Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4QYV6

Protein Details
Accession C4QYV6    Localization Confidence High Confidence Score 20.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-24MSETSKRRGGRPPRKAKSDDSGKEBasic
69-91HLTCNKCSIRQRALYKKNQCLVCHydrophilic
489-508QSARTKQKPKPKTFGLDPEKHydrophilic
558-581SLDAALTDKKDKRKKKQILFKVGIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
6-24KRRGGRPPRKAKSDDSGKE
567-573KDKRKKK
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 12.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR044288  ZNF598/Hel2  
IPR013087  Znf_C2H2_type  
IPR001841  Znf_RING  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0070181  F:small ribosomal subunit rRNA binding  
GO:0061630  F:ubiquitin protein ligase activity  
GO:0036205  P:histone catabolic process  
GO:0061157  P:mRNA destabilization  
GO:0070651  P:nonfunctional rRNA decay  
GO:0070534  P:protein K63-linked ubiquitination  
GO:0072344  P:rescue of stalled ribosome  
GO:1990116  P:ribosome-associated ubiquitin-dependent protein catabolic process  
KEGG ppa:PAS_chr1-4_0573  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF13920  zf-C3HC4_3  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50089  ZF_RING_2  
Amino Acid Sequences MSETSKRRGGRPPRKAKSDDSGKEKIKWTRNTTQGLQSKEDAVENEDKRTTCIICANPIVYGSITTCNHLTCNKCSIRQRALYKKNQCLVCRSENESVIVTADYQLKPIFDDYKPQDFIPNDNKLGMKFTSEEAAGATLDLLKLTCPLNSCKESKEYGSFKKLNQHCREAHDRQFCLICANFKHAFPSELKLYTQKKLQTHQVSGDEIGFKGHPVCMLCPNKHFYSDDELYAHLREKHEKCHVCNELDPTNPQYFRDYDQLFNHFNEVHFPCNVQECLDQKFVVFKDEFDLQAHMISEHPMLVGNRKTLNLFGGSNSKSVTTPHNNNKFRSQLSTLPSQATAHDVKRTRFEERARHYIHYDSAKFDEFITVNEAYDAGHLTAQNLLSRYNELFKFQKPEEINLLIYDLSELYPKNSSKAIDLVQLNAAHDRETEFNQKYPSLNNTDLFTPHGWGNNPIRANKKGVLSEQRFPKPAKSTLSTPTAFPSIQSARTKQKPKPKTFGLDPEKFPALPQNTTKKYPRVRPVENGPGQWGSSPAMSASSSLNSSANSSFVDLNSLDAALTDKKDKRKKKQILFKVGI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.86
2 0.85
3 0.82
4 0.81
5 0.81
6 0.78
7 0.75
8 0.75
9 0.7
10 0.71
11 0.72
12 0.7
13 0.69
14 0.7
15 0.7
16 0.7
17 0.74
18 0.75
19 0.72
20 0.73
21 0.7
22 0.65
23 0.61
24 0.53
25 0.48
26 0.42
27 0.39
28 0.3
29 0.29
30 0.33
31 0.3
32 0.33
33 0.34
34 0.33
35 0.33
36 0.35
37 0.31
38 0.25
39 0.3
40 0.28
41 0.3
42 0.33
43 0.31
44 0.28
45 0.27
46 0.26
47 0.19
48 0.17
49 0.14
50 0.17
51 0.17
52 0.19
53 0.2
54 0.19
55 0.21
56 0.26
57 0.29
58 0.26
59 0.35
60 0.37
61 0.44
62 0.51
63 0.58
64 0.61
65 0.65
66 0.71
67 0.73
68 0.78
69 0.81
70 0.83
71 0.83
72 0.82
73 0.79
74 0.72
75 0.67
76 0.64
77 0.62
78 0.58
79 0.55
80 0.53
81 0.48
82 0.47
83 0.41
84 0.34
85 0.27
86 0.22
87 0.16
88 0.14
89 0.17
90 0.15
91 0.16
92 0.16
93 0.15
94 0.16
95 0.19
96 0.21
97 0.16
98 0.25
99 0.29
100 0.37
101 0.38
102 0.37
103 0.41
104 0.37
105 0.44
106 0.43
107 0.43
108 0.36
109 0.37
110 0.37
111 0.31
112 0.34
113 0.28
114 0.22
115 0.17
116 0.17
117 0.17
118 0.16
119 0.15
120 0.12
121 0.12
122 0.1
123 0.08
124 0.08
125 0.06
126 0.06
127 0.06
128 0.05
129 0.04
130 0.06
131 0.07
132 0.08
133 0.1
134 0.14
135 0.21
136 0.25
137 0.27
138 0.28
139 0.32
140 0.33
141 0.34
142 0.39
143 0.39
144 0.41
145 0.49
146 0.49
147 0.47
148 0.54
149 0.57
150 0.59
151 0.59
152 0.6
153 0.54
154 0.58
155 0.65
156 0.61
157 0.64
158 0.61
159 0.56
160 0.51
161 0.49
162 0.42
163 0.37
164 0.32
165 0.26
166 0.2
167 0.25
168 0.25
169 0.23
170 0.26
171 0.23
172 0.24
173 0.22
174 0.25
175 0.22
176 0.22
177 0.23
178 0.27
179 0.3
180 0.31
181 0.34
182 0.35
183 0.36
184 0.38
185 0.47
186 0.45
187 0.45
188 0.46
189 0.44
190 0.4
191 0.36
192 0.34
193 0.25
194 0.18
195 0.17
196 0.12
197 0.09
198 0.09
199 0.08
200 0.09
201 0.09
202 0.1
203 0.18
204 0.24
205 0.25
206 0.28
207 0.32
208 0.31
209 0.33
210 0.32
211 0.25
212 0.28
213 0.28
214 0.26
215 0.22
216 0.22
217 0.21
218 0.21
219 0.21
220 0.15
221 0.15
222 0.23
223 0.24
224 0.29
225 0.38
226 0.41
227 0.41
228 0.48
229 0.5
230 0.43
231 0.44
232 0.43
233 0.37
234 0.34
235 0.33
236 0.27
237 0.27
238 0.25
239 0.23
240 0.21
241 0.19
242 0.21
243 0.26
244 0.24
245 0.24
246 0.26
247 0.29
248 0.29
249 0.28
250 0.26
251 0.2
252 0.18
253 0.2
254 0.19
255 0.17
256 0.15
257 0.15
258 0.14
259 0.17
260 0.17
261 0.12
262 0.14
263 0.14
264 0.18
265 0.18
266 0.17
267 0.15
268 0.18
269 0.17
270 0.17
271 0.16
272 0.12
273 0.13
274 0.15
275 0.15
276 0.12
277 0.13
278 0.1
279 0.1
280 0.1
281 0.08
282 0.07
283 0.07
284 0.07
285 0.06
286 0.06
287 0.06
288 0.06
289 0.1
290 0.11
291 0.12
292 0.13
293 0.14
294 0.14
295 0.13
296 0.14
297 0.12
298 0.11
299 0.11
300 0.15
301 0.16
302 0.16
303 0.16
304 0.15
305 0.14
306 0.15
307 0.2
308 0.21
309 0.28
310 0.37
311 0.48
312 0.51
313 0.53
314 0.57
315 0.54
316 0.49
317 0.45
318 0.39
319 0.34
320 0.34
321 0.36
322 0.32
323 0.29
324 0.28
325 0.24
326 0.21
327 0.19
328 0.19
329 0.15
330 0.2
331 0.23
332 0.24
333 0.3
334 0.33
335 0.33
336 0.36
337 0.4
338 0.44
339 0.47
340 0.55
341 0.51
342 0.51
343 0.49
344 0.45
345 0.43
346 0.4
347 0.35
348 0.28
349 0.27
350 0.25
351 0.24
352 0.22
353 0.21
354 0.15
355 0.14
356 0.16
357 0.14
358 0.13
359 0.12
360 0.12
361 0.09
362 0.09
363 0.09
364 0.05
365 0.06
366 0.06
367 0.07
368 0.09
369 0.09
370 0.11
371 0.1
372 0.11
373 0.1
374 0.12
375 0.13
376 0.16
377 0.16
378 0.18
379 0.21
380 0.23
381 0.29
382 0.27
383 0.34
384 0.3
385 0.33
386 0.34
387 0.33
388 0.31
389 0.25
390 0.25
391 0.17
392 0.15
393 0.12
394 0.08
395 0.06
396 0.07
397 0.07
398 0.08
399 0.13
400 0.13
401 0.15
402 0.17
403 0.18
404 0.18
405 0.21
406 0.21
407 0.23
408 0.23
409 0.22
410 0.24
411 0.24
412 0.22
413 0.21
414 0.2
415 0.14
416 0.13
417 0.14
418 0.13
419 0.16
420 0.24
421 0.23
422 0.26
423 0.28
424 0.3
425 0.29
426 0.3
427 0.32
428 0.3
429 0.31
430 0.3
431 0.29
432 0.29
433 0.29
434 0.28
435 0.23
436 0.19
437 0.17
438 0.19
439 0.18
440 0.23
441 0.27
442 0.3
443 0.33
444 0.36
445 0.4
446 0.4
447 0.44
448 0.41
449 0.41
450 0.39
451 0.43
452 0.49
453 0.48
454 0.53
455 0.57
456 0.58
457 0.57
458 0.55
459 0.55
460 0.51
461 0.52
462 0.51
463 0.47
464 0.46
465 0.48
466 0.53
467 0.47
468 0.41
469 0.38
470 0.35
471 0.3
472 0.26
473 0.27
474 0.23
475 0.3
476 0.34
477 0.36
478 0.42
479 0.52
480 0.6
481 0.6
482 0.67
483 0.71
484 0.75
485 0.8
486 0.78
487 0.78
488 0.77
489 0.81
490 0.8
491 0.76
492 0.7
493 0.66
494 0.6
495 0.51
496 0.44
497 0.42
498 0.37
499 0.35
500 0.4
501 0.45
502 0.48
503 0.55
504 0.61
505 0.61
506 0.66
507 0.7
508 0.73
509 0.72
510 0.73
511 0.75
512 0.78
513 0.79
514 0.75
515 0.67
516 0.61
517 0.53
518 0.46
519 0.39
520 0.31
521 0.22
522 0.17
523 0.16
524 0.12
525 0.12
526 0.12
527 0.12
528 0.13
529 0.13
530 0.13
531 0.15
532 0.15
533 0.14
534 0.17
535 0.16
536 0.16
537 0.14
538 0.16
539 0.16
540 0.15
541 0.18
542 0.15
543 0.16
544 0.15
545 0.14
546 0.12
547 0.1
548 0.13
549 0.12
550 0.15
551 0.22
552 0.28
553 0.38
554 0.49
555 0.59
556 0.67
557 0.76
558 0.84
559 0.87
560 0.92
561 0.92