FuNGI

A0A371CW83

Protein Details

Accession

A0A371CW83

Localization Confidence

High

Confidence Score

23.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
271-307	SDDERSAKEKKRKRRDDSPKRDRKRSKRSRSSSPSGS	Basic
310-392	DSDSEDERERRRRKKSRSRAASSDEDSDSERERERRKKKKKRSRESSDVEMSDDESSRRSKSKSKSKRKKSRRSHSSDEDSDS	Basic
396-419	SDRSRSRSKASSSKRKRSSSPGED	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
277-301	AKEKKRKRRDDSPKRDRKRSKRSRS
317-330	RERRRRKKSRSRAA
339-353	ERERERRKKKKKRSR
367-383	RRSKSKSKSKRKKSRRS
400-412	RSRSKASSSKRKR

Subcellular Location(s)

nucl 23.5, cyto_nucl 13.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007832 RNA_pol_Rpc34 IPR016049 RNA_pol_Rpc34-like IPR036388 WH-like_DNA-bd_sf IPR036390 WH_DNA-bd_sf
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05158 RNA_pol_Rpc34

Amino Acid Sequences

MSGRKLNTHELKLHQAALADPKHTLTQQECDAIVPDAAARTAALNFLLGTGLLKAMKDAKGAVSFRAVMKKELEVKKDLTGEEAMILSYIQAAKNEGIWTKHLKAKTELHQTVIDRCLKSLVQKQLIKTVKSKNYPTRKIYMLYHLQPSEEMTGGPWYTDNELDTEFIKLLCSACVRFIRDRSTPKQKNADSSSSSNQPLYPISAAPQYPTAQQVQSFLSKSRITETELSVDNVETLLNVLVLDGDIERVPAFGAASWDTSDNAARASDVSDDERSAKEKKRKRRDDSPKRDRKRSKRSRSSSPSGSDSDSDSEDERERRRRKKSRSRAASSDEDSDSERERERRKKKKKRSRESSDVEMSDDESSRRSKSKSKSKRKKSRRSHSSDEDSDSGSESDRSRSRSKASSSKRKRSSSPGEDITASFLQEGYGAYVYRAVRQELAAGGGGGLSQTPCVRCPTFDFCKGGGPVNPQECEYYGTWLSAAEVAKG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.45
2	0.38
3	0.34
4	0.36
5	0.34
6	0.26
7	0.24
8	0.24
9	0.26
10	0.26
11	0.28
12	0.24
13	0.27
14	0.29
15	0.32
16	0.3
17	0.28
18	0.29
19	0.25
20	0.21
21	0.16
22	0.13
23	0.1
24	0.1
25	0.09
26	0.08
27	0.08
28	0.08
29	0.09
30	0.08
31	0.08
32	0.08
33	0.08
34	0.08
35	0.06
36	0.06
37	0.06
38	0.08
39	0.08
40	0.08
41	0.09
42	0.14
43	0.15
44	0.16
45	0.16
46	0.18
47	0.25
48	0.26
49	0.26
50	0.24
51	0.25
52	0.27
53	0.34
54	0.32
55	0.28
56	0.29
57	0.33
58	0.4
59	0.44
60	0.45
61	0.41
62	0.42
63	0.44
64	0.45
65	0.4
66	0.33
67	0.28
68	0.24
69	0.2
70	0.18
71	0.13
72	0.1
73	0.09
74	0.06
75	0.07
76	0.08
77	0.08
78	0.08
79	0.1
80	0.1
81	0.13
82	0.15
83	0.16
84	0.17
85	0.2
86	0.25
87	0.28
88	0.33
89	0.33
90	0.35
91	0.38
92	0.44
93	0.5
94	0.54
95	0.51
96	0.49
97	0.51
98	0.49
99	0.47
100	0.46
101	0.43
102	0.32
103	0.31
104	0.31
105	0.27
106	0.32
107	0.35
108	0.37
109	0.4
110	0.43
111	0.44
112	0.51
113	0.56
114	0.52
115	0.51
116	0.52
117	0.51
118	0.55
119	0.62
120	0.62
121	0.68
122	0.74
123	0.72
124	0.68
125	0.62
126	0.59
127	0.54
128	0.51
129	0.48
130	0.43
131	0.44
132	0.39
133	0.36
134	0.33
135	0.31
136	0.25
137	0.18
138	0.14
139	0.09
140	0.11
141	0.11
142	0.1
143	0.09
144	0.08
145	0.1
146	0.1
147	0.1
148	0.09
149	0.1
150	0.1
151	0.1
152	0.1
153	0.09
154	0.08
155	0.08
156	0.08
157	0.07
158	0.08
159	0.09
160	0.09
161	0.13
162	0.16
163	0.2
164	0.23
165	0.26
166	0.3
167	0.35
168	0.41
169	0.45
170	0.53
171	0.56
172	0.59
173	0.65
174	0.62
175	0.64
176	0.62
177	0.59
178	0.52
179	0.5
180	0.47
181	0.42
182	0.41
183	0.33
184	0.28
185	0.24
186	0.2
187	0.17
188	0.14
189	0.1
190	0.1
191	0.13
192	0.13
193	0.12
194	0.14
195	0.13
196	0.13
197	0.15
198	0.15
199	0.13
200	0.13
201	0.14
202	0.14
203	0.16
204	0.16
205	0.15
206	0.18
207	0.18
208	0.18
209	0.19
210	0.18
211	0.18
212	0.2
213	0.2
214	0.19
215	0.19
216	0.2
217	0.17
218	0.16
219	0.12
220	0.1
221	0.08
222	0.05
223	0.04
224	0.04
225	0.03
226	0.03
227	0.03
228	0.03
229	0.03
230	0.03
231	0.03
232	0.03
233	0.03
234	0.03
235	0.03
236	0.04
237	0.04
238	0.04
239	0.04
240	0.03
241	0.05
242	0.05
243	0.06
244	0.07
245	0.07
246	0.07
247	0.08
248	0.08
249	0.07
250	0.07
251	0.06
252	0.06
253	0.06
254	0.06
255	0.06
256	0.07
257	0.09
258	0.09
259	0.1
260	0.11
261	0.12
262	0.14
263	0.18
264	0.24
265	0.31
266	0.38
267	0.49
268	0.59
269	0.69
270	0.74
271	0.81
272	0.85
273	0.88
274	0.91
275	0.92
276	0.92
277	0.89
278	0.91
279	0.9
280	0.9
281	0.89
282	0.89
283	0.89
284	0.89
285	0.89
286	0.89
287	0.87
288	0.84
289	0.79
290	0.72
291	0.64
292	0.55
293	0.5
294	0.4
295	0.32
296	0.26
297	0.21
298	0.18
299	0.15
300	0.15
301	0.16
302	0.2
303	0.24
304	0.32
305	0.4
306	0.48
307	0.58
308	0.67
309	0.75
310	0.82
311	0.87
312	0.89
313	0.9
314	0.89
315	0.85
316	0.82
317	0.77
318	0.68
319	0.61
320	0.51
321	0.41
322	0.35
323	0.29
324	0.25
325	0.21
326	0.22
327	0.24
328	0.32
329	0.41
330	0.5
331	0.6
332	0.69
333	0.79
334	0.86
335	0.92
336	0.94
337	0.95
338	0.96
339	0.95
340	0.94
341	0.89
342	0.86
343	0.81
344	0.71
345	0.61
346	0.5
347	0.41
348	0.31
349	0.25
350	0.17
351	0.13
352	0.14
353	0.16
354	0.19
355	0.21
356	0.28
357	0.38
358	0.49
359	0.58
360	0.68
361	0.76
362	0.84
363	0.92
364	0.95
365	0.96
366	0.96
367	0.96
368	0.95
369	0.93
370	0.91
371	0.9
372	0.88
373	0.81
374	0.75
375	0.65
376	0.55
377	0.46
378	0.38
379	0.29
380	0.21
381	0.19
382	0.15
383	0.19
384	0.22
385	0.27
386	0.29
387	0.33
388	0.38
389	0.42
390	0.49
391	0.53
392	0.6
393	0.66
394	0.73
395	0.8
396	0.84
397	0.83
398	0.81
399	0.81
400	0.81
401	0.78
402	0.76
403	0.7
404	0.64
405	0.59
406	0.53
407	0.48
408	0.38
409	0.29
410	0.2
411	0.15
412	0.12
413	0.12
414	0.12
415	0.08
416	0.09
417	0.09
418	0.09
419	0.14
420	0.15
421	0.19
422	0.21
423	0.2
424	0.21
425	0.21
426	0.23
427	0.18
428	0.2
429	0.15
430	0.13
431	0.11
432	0.09
433	0.09
434	0.06
435	0.06
436	0.05
437	0.06
438	0.09
439	0.11
440	0.13
441	0.19
442	0.2
443	0.22
444	0.29
445	0.36
446	0.41
447	0.46
448	0.49
449	0.44
450	0.5
451	0.49
452	0.47
453	0.43
454	0.42
455	0.44
456	0.45
457	0.45
458	0.39
459	0.39
460	0.36
461	0.36
462	0.3
463	0.28
464	0.23
465	0.23
466	0.21
467	0.19
468	0.19
469	0.19

A0A371CW83

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer