Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A1DBF2

Protein Details
Accession A1DBF2    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
241-260VTSKRKPTAVKKRNELCKRFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
63-67GRGRP
140-148RKAKAEKKA
Subcellular Location(s) cyto_nucl 14.333, nucl 13.5, cyto 12, cyto_mito 7.499
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000571  Znf_CCCH  
IPR036855  Znf_CCCH_sf  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
KEGG nfi:NFIA_098210  -  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50103  ZF_C3H1  
Amino Acid Sequences MTEDQELMAKISQLAGQINRHRNQTPQAQAQAHHGSELHAGPYVSRHTRARAGWAPYRGRPYGRGRPAAPHRHRTLVLNNANSGNSTSSAPVPTNENVGESRSATPNGWVAKRDRHMQLINSAIYDKEAQARAKAMEQTRKAKAEKKARIEQAKVLRYAQGFGRPHHATTVASQVSATTQPHGEYQVYLNDIPFKIAKGGSKLVRVSDDPNTANITPKKVTVAGVTFVRSKNGNLHRLGAVTSKRKPTAVKKRNELCKRFTSTGACYKGPSCLFIHDPNKVAICKEFLQTGNCSAGQNCDLSHEPSPHRSPVCVHFLRNRCSNPDCRYSHVRVTPGAPVCRDFANLGYCDKGAECEERHVHECPDYAATGVCNKKRCRLPHVDRAGQIRKNAASKADAADEEESDESSEEEEYDAIDSDDVDSDDLDDEPEYVEGADNGEQELFQQHDFIRF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.2
3 0.28
4 0.36
5 0.45
6 0.48
7 0.52
8 0.52
9 0.53
10 0.56
11 0.58
12 0.57
13 0.56
14 0.6
15 0.58
16 0.57
17 0.59
18 0.59
19 0.49
20 0.42
21 0.34
22 0.27
23 0.28
24 0.27
25 0.2
26 0.16
27 0.15
28 0.14
29 0.18
30 0.23
31 0.23
32 0.27
33 0.29
34 0.32
35 0.39
36 0.4
37 0.45
38 0.46
39 0.49
40 0.51
41 0.57
42 0.58
43 0.56
44 0.61
45 0.56
46 0.52
47 0.52
48 0.54
49 0.57
50 0.59
51 0.61
52 0.56
53 0.62
54 0.7
55 0.73
56 0.72
57 0.71
58 0.67
59 0.66
60 0.66
61 0.61
62 0.59
63 0.58
64 0.57
65 0.5
66 0.48
67 0.43
68 0.42
69 0.37
70 0.31
71 0.22
72 0.16
73 0.14
74 0.13
75 0.14
76 0.16
77 0.16
78 0.15
79 0.18
80 0.18
81 0.2
82 0.19
83 0.19
84 0.18
85 0.19
86 0.19
87 0.17
88 0.19
89 0.18
90 0.2
91 0.18
92 0.19
93 0.21
94 0.24
95 0.24
96 0.25
97 0.26
98 0.33
99 0.37
100 0.42
101 0.41
102 0.43
103 0.44
104 0.43
105 0.44
106 0.41
107 0.37
108 0.31
109 0.29
110 0.22
111 0.2
112 0.18
113 0.14
114 0.14
115 0.18
116 0.18
117 0.19
118 0.21
119 0.21
120 0.23
121 0.28
122 0.28
123 0.33
124 0.38
125 0.44
126 0.47
127 0.51
128 0.51
129 0.53
130 0.56
131 0.59
132 0.61
133 0.63
134 0.66
135 0.69
136 0.73
137 0.68
138 0.66
139 0.64
140 0.6
141 0.54
142 0.46
143 0.41
144 0.34
145 0.33
146 0.28
147 0.27
148 0.24
149 0.24
150 0.3
151 0.28
152 0.28
153 0.27
154 0.26
155 0.19
156 0.18
157 0.25
158 0.18
159 0.16
160 0.16
161 0.15
162 0.15
163 0.16
164 0.15
165 0.09
166 0.09
167 0.1
168 0.11
169 0.13
170 0.12
171 0.11
172 0.11
173 0.12
174 0.14
175 0.13
176 0.12
177 0.14
178 0.13
179 0.14
180 0.13
181 0.11
182 0.11
183 0.12
184 0.13
185 0.13
186 0.18
187 0.19
188 0.22
189 0.22
190 0.21
191 0.22
192 0.22
193 0.21
194 0.21
195 0.23
196 0.2
197 0.2
198 0.22
199 0.2
200 0.25
201 0.23
202 0.22
203 0.19
204 0.19
205 0.19
206 0.17
207 0.18
208 0.14
209 0.14
210 0.12
211 0.13
212 0.14
213 0.15
214 0.14
215 0.15
216 0.14
217 0.13
218 0.19
219 0.25
220 0.29
221 0.27
222 0.29
223 0.28
224 0.28
225 0.28
226 0.24
227 0.23
228 0.23
229 0.27
230 0.29
231 0.29
232 0.31
233 0.35
234 0.41
235 0.48
236 0.52
237 0.55
238 0.6
239 0.67
240 0.76
241 0.81
242 0.75
243 0.69
244 0.68
245 0.67
246 0.6
247 0.54
248 0.48
249 0.43
250 0.47
251 0.45
252 0.37
253 0.32
254 0.3
255 0.32
256 0.28
257 0.26
258 0.19
259 0.17
260 0.2
261 0.26
262 0.29
263 0.27
264 0.28
265 0.27
266 0.28
267 0.26
268 0.24
269 0.17
270 0.18
271 0.17
272 0.16
273 0.18
274 0.17
275 0.19
276 0.2
277 0.21
278 0.2
279 0.19
280 0.18
281 0.15
282 0.16
283 0.15
284 0.14
285 0.12
286 0.13
287 0.13
288 0.16
289 0.19
290 0.21
291 0.22
292 0.28
293 0.31
294 0.33
295 0.32
296 0.3
297 0.31
298 0.32
299 0.39
300 0.35
301 0.35
302 0.39
303 0.45
304 0.49
305 0.53
306 0.5
307 0.46
308 0.49
309 0.54
310 0.51
311 0.53
312 0.5
313 0.49
314 0.54
315 0.53
316 0.56
317 0.52
318 0.49
319 0.42
320 0.42
321 0.43
322 0.41
323 0.39
324 0.32
325 0.29
326 0.28
327 0.27
328 0.26
329 0.2
330 0.17
331 0.18
332 0.18
333 0.18
334 0.18
335 0.17
336 0.16
337 0.15
338 0.14
339 0.13
340 0.16
341 0.17
342 0.22
343 0.25
344 0.29
345 0.32
346 0.33
347 0.32
348 0.29
349 0.29
350 0.24
351 0.22
352 0.18
353 0.16
354 0.14
355 0.14
356 0.19
357 0.25
358 0.28
359 0.34
360 0.36
361 0.44
362 0.52
363 0.57
364 0.59
365 0.63
366 0.68
367 0.71
368 0.78
369 0.76
370 0.72
371 0.75
372 0.74
373 0.67
374 0.6
375 0.55
376 0.49
377 0.47
378 0.45
379 0.38
380 0.32
381 0.31
382 0.31
383 0.29
384 0.25
385 0.24
386 0.24
387 0.21
388 0.2
389 0.18
390 0.16
391 0.13
392 0.13
393 0.1
394 0.09
395 0.09
396 0.07
397 0.07
398 0.07
399 0.07
400 0.08
401 0.08
402 0.07
403 0.07
404 0.07
405 0.08
406 0.09
407 0.09
408 0.08
409 0.08
410 0.08
411 0.09
412 0.09
413 0.09
414 0.08
415 0.08
416 0.08
417 0.08
418 0.08
419 0.07
420 0.08
421 0.07
422 0.09
423 0.11
424 0.1
425 0.11
426 0.11
427 0.1
428 0.11
429 0.14
430 0.14
431 0.12
432 0.15