Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A376B539

Protein Details
Accession A0A376B539    Localization Confidence High Confidence Score 23.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
63-84EDPAVKRLKELRRKERAARGLDBasic
245-270PSDKLKSKLESKQRGKRSKNRGYYSEHydrophilic
340-365ARLEDKREEKWLKRHEQEKRQKLLDYBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
67-100VKRLKELRRKERAARGLDASVKKVKRSSSSTRAK
187-200SKKVAFKGFKPRTK
221-265HVPRRQKDSEKLVKVSLPKNSIARPSDKLKSKLESKQRGKRSKNR
Subcellular Location(s) nucl 25, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013256  Chromatin_SPT2  
Pfam View protein in Pfam  
PF08243  SPT2  
Amino Acid Sequences MSFLKKLTQIKKTKDTNATTVKSSTAARSSNFDSVSKTALNEMALDPLNMQSSLLPKKYIREEDPAVKRLKELRRKERAARGLDASVKKVKRSSSSTRAKSSLSMRTKKNGHNSNDNNILSESKFKKTLLERTANQNKSSLKPYKTIEKKLTFEELMKQAENVKNDKKGPTTSNSTNAEVPTNRFKSKKVAFKGFKPRTKTPTSSTNNRKIIKEPVVSKTHVPRRQKDSEKLVKVSLPKNSIARPSDKLKSKLESKQRGKRSKNRGYYSEEEDDDLDDFIEDDDPGYDRNEIWAMFNRNGRPGSSFGKEQYYDDDDDDDDDMEADGLDILEEEELSAKAARLEDKREEKWLKRHEQEKRQKLLDYRK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.79
2 0.76
3 0.75
4 0.75
5 0.7
6 0.63
7 0.56
8 0.48
9 0.41
10 0.37
11 0.33
12 0.29
13 0.29
14 0.27
15 0.31
16 0.34
17 0.37
18 0.37
19 0.34
20 0.32
21 0.3
22 0.32
23 0.28
24 0.24
25 0.21
26 0.2
27 0.2
28 0.17
29 0.16
30 0.17
31 0.16
32 0.16
33 0.14
34 0.14
35 0.15
36 0.13
37 0.12
38 0.1
39 0.16
40 0.22
41 0.23
42 0.25
43 0.25
44 0.31
45 0.39
46 0.45
47 0.43
48 0.44
49 0.48
50 0.55
51 0.61
52 0.61
53 0.56
54 0.49
55 0.49
56 0.5
57 0.54
58 0.55
59 0.58
60 0.62
61 0.7
62 0.76
63 0.81
64 0.83
65 0.81
66 0.76
67 0.7
68 0.62
69 0.56
70 0.56
71 0.49
72 0.44
73 0.43
74 0.39
75 0.38
76 0.38
77 0.38
78 0.37
79 0.43
80 0.48
81 0.5
82 0.59
83 0.63
84 0.65
85 0.63
86 0.58
87 0.55
88 0.51
89 0.51
90 0.5
91 0.51
92 0.49
93 0.54
94 0.6
95 0.61
96 0.66
97 0.65
98 0.6
99 0.64
100 0.65
101 0.64
102 0.65
103 0.59
104 0.5
105 0.42
106 0.38
107 0.27
108 0.31
109 0.28
110 0.22
111 0.24
112 0.23
113 0.28
114 0.32
115 0.4
116 0.4
117 0.45
118 0.44
119 0.53
120 0.63
121 0.59
122 0.54
123 0.5
124 0.44
125 0.4
126 0.46
127 0.43
128 0.35
129 0.37
130 0.39
131 0.45
132 0.5
133 0.54
134 0.55
135 0.54
136 0.53
137 0.51
138 0.53
139 0.43
140 0.37
141 0.35
142 0.3
143 0.26
144 0.24
145 0.22
146 0.23
147 0.25
148 0.26
149 0.26
150 0.25
151 0.28
152 0.3
153 0.32
154 0.29
155 0.3
156 0.3
157 0.3
158 0.34
159 0.32
160 0.37
161 0.37
162 0.36
163 0.34
164 0.31
165 0.29
166 0.23
167 0.23
168 0.24
169 0.25
170 0.26
171 0.25
172 0.26
173 0.33
174 0.39
175 0.45
176 0.43
177 0.5
178 0.5
179 0.58
180 0.68
181 0.68
182 0.67
183 0.66
184 0.65
185 0.62
186 0.65
187 0.6
188 0.53
189 0.54
190 0.55
191 0.57
192 0.6
193 0.63
194 0.65
195 0.64
196 0.61
197 0.54
198 0.55
199 0.52
200 0.48
201 0.43
202 0.41
203 0.42
204 0.42
205 0.42
206 0.43
207 0.46
208 0.48
209 0.51
210 0.52
211 0.57
212 0.65
213 0.69
214 0.67
215 0.68
216 0.71
217 0.69
218 0.64
219 0.57
220 0.51
221 0.49
222 0.46
223 0.41
224 0.34
225 0.31
226 0.33
227 0.34
228 0.37
229 0.34
230 0.35
231 0.33
232 0.36
233 0.41
234 0.46
235 0.48
236 0.46
237 0.49
238 0.52
239 0.55
240 0.6
241 0.63
242 0.66
243 0.71
244 0.77
245 0.82
246 0.84
247 0.86
248 0.86
249 0.86
250 0.86
251 0.83
252 0.78
253 0.75
254 0.71
255 0.68
256 0.62
257 0.52
258 0.43
259 0.36
260 0.32
261 0.24
262 0.19
263 0.12
264 0.07
265 0.07
266 0.06
267 0.06
268 0.05
269 0.05
270 0.06
271 0.06
272 0.07
273 0.08
274 0.09
275 0.08
276 0.1
277 0.12
278 0.11
279 0.14
280 0.2
281 0.24
282 0.28
283 0.33
284 0.33
285 0.36
286 0.37
287 0.35
288 0.31
289 0.3
290 0.31
291 0.31
292 0.32
293 0.29
294 0.35
295 0.35
296 0.33
297 0.34
298 0.33
299 0.31
300 0.29
301 0.28
302 0.21
303 0.22
304 0.21
305 0.16
306 0.11
307 0.1
308 0.09
309 0.07
310 0.07
311 0.06
312 0.05
313 0.04
314 0.04
315 0.04
316 0.04
317 0.04
318 0.04
319 0.04
320 0.05
321 0.05
322 0.07
323 0.08
324 0.08
325 0.1
326 0.12
327 0.19
328 0.22
329 0.28
330 0.36
331 0.44
332 0.46
333 0.54
334 0.61
335 0.63
336 0.68
337 0.73
338 0.73
339 0.74
340 0.81
341 0.81
342 0.84
343 0.87
344 0.88
345 0.87
346 0.81
347 0.79