Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A370TIP8

Protein Details
Accession A0A370TIP8    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
283-304TTTTNGGRRKKRKGALTNPSTYHydrophilic
368-387DYTMSGKKHVKKGKYQSGMEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
290-295RRKKRK
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 11, mito 5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007307  Ltv1  
Gene Ontology GO:0042274  P:ribosomal small subunit biogenesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF04180  LTV  
Amino Acid Sequences MARNKWIDKKTATHFTLVHRPQNDPLIHDASASSMVLNPTALPNSNKVKKLDDLASELGDDVEKIRDNEGEAASYGVYYDDTEYDYMQHMRELGSGAGEAHFIEAPAPRNKGKGKQSLEDALRDASLEDKAAALLDEDILPSKNLRKATYQAQQDIPDALAGFQPDMDPRLREVLEALEDEAYVDEDEDVFGELAKDGEEIEEHEFEEGAWDDEDGGWESDDTAKPAKEYKDAPIPSEQISSDEREDHGDGDWMADFSKFKKDQKSRTAAAPSPSDMQSSIMTTTTNGGRRKKRKGALTNPSTYSMTSSSMFRTEGLSTLDARFEVIEEKYNEDMDDMASVSAASSMSSVQGPVRGDFDSIMDDFLGDYTMSGKKHVKKGKYQSGMEQLDEVRKGLGPARVRT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.55
2 0.54
3 0.6
4 0.58
5 0.58
6 0.5
7 0.51
8 0.5
9 0.55
10 0.5
11 0.42
12 0.42
13 0.38
14 0.36
15 0.33
16 0.29
17 0.22
18 0.22
19 0.19
20 0.13
21 0.11
22 0.11
23 0.11
24 0.11
25 0.1
26 0.11
27 0.14
28 0.16
29 0.16
30 0.22
31 0.32
32 0.39
33 0.43
34 0.43
35 0.46
36 0.46
37 0.5
38 0.49
39 0.43
40 0.41
41 0.38
42 0.36
43 0.31
44 0.28
45 0.22
46 0.16
47 0.13
48 0.09
49 0.1
50 0.11
51 0.12
52 0.13
53 0.14
54 0.16
55 0.2
56 0.19
57 0.17
58 0.15
59 0.15
60 0.14
61 0.12
62 0.11
63 0.07
64 0.06
65 0.06
66 0.07
67 0.07
68 0.08
69 0.09
70 0.09
71 0.1
72 0.12
73 0.13
74 0.12
75 0.12
76 0.12
77 0.12
78 0.12
79 0.12
80 0.1
81 0.09
82 0.09
83 0.09
84 0.08
85 0.08
86 0.07
87 0.07
88 0.07
89 0.06
90 0.07
91 0.09
92 0.14
93 0.18
94 0.22
95 0.22
96 0.27
97 0.31
98 0.39
99 0.45
100 0.5
101 0.5
102 0.51
103 0.55
104 0.57
105 0.55
106 0.48
107 0.41
108 0.32
109 0.27
110 0.22
111 0.18
112 0.11
113 0.1
114 0.08
115 0.07
116 0.06
117 0.06
118 0.06
119 0.06
120 0.05
121 0.05
122 0.05
123 0.05
124 0.05
125 0.06
126 0.06
127 0.06
128 0.07
129 0.11
130 0.15
131 0.17
132 0.19
133 0.22
134 0.25
135 0.33
136 0.39
137 0.39
138 0.39
139 0.4
140 0.39
141 0.37
142 0.33
143 0.26
144 0.19
145 0.14
146 0.11
147 0.09
148 0.07
149 0.06
150 0.05
151 0.06
152 0.06
153 0.08
154 0.08
155 0.08
156 0.09
157 0.12
158 0.12
159 0.12
160 0.12
161 0.11
162 0.11
163 0.11
164 0.11
165 0.07
166 0.07
167 0.07
168 0.06
169 0.06
170 0.04
171 0.04
172 0.04
173 0.03
174 0.03
175 0.04
176 0.04
177 0.03
178 0.03
179 0.03
180 0.04
181 0.04
182 0.04
183 0.04
184 0.03
185 0.03
186 0.03
187 0.05
188 0.07
189 0.07
190 0.07
191 0.07
192 0.07
193 0.06
194 0.08
195 0.06
196 0.05
197 0.05
198 0.05
199 0.05
200 0.05
201 0.06
202 0.06
203 0.06
204 0.05
205 0.05
206 0.05
207 0.08
208 0.08
209 0.09
210 0.1
211 0.1
212 0.1
213 0.15
214 0.16
215 0.17
216 0.19
217 0.21
218 0.29
219 0.29
220 0.3
221 0.3
222 0.3
223 0.28
224 0.27
225 0.23
226 0.17
227 0.18
228 0.18
229 0.16
230 0.15
231 0.15
232 0.16
233 0.16
234 0.14
235 0.13
236 0.11
237 0.1
238 0.1
239 0.1
240 0.07
241 0.07
242 0.07
243 0.07
244 0.08
245 0.17
246 0.19
247 0.23
248 0.34
249 0.41
250 0.5
251 0.59
252 0.65
253 0.59
254 0.62
255 0.65
256 0.58
257 0.54
258 0.47
259 0.39
260 0.35
261 0.33
262 0.27
263 0.21
264 0.19
265 0.16
266 0.15
267 0.13
268 0.1
269 0.1
270 0.1
271 0.12
272 0.15
273 0.2
274 0.25
275 0.33
276 0.43
277 0.52
278 0.61
279 0.68
280 0.71
281 0.75
282 0.8
283 0.82
284 0.83
285 0.82
286 0.78
287 0.71
288 0.67
289 0.57
290 0.47
291 0.39
292 0.29
293 0.24
294 0.19
295 0.18
296 0.16
297 0.17
298 0.17
299 0.15
300 0.16
301 0.14
302 0.15
303 0.17
304 0.16
305 0.16
306 0.17
307 0.17
308 0.14
309 0.14
310 0.12
311 0.1
312 0.11
313 0.11
314 0.16
315 0.16
316 0.2
317 0.21
318 0.21
319 0.21
320 0.18
321 0.18
322 0.12
323 0.11
324 0.08
325 0.07
326 0.06
327 0.06
328 0.06
329 0.06
330 0.06
331 0.05
332 0.05
333 0.05
334 0.06
335 0.07
336 0.08
337 0.08
338 0.12
339 0.14
340 0.14
341 0.16
342 0.16
343 0.16
344 0.16
345 0.16
346 0.15
347 0.14
348 0.14
349 0.11
350 0.1
351 0.1
352 0.09
353 0.09
354 0.06
355 0.06
356 0.08
357 0.12
358 0.12
359 0.17
360 0.25
361 0.32
362 0.42
363 0.5
364 0.56
365 0.63
366 0.73
367 0.8
368 0.82
369 0.77
370 0.76
371 0.78
372 0.72
373 0.63
374 0.55
375 0.47
376 0.44
377 0.41
378 0.33
379 0.24
380 0.21
381 0.22
382 0.23
383 0.27