
424	0.44
425	0.42
426	0.42
427	0.42
428	0.42
429	0.38
430	0.37
431	0.38
432	0.42
433	0.4
434	0.38
435	0.4
436	0.39
437	0.42
438	0.4
439	0.38
440	0.33
441	0.28
442	0.24
443	0.21
444	0.2
445	0.18
446	0.18
447	0.2
448	0.21
449	0.19
450	0.22
451	0.25
452	0.26
453	0.27
454	0.26
455	0.24
456	0.25
457	0.28
458	0.32
459	0.32
460	0.38
461	0.41
462	0.46
463	0.47
464	0.48
465	0.49
466	0.44
467	0.47
468	0.43
469	0.4
470	0.39
471	0.4
472	0.38
473	0.35
474	0.32
475	0.29
476	0.29
477	0.33
478	0.31
479	0.36
480	0.34
481	0.34
482	0.34
483	0.35
484	0.35
485	0.31
486	0.3
487	0.25
488	0.26
489	0.25
490	0.23
491	0.19
492	0.14
493	0.12
494	0.14
495	0.14
496	0.14
497	0.18
498	0.22
499	0.22
500	0.22
501	0.24
502	0.25
503	0.25
504	0.27
505	0.27
506	0.23
507	0.26
508	0.26
509	0.24
510	0.2
511	0.17
512	0.17
513	0.15
514	0.19
515	0.17
516	0.2
517	0.26
518	0.29
519	0.35
520	0.39
521	0.41
522	0.42
523	0.44
524	0.43
525	0.44
526	0.48
527	0.5
528	0.48
529	0.51
530	0.47
531	0.42
532	0.41
533	0.38
534	0.36
535	0.28
536	0.32
537	0.27
538	0.28
539	0.29
540	0.33
541	0.4
542	0.37
543	0.39
544	0.36
545	0.43
546	0.42
547	0.41
548	0.36
549	0.27
550	0.28
551	0.26
552	0.23
553	0.14
554	0.15
555	0.16
556	0.16
557	0.16
558	0.12
559	0.13
560	0.15
561	0.16
562	0.18
563	0.16
564	0.16
565	0.23
566	0.23
567	0.22
568	0.21
569	0.21
570	0.2
571	0.22
572	0.23
573	0.18
574	0.23
575	0.27
576	0.33
577	0.32
578	0.35
579	0.38
580	0.38
581	0.38
582	0.4
583	0.37
584	0.29
585	0.28
586	0.24
587	0.19
588	0.2
589	0.19
590	0.14
591	0.12
592	0.11
593	0.11
594	0.16
595	0.21
596	0.25
597	0.28
598	0.32
599	0.36
600	0.37
601	0.4
602	0.41

A0A376B4Y7

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer