Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A376B8C1

Protein Details
Accession A0A376B8C1    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
381-402IYGSYQRQPPQQQQQQQQQQDYHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 26.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR008942  ENTH_VHS  
IPR036028  SH3-like_dom_sf  
IPR001452  SH3_domain  
IPR003903  UIM_dom  
IPR002014  VHS_dom  
Gene Ontology GO:0010008  C:endosome membrane  
GO:0035091  F:phosphatidylinositol binding  
GO:0043130  F:ubiquitin binding  
GO:0006886  P:intracellular protein transport  
GO:0007034  P:vacuolar transport  
GO:0016192  P:vesicle-mediated transport  
Pfam View protein in Pfam  
PF00018  SH3_1  
PF00790  VHS  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50002  SH3  
PS50330  UIM  
PS50179  VHS  
CDD cd16978  VHS_HSE1  
Amino Acid Sequences MAFSSMKLKNAVANATDPKLRADNWQYIMDVCDLVREDPEEASDSVVDLVEKVISKGNGNSILRSLSLILSLAENCGSRLQQKIGSKHFSHLLYTELVDNPNSHITIRTETAKMIDTLAKLFANDPSLRYMIDTRNLIMRNYPNLLSDLAKIPASNSHPVIPSKKQDSGYNEDETLQEALRLSLEEFEAEKKRKEQQQKTQDNSASNSNNNAKPTTVPASQPGKPKIRKVRAMYDLTSNEPDELSFKKDDIIRVLDVVYKDWWRGSLRGKIGIFPLNYVVPVQEKTKDELLLEDQQEKNILNKHQEINNLQHILRTSSTDIPNDTSPQINQMYNSVIPLRPQITKMIGKYAEKRDDLLSLHEVLSSAEAEYNKLLNNAANIYGSYQRQPPQQQQQQQQQQDYTQYASPANNGFALGYGMDSRP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.34
3 0.36
4 0.32
5 0.32
6 0.32
7 0.31
8 0.34
9 0.36
10 0.4
11 0.41
12 0.43
13 0.4
14 0.38
15 0.38
16 0.31
17 0.25
18 0.16
19 0.15
20 0.14
21 0.14
22 0.15
23 0.14
24 0.14
25 0.14
26 0.16
27 0.16
28 0.14
29 0.15
30 0.14
31 0.13
32 0.12
33 0.12
34 0.1
35 0.07
36 0.07
37 0.08
38 0.08
39 0.09
40 0.13
41 0.13
42 0.16
43 0.17
44 0.22
45 0.28
46 0.29
47 0.29
48 0.26
49 0.27
50 0.25
51 0.24
52 0.2
53 0.12
54 0.12
55 0.11
56 0.09
57 0.1
58 0.09
59 0.09
60 0.1
61 0.09
62 0.1
63 0.11
64 0.12
65 0.13
66 0.17
67 0.19
68 0.24
69 0.31
70 0.38
71 0.43
72 0.5
73 0.49
74 0.48
75 0.51
76 0.46
77 0.4
78 0.33
79 0.28
80 0.22
81 0.21
82 0.2
83 0.16
84 0.16
85 0.15
86 0.15
87 0.15
88 0.16
89 0.15
90 0.13
91 0.14
92 0.16
93 0.18
94 0.2
95 0.21
96 0.2
97 0.2
98 0.21
99 0.2
100 0.18
101 0.17
102 0.17
103 0.14
104 0.14
105 0.16
106 0.14
107 0.13
108 0.13
109 0.13
110 0.15
111 0.15
112 0.15
113 0.16
114 0.17
115 0.16
116 0.17
117 0.19
118 0.18
119 0.22
120 0.21
121 0.19
122 0.24
123 0.25
124 0.24
125 0.24
126 0.25
127 0.24
128 0.25
129 0.25
130 0.2
131 0.21
132 0.22
133 0.18
134 0.17
135 0.15
136 0.14
137 0.13
138 0.12
139 0.12
140 0.15
141 0.17
142 0.19
143 0.18
144 0.19
145 0.22
146 0.24
147 0.29
148 0.28
149 0.31
150 0.32
151 0.36
152 0.36
153 0.38
154 0.41
155 0.43
156 0.43
157 0.39
158 0.35
159 0.31
160 0.29
161 0.25
162 0.2
163 0.13
164 0.1
165 0.08
166 0.07
167 0.07
168 0.07
169 0.06
170 0.06
171 0.06
172 0.06
173 0.06
174 0.1
175 0.15
176 0.17
177 0.18
178 0.2
179 0.27
180 0.34
181 0.44
182 0.5
183 0.55
184 0.64
185 0.72
186 0.74
187 0.74
188 0.7
189 0.61
190 0.53
191 0.49
192 0.4
193 0.31
194 0.3
195 0.28
196 0.27
197 0.26
198 0.25
199 0.19
200 0.18
201 0.21
202 0.21
203 0.18
204 0.17
205 0.22
206 0.26
207 0.3
208 0.36
209 0.38
210 0.43
211 0.44
212 0.52
213 0.56
214 0.6
215 0.63
216 0.62
217 0.64
218 0.63
219 0.64
220 0.57
221 0.52
222 0.45
223 0.4
224 0.36
225 0.28
226 0.2
227 0.16
228 0.15
229 0.11
230 0.11
231 0.12
232 0.11
233 0.11
234 0.14
235 0.16
236 0.17
237 0.18
238 0.2
239 0.17
240 0.17
241 0.17
242 0.17
243 0.15
244 0.15
245 0.14
246 0.12
247 0.12
248 0.12
249 0.14
250 0.13
251 0.17
252 0.21
253 0.26
254 0.28
255 0.33
256 0.33
257 0.32
258 0.33
259 0.34
260 0.29
261 0.23
262 0.22
263 0.16
264 0.16
265 0.14
266 0.12
267 0.09
268 0.11
269 0.12
270 0.15
271 0.17
272 0.2
273 0.22
274 0.22
275 0.21
276 0.21
277 0.24
278 0.25
279 0.25
280 0.27
281 0.25
282 0.24
283 0.25
284 0.24
285 0.23
286 0.22
287 0.24
288 0.23
289 0.28
290 0.32
291 0.34
292 0.39
293 0.39
294 0.4
295 0.43
296 0.41
297 0.36
298 0.34
299 0.31
300 0.29
301 0.26
302 0.23
303 0.2
304 0.23
305 0.26
306 0.26
307 0.26
308 0.26
309 0.27
310 0.27
311 0.25
312 0.21
313 0.18
314 0.22
315 0.24
316 0.21
317 0.2
318 0.19
319 0.21
320 0.19
321 0.21
322 0.18
323 0.16
324 0.16
325 0.2
326 0.21
327 0.2
328 0.21
329 0.23
330 0.27
331 0.32
332 0.32
333 0.36
334 0.37
335 0.4
336 0.46
337 0.52
338 0.52
339 0.48
340 0.49
341 0.42
342 0.42
343 0.38
344 0.35
345 0.28
346 0.23
347 0.22
348 0.21
349 0.19
350 0.16
351 0.16
352 0.12
353 0.09
354 0.1
355 0.1
356 0.11
357 0.13
358 0.14
359 0.14
360 0.14
361 0.14
362 0.13
363 0.15
364 0.15
365 0.15
366 0.14
367 0.14
368 0.15
369 0.19
370 0.2
371 0.21
372 0.25
373 0.28
374 0.36
375 0.43
376 0.5
377 0.57
378 0.64
379 0.7
380 0.75
381 0.81
382 0.83
383 0.84
384 0.8
385 0.72
386 0.65
387 0.61
388 0.54
389 0.46
390 0.38
391 0.33
392 0.3
393 0.27
394 0.28
395 0.25
396 0.24
397 0.21
398 0.19
399 0.17
400 0.15
401 0.15
402 0.11
403 0.1