Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A371D5V5

Protein Details
Accession A0A371D5V5    Localization Confidence High Confidence Score 18.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-23SQPAEAHKTKKRKHAATAAAVEHydrophilic
26-66AAVGEPSTKRPKKDKDKDKDKDGKTQTQTHKHKHHHKAAVGBasic
342-372EERRARKAQEEGQKEKKRKRKEGKAQDAATSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
11-14KKRK
33-75TKRPKKDKDKDKDKDGKTQTQTHKHKHHHKAAVGATNADKKGK
344-383RRARKAQEEGQKEKKRKRKEGKAQDAATSAGEKKSKKKKS
Subcellular Location(s) cyto 19, cyto_mito 12, nucl 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036898  RNA_pol_Rpb7-like_N_sf  
IPR041901  RNAP_I_Rpa43_N  
IPR041178  RPA43_OB  
IPR045113  Rpb7-like  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF17875  RPA43_OB  
CDD cd04328  RNAP_I_Rpa43_N  
Amino Acid Sequences MSQPAEAHKTKKRKHAATAAAVEDAAAVGEPSTKRPKKDKDKDKDKDGKTQTQTHKHKHHHKAAVGATNADKKGKGRATDAAFRVVRASLAVSVPPVFASDLRGGVEEMLDSMLMRYIPALRGVVLAHDRLEFLDKVATIKADCPFANCRVAFDATVWSPQVGMKLSGKINLSSPDHISLLVHRTFNVSIPRHHITTDSYEFEYGPAENDPEFGAGQDGPAAAAAAEGEATEEGTEGHVDSGGRWVHKTTGTKLGDADGYLEFTVVGLTIANQMLSLVGSIQPDPFSPEHVPKATVTTAPSQSASAHLSEREVDAMMAEDDNPESDDDLDPFQKLGKMADEEERRARKAQEEGQKEKKRKRKEGKAQDAATSAGEKKSKKKKS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.79
2 0.82
3 0.82
4 0.8
5 0.79
6 0.7
7 0.6
8 0.52
9 0.42
10 0.31
11 0.22
12 0.13
13 0.06
14 0.04
15 0.03
16 0.08
17 0.09
18 0.15
19 0.26
20 0.31
21 0.38
22 0.48
23 0.59
24 0.66
25 0.76
26 0.82
27 0.82
28 0.89
29 0.91
30 0.92
31 0.92
32 0.84
33 0.84
34 0.81
35 0.79
36 0.74
37 0.75
38 0.74
39 0.75
40 0.8
41 0.79
42 0.82
43 0.82
44 0.86
45 0.87
46 0.88
47 0.85
48 0.79
49 0.77
50 0.74
51 0.7
52 0.6
53 0.52
54 0.45
55 0.43
56 0.4
57 0.34
58 0.29
59 0.23
60 0.31
61 0.33
62 0.33
63 0.3
64 0.37
65 0.41
66 0.48
67 0.48
68 0.47
69 0.42
70 0.4
71 0.37
72 0.3
73 0.24
74 0.16
75 0.16
76 0.09
77 0.1
78 0.1
79 0.1
80 0.1
81 0.1
82 0.09
83 0.09
84 0.08
85 0.08
86 0.11
87 0.11
88 0.11
89 0.12
90 0.12
91 0.12
92 0.11
93 0.11
94 0.07
95 0.06
96 0.05
97 0.05
98 0.04
99 0.04
100 0.05
101 0.05
102 0.05
103 0.05
104 0.06
105 0.07
106 0.09
107 0.09
108 0.08
109 0.09
110 0.09
111 0.11
112 0.11
113 0.11
114 0.11
115 0.11
116 0.11
117 0.1
118 0.13
119 0.11
120 0.1
121 0.11
122 0.1
123 0.11
124 0.11
125 0.12
126 0.09
127 0.12
128 0.12
129 0.14
130 0.13
131 0.16
132 0.19
133 0.21
134 0.26
135 0.23
136 0.23
137 0.22
138 0.23
139 0.2
140 0.18
141 0.18
142 0.13
143 0.14
144 0.13
145 0.1
146 0.1
147 0.1
148 0.11
149 0.09
150 0.1
151 0.1
152 0.14
153 0.14
154 0.17
155 0.17
156 0.16
157 0.17
158 0.19
159 0.2
160 0.18
161 0.18
162 0.17
163 0.16
164 0.16
165 0.14
166 0.12
167 0.14
168 0.15
169 0.14
170 0.12
171 0.14
172 0.14
173 0.17
174 0.22
175 0.19
176 0.19
177 0.24
178 0.26
179 0.25
180 0.25
181 0.23
182 0.18
183 0.23
184 0.24
185 0.2
186 0.18
187 0.18
188 0.18
189 0.17
190 0.16
191 0.1
192 0.08
193 0.06
194 0.07
195 0.06
196 0.07
197 0.07
198 0.07
199 0.07
200 0.06
201 0.06
202 0.05
203 0.05
204 0.05
205 0.05
206 0.04
207 0.04
208 0.04
209 0.03
210 0.03
211 0.03
212 0.02
213 0.02
214 0.02
215 0.03
216 0.03
217 0.03
218 0.03
219 0.03
220 0.03
221 0.03
222 0.04
223 0.04
224 0.04
225 0.05
226 0.05
227 0.05
228 0.1
229 0.11
230 0.12
231 0.12
232 0.13
233 0.14
234 0.19
235 0.22
236 0.21
237 0.29
238 0.3
239 0.3
240 0.3
241 0.29
242 0.24
243 0.21
244 0.2
245 0.1
246 0.1
247 0.09
248 0.08
249 0.07
250 0.06
251 0.06
252 0.04
253 0.04
254 0.03
255 0.03
256 0.05
257 0.06
258 0.05
259 0.05
260 0.05
261 0.05
262 0.05
263 0.05
264 0.04
265 0.05
266 0.06
267 0.07
268 0.08
269 0.08
270 0.08
271 0.13
272 0.12
273 0.16
274 0.18
275 0.23
276 0.27
277 0.28
278 0.29
279 0.25
280 0.29
281 0.26
282 0.25
283 0.22
284 0.23
285 0.24
286 0.24
287 0.24
288 0.21
289 0.2
290 0.21
291 0.2
292 0.16
293 0.15
294 0.14
295 0.15
296 0.15
297 0.15
298 0.13
299 0.12
300 0.1
301 0.09
302 0.09
303 0.09
304 0.08
305 0.07
306 0.07
307 0.07
308 0.08
309 0.08
310 0.08
311 0.08
312 0.09
313 0.1
314 0.11
315 0.14
316 0.14
317 0.14
318 0.14
319 0.15
320 0.16
321 0.15
322 0.16
323 0.17
324 0.19
325 0.21
326 0.3
327 0.34
328 0.36
329 0.45
330 0.48
331 0.46
332 0.47
333 0.47
334 0.44
335 0.47
336 0.51
337 0.52
338 0.56
339 0.62
340 0.7
341 0.77
342 0.8
343 0.82
344 0.83
345 0.84
346 0.86
347 0.89
348 0.89
349 0.91
350 0.93
351 0.94
352 0.95
353 0.87
354 0.8
355 0.7
356 0.6
357 0.5
358 0.42
359 0.33
360 0.29
361 0.31
362 0.31
363 0.39