Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A1DCN9

Protein Details
Accession A1DCN9    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
537-557DLSENRRKRRRIERHMVSRGSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
542-547RRKRRR
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 14, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039601  Rrn5  
IPR001005  SANT/Myb  
Gene Ontology GO:0000500  C:RNA polymerase I upstream activating factor complex  
GO:0042790  P:nucleolar large rRNA transcription by RNA polymerase I  
KEGG nfi:NFIA_026730  -  
CDD cd00167  SANT  
Amino Acid Sequences MSSSSVYEPDEDEEASDSDIESRYSGTKFSASSLPIDDFERLGSTEPEDEDTPEVIPRATRGTRAQILDTLRTSLGIGCVDAYSVELAGTANNTSSSAVGRENYNPTQNGVAIWTSQEKEILFSMLDRKGANGVAEIAQAIGSKSELEVQEHLKLLHRGLERQHVRDSHSRTIVLGEVPAALEISQECCKALDDYAELLALEEQRAEDVVGRKLHQNVWIVDREVAEMVEEQLEERDETPLPGSSVYVTAEIFNINKWIRLSERFFMNAGGPRLEDNWVNVACADETPSITADALADFYALAVSVTRRLVHSTLFFAMSRLRNMRETGNRKARIVRSRDVKTALNVLNMPQDRFDFWVGLARRCSLQVADLRHKKGWQSELMDYDEVEDILSGKVPVDESLDARSASRRRSESHAPHDTVEEDDDDVSDVYSYASSILSSPEMTPIDEPSVNLEEEHAEEIDQLNNASEEMRLWNLMGQPAPSGMSSLASNTEQGSKLRKPIGERKTKEDLVNWRDRTLYRSDWEEYGHEVHDLYEDLSENRRKRRRIERHMVSRGSPVSVASDRDHEMSGNDDSQGPRHHAVKNDLRADDDRDSDGAIQIEETNDAMDIEGSIHEETGSAGSGDSKMDVETNPLDQGPSQDFDQEGMEYGSNEEPAPDSELSDGEQKHPPSSWEPEVDATASEQQDSVPTSKGVAVAVDTSEQFDIEVAYDSDSDATSGAESGSDQKQHRPAQNQGGVPVIELAGPSIKHENLHFDHDSNSEPEQAPFSDPQSDEGNDDLDWKPSIHSQFETKNERIHASEDTVPVVKEENVKFSQSQDSESEYETDSRVESDEEGKPRAHLRAPSQPAIRPERRLRGTDSDSYLDSDDSDSDEGSSTRPQRGVKLEPDMHKQSASGADLDSESGSSFDDDTKDKDERYKNENEDDVSSGSDDDLPYDRYQNRDDSYSSSEDGDEKSNLPLHSQPMSPVV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.15
3 0.14
4 0.11
5 0.12
6 0.13
7 0.13
8 0.11
9 0.12
10 0.14
11 0.15
12 0.16
13 0.16
14 0.18
15 0.18
16 0.22
17 0.25
18 0.23
19 0.25
20 0.27
21 0.27
22 0.25
23 0.27
24 0.25
25 0.2
26 0.19
27 0.18
28 0.15
29 0.15
30 0.15
31 0.15
32 0.17
33 0.18
34 0.21
35 0.2
36 0.21
37 0.21
38 0.2
39 0.19
40 0.18
41 0.17
42 0.14
43 0.14
44 0.14
45 0.19
46 0.2
47 0.24
48 0.28
49 0.35
50 0.41
51 0.43
52 0.44
53 0.41
54 0.44
55 0.43
56 0.4
57 0.34
58 0.28
59 0.26
60 0.24
61 0.2
62 0.18
63 0.13
64 0.12
65 0.1
66 0.1
67 0.1
68 0.09
69 0.09
70 0.07
71 0.06
72 0.06
73 0.05
74 0.05
75 0.06
76 0.07
77 0.07
78 0.07
79 0.07
80 0.08
81 0.08
82 0.09
83 0.1
84 0.1
85 0.12
86 0.13
87 0.16
88 0.2
89 0.27
90 0.3
91 0.34
92 0.33
93 0.33
94 0.34
95 0.31
96 0.27
97 0.22
98 0.19
99 0.14
100 0.15
101 0.18
102 0.16
103 0.17
104 0.18
105 0.16
106 0.17
107 0.18
108 0.17
109 0.13
110 0.14
111 0.19
112 0.19
113 0.21
114 0.19
115 0.19
116 0.2
117 0.21
118 0.2
119 0.15
120 0.14
121 0.13
122 0.13
123 0.12
124 0.1
125 0.09
126 0.09
127 0.08
128 0.06
129 0.06
130 0.06
131 0.06
132 0.11
133 0.12
134 0.14
135 0.17
136 0.2
137 0.23
138 0.24
139 0.24
140 0.24
141 0.25
142 0.23
143 0.27
144 0.27
145 0.27
146 0.3
147 0.4
148 0.4
149 0.42
150 0.48
151 0.43
152 0.47
153 0.51
154 0.54
155 0.52
156 0.5
157 0.47
158 0.4
159 0.4
160 0.36
161 0.28
162 0.21
163 0.13
164 0.1
165 0.1
166 0.09
167 0.08
168 0.06
169 0.06
170 0.06
171 0.09
172 0.11
173 0.11
174 0.11
175 0.12
176 0.13
177 0.14
178 0.14
179 0.13
180 0.12
181 0.13
182 0.13
183 0.13
184 0.12
185 0.11
186 0.11
187 0.09
188 0.08
189 0.07
190 0.07
191 0.07
192 0.07
193 0.07
194 0.1
195 0.12
196 0.18
197 0.2
198 0.21
199 0.25
200 0.27
201 0.3
202 0.31
203 0.32
204 0.3
205 0.32
206 0.34
207 0.32
208 0.31
209 0.29
210 0.24
211 0.2
212 0.17
213 0.13
214 0.1
215 0.09
216 0.08
217 0.07
218 0.07
219 0.07
220 0.08
221 0.08
222 0.08
223 0.1
224 0.09
225 0.1
226 0.11
227 0.12
228 0.11
229 0.11
230 0.11
231 0.09
232 0.1
233 0.1
234 0.1
235 0.09
236 0.09
237 0.09
238 0.1
239 0.09
240 0.08
241 0.13
242 0.12
243 0.15
244 0.15
245 0.16
246 0.19
247 0.25
248 0.3
249 0.28
250 0.31
251 0.3
252 0.3
253 0.29
254 0.29
255 0.27
256 0.24
257 0.21
258 0.18
259 0.17
260 0.18
261 0.19
262 0.16
263 0.12
264 0.16
265 0.15
266 0.15
267 0.14
268 0.14
269 0.12
270 0.12
271 0.13
272 0.09
273 0.09
274 0.09
275 0.1
276 0.1
277 0.09
278 0.09
279 0.07
280 0.06
281 0.06
282 0.05
283 0.05
284 0.04
285 0.04
286 0.04
287 0.04
288 0.03
289 0.03
290 0.04
291 0.06
292 0.08
293 0.08
294 0.09
295 0.12
296 0.13
297 0.14
298 0.15
299 0.16
300 0.16
301 0.17
302 0.17
303 0.15
304 0.19
305 0.19
306 0.22
307 0.22
308 0.23
309 0.23
310 0.25
311 0.31
312 0.35
313 0.4
314 0.46
315 0.53
316 0.53
317 0.53
318 0.58
319 0.59
320 0.58
321 0.58
322 0.55
323 0.54
324 0.55
325 0.57
326 0.54
327 0.48
328 0.41
329 0.42
330 0.36
331 0.29
332 0.25
333 0.22
334 0.26
335 0.25
336 0.24
337 0.17
338 0.17
339 0.16
340 0.18
341 0.18
342 0.11
343 0.1
344 0.17
345 0.18
346 0.2
347 0.2
348 0.19
349 0.19
350 0.19
351 0.19
352 0.12
353 0.15
354 0.16
355 0.22
356 0.3
357 0.36
358 0.39
359 0.39
360 0.41
361 0.39
362 0.39
363 0.37
364 0.33
365 0.31
366 0.31
367 0.33
368 0.34
369 0.31
370 0.26
371 0.23
372 0.18
373 0.13
374 0.1
375 0.07
376 0.05
377 0.05
378 0.06
379 0.04
380 0.04
381 0.05
382 0.05
383 0.05
384 0.07
385 0.08
386 0.08
387 0.1
388 0.11
389 0.11
390 0.11
391 0.16
392 0.17
393 0.19
394 0.24
395 0.24
396 0.26
397 0.32
398 0.41
399 0.44
400 0.5
401 0.54
402 0.5
403 0.49
404 0.47
405 0.41
406 0.32
407 0.25
408 0.16
409 0.09
410 0.08
411 0.07
412 0.07
413 0.06
414 0.05
415 0.04
416 0.04
417 0.04
418 0.04
419 0.04
420 0.04
421 0.04
422 0.04
423 0.04
424 0.05
425 0.05
426 0.06
427 0.06
428 0.08
429 0.09
430 0.09
431 0.09
432 0.09
433 0.11
434 0.11
435 0.11
436 0.11
437 0.12
438 0.12
439 0.11
440 0.1
441 0.09
442 0.09
443 0.1
444 0.07
445 0.05
446 0.06
447 0.06
448 0.07
449 0.06
450 0.05
451 0.05
452 0.05
453 0.05
454 0.05
455 0.04
456 0.04
457 0.05
458 0.05
459 0.05
460 0.05
461 0.07
462 0.07
463 0.08
464 0.08
465 0.08
466 0.07
467 0.08
468 0.08
469 0.06
470 0.06
471 0.05
472 0.06
473 0.05
474 0.06
475 0.07
476 0.06
477 0.07
478 0.07
479 0.09
480 0.09
481 0.1
482 0.15
483 0.15
484 0.19
485 0.22
486 0.23
487 0.27
488 0.35
489 0.44
490 0.49
491 0.5
492 0.53
493 0.56
494 0.58
495 0.53
496 0.49
497 0.48
498 0.45
499 0.52
500 0.45
501 0.39
502 0.38
503 0.37
504 0.35
505 0.31
506 0.27
507 0.19
508 0.22
509 0.23
510 0.22
511 0.23
512 0.21
513 0.18
514 0.16
515 0.15
516 0.11
517 0.1
518 0.09
519 0.09
520 0.08
521 0.06
522 0.06
523 0.06
524 0.07
525 0.11
526 0.17
527 0.21
528 0.3
529 0.36
530 0.39
531 0.47
532 0.58
533 0.65
534 0.69
535 0.77
536 0.77
537 0.81
538 0.85
539 0.79
540 0.68
541 0.61
542 0.51
543 0.4
544 0.3
545 0.2
546 0.16
547 0.15
548 0.16
549 0.13
550 0.15
551 0.15
552 0.16
553 0.16
554 0.13
555 0.12
556 0.12
557 0.13
558 0.11
559 0.1
560 0.11
561 0.11
562 0.13
563 0.14
564 0.15
565 0.16
566 0.19
567 0.21
568 0.24
569 0.31
570 0.36
571 0.42
572 0.43
573 0.41
574 0.4
575 0.39
576 0.39
577 0.34
578 0.28
579 0.21
580 0.17
581 0.17
582 0.15
583 0.15
584 0.1
585 0.08
586 0.07
587 0.07
588 0.07
589 0.07
590 0.06
591 0.05
592 0.05
593 0.05
594 0.04
595 0.04
596 0.04
597 0.04
598 0.04
599 0.05
600 0.05
601 0.05
602 0.05
603 0.05
604 0.05
605 0.05
606 0.05
607 0.04
608 0.04
609 0.05
610 0.05
611 0.05
612 0.06
613 0.05
614 0.05
615 0.06
616 0.06
617 0.09
618 0.09
619 0.1
620 0.1
621 0.1
622 0.1
623 0.1
624 0.12
625 0.11
626 0.12
627 0.12
628 0.12
629 0.12
630 0.13
631 0.13
632 0.11
633 0.09
634 0.08
635 0.08
636 0.08
637 0.09
638 0.09
639 0.08
640 0.08
641 0.08
642 0.07
643 0.08
644 0.12
645 0.1
646 0.1
647 0.1
648 0.11
649 0.12
650 0.16
651 0.15
652 0.15
653 0.2
654 0.2
655 0.21
656 0.21
657 0.23
658 0.23
659 0.28
660 0.29
661 0.26
662 0.26
663 0.26
664 0.26
665 0.24
666 0.2
667 0.15
668 0.16
669 0.14
670 0.12
671 0.11
672 0.11
673 0.12
674 0.14
675 0.14
676 0.11
677 0.11
678 0.11
679 0.12
680 0.13
681 0.11
682 0.1
683 0.09
684 0.08
685 0.08
686 0.08
687 0.08
688 0.08
689 0.08
690 0.08
691 0.07
692 0.06
693 0.06
694 0.06
695 0.07
696 0.06
697 0.07
698 0.07
699 0.07
700 0.08
701 0.07
702 0.07
703 0.06
704 0.05
705 0.05
706 0.05
707 0.05
708 0.04
709 0.05
710 0.09
711 0.11
712 0.17
713 0.18
714 0.23
715 0.32
716 0.38
717 0.45
718 0.47
719 0.51
720 0.56
721 0.61
722 0.56
723 0.49
724 0.46
725 0.39
726 0.33
727 0.26
728 0.16
729 0.1
730 0.09
731 0.08
732 0.07
733 0.07
734 0.09
735 0.12
736 0.12
737 0.13
738 0.14
739 0.21
740 0.21
741 0.28
742 0.28
743 0.25
744 0.27
745 0.27
746 0.29
747 0.24
748 0.23
749 0.2
750 0.2
751 0.19
752 0.19
753 0.19
754 0.2
755 0.19
756 0.2
757 0.21
758 0.21
759 0.23
760 0.25
761 0.24
762 0.22
763 0.21
764 0.21
765 0.15
766 0.18
767 0.16
768 0.14
769 0.14
770 0.14
771 0.14
772 0.18
773 0.22
774 0.21
775 0.23
776 0.27
777 0.32
778 0.4
779 0.46
780 0.43
781 0.44
782 0.44
783 0.44
784 0.4
785 0.36
786 0.31
787 0.28
788 0.3
789 0.26
790 0.26
791 0.25
792 0.23
793 0.21
794 0.2
795 0.18
796 0.21
797 0.21
798 0.25
799 0.26
800 0.28
801 0.29
802 0.29
803 0.36
804 0.29
805 0.32
806 0.27
807 0.3
808 0.29
809 0.29
810 0.28
811 0.22
812 0.22
813 0.19
814 0.18
815 0.14
816 0.13
817 0.13
818 0.12
819 0.12
820 0.16
821 0.21
822 0.24
823 0.26
824 0.26
825 0.27
826 0.29
827 0.32
828 0.33
829 0.32
830 0.36
831 0.44
832 0.5
833 0.55
834 0.55
835 0.55
836 0.57
837 0.61
838 0.6
839 0.58
840 0.6
841 0.63
842 0.65
843 0.64
844 0.63
845 0.62
846 0.63
847 0.6
848 0.56
849 0.49
850 0.45
851 0.43
852 0.38
853 0.29
854 0.23
855 0.18
856 0.13
857 0.13
858 0.13
859 0.11
860 0.1
861 0.11
862 0.11
863 0.12
864 0.19
865 0.2
866 0.24
867 0.28
868 0.3
869 0.35
870 0.42
871 0.47
872 0.46
873 0.53
874 0.56
875 0.57
876 0.63
877 0.63
878 0.57
879 0.51
880 0.44
881 0.37
882 0.35
883 0.31
884 0.24
885 0.18
886 0.17
887 0.17
888 0.18
889 0.15
890 0.11
891 0.09
892 0.08
893 0.09
894 0.08
895 0.09
896 0.1
897 0.12
898 0.14
899 0.18
900 0.23
901 0.25
902 0.26
903 0.34
904 0.41
905 0.45
906 0.49
907 0.56
908 0.56
909 0.6
910 0.62
911 0.56
912 0.5
913 0.47
914 0.41
915 0.32
916 0.27
917 0.21
918 0.17
919 0.16
920 0.13
921 0.13
922 0.14
923 0.17
924 0.18
925 0.25
926 0.27
927 0.29
928 0.33
929 0.37
930 0.38
931 0.39
932 0.39
933 0.37
934 0.4
935 0.39
936 0.37
937 0.31
938 0.29
939 0.27
940 0.28
941 0.26
942 0.22
943 0.2
944 0.22
945 0.26
946 0.25
947 0.27
948 0.28
949 0.29
950 0.31
951 0.31