Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A1DMH0

Protein Details
Accession A1DMH0    Localization Confidence High Confidence Score 24
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-22MSATPGTRRHRHTSRNDRTSTTHydrophilic
90-116LTDARVRYQKERARKRRRANGETPGAEHydrophilic
198-217AAELRSRRTRRRRGDDEGDQBasic
378-401TTVPGPPSRGRRNRIRCVKCPVCSHydrophilic
435-455LDAHGNPRRRPREGRKSGITVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
99-108KERARKRRRA
205-209RTRRR
442-449RRRPREGR
Subcellular Location(s) nucl 21, mito 3, cyto 3, cyto_mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR026846  Nse2(Mms21)  
IPR004181  Znf_MIZ  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0030915  C:Smc5-Smc6 complex  
GO:0019789  F:SUMO transferase activity  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0000724  P:double-strand break repair via homologous recombination  
GO:0016925  P:protein sumoylation  
KEGG nfi:NFIA_053370  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF11789  zf-Nse  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51044  ZF_SP_RING  
CDD cd16651  SPL-RING_NSE2  
Amino Acid Sequences MSATPGTRRHRHTSRNDRTSTTANRHTQAPSRASTPPLPAYEPPIAPLNAAGHNAIIALLNAPSLRQLKTHIQRAEETLTDSAGEVNERLTDARVRYQKERARKRRRANGETPGAEGVGAKQEEGEDDNEDDDDGDDGDEINRLARLEEQVQSVTEELEARMRQTIDAEVKLEGLKGVLADMAKEAEEATIAGAGAGAAELRSRRTRRRRGDDEGDQDPEEEGDEDYEATPEPQMTGIPPSRRLDQKLDEESARWTSQSLTQRYSTNNAYIGFYRIVHDAKHPGDDIPPLPHASTWFAHMEDPHATTTSTTDQTSARRTRQRRSPSPADSDEIAIERERISLKCPLTLLPFRDPVTSTKCPHSFEREAITDMIAHSSTTVPGPPSRGRRNRIRCVKCPVCSIVLTAEDLRSDPVLLRRVRRAEAASQREAEDDELDAHGNPRRRPREGRKSGITVASDDDSEEGGTTYQEPTDAAIRIKQERLSQAQGALSDEVDDDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.84
2 0.86
3 0.83
4 0.78
5 0.73
6 0.72
7 0.69
8 0.67
9 0.65
10 0.61
11 0.59
12 0.59
13 0.59
14 0.58
15 0.57
16 0.54
17 0.47
18 0.45
19 0.46
20 0.47
21 0.46
22 0.44
23 0.41
24 0.39
25 0.4
26 0.37
27 0.4
28 0.41
29 0.37
30 0.33
31 0.32
32 0.3
33 0.26
34 0.26
35 0.23
36 0.2
37 0.21
38 0.19
39 0.14
40 0.14
41 0.13
42 0.11
43 0.08
44 0.06
45 0.06
46 0.05
47 0.06
48 0.06
49 0.06
50 0.11
51 0.13
52 0.14
53 0.14
54 0.2
55 0.3
56 0.39
57 0.48
58 0.47
59 0.48
60 0.49
61 0.53
62 0.51
63 0.42
64 0.36
65 0.27
66 0.24
67 0.2
68 0.18
69 0.14
70 0.11
71 0.1
72 0.08
73 0.08
74 0.08
75 0.08
76 0.09
77 0.1
78 0.14
79 0.15
80 0.23
81 0.29
82 0.33
83 0.38
84 0.47
85 0.52
86 0.59
87 0.68
88 0.71
89 0.77
90 0.82
91 0.87
92 0.88
93 0.92
94 0.91
95 0.88
96 0.87
97 0.84
98 0.75
99 0.67
100 0.57
101 0.46
102 0.36
103 0.28
104 0.18
105 0.15
106 0.13
107 0.11
108 0.1
109 0.1
110 0.11
111 0.13
112 0.14
113 0.1
114 0.1
115 0.11
116 0.11
117 0.11
118 0.1
119 0.08
120 0.07
121 0.06
122 0.05
123 0.05
124 0.05
125 0.05
126 0.06
127 0.05
128 0.05
129 0.06
130 0.06
131 0.07
132 0.08
133 0.11
134 0.13
135 0.15
136 0.16
137 0.16
138 0.16
139 0.17
140 0.15
141 0.13
142 0.1
143 0.09
144 0.07
145 0.11
146 0.11
147 0.11
148 0.13
149 0.13
150 0.13
151 0.13
152 0.17
153 0.16
154 0.17
155 0.17
156 0.15
157 0.15
158 0.15
159 0.14
160 0.1
161 0.07
162 0.06
163 0.05
164 0.05
165 0.05
166 0.05
167 0.05
168 0.05
169 0.06
170 0.05
171 0.05
172 0.05
173 0.04
174 0.04
175 0.04
176 0.04
177 0.04
178 0.04
179 0.03
180 0.03
181 0.03
182 0.03
183 0.03
184 0.02
185 0.02
186 0.03
187 0.04
188 0.07
189 0.14
190 0.18
191 0.28
192 0.39
193 0.49
194 0.59
195 0.69
196 0.74
197 0.76
198 0.8
199 0.78
200 0.73
201 0.66
202 0.58
203 0.47
204 0.4
205 0.31
206 0.23
207 0.15
208 0.1
209 0.07
210 0.05
211 0.05
212 0.05
213 0.05
214 0.05
215 0.05
216 0.05
217 0.05
218 0.04
219 0.05
220 0.04
221 0.04
222 0.05
223 0.09
224 0.12
225 0.14
226 0.18
227 0.2
228 0.24
229 0.27
230 0.29
231 0.3
232 0.31
233 0.36
234 0.36
235 0.36
236 0.32
237 0.3
238 0.29
239 0.26
240 0.21
241 0.15
242 0.12
243 0.11
244 0.17
245 0.23
246 0.24
247 0.24
248 0.26
249 0.28
250 0.29
251 0.32
252 0.27
253 0.21
254 0.21
255 0.19
256 0.18
257 0.17
258 0.18
259 0.15
260 0.13
261 0.13
262 0.13
263 0.13
264 0.12
265 0.14
266 0.16
267 0.16
268 0.18
269 0.17
270 0.15
271 0.16
272 0.17
273 0.17
274 0.14
275 0.14
276 0.14
277 0.13
278 0.13
279 0.13
280 0.14
281 0.13
282 0.14
283 0.14
284 0.13
285 0.14
286 0.14
287 0.15
288 0.13
289 0.14
290 0.12
291 0.12
292 0.11
293 0.11
294 0.13
295 0.14
296 0.14
297 0.13
298 0.13
299 0.15
300 0.18
301 0.25
302 0.29
303 0.33
304 0.4
305 0.45
306 0.52
307 0.6
308 0.68
309 0.69
310 0.73
311 0.74
312 0.71
313 0.73
314 0.68
315 0.61
316 0.51
317 0.43
318 0.35
319 0.26
320 0.21
321 0.14
322 0.12
323 0.09
324 0.1
325 0.11
326 0.11
327 0.13
328 0.19
329 0.19
330 0.21
331 0.21
332 0.21
333 0.26
334 0.3
335 0.32
336 0.29
337 0.32
338 0.32
339 0.32
340 0.32
341 0.3
342 0.33
343 0.35
344 0.33
345 0.38
346 0.4
347 0.42
348 0.44
349 0.49
350 0.44
351 0.41
352 0.44
353 0.38
354 0.37
355 0.34
356 0.3
357 0.22
358 0.19
359 0.17
360 0.11
361 0.09
362 0.08
363 0.08
364 0.09
365 0.09
366 0.1
367 0.1
368 0.12
369 0.17
370 0.23
371 0.32
372 0.42
373 0.5
374 0.56
375 0.65
376 0.73
377 0.79
378 0.83
379 0.83
380 0.8
381 0.81
382 0.82
383 0.75
384 0.71
385 0.63
386 0.56
387 0.48
388 0.42
389 0.34
390 0.27
391 0.25
392 0.2
393 0.18
394 0.14
395 0.14
396 0.14
397 0.11
398 0.11
399 0.11
400 0.15
401 0.22
402 0.26
403 0.31
404 0.37
405 0.41
406 0.43
407 0.45
408 0.44
409 0.46
410 0.52
411 0.55
412 0.51
413 0.48
414 0.47
415 0.43
416 0.4
417 0.32
418 0.23
419 0.16
420 0.13
421 0.12
422 0.12
423 0.12
424 0.14
425 0.17
426 0.22
427 0.27
428 0.36
429 0.42
430 0.49
431 0.59
432 0.68
433 0.75
434 0.79
435 0.83
436 0.8
437 0.79
438 0.77
439 0.71
440 0.62
441 0.52
442 0.45
443 0.37
444 0.29
445 0.23
446 0.19
447 0.14
448 0.13
449 0.11
450 0.09
451 0.07
452 0.08
453 0.09
454 0.09
455 0.09
456 0.09
457 0.09
458 0.1
459 0.14
460 0.16
461 0.17
462 0.19
463 0.25
464 0.29
465 0.33
466 0.35
467 0.37
468 0.42
469 0.46
470 0.49
471 0.46
472 0.44
473 0.43
474 0.4
475 0.36
476 0.3
477 0.23
478 0.18