Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A370TW65

Protein Details
Accession A0A370TW65    Localization Confidence Low Confidence Score 7.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
30-49ANPCSSTKSKSKSIRCRESIHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cyto_nucl 13.333, cyto 11.5, nucl 11, cyto_mito 8.332
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034105  Lsm3  
IPR010920  LSM_dom_sf  
IPR047575  Sm  
IPR040002  Sm-like_LSM3  
IPR001163  Sm_dom_euk/arc  
Gene Ontology GO:0120114  C:Sm-like protein family complex  
GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF01423  LSM  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS52002  SM  
CDD cd01730  LSm3  
Amino Acid Sequences MVQLGSGEISWGRNGGSGAERNFLPSACVANPCSSTKSKSKSIRCRESIINAAGANNVALLPTPTHISISSAMADVEDGAAAPVSEPLDLVRLCLDEVVFVKLRGDRELKGRLHAYDSHCNLVLGDVQETVYVVEEDDDGDETVKKTIQKKSEMLFVRGKPARLLDLLFGIISADHPKATVLSSYLLKGFLEFEMNRAIRTLCNGDYILELLRQASAVKAEYKDLLEDGGYRHGLLRKREQLDLAKDPDPDPTTNNATNLQGRLETMAVSDMMRRVSPELPLSRNMLVGDSQWSGPS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.13
3 0.17
4 0.22
5 0.23
6 0.25
7 0.25
8 0.26
9 0.27
10 0.24
11 0.21
12 0.16
13 0.18
14 0.17
15 0.21
16 0.19
17 0.22
18 0.25
19 0.26
20 0.3
21 0.3
22 0.34
23 0.39
24 0.43
25 0.49
26 0.56
27 0.64
28 0.7
29 0.78
30 0.82
31 0.78
32 0.77
33 0.73
34 0.69
35 0.65
36 0.56
37 0.48
38 0.38
39 0.34
40 0.29
41 0.24
42 0.17
43 0.1
44 0.08
45 0.05
46 0.05
47 0.05
48 0.05
49 0.06
50 0.08
51 0.08
52 0.1
53 0.1
54 0.12
55 0.13
56 0.13
57 0.13
58 0.12
59 0.11
60 0.1
61 0.1
62 0.08
63 0.06
64 0.04
65 0.03
66 0.03
67 0.03
68 0.03
69 0.03
70 0.04
71 0.05
72 0.05
73 0.05
74 0.05
75 0.08
76 0.08
77 0.09
78 0.08
79 0.08
80 0.09
81 0.09
82 0.09
83 0.06
84 0.08
85 0.11
86 0.1
87 0.1
88 0.12
89 0.14
90 0.15
91 0.17
92 0.19
93 0.17
94 0.22
95 0.3
96 0.29
97 0.31
98 0.32
99 0.29
100 0.3
101 0.33
102 0.33
103 0.33
104 0.34
105 0.32
106 0.31
107 0.3
108 0.26
109 0.22
110 0.18
111 0.1
112 0.09
113 0.07
114 0.07
115 0.07
116 0.07
117 0.06
118 0.05
119 0.04
120 0.04
121 0.04
122 0.04
123 0.04
124 0.04
125 0.05
126 0.04
127 0.05
128 0.05
129 0.05
130 0.06
131 0.08
132 0.11
133 0.15
134 0.21
135 0.25
136 0.29
137 0.32
138 0.33
139 0.4
140 0.39
141 0.38
142 0.38
143 0.34
144 0.38
145 0.36
146 0.35
147 0.28
148 0.27
149 0.24
150 0.19
151 0.19
152 0.11
153 0.1
154 0.1
155 0.09
156 0.08
157 0.06
158 0.05
159 0.05
160 0.06
161 0.06
162 0.05
163 0.06
164 0.06
165 0.07
166 0.07
167 0.07
168 0.06
169 0.08
170 0.09
171 0.1
172 0.1
173 0.1
174 0.1
175 0.09
176 0.09
177 0.08
178 0.11
179 0.1
180 0.11
181 0.18
182 0.18
183 0.18
184 0.18
185 0.18
186 0.14
187 0.17
188 0.19
189 0.12
190 0.15
191 0.15
192 0.15
193 0.14
194 0.15
195 0.13
196 0.1
197 0.09
198 0.07
199 0.07
200 0.07
201 0.06
202 0.06
203 0.07
204 0.08
205 0.11
206 0.12
207 0.13
208 0.14
209 0.15
210 0.15
211 0.14
212 0.13
213 0.1
214 0.1
215 0.1
216 0.13
217 0.12
218 0.12
219 0.14
220 0.19
221 0.24
222 0.29
223 0.37
224 0.42
225 0.45
226 0.47
227 0.49
228 0.52
229 0.54
230 0.55
231 0.5
232 0.44
233 0.42
234 0.4
235 0.42
236 0.37
237 0.31
238 0.27
239 0.28
240 0.32
241 0.32
242 0.34
243 0.3
244 0.3
245 0.33
246 0.31
247 0.27
248 0.21
249 0.2
250 0.2
251 0.18
252 0.14
253 0.11
254 0.11
255 0.1
256 0.1
257 0.11
258 0.11
259 0.13
260 0.13
261 0.14
262 0.16
263 0.17
264 0.21
265 0.26
266 0.3
267 0.32
268 0.35
269 0.38
270 0.35
271 0.35
272 0.32
273 0.26
274 0.21
275 0.19
276 0.2
277 0.18