FuNGI

A0A370TCM2

Protein Details

Accession

A0A370TCM2

Localization Confidence

High

Confidence Score

16.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
121-145	TTTTRASKFKPKSIRRTQSERDQLA	Hydrophilic
405-431	NLDVEKKARRPSKKKEKKPVIQTEEDR	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
4-23	KAARGGAPRGRGRGRGRGKA
157-183	KKAQEEADRKERAANRSRGFRGGRGRG
307-327	AVRKGKAKAGKGGLKPVRLHR
410-423	KKARRPSKKKEKKP

Subcellular Location(s)

nucl 10.5, mito 10, cyto_nucl 9, cyto 6.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007811 RPC4
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05132 RNA_pol_Rpc4

Amino Acid Sequences

MPPKAARGGAPRGRGRGRGRGKAAAEPSTAAQDENSSQSQSTIEGSPPPESAPPQAITALHNELADDDTAMASPNSSPATVPTETPAPTPVRAPEPRPESSTATATTSARGGRGRGGAAGTTTTRASKFKPKSIRRTQSERDQLAEDEQKRKEDFIKKAQEEADRKERAANRSRGFRGGRGRGDVMGGRGAGRGSSASGLFGVAPEAMEHRRDGPVFGRLGGGAGGGGGTGAGWSAGSGAGAGGPRIKSEGGHHGSGTYSGGNKGAFYEPLYPGFEDDDDTPRIDIEQINLVSDAESDEPIPTGTRAVRKGKAKAGKGGLKPVRLHREEHKERVTIVNTQPQTKTEPQLKVENDEMEIDELRSSQAEPPADIIRIKTEPDQSLDIQSALELPGPSSPELRKSTINLDVEKKARRPSKKKEKKPVIQTEEDRAEYERHLEDVRVLAEELGGMQTADSDKDAATTGMEAEEVDKRLGRLYLFQFPPVLPKLYNPMAKPKPPPSKTAELGTEGPTDVEVTGSASKPGQAGGKDPHIKTEEAVVVRVEEEEARESNDVVEEEGWIGKLIVRESGRVELSWGGTSMVVGRGVESGFLSTGVVVDSLEKGIHYPNGEAPEGKAMGMGQVMGKFVVTPDWEKMA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.65
2	0.64
3	0.65
4	0.67
5	0.68
6	0.69
7	0.68
8	0.67
9	0.66
10	0.65
11	0.59
12	0.51
13	0.43
14	0.38
15	0.35
16	0.32
17	0.24
18	0.19
19	0.17
20	0.18
21	0.21
22	0.22
23	0.19
24	0.18
25	0.19
26	0.19
27	0.18
28	0.18
29	0.15
30	0.15
31	0.18
32	0.21
33	0.22
34	0.22
35	0.23
36	0.23
37	0.23
38	0.25
39	0.25
40	0.24
41	0.24
42	0.25
43	0.24
44	0.23
45	0.25
46	0.25
47	0.21
48	0.2
49	0.18
50	0.17
51	0.18
52	0.16
53	0.12
54	0.09
55	0.07
56	0.08
57	0.09
58	0.08
59	0.07
60	0.07
61	0.09
62	0.1
63	0.1
64	0.1
65	0.12
66	0.18
67	0.18
68	0.19
69	0.19
70	0.22
71	0.22
72	0.23
73	0.25
74	0.22
75	0.22
76	0.24
77	0.25
78	0.3
79	0.34
80	0.37
81	0.41
82	0.44
83	0.47
84	0.48
85	0.49
86	0.45
87	0.44
88	0.43
89	0.36
90	0.32
91	0.32
92	0.28
93	0.25
94	0.22
95	0.2
96	0.19
97	0.19
98	0.18
99	0.19
100	0.21
101	0.2
102	0.19
103	0.19
104	0.17
105	0.16
106	0.17
107	0.14
108	0.13
109	0.13
110	0.14
111	0.15
112	0.17
113	0.21
114	0.29
115	0.35
116	0.42
117	0.52
118	0.6
119	0.69
120	0.78
121	0.84
122	0.82
123	0.84
124	0.83
125	0.82
126	0.82
127	0.73
128	0.65
129	0.57
130	0.5
131	0.46
132	0.47
133	0.41
134	0.38
135	0.38
136	0.4
137	0.38
138	0.39
139	0.42
140	0.42
141	0.45
142	0.48
143	0.57
144	0.54
145	0.58
146	0.6
147	0.6
148	0.56
149	0.56
150	0.55
151	0.47
152	0.46
153	0.49
154	0.5
155	0.49
156	0.54
157	0.56
158	0.52
159	0.58
160	0.6
161	0.61
162	0.57
163	0.55
164	0.55
165	0.54
166	0.52
167	0.47
168	0.46
169	0.39
170	0.39
171	0.33
172	0.25
173	0.19
174	0.16
175	0.12
176	0.11
177	0.11
178	0.08
179	0.08
180	0.07
181	0.06
182	0.07
183	0.07
184	0.06
185	0.06
186	0.07
187	0.06
188	0.06
189	0.06
190	0.05
191	0.04
192	0.04
193	0.07
194	0.08
195	0.09
196	0.09
197	0.11
198	0.13
199	0.13
200	0.15
201	0.15
202	0.18
203	0.18
204	0.18
205	0.16
206	0.14
207	0.14
208	0.12
209	0.1
210	0.05
211	0.04
212	0.03
213	0.03
214	0.02
215	0.02
216	0.02
217	0.02
218	0.02
219	0.02
220	0.02
221	0.02
222	0.02
223	0.03
224	0.03
225	0.03
226	0.03
227	0.04
228	0.04
229	0.04
230	0.06
231	0.06
232	0.07
233	0.08
234	0.08
235	0.08
236	0.11
237	0.2
238	0.21
239	0.22
240	0.22
241	0.21
242	0.21
243	0.21
244	0.19
245	0.1
246	0.07
247	0.07
248	0.09
249	0.08
250	0.08
251	0.09
252	0.1
253	0.09
254	0.1
255	0.13
256	0.13
257	0.15
258	0.16
259	0.14
260	0.14
261	0.14
262	0.13
263	0.1
264	0.11
265	0.12
266	0.12
267	0.12
268	0.12
269	0.11
270	0.11
271	0.11
272	0.1
273	0.07
274	0.11
275	0.11
276	0.11
277	0.11
278	0.11
279	0.1
280	0.1
281	0.09
282	0.05
283	0.05
284	0.05
285	0.05
286	0.05
287	0.06
288	0.06
289	0.05
290	0.06
291	0.08
292	0.12
293	0.17
294	0.22
295	0.27
296	0.31
297	0.35
298	0.41
299	0.46
300	0.44
301	0.45
302	0.46
303	0.48
304	0.44
305	0.5
306	0.45
307	0.43
308	0.43
309	0.43
310	0.45
311	0.4
312	0.41
313	0.4
314	0.48
315	0.49
316	0.53
317	0.5
318	0.43
319	0.42
320	0.43
321	0.37
322	0.32
323	0.29
324	0.29
325	0.27
326	0.29
327	0.28
328	0.25
329	0.29
330	0.26
331	0.29
332	0.29
333	0.31
334	0.31
335	0.38
336	0.37
337	0.35
338	0.34
339	0.3
340	0.24
341	0.21
342	0.18
343	0.12
344	0.12
345	0.09
346	0.07
347	0.07
348	0.06
349	0.06
350	0.06
351	0.07
352	0.11
353	0.11
354	0.11
355	0.13
356	0.14
357	0.15
358	0.15
359	0.13
360	0.13
361	0.13
362	0.14
363	0.15
364	0.18
365	0.18
366	0.2
367	0.23
368	0.2
369	0.21
370	0.2
371	0.17
372	0.13
373	0.12
374	0.1
375	0.07
376	0.08
377	0.06
378	0.06
379	0.07
380	0.09
381	0.09
382	0.11
383	0.12
384	0.17
385	0.2
386	0.22
387	0.23
388	0.23
389	0.27
390	0.31
391	0.33
392	0.3
393	0.31
394	0.33
395	0.36
396	0.39
397	0.38
398	0.39
399	0.45
400	0.52
401	0.57
402	0.64
403	0.71
404	0.78
405	0.85
406	0.89
407	0.92
408	0.9
409	0.92
410	0.91
411	0.87
412	0.84
413	0.76
414	0.72
415	0.65
416	0.56
417	0.46
418	0.37
419	0.31
420	0.24
421	0.24
422	0.17
423	0.15
424	0.14
425	0.14
426	0.13
427	0.14
428	0.14
429	0.11
430	0.11
431	0.09
432	0.08
433	0.08
434	0.07
435	0.05
436	0.05
437	0.04
438	0.03
439	0.04
440	0.05
441	0.05
442	0.05
443	0.06
444	0.06
445	0.06
446	0.07
447	0.07
448	0.06
449	0.06
450	0.06
451	0.06
452	0.06
453	0.05
454	0.06
455	0.09
456	0.1
457	0.11
458	0.11
459	0.11
460	0.13
461	0.14
462	0.13
463	0.17
464	0.19
465	0.28
466	0.28
467	0.29
468	0.29
469	0.27
470	0.32
471	0.29
472	0.27
473	0.18
474	0.19
475	0.24
476	0.29
477	0.34
478	0.3
479	0.38
480	0.43
481	0.48
482	0.54
483	0.57
484	0.62
485	0.6
486	0.64
487	0.61
488	0.62
489	0.6
490	0.58
491	0.5
492	0.44
493	0.43
494	0.4
495	0.34
496	0.26
497	0.23
498	0.17
499	0.15
500	0.11
501	0.09
502	0.06
503	0.07
504	0.1
505	0.1
506	0.11
507	0.11
508	0.12
509	0.12
510	0.14
511	0.15
512	0.13
513	0.18
514	0.22
515	0.31
516	0.37
517	0.37
518	0.42
519	0.41
520	0.4
521	0.36
522	0.37
523	0.33
524	0.27
525	0.28
526	0.22
527	0.2
528	0.2
529	0.2
530	0.14
531	0.09
532	0.1
533	0.12
534	0.12
535	0.14
536	0.15
537	0.15
538	0.14
539	0.16
540	0.14
541	0.12
542	0.12
543	0.1
544	0.1
545	0.1
546	0.1
547	0.08
548	0.08
549	0.09
550	0.11
551	0.11
552	0.17
553	0.17
554	0.19
555	0.21
556	0.26
557	0.25
558	0.22
559	0.24
560	0.2
561	0.21
562	0.2
563	0.18
564	0.14
565	0.13
566	0.13
567	0.13
568	0.12
569	0.11
570	0.1
571	0.1
572	0.11
573	0.11
574	0.11
575	0.1
576	0.09
577	0.08
578	0.09
579	0.08
580	0.07
581	0.07
582	0.07
583	0.06
584	0.05
585	0.06
586	0.07
587	0.08
588	0.08
589	0.08
590	0.09
591	0.12
592	0.15
593	0.15
594	0.17
595	0.21
596	0.25
597	0.26
598	0.26
599	0.25
600	0.28
601	0.27
602	0.24
603	0.2
604	0.16
605	0.16
606	0.15
607	0.14
608	0.1
609	0.1
610	0.11
611	0.11
612	0.1
613	0.09
614	0.09
615	0.13
616	0.14
617	0.16

A0A370TCM2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer