Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A1DCD3

Protein Details
Accession A1DCD3    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
9-34ADSSTPRPKTGRRRGRGGRGGRGSVRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
15-31RPKTGRRRGRGGRGGRG
72-100RGSRGGKRGGRGGGASLDNGRRRGRGRGE
Subcellular Location(s) mito 20, cyto_nucl 4, nucl 3.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034078  NFX1_fam  
IPR001374  R3H_dom  
IPR036867  R3H_dom_sf  
IPR034077  R3H_FAP1  
IPR000967  Znf_NFX1  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003700  F:DNA-binding transcription factor activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
KEGG nfi:NFIA_025660  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01424  R3H  
PF01422  zf-NF-X1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51061  R3H  
CDD cd06008  NF-X1-zinc-finger  
cd06006  R3H_unknown_2  
Amino Acid Sequences MSGSPVATADSSTPRPKTGRRRGRGGRGGRGSVRSTPTASNTQPEAQETSQVPANEPSSLNVQPNESLRAVRGSRGGKRGGRGGGASLDNGRRRGRGRGEDSKAVSGGLGGRTFEGRLSKPERASDENQPDDAGDLSLRADAPEFVPGAPTDGVIPNGITSSAANSTIGKGKSKNVQARPPKVTTKSTAPDIATRIHEDIAHNLYECPICTSELGRRSRVWSCGLCWTVFHLSCVKKWSKNEGSAAQDAARRQAEGEPSAPRAWRCPGCNLPHEIFPSTYSCWCEKEVDPRPLPGLPPHSCGQTCSRPRKGCPHPCDATCHAGPCSPCTAMGPTQDCFCGRNSSTKRCRDTDYENGWSCGEICGDLLPCGEHTCTRPCHEGLCGTCEVKIEGRCYCGKVQTEMLCSSKDEEFESQLARGEDGTIDEWIGCFSCGDQCSRPFDCGVHFCEKDCHPQDAHPAHCPWSPDVVSHCPCGKTPLTKMSDFSRRTSCEDPIPNCSKPCGKMLDCGHSCDQICHTGPCGSCRRKVPVHCRCGRTTVITVCHQGTIEPPWCFRVCKAGLHCGRHACAERCCPGEQKAIERQAMRRKLKAHLRPSDEDVEAEHICTRVCGRPLKCGRHTCPEICHKGPCNTCREAIFEDIPCNCGRTVLSPPLPCGTKPPACSFPCERPKPCGHPQTPHNCHTDEESCPKCPFLTEKACLCGKRVLKNQPCWLAETRCGEVCGEPLKCGSHSCQKTCHRPGECEDASRPCQQPCGKTKSLCGHPCTEPCHAPYQCPEKTPCASTVTVTCGCGRLRQSRRCNAAAASKGPVPQATRGTSLTPLACDDECARLERNRALASALGVEINPTTTAASNISPSTLPYSTETLDLYVQLSSTSPLSTLQTYESTLHSLATSTTQRSVRFQPAKSPLRAFIHSLAADWGFASESFDPEPHRHVFVLKPTTWTPPLLGFGPENSIGIGGKSVGECVKLRERQRLKEREAQRLAAAEAKALKEAAKAQQSTDTASEGGWAQVAASRRSNGVSSTRSTTPVASPSPWSGSKFAALAGSDSGSWGLPKKEKLVLRSGVGAAKKNLSTPPATEVADNWEEEEEKVEQEEEREREREREQQSEGEEQPRVEGNNEMTDVKDSVEMPAEAAVSTD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.41
3 0.5
4 0.58
5 0.63
6 0.69
7 0.7
8 0.79
9 0.83
10 0.88
11 0.89
12 0.86
13 0.85
14 0.82
15 0.8
16 0.74
17 0.7
18 0.63
19 0.59
20 0.55
21 0.48
22 0.44
23 0.41
24 0.41
25 0.43
26 0.41
27 0.4
28 0.39
29 0.4
30 0.39
31 0.38
32 0.39
33 0.32
34 0.36
35 0.32
36 0.31
37 0.31
38 0.3
39 0.29
40 0.28
41 0.29
42 0.25
43 0.25
44 0.24
45 0.25
46 0.27
47 0.28
48 0.25
49 0.26
50 0.27
51 0.29
52 0.32
53 0.28
54 0.26
55 0.24
56 0.3
57 0.29
58 0.28
59 0.33
60 0.35
61 0.41
62 0.46
63 0.52
64 0.49
65 0.52
66 0.56
67 0.52
68 0.47
69 0.41
70 0.37
71 0.34
72 0.31
73 0.28
74 0.27
75 0.31
76 0.32
77 0.36
78 0.36
79 0.36
80 0.38
81 0.46
82 0.5
83 0.53
84 0.58
85 0.64
86 0.69
87 0.71
88 0.71
89 0.65
90 0.56
91 0.46
92 0.36
93 0.27
94 0.23
95 0.18
96 0.16
97 0.13
98 0.14
99 0.15
100 0.16
101 0.17
102 0.19
103 0.17
104 0.25
105 0.31
106 0.36
107 0.39
108 0.44
109 0.48
110 0.5
111 0.53
112 0.55
113 0.58
114 0.54
115 0.52
116 0.46
117 0.4
118 0.34
119 0.3
120 0.2
121 0.11
122 0.08
123 0.08
124 0.09
125 0.09
126 0.08
127 0.08
128 0.08
129 0.09
130 0.11
131 0.12
132 0.1
133 0.12
134 0.12
135 0.14
136 0.13
137 0.13
138 0.12
139 0.13
140 0.14
141 0.13
142 0.13
143 0.1
144 0.1
145 0.1
146 0.08
147 0.07
148 0.09
149 0.1
150 0.1
151 0.11
152 0.11
153 0.13
154 0.2
155 0.21
156 0.22
157 0.23
158 0.28
159 0.35
160 0.44
161 0.51
162 0.52
163 0.61
164 0.67
165 0.74
166 0.76
167 0.74
168 0.73
169 0.69
170 0.66
171 0.61
172 0.6
173 0.56
174 0.53
175 0.51
176 0.45
177 0.43
178 0.4
179 0.39
180 0.33
181 0.32
182 0.29
183 0.25
184 0.25
185 0.22
186 0.24
187 0.23
188 0.21
189 0.19
190 0.17
191 0.19
192 0.17
193 0.17
194 0.15
195 0.14
196 0.14
197 0.14
198 0.16
199 0.21
200 0.29
201 0.32
202 0.32
203 0.33
204 0.37
205 0.41
206 0.42
207 0.41
208 0.35
209 0.33
210 0.39
211 0.39
212 0.34
213 0.3
214 0.31
215 0.32
216 0.3
217 0.29
218 0.28
219 0.28
220 0.3
221 0.37
222 0.38
223 0.37
224 0.41
225 0.5
226 0.51
227 0.55
228 0.58
229 0.57
230 0.56
231 0.52
232 0.49
233 0.41
234 0.36
235 0.31
236 0.3
237 0.25
238 0.19
239 0.19
240 0.21
241 0.22
242 0.22
243 0.24
244 0.22
245 0.24
246 0.26
247 0.28
248 0.25
249 0.25
250 0.3
251 0.32
252 0.32
253 0.37
254 0.43
255 0.46
256 0.5
257 0.53
258 0.48
259 0.46
260 0.46
261 0.4
262 0.33
263 0.29
264 0.27
265 0.24
266 0.24
267 0.23
268 0.22
269 0.22
270 0.24
271 0.26
272 0.25
273 0.33
274 0.4
275 0.46
276 0.45
277 0.45
278 0.46
279 0.43
280 0.42
281 0.36
282 0.36
283 0.29
284 0.31
285 0.31
286 0.33
287 0.31
288 0.33
289 0.34
290 0.36
291 0.42
292 0.48
293 0.56
294 0.57
295 0.62
296 0.7
297 0.74
298 0.74
299 0.72
300 0.71
301 0.67
302 0.63
303 0.66
304 0.59
305 0.55
306 0.45
307 0.41
308 0.33
309 0.3
310 0.29
311 0.25
312 0.24
313 0.18
314 0.17
315 0.16
316 0.19
317 0.19
318 0.24
319 0.24
320 0.21
321 0.22
322 0.23
323 0.22
324 0.2
325 0.19
326 0.2
327 0.18
328 0.28
329 0.33
330 0.43
331 0.51
332 0.59
333 0.62
334 0.59
335 0.63
336 0.58
337 0.59
338 0.59
339 0.57
340 0.56
341 0.52
342 0.5
343 0.45
344 0.39
345 0.32
346 0.23
347 0.16
348 0.08
349 0.07
350 0.07
351 0.08
352 0.08
353 0.07
354 0.07
355 0.07
356 0.08
357 0.09
358 0.09
359 0.11
360 0.17
361 0.2
362 0.23
363 0.26
364 0.25
365 0.26
366 0.27
367 0.29
368 0.25
369 0.26
370 0.25
371 0.21
372 0.21
373 0.2
374 0.2
375 0.19
376 0.2
377 0.18
378 0.17
379 0.2
380 0.21
381 0.23
382 0.24
383 0.25
384 0.24
385 0.24
386 0.28
387 0.28
388 0.3
389 0.3
390 0.29
391 0.24
392 0.23
393 0.23
394 0.19
395 0.17
396 0.15
397 0.14
398 0.15
399 0.15
400 0.16
401 0.14
402 0.15
403 0.14
404 0.13
405 0.11
406 0.1
407 0.08
408 0.09
409 0.09
410 0.06
411 0.06
412 0.06
413 0.06
414 0.06
415 0.06
416 0.05
417 0.04
418 0.04
419 0.08
420 0.09
421 0.12
422 0.14
423 0.16
424 0.22
425 0.23
426 0.24
427 0.21
428 0.21
429 0.22
430 0.23
431 0.25
432 0.25
433 0.25
434 0.24
435 0.28
436 0.29
437 0.35
438 0.34
439 0.32
440 0.27
441 0.28
442 0.37
443 0.38
444 0.38
445 0.33
446 0.31
447 0.31
448 0.32
449 0.32
450 0.24
451 0.23
452 0.21
453 0.19
454 0.22
455 0.26
456 0.26
457 0.27
458 0.27
459 0.23
460 0.23
461 0.26
462 0.25
463 0.22
464 0.24
465 0.3
466 0.32
467 0.32
468 0.34
469 0.35
470 0.42
471 0.39
472 0.39
473 0.36
474 0.35
475 0.39
476 0.4
477 0.37
478 0.34
479 0.38
480 0.37
481 0.39
482 0.42
483 0.39
484 0.36
485 0.37
486 0.33
487 0.28
488 0.3
489 0.29
490 0.25
491 0.3
492 0.33
493 0.4
494 0.37
495 0.39
496 0.37
497 0.33
498 0.33
499 0.26
500 0.24
501 0.19
502 0.19
503 0.16
504 0.16
505 0.17
506 0.17
507 0.21
508 0.29
509 0.28
510 0.31
511 0.34
512 0.39
513 0.41
514 0.49
515 0.55
516 0.56
517 0.63
518 0.65
519 0.66
520 0.61
521 0.59
522 0.53
523 0.45
524 0.39
525 0.32
526 0.29
527 0.27
528 0.27
529 0.23
530 0.23
531 0.19
532 0.15
533 0.13
534 0.14
535 0.16
536 0.15
537 0.15
538 0.17
539 0.18
540 0.19
541 0.18
542 0.22
543 0.19
544 0.23
545 0.25
546 0.31
547 0.36
548 0.38
549 0.4
550 0.34
551 0.33
552 0.31
553 0.32
554 0.26
555 0.24
556 0.25
557 0.25
558 0.26
559 0.27
560 0.26
561 0.25
562 0.28
563 0.26
564 0.27
565 0.3
566 0.32
567 0.34
568 0.33
569 0.36
570 0.39
571 0.47
572 0.45
573 0.42
574 0.41
575 0.46
576 0.53
577 0.57
578 0.57
579 0.55
580 0.59
581 0.57
582 0.59
583 0.55
584 0.45
585 0.37
586 0.28
587 0.24
588 0.18
589 0.16
590 0.12
591 0.09
592 0.09
593 0.09
594 0.1
595 0.09
596 0.13
597 0.19
598 0.2
599 0.3
600 0.38
601 0.45
602 0.51
603 0.56
604 0.56
605 0.58
606 0.62
607 0.54
608 0.52
609 0.53
610 0.52
611 0.46
612 0.46
613 0.41
614 0.43
615 0.47
616 0.44
617 0.42
618 0.38
619 0.37
620 0.34
621 0.34
622 0.29
623 0.26
624 0.24
625 0.19
626 0.2
627 0.18
628 0.19
629 0.16
630 0.15
631 0.12
632 0.1
633 0.1
634 0.1
635 0.14
636 0.19
637 0.23
638 0.23
639 0.24
640 0.26
641 0.27
642 0.24
643 0.24
644 0.25
645 0.25
646 0.27
647 0.3
648 0.36
649 0.36
650 0.41
651 0.41
652 0.44
653 0.5
654 0.54
655 0.51
656 0.5
657 0.55
658 0.58
659 0.62
660 0.62
661 0.56
662 0.55
663 0.62
664 0.66
665 0.66
666 0.63
667 0.57
668 0.48
669 0.45
670 0.43
671 0.37
672 0.3
673 0.31
674 0.3
675 0.3
676 0.29
677 0.29
678 0.24
679 0.23
680 0.23
681 0.23
682 0.27
683 0.28
684 0.3
685 0.34
686 0.37
687 0.36
688 0.35
689 0.34
690 0.31
691 0.35
692 0.41
693 0.47
694 0.52
695 0.59
696 0.63
697 0.64
698 0.6
699 0.56
700 0.53
701 0.45
702 0.42
703 0.38
704 0.34
705 0.27
706 0.27
707 0.23
708 0.19
709 0.18
710 0.18
711 0.15
712 0.14
713 0.14
714 0.15
715 0.15
716 0.16
717 0.18
718 0.23
719 0.28
720 0.29
721 0.38
722 0.44
723 0.53
724 0.59
725 0.63
726 0.57
727 0.55
728 0.57
729 0.58
730 0.52
731 0.45
732 0.41
733 0.38
734 0.38
735 0.41
736 0.39
737 0.29
738 0.36
739 0.36
740 0.4
741 0.43
742 0.48
743 0.47
744 0.46
745 0.52
746 0.53
747 0.59
748 0.57
749 0.52
750 0.49
751 0.48
752 0.5
753 0.48
754 0.44
755 0.37
756 0.34
757 0.39
758 0.35
759 0.33
760 0.35
761 0.39
762 0.37
763 0.39
764 0.39
765 0.36
766 0.38
767 0.38
768 0.34
769 0.3
770 0.28
771 0.26
772 0.25
773 0.25
774 0.23
775 0.22
776 0.2
777 0.19
778 0.19
779 0.22
780 0.25
781 0.29
782 0.38
783 0.47
784 0.55
785 0.61
786 0.67
787 0.64
788 0.62
789 0.54
790 0.53
791 0.47
792 0.4
793 0.35
794 0.3
795 0.3
796 0.28
797 0.28
798 0.22
799 0.22
800 0.24
801 0.24
802 0.25
803 0.24
804 0.25
805 0.24
806 0.25
807 0.21
808 0.17
809 0.16
810 0.16
811 0.14
812 0.14
813 0.14
814 0.15
815 0.16
816 0.17
817 0.19
818 0.19
819 0.23
820 0.24
821 0.27
822 0.24
823 0.24
824 0.23
825 0.21
826 0.19
827 0.16
828 0.14
829 0.09
830 0.08
831 0.08
832 0.07
833 0.07
834 0.06
835 0.05
836 0.06
837 0.06
838 0.07
839 0.08
840 0.09
841 0.1
842 0.1
843 0.11
844 0.11
845 0.11
846 0.15
847 0.14
848 0.15
849 0.15
850 0.18
851 0.18
852 0.19
853 0.18
854 0.15
855 0.15
856 0.13
857 0.12
858 0.09
859 0.08
860 0.07
861 0.07
862 0.07
863 0.07
864 0.07
865 0.07
866 0.08
867 0.1
868 0.11
869 0.11
870 0.12
871 0.13
872 0.15
873 0.16
874 0.16
875 0.16
876 0.15
877 0.15
878 0.13
879 0.12
880 0.1
881 0.14
882 0.15
883 0.15
884 0.2
885 0.23
886 0.25
887 0.29
888 0.34
889 0.4
890 0.44
891 0.44
892 0.48
893 0.55
894 0.6
895 0.61
896 0.58
897 0.54
898 0.52
899 0.53
900 0.47
901 0.4
902 0.39
903 0.34
904 0.31
905 0.26
906 0.21
907 0.19
908 0.16
909 0.13
910 0.08
911 0.07
912 0.1
913 0.09
914 0.1
915 0.11
916 0.13
917 0.16
918 0.17
919 0.22
920 0.21
921 0.23
922 0.22
923 0.23
924 0.26
925 0.32
926 0.38
927 0.34
928 0.36
929 0.36
930 0.41
931 0.4
932 0.37
933 0.3
934 0.25
935 0.27
936 0.23
937 0.23
938 0.18
939 0.17
940 0.2
941 0.18
942 0.16
943 0.13
944 0.12
945 0.1
946 0.1
947 0.09
948 0.06
949 0.07
950 0.07
951 0.08
952 0.09
953 0.11
954 0.12
955 0.17
956 0.26
957 0.32
958 0.37
959 0.46
960 0.53
961 0.61
962 0.71
963 0.75
964 0.73
965 0.75
966 0.78
967 0.78
968 0.75
969 0.67
970 0.58
971 0.51
972 0.45
973 0.41
974 0.34
975 0.25
976 0.23
977 0.21
978 0.2
979 0.19
980 0.18
981 0.15
982 0.19
983 0.23
984 0.28
985 0.28
986 0.28
987 0.34
988 0.35
989 0.36
990 0.33
991 0.27
992 0.2
993 0.19
994 0.19
995 0.13
996 0.13
997 0.1
998 0.08
999 0.07
1000 0.09
1001 0.13
1002 0.15
1003 0.18
1004 0.19
1005 0.2
1006 0.22
1007 0.23
1008 0.23
1009 0.26
1010 0.27
1011 0.28
1012 0.32
1013 0.33
1014 0.34
1015 0.34
1016 0.33
1017 0.3
1018 0.32
1019 0.31
1020 0.27
1021 0.29
1022 0.3
1023 0.34
1024 0.34
1025 0.34
1026 0.31
1027 0.29
1028 0.3
1029 0.26
1030 0.24
1031 0.21
1032 0.18
1033 0.16
1034 0.15
1035 0.14
1036 0.12
1037 0.12
1038 0.12
1039 0.09
1040 0.1
1041 0.12
1042 0.17
1043 0.21
1044 0.25
1045 0.29
1046 0.36
1047 0.4
1048 0.43
1049 0.49
1050 0.48
1051 0.45
1052 0.45
1053 0.43
1054 0.41
1055 0.4
1056 0.4
1057 0.34
1058 0.34
1059 0.32
1060 0.31
1061 0.32
1062 0.31
1063 0.3
1064 0.28
1065 0.3
1066 0.3
1067 0.3
1068 0.28
1069 0.25
1070 0.29
1071 0.29
1072 0.26
1073 0.22
1074 0.2
1075 0.2
1076 0.19
1077 0.22
1078 0.15
1079 0.14
1080 0.15
1081 0.15
1082 0.14
1083 0.17
1084 0.24
1085 0.25
1086 0.3
1087 0.33
1088 0.34
1089 0.39
1090 0.43
1091 0.49
1092 0.47
1093 0.49
1094 0.48
1095 0.5
1096 0.51
1097 0.53
1098 0.52
1099 0.49
1100 0.45
1101 0.38
1102 0.37
1103 0.34
1104 0.31
1105 0.25
1106 0.26
1107 0.23
1108 0.26
1109 0.28
1110 0.26
1111 0.24
1112 0.25
1113 0.24
1114 0.21
1115 0.2
1116 0.16
1117 0.16
1118 0.19
1119 0.18
1120 0.16
1121 0.16
1122 0.16