Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A370TKL6

Protein Details
Accession A0A370TKL6    Localization Confidence High Confidence Score 27
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
9-29EVSRAECKAKKRKLEDAIPDIHydrophilic
38-90DDAPSTEKASKKRKRSKEDGEGVDTEESERKARKKEKKEKKGKKDDGDKDEQPBasic
100-123MQDDAPRKSKKERKAERKAREAAEBasic
151-174AAAEKKSKKSNPNREKKKASKTDGHydrophilic
276-300GGNTKDRKAKIQNKNQKLNEQRVRRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
45-55KASKKRKRSKE
65-81SERKARKKEKKEKKGKK
105-121PRKSKKERKAERKAREA
154-171EKKSKKSNPNREKKKASK
283-286KAKI
288-310NKNQKLNEQRVRRIKEEEKTKMG
Subcellular Location(s) nucl 26
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034228  Nop6_RRM  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12400  RRM_Nop6  
Amino Acid Sequences MGPIKKGSEVSRAECKAKKRKLEDAIPDIPGEDIETPDDAPSTEKASKKRKRSKEDGEGVDTEESERKARKKEKKEKKGKKDDGDKDEQPEEPAEPAVEMQDDAPRKSKKERKAERKAREAAEAKENTKEAESLDAEPSKSNGDNNTPAAAAAEKKSKKSNPNREKKKASKTDGAADGEANGEVKSRASRFIVFIGNLPFSATTESVRKHFASVKPISVRHLTQKDDPAKSKGCAFIEFDGYDHMKTCLKLFHHSMFDDGISAARKINVELTAGGGGNTKDRKAKIQNKNQKLNEQRVRRIKEEEKTKMGKREAALDESGIHPSRRAQMPSIV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.55
2 0.61
3 0.63
4 0.67
5 0.71
6 0.69
7 0.74
8 0.77
9 0.81
10 0.81
11 0.78
12 0.74
13 0.66
14 0.58
15 0.49
16 0.39
17 0.29
18 0.22
19 0.14
20 0.1
21 0.1
22 0.11
23 0.11
24 0.11
25 0.11
26 0.1
27 0.11
28 0.11
29 0.16
30 0.21
31 0.26
32 0.34
33 0.45
34 0.54
35 0.63
36 0.72
37 0.77
38 0.81
39 0.87
40 0.88
41 0.89
42 0.89
43 0.84
44 0.78
45 0.69
46 0.61
47 0.51
48 0.4
49 0.31
50 0.24
51 0.2
52 0.18
53 0.23
54 0.25
55 0.34
56 0.45
57 0.53
58 0.62
59 0.72
60 0.79
61 0.85
62 0.92
63 0.94
64 0.95
65 0.96
66 0.94
67 0.93
68 0.93
69 0.91
70 0.88
71 0.84
72 0.76
73 0.69
74 0.62
75 0.52
76 0.43
77 0.34
78 0.27
79 0.19
80 0.17
81 0.12
82 0.1
83 0.09
84 0.08
85 0.07
86 0.06
87 0.06
88 0.11
89 0.12
90 0.13
91 0.21
92 0.22
93 0.25
94 0.35
95 0.43
96 0.48
97 0.57
98 0.67
99 0.71
100 0.8
101 0.88
102 0.86
103 0.88
104 0.85
105 0.75
106 0.73
107 0.65
108 0.57
109 0.55
110 0.49
111 0.41
112 0.37
113 0.35
114 0.27
115 0.24
116 0.21
117 0.13
118 0.13
119 0.14
120 0.13
121 0.15
122 0.16
123 0.15
124 0.15
125 0.16
126 0.14
127 0.13
128 0.12
129 0.11
130 0.14
131 0.16
132 0.17
133 0.17
134 0.15
135 0.15
136 0.14
137 0.13
138 0.1
139 0.09
140 0.16
141 0.17
142 0.19
143 0.25
144 0.3
145 0.39
146 0.49
147 0.58
148 0.61
149 0.71
150 0.79
151 0.83
152 0.87
153 0.86
154 0.85
155 0.83
156 0.78
157 0.74
158 0.66
159 0.62
160 0.57
161 0.5
162 0.39
163 0.3
164 0.25
165 0.18
166 0.15
167 0.1
168 0.06
169 0.05
170 0.05
171 0.05
172 0.07
173 0.07
174 0.1
175 0.11
176 0.12
177 0.13
178 0.16
179 0.17
180 0.15
181 0.17
182 0.17
183 0.15
184 0.14
185 0.13
186 0.11
187 0.09
188 0.1
189 0.09
190 0.08
191 0.12
192 0.13
193 0.14
194 0.18
195 0.17
196 0.18
197 0.24
198 0.26
199 0.31
200 0.32
201 0.36
202 0.38
203 0.39
204 0.39
205 0.37
206 0.35
207 0.36
208 0.38
209 0.35
210 0.35
211 0.43
212 0.47
213 0.49
214 0.51
215 0.47
216 0.46
217 0.43
218 0.42
219 0.38
220 0.33
221 0.29
222 0.29
223 0.25
224 0.26
225 0.25
226 0.22
227 0.2
228 0.2
229 0.18
230 0.16
231 0.16
232 0.14
233 0.14
234 0.15
235 0.17
236 0.18
237 0.23
238 0.27
239 0.31
240 0.33
241 0.33
242 0.33
243 0.29
244 0.26
245 0.22
246 0.17
247 0.14
248 0.11
249 0.12
250 0.11
251 0.12
252 0.12
253 0.12
254 0.15
255 0.14
256 0.14
257 0.13
258 0.14
259 0.14
260 0.14
261 0.13
262 0.12
263 0.11
264 0.16
265 0.18
266 0.18
267 0.22
268 0.24
269 0.32
270 0.41
271 0.52
272 0.57
273 0.66
274 0.75
275 0.8
276 0.89
277 0.86
278 0.85
279 0.83
280 0.83
281 0.81
282 0.8
283 0.79
284 0.79
285 0.8
286 0.74
287 0.75
288 0.72
289 0.71
290 0.73
291 0.71
292 0.7
293 0.71
294 0.74
295 0.74
296 0.7
297 0.66
298 0.57
299 0.59
300 0.54
301 0.5
302 0.45
303 0.37
304 0.34
305 0.3
306 0.33
307 0.26
308 0.22
309 0.19
310 0.22
311 0.29
312 0.34
313 0.37