Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A376B5K1

Protein Details
Accession A0A376B5K1    Localization Confidence Medium Confidence Score 14
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
208-235NNNNNGPKRSSRPPKRGNVNRGPKNEGKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
17-61RRVSASTKRNVPRRGAPGPRRGAPGPRRVSKQVNDRRRVGGRPRI
214-236PKRSSRPPKRGNVNRGPKNEGKK
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto_nucl 15.5, cyto 10
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MSANLDKSLDEIIDSKRRVSASTKRNVPRRGAPGPRRGAPGPRRVSKQVNDRRRVGGRPRIPGAAVNLPPSSLLDMAYSTRVSVEGLPKDISQDSIKEFFQTAVGGVQRVLLSYNEKGQSMGMATLTFTSNEKARKAVTTYNNSPIDGGKSRLKVQMIIDPTKKPLASRIGGAGAIGPVSRNVSNRGKLSSRLNRNGPRNNNMNNNNNNNNNGPKRSSRPPKRGNVNRGPKNEGKKSLEELDKEMAAYFDKN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.27
3 0.29
4 0.3
5 0.31
6 0.36
7 0.4
8 0.41
9 0.5
10 0.59
11 0.63
12 0.72
13 0.76
14 0.75
15 0.74
16 0.72
17 0.72
18 0.73
19 0.73
20 0.74
21 0.75
22 0.72
23 0.69
24 0.63
25 0.64
26 0.61
27 0.62
28 0.61
29 0.61
30 0.63
31 0.63
32 0.69
33 0.66
34 0.69
35 0.7
36 0.71
37 0.71
38 0.69
39 0.7
40 0.67
41 0.67
42 0.65
43 0.65
44 0.61
45 0.61
46 0.6
47 0.54
48 0.5
49 0.45
50 0.4
51 0.37
52 0.32
53 0.28
54 0.24
55 0.23
56 0.22
57 0.21
58 0.17
59 0.1
60 0.09
61 0.07
62 0.08
63 0.09
64 0.1
65 0.1
66 0.08
67 0.08
68 0.08
69 0.08
70 0.09
71 0.14
72 0.14
73 0.16
74 0.17
75 0.17
76 0.19
77 0.18
78 0.18
79 0.14
80 0.14
81 0.15
82 0.16
83 0.16
84 0.15
85 0.15
86 0.13
87 0.13
88 0.11
89 0.09
90 0.08
91 0.08
92 0.08
93 0.07
94 0.08
95 0.07
96 0.07
97 0.08
98 0.06
99 0.09
100 0.09
101 0.13
102 0.13
103 0.13
104 0.13
105 0.12
106 0.12
107 0.1
108 0.1
109 0.06
110 0.05
111 0.05
112 0.05
113 0.06
114 0.06
115 0.06
116 0.07
117 0.09
118 0.12
119 0.12
120 0.13
121 0.13
122 0.15
123 0.17
124 0.23
125 0.27
126 0.32
127 0.35
128 0.42
129 0.42
130 0.4
131 0.38
132 0.31
133 0.28
134 0.22
135 0.23
136 0.19
137 0.21
138 0.23
139 0.26
140 0.26
141 0.24
142 0.24
143 0.26
144 0.27
145 0.3
146 0.3
147 0.28
148 0.29
149 0.3
150 0.28
151 0.23
152 0.24
153 0.25
154 0.24
155 0.24
156 0.24
157 0.22
158 0.21
159 0.21
160 0.16
161 0.09
162 0.08
163 0.07
164 0.05
165 0.04
166 0.07
167 0.09
168 0.1
169 0.16
170 0.22
171 0.27
172 0.29
173 0.33
174 0.33
175 0.35
176 0.44
177 0.48
178 0.51
179 0.54
180 0.61
181 0.65
182 0.72
183 0.77
184 0.74
185 0.72
186 0.7
187 0.68
188 0.69
189 0.68
190 0.68
191 0.67
192 0.67
193 0.67
194 0.63
195 0.6
196 0.54
197 0.56
198 0.52
199 0.48
200 0.45
201 0.45
202 0.48
203 0.56
204 0.63
205 0.65
206 0.7
207 0.76
208 0.81
209 0.86
210 0.9
211 0.9
212 0.89
213 0.9
214 0.88
215 0.84
216 0.82
217 0.78
218 0.77
219 0.75
220 0.73
221 0.68
222 0.64
223 0.64
224 0.64
225 0.63
226 0.56
227 0.52
228 0.47
229 0.41
230 0.37
231 0.32
232 0.24