Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A1D514

Protein Details
Accession A1D514    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
297-328ARIGKGAPKKPKWQAKKNKNRSKQNRAQAEDTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
247-265KDIRRAKEAAEKREAERKE
298-320RIGKGAPKKPKWQAKKNKNRSKQ
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 11, cyto 4.5, pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039905  CD2BP2/Lin1  
IPR003169  GYF  
IPR035445  GYF-like_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005682  C:U5 snRNP  
KEGG nfi:NFIA_022180  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02213  GYF  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50829  GYF  
Amino Acid Sequences MMFSQPRPKRAGEDFTRTHHHDEDDPNGPSEHKKPRFDLRNPSNLAPDALDEDPVLDADEIGRRGQQVRRKAVNLDGYDSDSENEGFSARIEAKAKRSRAKHDAEDDDMFAELQEDFGAEEIDADEALRKNKKTVRFLRDDEIEGQVASSKGGVTLRADLNATGDTVEEDEVESESDVADEDRARLEEGMDEELGAGAKKKHAPLLDAFNMRAEQEEGKFDDQGNYIRKAADPDEIYDSWLEGVSKKDIRRAKEAAEKREAERKERDRLNDSIITADALRTLITHLQRGETALEALARIGKGAPKKPKWQAKKNKNRSKQNRAQAEDTEMTEDDPNEASRKQVIETITGAADILMTRGQTDIYDTEREMLTRQYRQETGEDWVDPPSESAAPTSAEEEPVMWQFRWSDARDGGVEHGPYDSQTMESWKRAGYFGEGVEFRKVGDTGDWTSEATFL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.59
2 0.6
3 0.66
4 0.62
5 0.59
6 0.53
7 0.48
8 0.45
9 0.46
10 0.46
11 0.45
12 0.43
13 0.4
14 0.38
15 0.36
16 0.34
17 0.38
18 0.43
19 0.44
20 0.48
21 0.52
22 0.62
23 0.71
24 0.74
25 0.77
26 0.74
27 0.76
28 0.75
29 0.72
30 0.66
31 0.56
32 0.5
33 0.39
34 0.31
35 0.25
36 0.21
37 0.19
38 0.14
39 0.13
40 0.12
41 0.12
42 0.11
43 0.07
44 0.07
45 0.07
46 0.11
47 0.12
48 0.12
49 0.13
50 0.14
51 0.19
52 0.25
53 0.32
54 0.38
55 0.46
56 0.53
57 0.54
58 0.56
59 0.58
60 0.6
61 0.54
62 0.49
63 0.41
64 0.37
65 0.35
66 0.33
67 0.26
68 0.19
69 0.17
70 0.13
71 0.12
72 0.09
73 0.08
74 0.08
75 0.11
76 0.1
77 0.14
78 0.17
79 0.2
80 0.29
81 0.37
82 0.43
83 0.48
84 0.53
85 0.57
86 0.63
87 0.67
88 0.66
89 0.66
90 0.64
91 0.61
92 0.57
93 0.49
94 0.4
95 0.33
96 0.25
97 0.16
98 0.12
99 0.07
100 0.05
101 0.05
102 0.04
103 0.04
104 0.04
105 0.05
106 0.04
107 0.04
108 0.04
109 0.05
110 0.04
111 0.04
112 0.07
113 0.09
114 0.14
115 0.18
116 0.19
117 0.25
118 0.3
119 0.39
120 0.46
121 0.54
122 0.59
123 0.62
124 0.65
125 0.65
126 0.63
127 0.57
128 0.49
129 0.41
130 0.32
131 0.24
132 0.2
133 0.15
134 0.12
135 0.1
136 0.08
137 0.05
138 0.06
139 0.07
140 0.08
141 0.08
142 0.12
143 0.12
144 0.13
145 0.13
146 0.12
147 0.13
148 0.12
149 0.11
150 0.07
151 0.06
152 0.06
153 0.06
154 0.06
155 0.05
156 0.05
157 0.05
158 0.05
159 0.05
160 0.05
161 0.04
162 0.04
163 0.04
164 0.04
165 0.04
166 0.05
167 0.05
168 0.05
169 0.06
170 0.06
171 0.07
172 0.07
173 0.07
174 0.07
175 0.08
176 0.09
177 0.08
178 0.08
179 0.07
180 0.07
181 0.07
182 0.06
183 0.06
184 0.05
185 0.08
186 0.1
187 0.11
188 0.14
189 0.15
190 0.17
191 0.19
192 0.26
193 0.29
194 0.28
195 0.27
196 0.24
197 0.24
198 0.21
199 0.19
200 0.13
201 0.09
202 0.09
203 0.1
204 0.11
205 0.12
206 0.13
207 0.12
208 0.13
209 0.13
210 0.17
211 0.18
212 0.18
213 0.18
214 0.17
215 0.18
216 0.18
217 0.18
218 0.17
219 0.14
220 0.14
221 0.18
222 0.18
223 0.18
224 0.16
225 0.15
226 0.11
227 0.11
228 0.09
229 0.06
230 0.07
231 0.1
232 0.14
233 0.15
234 0.22
235 0.26
236 0.29
237 0.34
238 0.35
239 0.37
240 0.42
241 0.48
242 0.47
243 0.5
244 0.48
245 0.44
246 0.5
247 0.46
248 0.42
249 0.45
250 0.44
251 0.46
252 0.49
253 0.51
254 0.48
255 0.49
256 0.49
257 0.42
258 0.37
259 0.29
260 0.24
261 0.21
262 0.16
263 0.14
264 0.08
265 0.06
266 0.06
267 0.05
268 0.06
269 0.1
270 0.11
271 0.13
272 0.13
273 0.14
274 0.14
275 0.15
276 0.15
277 0.11
278 0.1
279 0.08
280 0.08
281 0.07
282 0.07
283 0.07
284 0.06
285 0.06
286 0.06
287 0.09
288 0.14
289 0.22
290 0.32
291 0.36
292 0.45
293 0.54
294 0.64
295 0.7
296 0.76
297 0.8
298 0.82
299 0.88
300 0.91
301 0.92
302 0.92
303 0.94
304 0.93
305 0.93
306 0.91
307 0.9
308 0.88
309 0.82
310 0.76
311 0.66
312 0.62
313 0.53
314 0.44
315 0.36
316 0.27
317 0.23
318 0.2
319 0.18
320 0.13
321 0.12
322 0.12
323 0.12
324 0.12
325 0.12
326 0.14
327 0.15
328 0.14
329 0.17
330 0.17
331 0.18
332 0.19
333 0.19
334 0.16
335 0.15
336 0.14
337 0.1
338 0.09
339 0.06
340 0.06
341 0.05
342 0.05
343 0.05
344 0.06
345 0.06
346 0.06
347 0.08
348 0.1
349 0.12
350 0.15
351 0.15
352 0.17
353 0.17
354 0.17
355 0.16
356 0.21
357 0.23
358 0.27
359 0.31
360 0.34
361 0.35
362 0.37
363 0.39
364 0.34
365 0.33
366 0.32
367 0.29
368 0.24
369 0.24
370 0.23
371 0.2
372 0.18
373 0.16
374 0.13
375 0.12
376 0.12
377 0.12
378 0.13
379 0.13
380 0.16
381 0.14
382 0.14
383 0.14
384 0.14
385 0.15
386 0.17
387 0.19
388 0.16
389 0.17
390 0.17
391 0.22
392 0.27
393 0.28
394 0.3
395 0.28
396 0.31
397 0.3
398 0.31
399 0.3
400 0.28
401 0.25
402 0.2
403 0.19
404 0.16
405 0.16
406 0.16
407 0.13
408 0.1
409 0.11
410 0.18
411 0.22
412 0.24
413 0.26
414 0.26
415 0.27
416 0.28
417 0.28
418 0.26
419 0.25
420 0.23
421 0.28
422 0.27
423 0.28
424 0.3
425 0.28
426 0.23
427 0.23
428 0.22
429 0.17
430 0.18
431 0.21
432 0.21
433 0.25
434 0.25
435 0.23