Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A370TRA0

Protein Details
Accession A0A370TRA0    Localization Confidence High Confidence Score 22.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
74-99KETNGDSKTPKAKKKDTRSSKAANGEHydrophilic
373-397PSTEDAKSKKSKKTKAVDTPKEAVAHydrophilic
404-428AEELEQPKRKEKKSKIAKGEEPAADHydrophilic
434-453VVEEKVERPKRSKSKKGKTTBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
8-60KKRKASVPESGAEKVKKIKKVEVTEVPVKKRKAIDDAGVSEIKKSKKAAKSAK
81-104KTPKAKKKDTRSSKAANGEPKTKK
168-175KKEKKQLK
278-285KRFKKVPW
287-287K
310-317EKKRAAKA
411-421KRKEKKSKIAK
440-452ERPKRSKSKKGKT
Subcellular Location(s) nucl 22.5, mito_nucl 13.5, mito 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12307  RRM_NIFK_like  
Amino Acid Sequences MAKDTVSKKRKASVPESGAEKVKKIKKVEVTEVPVKKRKAIDDAGVSEIKKSKKAAKSAKSAVEESATLDKHDKETNGDSKTPKAKKKDTRSSKAANGEPKTKKSEPAETNNEEAEEVGSEDDDNASVIDDQTEALLEGFESDRDEADNSNDQGLEPGQGVPELKLSKKEKKQLKKASEAAALDKPGVVYVGRIPHGFYEHEMREYFKQFGTILKLRLSRNRTTGASKHYAFIQFDSAAVAEIVSKAMDNYLLFGHILKVKFVPEEQVPANVFKGANKRFKKVPWNKIEGRKLAQGASEETWAKRIELEEKKRAAKAEKLKSLGYEFNSPQIKSAKGVAKEHVVIPAVEANGESEPLAIEESPSDIKAIEVAPSTEDAKSKKSKKTKAVDTPKEAVADTTTAPAEELEQPKRKEKKSKIAKGEEPAADGLSGDVVEEKVERPKRSKSKKGKTT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.65
2 0.64
3 0.65
4 0.6
5 0.61
6 0.54
7 0.5
8 0.49
9 0.5
10 0.51
11 0.51
12 0.55
13 0.58
14 0.64
15 0.69
16 0.69
17 0.69
18 0.72
19 0.74
20 0.74
21 0.72
22 0.66
23 0.63
24 0.59
25 0.56
26 0.55
27 0.53
28 0.52
29 0.51
30 0.53
31 0.52
32 0.49
33 0.44
34 0.39
35 0.4
36 0.35
37 0.31
38 0.32
39 0.37
40 0.42
41 0.52
42 0.59
43 0.62
44 0.69
45 0.73
46 0.77
47 0.72
48 0.66
49 0.57
50 0.49
51 0.4
52 0.34
53 0.32
54 0.24
55 0.21
56 0.23
57 0.23
58 0.24
59 0.27
60 0.25
61 0.24
62 0.31
63 0.37
64 0.38
65 0.42
66 0.41
67 0.45
68 0.54
69 0.57
70 0.57
71 0.6
72 0.66
73 0.71
74 0.8
75 0.84
76 0.85
77 0.85
78 0.86
79 0.83
80 0.81
81 0.78
82 0.73
83 0.7
84 0.64
85 0.65
86 0.63
87 0.6
88 0.61
89 0.55
90 0.56
91 0.52
92 0.57
93 0.55
94 0.58
95 0.62
96 0.57
97 0.58
98 0.51
99 0.46
100 0.36
101 0.29
102 0.2
103 0.12
104 0.09
105 0.06
106 0.06
107 0.05
108 0.06
109 0.05
110 0.05
111 0.05
112 0.04
113 0.05
114 0.05
115 0.05
116 0.05
117 0.05
118 0.05
119 0.05
120 0.05
121 0.05
122 0.04
123 0.04
124 0.04
125 0.05
126 0.05
127 0.05
128 0.06
129 0.06
130 0.06
131 0.07
132 0.08
133 0.08
134 0.11
135 0.15
136 0.15
137 0.15
138 0.15
139 0.14
140 0.14
141 0.14
142 0.11
143 0.08
144 0.07
145 0.07
146 0.07
147 0.08
148 0.07
149 0.11
150 0.12
151 0.12
152 0.2
153 0.26
154 0.34
155 0.41
156 0.49
157 0.55
158 0.64
159 0.74
160 0.76
161 0.78
162 0.77
163 0.75
164 0.71
165 0.67
166 0.57
167 0.5
168 0.42
169 0.35
170 0.26
171 0.21
172 0.16
173 0.11
174 0.1
175 0.06
176 0.05
177 0.07
178 0.1
179 0.11
180 0.11
181 0.12
182 0.12
183 0.14
184 0.14
185 0.13
186 0.16
187 0.15
188 0.17
189 0.17
190 0.19
191 0.2
192 0.22
193 0.22
194 0.15
195 0.16
196 0.14
197 0.16
198 0.2
199 0.2
200 0.2
201 0.22
202 0.27
203 0.27
204 0.34
205 0.37
206 0.34
207 0.34
208 0.36
209 0.34
210 0.34
211 0.36
212 0.35
213 0.35
214 0.32
215 0.3
216 0.28
217 0.29
218 0.25
219 0.22
220 0.19
221 0.13
222 0.13
223 0.12
224 0.1
225 0.07
226 0.07
227 0.06
228 0.04
229 0.04
230 0.04
231 0.03
232 0.03
233 0.03
234 0.03
235 0.04
236 0.04
237 0.05
238 0.05
239 0.05
240 0.05
241 0.06
242 0.07
243 0.1
244 0.1
245 0.1
246 0.11
247 0.11
248 0.12
249 0.12
250 0.13
251 0.1
252 0.14
253 0.14
254 0.16
255 0.17
256 0.17
257 0.17
258 0.16
259 0.15
260 0.15
261 0.23
262 0.26
263 0.35
264 0.37
265 0.41
266 0.43
267 0.49
268 0.57
269 0.59
270 0.63
271 0.61
272 0.67
273 0.71
274 0.76
275 0.77
276 0.71
277 0.64
278 0.57
279 0.5
280 0.43
281 0.37
282 0.29
283 0.24
284 0.21
285 0.21
286 0.18
287 0.16
288 0.19
289 0.17
290 0.16
291 0.14
292 0.15
293 0.21
294 0.29
295 0.37
296 0.42
297 0.47
298 0.5
299 0.51
300 0.53
301 0.48
302 0.47
303 0.49
304 0.51
305 0.52
306 0.52
307 0.51
308 0.49
309 0.48
310 0.44
311 0.37
312 0.33
313 0.27
314 0.31
315 0.34
316 0.32
317 0.33
318 0.31
319 0.29
320 0.25
321 0.31
322 0.3
323 0.31
324 0.34
325 0.33
326 0.34
327 0.35
328 0.34
329 0.3
330 0.24
331 0.2
332 0.18
333 0.18
334 0.14
335 0.12
336 0.12
337 0.1
338 0.09
339 0.1
340 0.08
341 0.06
342 0.06
343 0.06
344 0.07
345 0.05
346 0.06
347 0.06
348 0.08
349 0.09
350 0.09
351 0.09
352 0.08
353 0.08
354 0.1
355 0.1
356 0.09
357 0.1
358 0.1
359 0.11
360 0.12
361 0.14
362 0.14
363 0.17
364 0.17
365 0.23
366 0.32
367 0.39
368 0.47
369 0.56
370 0.64
371 0.71
372 0.79
373 0.83
374 0.84
375 0.88
376 0.88
377 0.85
378 0.8
379 0.72
380 0.64
381 0.53
382 0.43
383 0.33
384 0.25
385 0.18
386 0.16
387 0.14
388 0.13
389 0.13
390 0.12
391 0.13
392 0.18
393 0.23
394 0.29
395 0.37
396 0.41
397 0.51
398 0.6
399 0.65
400 0.69
401 0.73
402 0.76
403 0.79
404 0.86
405 0.87
406 0.88
407 0.87
408 0.83
409 0.82
410 0.72
411 0.64
412 0.54
413 0.44
414 0.34
415 0.26
416 0.19
417 0.11
418 0.09
419 0.06
420 0.06
421 0.06
422 0.07
423 0.08
424 0.1
425 0.19
426 0.26
427 0.32
428 0.37
429 0.48
430 0.58
431 0.68
432 0.77
433 0.79