Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A371CKL9

Protein Details
Accession A0A371CKL9    Localization Confidence High Confidence Score 23.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
271-307SDDERSAKEKKRKRRDDSPKRDRKRSKRSRSSSPSGSBasic
310-393DSDSEDERERRRRRKKSRSRVASSDENSDSERERERRKKKKKRSRESSDVDMSDDESSRRSKSKSKSKRKKSRRSHSSDEDSDSBasic
397-420SDRSRSRSKASSSKRKRSASPGEDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
277-301AKEKKRKRRDDSPKRDRKRSKRSRS
317-331RERRRRRKKSRSRVA
339-354SERERERRKKKKKRSR
368-384RRSKSKSKSKRKKSRRS
401-413RSRSKASSSKRKR
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007832  RNA_pol_Rpc34  
IPR016049  RNA_pol_Rpc34-like  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
IPR036390  WH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0005666  C:RNA polymerase III complex  
GO:0006383  P:transcription by RNA polymerase III  
Pfam View protein in Pfam  
PF05158  RNA_pol_Rpc34  
Amino Acid Sequences MSGRKLNTHELKLHQAALADPKHTLTQQECDAIVPDAAARTAALNFLLGTGLLKAMKDAKGAVSFRAVMKKELEVKKDLTGEEAMILSYIQAAKNEGIWTKHLKAKTELHQTVIDRCLKSLVQKQLIKATKSVKYPTRKIYMLYHLQPSDEMTGGPWYTDNELDTEFIKLLCSACVRFIRDRSTPKQKNADSSSSSNQPLYPISAAPQYPTAQQVQSFLSKSRITETELSVDNVETLLNVLVLDGDIERVPAFGAASWDTSDNAARASDVSDDERSAKEKKRKRRDDSPKRDRKRSKRSRSSSPSGSDSDSDSEDERERRRRRKKSRSRVASSDENSDSERERERRKKKKKRSRESSDVDMSDDESSRRSKSKSKSKRKKSRRSHSSDEDSDSGSESDRSRSRSKASSSKRKRSASPGEDITASFLQEGYGAYVYRAVRQELAAGGGGGLSQTPCVRCPTFDFCKGGGPVNPQECEYYGTWLSAAEVAKG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.45
2 0.38
3 0.34
4 0.36
5 0.34
6 0.26
7 0.24
8 0.24
9 0.26
10 0.26
11 0.28
12 0.24
13 0.27
14 0.29
15 0.32
16 0.3
17 0.28
18 0.29
19 0.25
20 0.21
21 0.16
22 0.13
23 0.1
24 0.1
25 0.09
26 0.08
27 0.08
28 0.08
29 0.09
30 0.08
31 0.08
32 0.08
33 0.08
34 0.08
35 0.06
36 0.06
37 0.06
38 0.08
39 0.08
40 0.08
41 0.09
42 0.14
43 0.15
44 0.16
45 0.16
46 0.18
47 0.25
48 0.26
49 0.26
50 0.24
51 0.25
52 0.27
53 0.34
54 0.32
55 0.28
56 0.29
57 0.33
58 0.4
59 0.44
60 0.45
61 0.41
62 0.42
63 0.44
64 0.45
65 0.4
66 0.33
67 0.28
68 0.24
69 0.2
70 0.18
71 0.13
72 0.1
73 0.09
74 0.06
75 0.07
76 0.08
77 0.08
78 0.08
79 0.1
80 0.1
81 0.13
82 0.15
83 0.16
84 0.17
85 0.2
86 0.25
87 0.28
88 0.33
89 0.33
90 0.35
91 0.38
92 0.44
93 0.5
94 0.54
95 0.51
96 0.49
97 0.51
98 0.49
99 0.47
100 0.46
101 0.43
102 0.32
103 0.31
104 0.31
105 0.27
106 0.32
107 0.35
108 0.37
109 0.4
110 0.43
111 0.45
112 0.51
113 0.56
114 0.51
115 0.48
116 0.46
117 0.43
118 0.44
119 0.49
120 0.48
121 0.51
122 0.56
123 0.59
124 0.59
125 0.54
126 0.53
127 0.52
128 0.52
129 0.51
130 0.47
131 0.46
132 0.4
133 0.39
134 0.36
135 0.31
136 0.25
137 0.18
138 0.14
139 0.09
140 0.11
141 0.11
142 0.11
143 0.09
144 0.08
145 0.1
146 0.1
147 0.1
148 0.09
149 0.1
150 0.1
151 0.1
152 0.1
153 0.09
154 0.08
155 0.08
156 0.08
157 0.07
158 0.08
159 0.09
160 0.09
161 0.13
162 0.16
163 0.2
164 0.23
165 0.26
166 0.3
167 0.35
168 0.41
169 0.45
170 0.53
171 0.56
172 0.59
173 0.65
174 0.62
175 0.64
176 0.62
177 0.59
178 0.52
179 0.5
180 0.47
181 0.42
182 0.41
183 0.33
184 0.28
185 0.24
186 0.2
187 0.17
188 0.14
189 0.1
190 0.1
191 0.13
192 0.13
193 0.12
194 0.14
195 0.13
196 0.13
197 0.15
198 0.15
199 0.13
200 0.13
201 0.15
202 0.14
203 0.16
204 0.16
205 0.15
206 0.18
207 0.18
208 0.18
209 0.19
210 0.18
211 0.18
212 0.2
213 0.2
214 0.19
215 0.19
216 0.2
217 0.17
218 0.16
219 0.12
220 0.1
221 0.08
222 0.05
223 0.04
224 0.04
225 0.03
226 0.03
227 0.03
228 0.03
229 0.03
230 0.03
231 0.03
232 0.03
233 0.03
234 0.03
235 0.03
236 0.04
237 0.04
238 0.04
239 0.04
240 0.03
241 0.05
242 0.05
243 0.06
244 0.06
245 0.07
246 0.07
247 0.08
248 0.08
249 0.07
250 0.07
251 0.06
252 0.06
253 0.06
254 0.06
255 0.06
256 0.07
257 0.09
258 0.09
259 0.1
260 0.11
261 0.12
262 0.14
263 0.18
264 0.24
265 0.31
266 0.38
267 0.49
268 0.59
269 0.69
270 0.74
271 0.81
272 0.85
273 0.88
274 0.91
275 0.92
276 0.92
277 0.89
278 0.91
279 0.9
280 0.89
281 0.89
282 0.89
283 0.89
284 0.89
285 0.89
286 0.89
287 0.87
288 0.84
289 0.79
290 0.72
291 0.64
292 0.55
293 0.5
294 0.4
295 0.32
296 0.26
297 0.21
298 0.18
299 0.15
300 0.15
301 0.16
302 0.2
303 0.24
304 0.32
305 0.4
306 0.5
307 0.6
308 0.69
309 0.77
310 0.85
311 0.9
312 0.92
313 0.94
314 0.94
315 0.91
316 0.87
317 0.82
318 0.8
319 0.7
320 0.65
321 0.55
322 0.46
323 0.39
324 0.33
325 0.28
326 0.22
327 0.27
328 0.26
329 0.35
330 0.44
331 0.54
332 0.64
333 0.74
334 0.83
335 0.87
336 0.93
337 0.94
338 0.95
339 0.96
340 0.95
341 0.94
342 0.89
343 0.86
344 0.81
345 0.71
346 0.61
347 0.5
348 0.41
349 0.32
350 0.25
351 0.17
352 0.13
353 0.14
354 0.16
355 0.19
356 0.21
357 0.28
358 0.38
359 0.49
360 0.58
361 0.68
362 0.76
363 0.84
364 0.92
365 0.95
366 0.96
367 0.96
368 0.96
369 0.95
370 0.93
371 0.91
372 0.9
373 0.88
374 0.81
375 0.75
376 0.65
377 0.55
378 0.46
379 0.38
380 0.29
381 0.21
382 0.19
383 0.15
384 0.19
385 0.22
386 0.27
387 0.29
388 0.33
389 0.38
390 0.42
391 0.49
392 0.53
393 0.6
394 0.66
395 0.73
396 0.8
397 0.84
398 0.82
399 0.81
400 0.8
401 0.81
402 0.75
403 0.72
404 0.66
405 0.58
406 0.53
407 0.47
408 0.42
409 0.32
410 0.26
411 0.18
412 0.13
413 0.11
414 0.11
415 0.11
416 0.08
417 0.09
418 0.09
419 0.09
420 0.14
421 0.15
422 0.19
423 0.21
424 0.2
425 0.21
426 0.21
427 0.23
428 0.18
429 0.2
430 0.15
431 0.13
432 0.11
433 0.09
434 0.09
435 0.06
436 0.06
437 0.05
438 0.06
439 0.09
440 0.11
441 0.13
442 0.19
443 0.2
444 0.22
445 0.29
446 0.36
447 0.41
448 0.46
449 0.49
450 0.44
451 0.5
452 0.49
453 0.47
454 0.43
455 0.42
456 0.44
457 0.45
458 0.45
459 0.39
460 0.39
461 0.36
462 0.36
463 0.3
464 0.28
465 0.23
466 0.23
467 0.21
468 0.19
469 0.19
470 0.19