Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A370TBI1

Protein Details
Accession A0A370TBI1    Localization Confidence High Confidence Score 19.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
78-109VPQFIRKSKPADPLRPRQKPRQKLVLQKLPPGHydrophilic
587-612ESSGNESVRKKHKKKHGTPQPSGTSTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
83-126RKSKPADPLRPRQKPRQKLVLQKLPPGAPGPKPKGPGAPARPGP
491-499KLGKKVRKA
536-583RRKDEEAKAKSKLPSGASSKGTNTPSGRPKHTDPLKKAKNALKRSGSP
592-602ESVRKKHKKKH
678-695GKKKKVKLRLNASPAGSR
Subcellular Location(s) nucl 19.5, mito_nucl 10.5, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR008851  TFIIF-alpha  
IPR011039  TFIIF_interaction  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0032968  P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II  
GO:0006367  P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter  
Pfam View protein in Pfam  
PF05793  TFIIF_alpha  
Amino Acid Sequences MSVWQSPSLHEGNLSKEHSSAGDSVLGVAFIAPRTLFPSAPTTLDSLCNRDSAYILFIMSASPSGQSNGRTPTPGSGVPQFIRKSKPADPLRPRQKPRQKLVLQKLPPGAPGPKPKGPGAPARPGPARQYPVNGTAPQKPQSGSQPSTINGANAPKSHGGWTNAPTGPYQDFPLYTTKRALREGIRHHISRFATKKDIDPVNQDEFTRPVVLHRRDPRQPPPGKAAKEEELAPDELMDSKEREKLEIMKAEKEARRAADLAQIAPTGNNAAALAAKKTQSFRNEKTTQVYRLDKTEEQKKASDLRYEEALPWHLEDADNKNTWVGNYEAALSHTNVIFVIDGSRFLMIPIEKWYKFTAKNQFKTLTIEEAEAQLNKKTREPRWVMRDNEKKGAEVGPMHKLFTVKSESKTFLNASKGERQDMDDLDFAESDLFQDDDEQPTLEPDHDEESKEAQTKIKREQLGANFFGQANEVEVERELEQEEKDTEQQRKLGKKVRKALTRRERNLIYESDSDHPYSETSEDDTSDEEKQKEIDRRKDEEAKAKSKLPSGASSKGTNTPSGRPKHTDPLKKAKNALKRSGSPNLSESSGNESVRKKHKKKHGTPQPSGTSTPVPGSRPMSPAPSGSQPGQSQRRSSVVKLNVNPSKLTEIQAAPPNPSHGGSMSDGEATGGEMSDGGKKKKVKLRLNASPAGSRAGSPDPARARSIGAGGSRAGSPSTAPDTSRAQSPGAGPIQPHEIAAALPPSGILIGELMKRFAGRVGDGPGQTPKKDFIQLVKVNSKYGPDRILRPK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.3
3 0.29
4 0.29
5 0.26
6 0.26
7 0.22
8 0.17
9 0.16
10 0.15
11 0.16
12 0.15
13 0.14
14 0.1
15 0.1
16 0.09
17 0.07
18 0.08
19 0.07
20 0.08
21 0.12
22 0.15
23 0.14
24 0.16
25 0.21
26 0.22
27 0.23
28 0.24
29 0.22
30 0.22
31 0.29
32 0.28
33 0.28
34 0.27
35 0.27
36 0.26
37 0.24
38 0.24
39 0.18
40 0.18
41 0.14
42 0.13
43 0.12
44 0.11
45 0.11
46 0.1
47 0.09
48 0.07
49 0.07
50 0.08
51 0.1
52 0.13
53 0.15
54 0.2
55 0.25
56 0.26
57 0.28
58 0.28
59 0.3
60 0.32
61 0.32
62 0.31
63 0.3
64 0.33
65 0.33
66 0.39
67 0.38
68 0.39
69 0.42
70 0.42
71 0.44
72 0.46
73 0.54
74 0.57
75 0.64
76 0.69
77 0.74
78 0.81
79 0.85
80 0.85
81 0.86
82 0.87
83 0.87
84 0.86
85 0.86
86 0.83
87 0.84
88 0.87
89 0.87
90 0.8
91 0.77
92 0.73
93 0.63
94 0.57
95 0.5
96 0.44
97 0.41
98 0.46
99 0.47
100 0.47
101 0.49
102 0.5
103 0.52
104 0.52
105 0.55
106 0.51
107 0.54
108 0.52
109 0.55
110 0.56
111 0.52
112 0.54
113 0.51
114 0.5
115 0.42
116 0.44
117 0.42
118 0.44
119 0.46
120 0.44
121 0.4
122 0.42
123 0.46
124 0.44
125 0.43
126 0.38
127 0.37
128 0.42
129 0.47
130 0.41
131 0.4
132 0.4
133 0.38
134 0.4
135 0.37
136 0.29
137 0.23
138 0.25
139 0.23
140 0.21
141 0.23
142 0.22
143 0.22
144 0.24
145 0.27
146 0.26
147 0.28
148 0.3
149 0.34
150 0.33
151 0.33
152 0.3
153 0.28
154 0.26
155 0.23
156 0.23
157 0.17
158 0.16
159 0.17
160 0.26
161 0.26
162 0.26
163 0.31
164 0.33
165 0.35
166 0.37
167 0.4
168 0.38
169 0.43
170 0.49
171 0.52
172 0.54
173 0.52
174 0.51
175 0.53
176 0.48
177 0.48
178 0.46
179 0.41
180 0.41
181 0.41
182 0.44
183 0.45
184 0.48
185 0.41
186 0.42
187 0.43
188 0.42
189 0.42
190 0.39
191 0.33
192 0.29
193 0.28
194 0.23
195 0.18
196 0.18
197 0.27
198 0.3
199 0.37
200 0.44
201 0.5
202 0.56
203 0.64
204 0.66
205 0.67
206 0.69
207 0.65
208 0.66
209 0.66
210 0.62
211 0.59
212 0.55
213 0.48
214 0.44
215 0.41
216 0.34
217 0.28
218 0.27
219 0.22
220 0.17
221 0.14
222 0.13
223 0.13
224 0.12
225 0.11
226 0.11
227 0.16
228 0.16
229 0.17
230 0.18
231 0.22
232 0.26
233 0.32
234 0.32
235 0.31
236 0.34
237 0.4
238 0.4
239 0.38
240 0.36
241 0.3
242 0.3
243 0.27
244 0.26
245 0.24
246 0.23
247 0.2
248 0.18
249 0.17
250 0.14
251 0.13
252 0.13
253 0.08
254 0.06
255 0.06
256 0.05
257 0.05
258 0.06
259 0.07
260 0.08
261 0.09
262 0.1
263 0.12
264 0.14
265 0.19
266 0.26
267 0.33
268 0.37
269 0.44
270 0.46
271 0.47
272 0.51
273 0.51
274 0.48
275 0.47
276 0.47
277 0.39
278 0.39
279 0.41
280 0.38
281 0.39
282 0.43
283 0.41
284 0.39
285 0.39
286 0.39
287 0.41
288 0.4
289 0.4
290 0.32
291 0.29
292 0.29
293 0.28
294 0.26
295 0.22
296 0.21
297 0.16
298 0.15
299 0.13
300 0.11
301 0.1
302 0.12
303 0.15
304 0.18
305 0.18
306 0.17
307 0.18
308 0.17
309 0.17
310 0.16
311 0.12
312 0.09
313 0.08
314 0.09
315 0.09
316 0.1
317 0.11
318 0.1
319 0.1
320 0.09
321 0.09
322 0.08
323 0.08
324 0.06
325 0.05
326 0.06
327 0.05
328 0.05
329 0.06
330 0.06
331 0.06
332 0.06
333 0.08
334 0.06
335 0.07
336 0.13
337 0.18
338 0.18
339 0.2
340 0.22
341 0.24
342 0.27
343 0.33
344 0.38
345 0.42
346 0.46
347 0.49
348 0.49
349 0.45
350 0.47
351 0.41
352 0.33
353 0.24
354 0.21
355 0.17
356 0.17
357 0.16
358 0.13
359 0.12
360 0.12
361 0.14
362 0.14
363 0.18
364 0.23
365 0.26
366 0.34
367 0.4
368 0.44
369 0.5
370 0.57
371 0.57
372 0.61
373 0.67
374 0.61
375 0.62
376 0.55
377 0.46
378 0.39
379 0.37
380 0.28
381 0.22
382 0.2
383 0.2
384 0.2
385 0.2
386 0.19
387 0.18
388 0.17
389 0.17
390 0.21
391 0.17
392 0.19
393 0.22
394 0.23
395 0.23
396 0.25
397 0.23
398 0.21
399 0.22
400 0.22
401 0.22
402 0.27
403 0.28
404 0.27
405 0.26
406 0.25
407 0.24
408 0.22
409 0.21
410 0.15
411 0.14
412 0.13
413 0.13
414 0.11
415 0.08
416 0.07
417 0.05
418 0.05
419 0.04
420 0.04
421 0.06
422 0.06
423 0.08
424 0.08
425 0.08
426 0.08
427 0.08
428 0.09
429 0.08
430 0.07
431 0.07
432 0.1
433 0.1
434 0.11
435 0.11
436 0.13
437 0.15
438 0.17
439 0.17
440 0.18
441 0.21
442 0.25
443 0.3
444 0.35
445 0.34
446 0.34
447 0.4
448 0.42
449 0.44
450 0.41
451 0.36
452 0.3
453 0.29
454 0.27
455 0.21
456 0.14
457 0.09
458 0.08
459 0.07
460 0.06
461 0.06
462 0.08
463 0.07
464 0.08
465 0.07
466 0.08
467 0.08
468 0.09
469 0.1
470 0.1
471 0.14
472 0.19
473 0.22
474 0.23
475 0.28
476 0.32
477 0.37
478 0.42
479 0.47
480 0.49
481 0.54
482 0.61
483 0.65
484 0.68
485 0.69
486 0.74
487 0.76
488 0.8
489 0.75
490 0.73
491 0.66
492 0.6
493 0.58
494 0.49
495 0.42
496 0.33
497 0.32
498 0.28
499 0.27
500 0.24
501 0.2
502 0.19
503 0.14
504 0.14
505 0.12
506 0.09
507 0.11
508 0.11
509 0.11
510 0.11
511 0.12
512 0.13
513 0.16
514 0.19
515 0.16
516 0.16
517 0.18
518 0.23
519 0.3
520 0.37
521 0.43
522 0.46
523 0.51
524 0.57
525 0.64
526 0.62
527 0.64
528 0.63
529 0.6
530 0.56
531 0.56
532 0.52
533 0.47
534 0.46
535 0.4
536 0.39
537 0.38
538 0.41
539 0.39
540 0.38
541 0.37
542 0.39
543 0.37
544 0.35
545 0.32
546 0.34
547 0.39
548 0.43
549 0.45
550 0.44
551 0.47
552 0.53
553 0.59
554 0.61
555 0.61
556 0.67
557 0.7
558 0.69
559 0.72
560 0.69
561 0.7
562 0.68
563 0.7
564 0.66
565 0.64
566 0.66
567 0.67
568 0.62
569 0.54
570 0.49
571 0.42
572 0.37
573 0.31
574 0.26
575 0.25
576 0.27
577 0.25
578 0.27
579 0.28
580 0.34
581 0.44
582 0.54
583 0.54
584 0.59
585 0.69
586 0.76
587 0.83
588 0.87
589 0.88
590 0.87
591 0.87
592 0.87
593 0.83
594 0.75
595 0.67
596 0.58
597 0.49
598 0.4
599 0.36
600 0.3
601 0.25
602 0.25
603 0.27
604 0.27
605 0.28
606 0.29
607 0.29
608 0.28
609 0.28
610 0.27
611 0.28
612 0.28
613 0.26
614 0.3
615 0.29
616 0.36
617 0.43
618 0.43
619 0.42
620 0.42
621 0.47
622 0.46
623 0.46
624 0.46
625 0.46
626 0.51
627 0.52
628 0.58
629 0.56
630 0.54
631 0.52
632 0.45
633 0.42
634 0.35
635 0.33
636 0.28
637 0.25
638 0.29
639 0.36
640 0.35
641 0.31
642 0.31
643 0.32
644 0.28
645 0.28
646 0.23
647 0.17
648 0.19
649 0.18
650 0.19
651 0.17
652 0.15
653 0.14
654 0.13
655 0.12
656 0.09
657 0.08
658 0.06
659 0.05
660 0.05
661 0.06
662 0.12
663 0.17
664 0.19
665 0.25
666 0.29
667 0.38
668 0.45
669 0.55
670 0.58
671 0.64
672 0.72
673 0.76
674 0.8
675 0.77
676 0.73
677 0.66
678 0.57
679 0.5
680 0.41
681 0.31
682 0.27
683 0.24
684 0.26
685 0.23
686 0.3
687 0.32
688 0.34
689 0.36
690 0.33
691 0.32
692 0.29
693 0.29
694 0.25
695 0.21
696 0.2
697 0.18
698 0.19
699 0.17
700 0.16
701 0.15
702 0.11
703 0.1
704 0.13
705 0.18
706 0.18
707 0.19
708 0.22
709 0.26
710 0.28
711 0.33
712 0.3
713 0.26
714 0.27
715 0.28
716 0.32
717 0.29
718 0.29
719 0.24
720 0.25
721 0.29
722 0.26
723 0.25
724 0.18
725 0.15
726 0.14
727 0.16
728 0.15
729 0.09
730 0.09
731 0.09
732 0.08
733 0.08
734 0.08
735 0.06
736 0.05
737 0.08
738 0.12
739 0.13
740 0.14
741 0.14
742 0.15
743 0.15
744 0.17
745 0.17
746 0.16
747 0.19
748 0.24
749 0.29
750 0.3
751 0.32
752 0.38
753 0.39
754 0.38
755 0.37
756 0.35
757 0.34
758 0.39
759 0.4
760 0.38
761 0.45
762 0.49
763 0.55
764 0.6
765 0.56
766 0.53
767 0.52
768 0.5
769 0.44
770 0.43
771 0.43
772 0.39