FuNGI

A0A376BAU1

Protein Details

Accession

A0A376BAU1

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
310-336	GGARVVKRGWPKRRTRKLKLLDENAKK	Basic
600-638	NSNNNKSETKKVKNKSPQKGKTKKSKKPIIAVKKSKNGV	Hydrophilic
669-694	IISNKDDKSPSKKRIKKPLENGIPGN	Hydrophilic
769-789	IRDLKKKVSMHPENKERMKNY	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
315-328	VKRGWPKRRTRKLK
608-635	TKKVKNKSPQKGKTKKSKKPIIAVKKSK
678-685	PSKKRIKK

Subcellular Location(s)

nucl 25

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0003743 F:translation initiation factor activity GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MMSQQTTSTTNGKKTENIKKNSVSPFRASTASPFIKREQLRRGFFKARMKKLATTKSIGVKKEDPDLAAAKLLKKEDGLTVDGLVQHPSAKKKKAITTDANQFEEFPLRAVDASALNSVKTHIMKFQSKKKLEPVKDFHLPVRLHRKDTRNLQFQLTRAEIVQRQKEITEYKQKLLEEKGSKSIPTKYFNSNYTNKNNNDYKNKYNNNDNNNNNNNNNNNKNMGPPKLFNGTSVTNNNNNDNDNNTSKSTDHQNNTPDIGHGKNKDKDTPDTEHQHNPEEVGKVLYDGKEEPEEFEEGTTDPLADVAPDGGARVVKRGWPKRRTRKLKLLDENAKKLRFEEFYPWVLEDFDGYNTWVGSYEAGNSDQYVLLSVETDGSFTMIPADKVYRFTARNKYATLTIEEAEKRIDKNKTSVPRWLMKHLDDIGTTTTRYDRTMRKLRAVDRRTEEDGEDRGDNSDNELDFDEEFQDDEEAPIIDNNEEENKESEQRIKKEMLQANAMGLRDDNVELDDDNDDGELFGGKVKKEIDEEGKEVKKALKKTDLGALYDSDDDEANPYLSKSEDEDEEHEGDDNKDKSKSPAVKKESTDKDNAAVTDSNNSNNNKSETKKVKNKSPQKGKTKKSKKPIIAVKKSKNGVIVIKGDKTVLDKFPSGEWNPEVANKRKLEDIISNKDDKSPSKKRIKKPLENGIPGNTSMKPGMSQDSKISNVNTKGIVSSISGGNNVTGNNDNSNNSNSSNKEVSVSNNLLTEQDIIERVTSRKMTLKDLIRDLKKKVSMHPENKERMKNYVKRLVKLNNGYLELNTQHVSS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.53
2	0.61
3	0.63
4	0.64
5	0.66
6	0.66
7	0.72
8	0.75
9	0.74
10	0.69
11	0.64
12	0.62
13	0.57
14	0.54
15	0.46
16	0.41
17	0.42
18	0.44
19	0.43
20	0.41
21	0.42
22	0.49
23	0.53
24	0.56
25	0.57
26	0.59
27	0.64
28	0.67
29	0.72
30	0.7
31	0.72
32	0.75
33	0.75
34	0.74
35	0.75
36	0.73
37	0.73
38	0.75
39	0.77
40	0.72
41	0.66
42	0.63
43	0.63
44	0.65
45	0.6
46	0.56
47	0.52
48	0.49
49	0.52
50	0.48
51	0.4
52	0.37
53	0.37
54	0.32
55	0.3
56	0.3
57	0.26
58	0.28
59	0.29
60	0.26
61	0.24
62	0.25
63	0.25
64	0.25
65	0.24
66	0.21
67	0.2
68	0.2
69	0.21
70	0.2
71	0.17
72	0.14
73	0.15
74	0.19
75	0.27
76	0.34
77	0.38
78	0.44
79	0.5
80	0.58
81	0.63
82	0.68
83	0.68
84	0.68
85	0.73
86	0.73
87	0.69
88	0.61
89	0.52
90	0.44
91	0.4
92	0.32
93	0.22
94	0.16
95	0.14
96	0.14
97	0.13
98	0.13
99	0.1
100	0.12
101	0.15
102	0.14
103	0.14
104	0.14
105	0.15
106	0.18
107	0.18
108	0.18
109	0.19
110	0.26
111	0.35
112	0.43
113	0.52
114	0.58
115	0.6
116	0.64
117	0.69
118	0.72
119	0.71
120	0.73
121	0.7
122	0.68
123	0.71
124	0.68
125	0.61
126	0.58
127	0.51
128	0.5
129	0.54
130	0.5
131	0.5
132	0.55
133	0.6
134	0.6
135	0.7
136	0.71
137	0.69
138	0.67
139	0.67
140	0.63
141	0.58
142	0.56
143	0.47
144	0.38
145	0.29
146	0.32
147	0.3
148	0.34
149	0.37
150	0.33
151	0.32
152	0.32
153	0.36
154	0.36
155	0.38
156	0.42
157	0.4
158	0.41
159	0.44
160	0.45
161	0.44
162	0.44
163	0.46
164	0.4
165	0.4
166	0.43
167	0.4
168	0.41
169	0.4
170	0.43
171	0.4
172	0.39
173	0.4
174	0.42
175	0.45
176	0.48
177	0.52
178	0.5
179	0.52
180	0.55
181	0.59
182	0.53
183	0.57
184	0.59
185	0.6
186	0.63
187	0.62
188	0.63
189	0.65
190	0.7
191	0.66
192	0.7
193	0.7
194	0.7
195	0.73
196	0.7
197	0.69
198	0.69
199	0.7
200	0.62
201	0.59
202	0.56
203	0.54
204	0.52
205	0.45
206	0.41
207	0.36
208	0.41
209	0.4
210	0.4
211	0.36
212	0.34
213	0.35
214	0.38
215	0.37
216	0.31
217	0.31
218	0.28
219	0.29
220	0.31
221	0.32
222	0.31
223	0.33
224	0.35
225	0.32
226	0.31
227	0.27
228	0.27
229	0.28
230	0.25
231	0.26
232	0.24
233	0.24
234	0.23
235	0.24
236	0.29
237	0.33
238	0.32
239	0.35
240	0.37
241	0.38
242	0.39
243	0.37
244	0.29
245	0.24
246	0.24
247	0.24
248	0.26
249	0.32
250	0.35
251	0.38
252	0.42
253	0.43
254	0.46
255	0.46
256	0.47
257	0.46
258	0.47
259	0.48
260	0.49
261	0.47
262	0.45
263	0.39
264	0.35
265	0.31
266	0.26
267	0.22
268	0.17
269	0.15
270	0.12
271	0.14
272	0.13
273	0.11
274	0.1
275	0.12
276	0.13
277	0.13
278	0.14
279	0.14
280	0.14
281	0.13
282	0.12
283	0.11
284	0.09
285	0.1
286	0.08
287	0.06
288	0.05
289	0.05
290	0.05
291	0.04
292	0.04
293	0.03
294	0.04
295	0.03
296	0.04
297	0.04
298	0.05
299	0.05
300	0.07
301	0.08
302	0.11
303	0.21
304	0.3
305	0.4
306	0.48
307	0.59
308	0.69
309	0.79
310	0.86
311	0.86
312	0.87
313	0.87
314	0.88
315	0.86
316	0.84
317	0.83
318	0.79
319	0.77
320	0.72
321	0.64
322	0.53
323	0.45
324	0.39
325	0.31
326	0.27
327	0.26
328	0.24
329	0.25
330	0.26
331	0.25
332	0.22
333	0.2
334	0.18
335	0.12
336	0.09
337	0.08
338	0.07
339	0.07
340	0.07
341	0.07
342	0.07
343	0.06
344	0.06
345	0.05
346	0.05
347	0.06
348	0.07
349	0.08
350	0.08
351	0.07
352	0.08
353	0.07
354	0.07
355	0.07
356	0.06
357	0.05
358	0.05
359	0.05
360	0.06
361	0.05
362	0.06
363	0.05
364	0.05
365	0.05
366	0.05
367	0.06
368	0.06
369	0.06
370	0.07
371	0.09
372	0.09
373	0.11
374	0.13
375	0.15
376	0.17
377	0.23
378	0.31
379	0.34
380	0.36
381	0.35
382	0.34
383	0.33
384	0.32
385	0.28
386	0.21
387	0.16
388	0.17
389	0.16
390	0.15
391	0.14
392	0.13
393	0.12
394	0.16
395	0.19
396	0.17
397	0.21
398	0.28
399	0.34
400	0.35
401	0.4
402	0.39
403	0.43
404	0.44
405	0.45
406	0.42
407	0.35
408	0.37
409	0.32
410	0.29
411	0.22
412	0.2
413	0.17
414	0.15
415	0.14
416	0.1
417	0.1
418	0.1
419	0.12
420	0.15
421	0.18
422	0.27
423	0.36
424	0.38
425	0.44
426	0.48
427	0.54
428	0.6
429	0.58
430	0.56
431	0.51
432	0.54
433	0.5
434	0.46
435	0.39
436	0.31
437	0.3
438	0.25
439	0.2
440	0.15
441	0.13
442	0.13
443	0.12
444	0.11
445	0.12
446	0.1
447	0.11
448	0.11
449	0.11
450	0.09
451	0.1
452	0.09
453	0.07
454	0.07
455	0.06
456	0.06
457	0.05
458	0.05
459	0.06
460	0.05
461	0.05
462	0.05
463	0.06
464	0.05
465	0.05
466	0.06
467	0.08
468	0.08
469	0.09
470	0.11
471	0.12
472	0.14
473	0.15
474	0.22
475	0.26
476	0.29
477	0.31
478	0.32
479	0.33
480	0.4
481	0.44
482	0.39
483	0.34
484	0.32
485	0.3
486	0.3
487	0.26
488	0.17
489	0.13
490	0.11
491	0.09
492	0.09
493	0.08
494	0.06
495	0.06
496	0.06
497	0.07
498	0.07
499	0.06
500	0.06
501	0.05
502	0.05
503	0.04
504	0.04
505	0.04
506	0.03
507	0.06
508	0.08
509	0.08
510	0.11
511	0.12
512	0.13
513	0.14
514	0.18
515	0.22
516	0.24
517	0.27
518	0.32
519	0.33
520	0.32
521	0.31
522	0.32
523	0.31
524	0.31
525	0.34
526	0.35
527	0.35
528	0.37
529	0.43
530	0.4
531	0.36
532	0.33
533	0.28
534	0.21
535	0.2
536	0.18
537	0.12
538	0.1
539	0.08
540	0.09
541	0.08
542	0.07
543	0.07
544	0.07
545	0.07
546	0.08
547	0.09
548	0.09
549	0.1
550	0.12
551	0.14
552	0.16
553	0.19
554	0.19
555	0.19
556	0.18
557	0.17
558	0.16
559	0.2
560	0.19
561	0.18
562	0.19
563	0.2
564	0.22
565	0.3
566	0.38
567	0.41
568	0.5
569	0.55
570	0.6
571	0.62
572	0.69
573	0.68
574	0.63
575	0.59
576	0.5
577	0.45
578	0.41
579	0.38
580	0.31
581	0.24
582	0.2
583	0.22
584	0.21
585	0.22
586	0.25
587	0.26
588	0.26
589	0.28
590	0.31
591	0.3
592	0.32
593	0.39
594	0.43
595	0.51
596	0.59
597	0.62
598	0.69
599	0.75
600	0.82
601	0.83
602	0.85
603	0.85
604	0.87
605	0.9
606	0.89
607	0.89
608	0.9
609	0.88
610	0.88
611	0.88
612	0.84
613	0.84
614	0.86
615	0.85
616	0.85
617	0.87
618	0.84
619	0.83
620	0.77
621	0.69
622	0.62
623	0.54
624	0.47
625	0.42
626	0.4
627	0.35
628	0.35
629	0.33
630	0.3
631	0.27
632	0.26
633	0.25
634	0.22
635	0.22
636	0.21
637	0.22
638	0.25
639	0.3
640	0.28
641	0.29
642	0.27
643	0.25
644	0.25
645	0.3
646	0.35
647	0.35
648	0.41
649	0.38
650	0.38
651	0.39
652	0.4
653	0.37
654	0.39
655	0.42
656	0.43
657	0.46
658	0.48
659	0.45
660	0.48
661	0.47
662	0.44
663	0.45
664	0.46
665	0.51
666	0.6
667	0.69
668	0.74
669	0.83
670	0.88
671	0.88
672	0.89
673	0.89
674	0.88
675	0.85
676	0.78
677	0.72
678	0.63
679	0.53
680	0.46
681	0.36
682	0.28
683	0.22
684	0.2
685	0.16
686	0.16
687	0.22
688	0.22
689	0.24
690	0.27
691	0.31
692	0.33
693	0.35
694	0.35
695	0.35
696	0.35
697	0.35
698	0.32
699	0.28
700	0.25
701	0.23
702	0.21
703	0.15
704	0.15
705	0.15
706	0.14
707	0.14
708	0.14
709	0.15
710	0.15
711	0.14
712	0.14
713	0.15
714	0.16
715	0.19
716	0.21
717	0.22
718	0.24
719	0.27
720	0.26
721	0.25
722	0.29
723	0.27
724	0.31
725	0.32
726	0.29
727	0.28
728	0.28
729	0.3
730	0.33
731	0.33
732	0.28
733	0.27
734	0.27
735	0.25
736	0.24
737	0.21
738	0.14
739	0.13
740	0.13
741	0.12
742	0.13
743	0.16
744	0.16
745	0.21
746	0.22
747	0.23
748	0.29
749	0.31
750	0.36
751	0.42
752	0.49
753	0.5
754	0.57
755	0.64
756	0.66
757	0.69
758	0.67
759	0.67
760	0.66
761	0.62
762	0.61
763	0.63
764	0.65
765	0.69
766	0.75
767	0.76
768	0.79
769	0.84
770	0.84
771	0.76
772	0.74
773	0.75
774	0.72
775	0.72
776	0.73
777	0.71
778	0.67
779	0.73
780	0.72
781	0.72
782	0.72
783	0.7
784	0.65
785	0.62
786	0.58
787	0.5
788	0.46
789	0.37
790	0.32

A0A376BAU1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer