Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A1DCQ4

Protein Details
Accession A1DCQ4    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
173-195NSWGKPVAKSRRRNIRKKWYYAVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
177-190KPVAKSRRRNIRKK
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 10.5, mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR046896  Cup1-like_N  
KEGG nfi:NFIA_026880  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF20263  LYRM2-like  
CDD cd20273  Complex1_LYR_unchar  
Amino Acid Sequences MSSSPLIPPEQWRHLFRALLRECTYLPDPIARGYMHDYVVRRFRRYSDKSQSKLQDDLHRQHLLRKTATQKLSLLKRANEGYSRPLEKVLRLSYGRNGKKRRDLLDVFIVPEVPPDALAVEGILKGPSMFEDDWKPPTIVLDLLKSQLRNGVISQLSDRSVVKTLEPPIPKENSWGKPVAKSRRRNIRKKWYYAVLDSLLPPLPDAELDTLHGLISGRIPWTPPKRRKAVGVPLDSPSQTSLDVAFLTEGPKKGPTFRDFVNGRPHQITRRFMQRLWRRIYCMVPRLEWDEKNQKHYFKWESVKPFPHIPTVVEHDQVPDLFQKVDVNGRLIQRPSRGRVEVATEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.53
2 0.55
3 0.5
4 0.53
5 0.47
6 0.49
7 0.48
8 0.45
9 0.4
10 0.42
11 0.41
12 0.33
13 0.3
14 0.27
15 0.25
16 0.24
17 0.27
18 0.21
19 0.21
20 0.24
21 0.26
22 0.23
23 0.26
24 0.27
25 0.3
26 0.4
27 0.42
28 0.4
29 0.39
30 0.44
31 0.51
32 0.56
33 0.6
34 0.62
35 0.68
36 0.68
37 0.75
38 0.77
39 0.7
40 0.68
41 0.63
42 0.62
43 0.6
44 0.61
45 0.59
46 0.57
47 0.53
48 0.55
49 0.56
50 0.52
51 0.47
52 0.49
53 0.49
54 0.52
55 0.54
56 0.5
57 0.47
58 0.49
59 0.53
60 0.54
61 0.52
62 0.45
63 0.48
64 0.48
65 0.47
66 0.42
67 0.37
68 0.35
69 0.36
70 0.37
71 0.32
72 0.34
73 0.32
74 0.31
75 0.35
76 0.32
77 0.3
78 0.3
79 0.31
80 0.34
81 0.42
82 0.48
83 0.5
84 0.55
85 0.57
86 0.65
87 0.7
88 0.67
89 0.65
90 0.6
91 0.56
92 0.58
93 0.52
94 0.43
95 0.37
96 0.33
97 0.23
98 0.21
99 0.17
100 0.07
101 0.06
102 0.05
103 0.05
104 0.05
105 0.05
106 0.04
107 0.04
108 0.04
109 0.04
110 0.04
111 0.04
112 0.04
113 0.04
114 0.04
115 0.08
116 0.08
117 0.1
118 0.14
119 0.16
120 0.19
121 0.2
122 0.2
123 0.16
124 0.17
125 0.16
126 0.13
127 0.12
128 0.12
129 0.11
130 0.13
131 0.15
132 0.14
133 0.13
134 0.15
135 0.14
136 0.13
137 0.12
138 0.15
139 0.14
140 0.15
141 0.16
142 0.14
143 0.14
144 0.14
145 0.14
146 0.11
147 0.13
148 0.12
149 0.12
150 0.14
151 0.17
152 0.22
153 0.23
154 0.24
155 0.25
156 0.27
157 0.26
158 0.28
159 0.32
160 0.29
161 0.31
162 0.32
163 0.29
164 0.33
165 0.4
166 0.46
167 0.47
168 0.52
169 0.58
170 0.65
171 0.74
172 0.78
173 0.81
174 0.82
175 0.82
176 0.8
177 0.77
178 0.73
179 0.67
180 0.59
181 0.51
182 0.41
183 0.33
184 0.27
185 0.24
186 0.17
187 0.13
188 0.11
189 0.08
190 0.07
191 0.06
192 0.07
193 0.06
194 0.06
195 0.07
196 0.07
197 0.07
198 0.07
199 0.07
200 0.06
201 0.06
202 0.06
203 0.06
204 0.07
205 0.07
206 0.08
207 0.16
208 0.25
209 0.36
210 0.44
211 0.51
212 0.57
213 0.59
214 0.65
215 0.66
216 0.66
217 0.65
218 0.62
219 0.56
220 0.52
221 0.51
222 0.45
223 0.36
224 0.27
225 0.19
226 0.13
227 0.11
228 0.09
229 0.08
230 0.08
231 0.08
232 0.07
233 0.07
234 0.09
235 0.11
236 0.11
237 0.12
238 0.15
239 0.16
240 0.2
241 0.27
242 0.28
243 0.29
244 0.3
245 0.38
246 0.36
247 0.4
248 0.46
249 0.41
250 0.42
251 0.42
252 0.43
253 0.42
254 0.48
255 0.48
256 0.42
257 0.5
258 0.5
259 0.48
260 0.56
261 0.58
262 0.6
263 0.64
264 0.63
265 0.58
266 0.58
267 0.64
268 0.61
269 0.59
270 0.53
271 0.46
272 0.45
273 0.47
274 0.49
275 0.43
276 0.43
277 0.46
278 0.46
279 0.53
280 0.56
281 0.53
282 0.5
283 0.57
284 0.55
285 0.53
286 0.58
287 0.57
288 0.61
289 0.65
290 0.68
291 0.64
292 0.64
293 0.58
294 0.56
295 0.5
296 0.42
297 0.39
298 0.41
299 0.4
300 0.34
301 0.32
302 0.27
303 0.28
304 0.27
305 0.23
306 0.18
307 0.17
308 0.15
309 0.16
310 0.16
311 0.16
312 0.23
313 0.24
314 0.24
315 0.27
316 0.31
317 0.36
318 0.38
319 0.41
320 0.43
321 0.48
322 0.51
323 0.54
324 0.53
325 0.49
326 0.49