Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A370TDN9

Protein Details
Accession A0A370TDN9    Localization Confidence High Confidence Score 23.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-33MAKSAKAKKPSAPSKKPEKKTIAPKKLSKEFVQHydrophilic
362-384LDGKQLKRLKTKQTKPDKRITGGHydrophilic
472-500PQETRISGKKSLKKKDKNRPTAPARDSTSHydrophilic
513-533PPLMSNKRRIKSKELQRGKLGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
4-27SAKAKKPSAPSKKPEKKTIAPKKL
340-356KRKHSEVSEKKTKKSSS
364-377GKQLKRLKTKQTKP
478-492SGKKSLKKKDKNRPT
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013240  DNA-dir_RNA_pol1_su_RPA34  
Gene Ontology GO:0006360  P:transcription by RNA polymerase I  
Pfam View protein in Pfam  
PF08208  RNA_polI_A34  
Amino Acid Sequences MAKSAKAKKPSAPSKKPEKKTIAPKKLSKEFVQESEGEGEDSSSEGESLPENPADSITKKQRQLASSEGSSSSSEIESGSSSSSEEDEDTDGSDESEDGPVRAPKAPTVAPVPSGPYGVPPLFKSAAIQDAKQAPAAFKKYKSEGKQIWYFTAPASVPISSIKKMSLSGVKAREKVCSHDGNDYGFVQDVANDGTEAKIMVPHGSETYQAVSNPVDQIFHLQQIPKLHDGLKATVPAKKPVQPQPKGLKMRFLPLGYSDGNAGNMDSNISSEDPDDANVPKQFKKPVSMPSDSDEDSEAASDSDEEMTEAPPLPSKAATSRKQKSSKASPVESTANGSVKRKHSEVSEKKTKKSSSIPAANLDGKQLKRLKTKQTKPDKRITGGLLALARVRATSPTPPLKPSTALTKSETSIPTPKLPMHQPATSLPEPSGSLGKPTTSIIPPTNPTFIPPLPHHVSIKPQTSQIPSSKIPQETRISGKKSLKKKDKNRPTAPARDSTSKSSMRGLIIATDPPLMSNKRRIKSKELQRGKLGWPSEGEGKIENE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.82
2 0.88
3 0.89
4 0.88
5 0.86
6 0.85
7 0.86
8 0.88
9 0.87
10 0.86
11 0.86
12 0.86
13 0.86
14 0.82
15 0.75
16 0.73
17 0.68
18 0.63
19 0.59
20 0.49
21 0.43
22 0.41
23 0.36
24 0.27
25 0.21
26 0.17
27 0.13
28 0.13
29 0.1
30 0.07
31 0.07
32 0.06
33 0.07
34 0.08
35 0.09
36 0.12
37 0.12
38 0.12
39 0.12
40 0.14
41 0.17
42 0.18
43 0.26
44 0.33
45 0.41
46 0.44
47 0.51
48 0.55
49 0.54
50 0.57
51 0.55
52 0.51
53 0.45
54 0.44
55 0.38
56 0.33
57 0.31
58 0.27
59 0.21
60 0.15
61 0.13
62 0.1
63 0.1
64 0.09
65 0.09
66 0.1
67 0.08
68 0.09
69 0.09
70 0.1
71 0.1
72 0.09
73 0.1
74 0.1
75 0.1
76 0.11
77 0.11
78 0.11
79 0.1
80 0.1
81 0.09
82 0.08
83 0.11
84 0.1
85 0.09
86 0.12
87 0.14
88 0.16
89 0.2
90 0.2
91 0.19
92 0.23
93 0.24
94 0.24
95 0.27
96 0.26
97 0.24
98 0.24
99 0.26
100 0.22
101 0.22
102 0.19
103 0.16
104 0.19
105 0.18
106 0.19
107 0.16
108 0.2
109 0.2
110 0.2
111 0.2
112 0.17
113 0.24
114 0.24
115 0.23
116 0.23
117 0.26
118 0.27
119 0.28
120 0.26
121 0.2
122 0.25
123 0.32
124 0.31
125 0.3
126 0.35
127 0.39
128 0.47
129 0.51
130 0.54
131 0.53
132 0.56
133 0.59
134 0.56
135 0.53
136 0.46
137 0.41
138 0.31
139 0.3
140 0.22
141 0.18
142 0.18
143 0.14
144 0.13
145 0.17
146 0.19
147 0.16
148 0.17
149 0.16
150 0.15
151 0.15
152 0.18
153 0.2
154 0.2
155 0.26
156 0.34
157 0.37
158 0.41
159 0.41
160 0.44
161 0.4
162 0.42
163 0.41
164 0.38
165 0.36
166 0.37
167 0.37
168 0.33
169 0.33
170 0.28
171 0.23
172 0.17
173 0.15
174 0.1
175 0.09
176 0.07
177 0.06
178 0.06
179 0.06
180 0.06
181 0.05
182 0.05
183 0.05
184 0.05
185 0.05
186 0.06
187 0.06
188 0.06
189 0.07
190 0.08
191 0.08
192 0.09
193 0.09
194 0.1
195 0.11
196 0.1
197 0.11
198 0.1
199 0.11
200 0.12
201 0.11
202 0.09
203 0.08
204 0.13
205 0.12
206 0.13
207 0.14
208 0.13
209 0.16
210 0.19
211 0.22
212 0.19
213 0.19
214 0.18
215 0.2
216 0.21
217 0.2
218 0.19
219 0.2
220 0.2
221 0.23
222 0.23
223 0.25
224 0.26
225 0.29
226 0.34
227 0.4
228 0.49
229 0.48
230 0.55
231 0.59
232 0.65
233 0.67
234 0.61
235 0.58
236 0.49
237 0.5
238 0.45
239 0.37
240 0.28
241 0.22
242 0.25
243 0.18
244 0.18
245 0.14
246 0.11
247 0.11
248 0.11
249 0.09
250 0.06
251 0.06
252 0.06
253 0.04
254 0.04
255 0.05
256 0.05
257 0.05
258 0.05
259 0.07
260 0.06
261 0.07
262 0.08
263 0.08
264 0.1
265 0.12
266 0.14
267 0.16
268 0.19
269 0.23
270 0.23
271 0.27
272 0.28
273 0.34
274 0.39
275 0.39
276 0.37
277 0.35
278 0.37
279 0.33
280 0.3
281 0.22
282 0.16
283 0.13
284 0.12
285 0.09
286 0.06
287 0.05
288 0.05
289 0.04
290 0.04
291 0.04
292 0.04
293 0.05
294 0.05
295 0.06
296 0.06
297 0.06
298 0.07
299 0.08
300 0.08
301 0.08
302 0.09
303 0.15
304 0.23
305 0.3
306 0.39
307 0.45
308 0.54
309 0.6
310 0.63
311 0.65
312 0.66
313 0.68
314 0.65
315 0.61
316 0.54
317 0.51
318 0.49
319 0.42
320 0.34
321 0.28
322 0.24
323 0.23
324 0.24
325 0.25
326 0.27
327 0.3
328 0.28
329 0.28
330 0.3
331 0.4
332 0.47
333 0.51
334 0.57
335 0.58
336 0.6
337 0.66
338 0.62
339 0.56
340 0.54
341 0.53
342 0.52
343 0.56
344 0.54
345 0.5
346 0.52
347 0.49
348 0.42
349 0.37
350 0.32
351 0.24
352 0.29
353 0.31
354 0.33
355 0.41
356 0.47
357 0.55
358 0.61
359 0.7
360 0.73
361 0.79
362 0.84
363 0.82
364 0.85
365 0.8
366 0.73
367 0.68
368 0.6
369 0.52
370 0.42
371 0.38
372 0.28
373 0.22
374 0.2
375 0.15
376 0.13
377 0.09
378 0.09
379 0.08
380 0.1
381 0.13
382 0.2
383 0.27
384 0.29
385 0.32
386 0.35
387 0.35
388 0.36
389 0.34
390 0.36
391 0.34
392 0.35
393 0.36
394 0.36
395 0.34
396 0.38
397 0.37
398 0.31
399 0.32
400 0.32
401 0.32
402 0.32
403 0.32
404 0.32
405 0.35
406 0.39
407 0.37
408 0.36
409 0.35
410 0.36
411 0.42
412 0.38
413 0.35
414 0.27
415 0.24
416 0.23
417 0.22
418 0.22
419 0.14
420 0.16
421 0.16
422 0.16
423 0.16
424 0.16
425 0.19
426 0.17
427 0.22
428 0.21
429 0.25
430 0.28
431 0.3
432 0.32
433 0.28
434 0.28
435 0.29
436 0.27
437 0.29
438 0.28
439 0.33
440 0.35
441 0.38
442 0.39
443 0.36
444 0.43
445 0.45
446 0.48
447 0.42
448 0.4
449 0.41
450 0.43
451 0.47
452 0.44
453 0.43
454 0.39
455 0.44
456 0.47
457 0.48
458 0.47
459 0.47
460 0.48
461 0.47
462 0.54
463 0.56
464 0.54
465 0.56
466 0.63
467 0.64
468 0.68
469 0.74
470 0.76
471 0.79
472 0.85
473 0.88
474 0.9
475 0.93
476 0.92
477 0.91
478 0.89
479 0.89
480 0.84
481 0.8
482 0.75
483 0.73
484 0.67
485 0.63
486 0.62
487 0.55
488 0.52
489 0.48
490 0.46
491 0.39
492 0.37
493 0.31
494 0.26
495 0.25
496 0.24
497 0.21
498 0.18
499 0.17
500 0.16
501 0.21
502 0.22
503 0.25
504 0.34
505 0.43
506 0.49
507 0.58
508 0.63
509 0.67
510 0.73
511 0.79
512 0.8
513 0.81
514 0.81
515 0.79
516 0.79
517 0.74
518 0.71
519 0.62
520 0.53
521 0.46
522 0.43
523 0.42
524 0.38
525 0.35