FuNGI

A0A371CX46

Protein Details

Accession

A0A371CX46

Localization Confidence

High

Confidence Score

21.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
266-290	GDSLRSRSKRSKNVSSKRKRREALD	Hydrophilic
292-330	DSDEGDKRKKRRHHTVSRSSSRPDRKRRRSRHSDDEDTD	Basic
335-378	DDSIEDGKPRRKRSRRQESSSESDHKYVRKRSKGKGKHRGSSLS	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
270-288	RSRSKRSKNVSSKRKRREA
296-322	GDKRKKRRHHTVSRSSSRPDRKRRRSR
342-373	KPRRKRSRRQESSSESDHKYVRKRSKGKGKHR

Subcellular Location(s)

nucl 17, cyto_nucl 11, mito 4, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007832 RNA_pol_Rpc34 IPR016049 RNA_pol_Rpc34-like IPR036388 WH-like_DNA-bd_sf IPR036390 WH_DNA-bd_sf
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05158 RNA_pol_Rpc34

Amino Acid Sequences

MSHRQLNATERKLHQYALERPNKVVNQKELEALIPDAKGRLAAINFLLGTGLFVVLESRGGGLSYRAVSHSEIDLKKGLSHEEGLVLDRIRAAGNEGIWTKHIKVKTQLHQTIVDKCLKSLTHKQLVKTVTDVRHSTRKICMLFSIEPSVEMTGGPWYTDKELDTEFIKLLSDVCLKIVRDRSLPKARHVDDGRPRQLYPLVHASYSNAEQILGLLNKSQVTETVLTVEHVNMFLDLLVLDGKIEKLPAFNAAVLDDAEDGEEDRGDSLRSRSKRSKNVSSKRKRREALDEDSDEGDKRKKRRHHTVSRSSSRPDRKRRRSRHSDDEDTDTDEDDDSIEDGKPRRKRSRRQESSSESDHKYVRKRSKGKGKHRGSSLSSASETESSDDSDASGRSNDSPSNRTAPAPSATLADVGGSHFLGGTVYRAVYEERIRELGLDQAPCVRCPTFEFCQSGGPVNPQECIYYEGWLAVEAGAL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.49
2	0.48
3	0.53
4	0.55
5	0.61
6	0.55
7	0.55
8	0.62
9	0.62
10	0.6
11	0.58
12	0.55
13	0.53
14	0.52
15	0.53
16	0.46
17	0.41
18	0.36
19	0.3
20	0.24
21	0.18
22	0.17
23	0.15
24	0.14
25	0.13
26	0.12
27	0.14
28	0.13
29	0.14
30	0.14
31	0.16
32	0.16
33	0.15
34	0.15
35	0.1
36	0.1
37	0.08
38	0.07
39	0.04
40	0.04
41	0.05
42	0.05
43	0.06
44	0.05
45	0.05
46	0.05
47	0.06
48	0.06
49	0.07
50	0.1
51	0.11
52	0.12
53	0.12
54	0.14
55	0.15
56	0.17
57	0.19
58	0.25
59	0.24
60	0.26
61	0.27
62	0.26
63	0.27
64	0.26
65	0.25
66	0.19
67	0.2
68	0.18
69	0.18
70	0.18
71	0.18
72	0.19
73	0.17
74	0.15
75	0.13
76	0.13
77	0.11
78	0.1
79	0.11
80	0.11
81	0.11
82	0.15
83	0.16
84	0.16
85	0.17
86	0.19
87	0.19
88	0.22
89	0.24
90	0.24
91	0.33
92	0.41
93	0.49
94	0.57
95	0.59
96	0.57
97	0.61
98	0.6
99	0.57
100	0.52
101	0.5
102	0.39
103	0.35
104	0.36
105	0.31
106	0.35
107	0.38
108	0.43
109	0.46
110	0.49
111	0.5
112	0.52
113	0.53
114	0.48
115	0.42
116	0.4
117	0.34
118	0.36
119	0.37
120	0.35
121	0.41
122	0.41
123	0.4
124	0.38
125	0.41
126	0.37
127	0.36
128	0.34
129	0.31
130	0.31
131	0.31
132	0.29
133	0.23
134	0.22
135	0.21
136	0.19
137	0.14
138	0.11
139	0.09
140	0.08
141	0.08
142	0.08
143	0.07
144	0.08
145	0.1
146	0.11
147	0.11
148	0.11
149	0.11
150	0.13
151	0.13
152	0.13
153	0.12
154	0.11
155	0.1
156	0.08
157	0.08
158	0.09
159	0.1
160	0.09
161	0.11
162	0.13
163	0.14
164	0.18
165	0.23
166	0.23
167	0.25
168	0.29
169	0.36
170	0.43
171	0.44
172	0.46
173	0.5
174	0.49
175	0.53
176	0.52
177	0.52
178	0.52
179	0.6
180	0.59
181	0.52
182	0.5
183	0.43
184	0.45
185	0.36
186	0.31
187	0.29
188	0.25
189	0.23
190	0.23
191	0.22
192	0.21
193	0.21
194	0.18
195	0.1
196	0.09
197	0.08
198	0.08
199	0.1
200	0.08
201	0.07
202	0.07
203	0.07
204	0.08
205	0.08
206	0.08
207	0.06
208	0.08
209	0.09
210	0.09
211	0.1
212	0.09
213	0.1
214	0.1
215	0.1
216	0.07
217	0.06
218	0.06
219	0.05
220	0.04
221	0.04
222	0.03
223	0.03
224	0.03
225	0.03
226	0.03
227	0.03
228	0.03
229	0.04
230	0.04
231	0.04
232	0.04
233	0.04
234	0.05
235	0.07
236	0.07
237	0.07
238	0.08
239	0.07
240	0.08
241	0.07
242	0.07
243	0.05
244	0.05
245	0.04
246	0.04
247	0.04
248	0.04
249	0.04
250	0.03
251	0.04
252	0.04
253	0.05
254	0.06
255	0.09
256	0.16
257	0.18
258	0.26
259	0.34
260	0.43
261	0.52
262	0.58
263	0.66
264	0.7
265	0.78
266	0.83
267	0.85
268	0.87
269	0.87
270	0.89
271	0.81
272	0.75
273	0.75
274	0.71
275	0.68
276	0.64
277	0.57
278	0.49
279	0.47
280	0.42
281	0.32
282	0.27
283	0.25
284	0.22
285	0.27
286	0.34
287	0.42
288	0.51
289	0.62
290	0.71
291	0.76
292	0.82
293	0.87
294	0.89
295	0.88
296	0.82
297	0.75
298	0.73
299	0.73
300	0.71
301	0.72
302	0.73
303	0.76
304	0.84
305	0.9
306	0.92
307	0.92
308	0.91
309	0.91
310	0.89
311	0.86
312	0.79
313	0.75
314	0.65
315	0.57
316	0.48
317	0.38
318	0.29
319	0.2
320	0.17
321	0.1
322	0.09
323	0.06
324	0.07
325	0.07
326	0.1
327	0.14
328	0.21
329	0.28
330	0.37
331	0.48
332	0.56
333	0.67
334	0.75
335	0.83
336	0.86
337	0.87
338	0.88
339	0.85
340	0.82
341	0.79
342	0.74
343	0.65
344	0.58
345	0.54
346	0.49
347	0.49
348	0.52
349	0.55
350	0.59
351	0.64
352	0.7
353	0.78
354	0.83
355	0.86
356	0.88
357	0.87
358	0.84
359	0.82
360	0.79
361	0.73
362	0.7
363	0.62
364	0.54
365	0.46
366	0.39
367	0.34
368	0.28
369	0.24
370	0.18
371	0.16
372	0.13
373	0.13
374	0.12
375	0.11
376	0.12
377	0.11
378	0.11
379	0.11
380	0.11
381	0.13
382	0.15
383	0.19
384	0.21
385	0.24
386	0.27
387	0.31
388	0.31
389	0.31
390	0.3
391	0.3
392	0.29
393	0.28
394	0.24
395	0.21
396	0.2
397	0.19
398	0.16
399	0.13
400	0.1
401	0.09
402	0.09
403	0.07
404	0.07
405	0.06
406	0.06
407	0.06
408	0.06
409	0.07
410	0.07
411	0.08
412	0.08
413	0.09
414	0.11
415	0.15
416	0.2
417	0.21
418	0.23
419	0.25
420	0.24
421	0.24
422	0.24
423	0.26
424	0.26
425	0.24
426	0.21
427	0.27
428	0.29
429	0.28
430	0.32
431	0.25
432	0.21
433	0.26
434	0.33
435	0.31
436	0.36
437	0.4
438	0.37
439	0.42
440	0.43
441	0.41
442	0.36
443	0.36
444	0.35
445	0.32
446	0.32
447	0.28
448	0.27
449	0.24
450	0.27
451	0.22
452	0.19
453	0.18
454	0.18
455	0.17
456	0.16
457	0.15

A0A371CX46

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer