Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A1D987

Protein Details
Accession A1D987    Localization Confidence High Confidence Score 15.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
13-74APAAVAEPERKRKHKHKDQSSKKKRKHDSKLIADETTVHETTSKKSSKSKEKSKQKSSEDAPHydrophilic
400-431ALEESPSKKKERKTEKEKKSKPSKSKKKKEEKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
21-39ERKRKHKHKDQSSKKKRKH
406-431SKKKERKTEKEKKSKPSKSKKKKEEK
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 14.333, mito_nucl 10.499, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036898  RNA_pol_Rpb7-like_N_sf  
IPR041178  RPA43_OB  
IPR045113  Rpb7-like  
IPR005576  Rpb7-like_N  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
KEGG nfi:NFIA_114810  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF17875  RPA43_OB  
PF03876  SHS2_Rpb7-N  
Amino Acid Sequences MAVDAMDVDSSPAPAAVAEPERKRKHKHKDQSSKKKRKHDSKLIADETTVHETTSKKSSKSKEKSKQKSSEDAPLPSDSPYVLTTATLYLPLSPISISPTHALASLLAEHLSPLLLTYYPPLQGVILAYSNASISSEPPSASSPSSDPQDNPQPLTLAKTADEYGVLYIYLTATFLVFRPQRGQILEGWVNVQSEGFLGAVVLNLFSVGIERKRLPSDWKWVPPGEEEEENGFNSSEKPKKKVFSSTEDEDDSEPSSHFDPEMEHFKPISLASNANPFSETMDLNNGSADDDESAAEGYFQSVSGHRVRGTVRFRVVDIDVIPGSDRERGFLSIEGTMLSPEEEARVLEDERNGNYSSMTPRPQGQWEPSSAMSGALAGSSSAAPSTADAGADADAGTGALEESPSKKKERKTEKEKKSKPSKSKKKKEEK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.07
2 0.08
3 0.11
4 0.17
5 0.24
6 0.32
7 0.42
8 0.51
9 0.59
10 0.68
11 0.73
12 0.79
13 0.82
14 0.86
15 0.87
16 0.9
17 0.94
18 0.96
19 0.97
20 0.97
21 0.95
22 0.94
23 0.94
24 0.93
25 0.93
26 0.93
27 0.92
28 0.92
29 0.93
30 0.86
31 0.76
32 0.65
33 0.56
34 0.49
35 0.45
36 0.34
37 0.23
38 0.22
39 0.22
40 0.25
41 0.33
42 0.32
43 0.3
44 0.38
45 0.48
46 0.57
47 0.66
48 0.74
49 0.75
50 0.82
51 0.89
52 0.91
53 0.92
54 0.87
55 0.86
56 0.79
57 0.79
58 0.73
59 0.65
60 0.57
61 0.5
62 0.44
63 0.35
64 0.31
65 0.21
66 0.17
67 0.15
68 0.13
69 0.1
70 0.09
71 0.09
72 0.1
73 0.1
74 0.09
75 0.09
76 0.08
77 0.09
78 0.09
79 0.09
80 0.07
81 0.07
82 0.1
83 0.11
84 0.12
85 0.13
86 0.14
87 0.14
88 0.14
89 0.14
90 0.1
91 0.11
92 0.1
93 0.09
94 0.08
95 0.08
96 0.07
97 0.07
98 0.06
99 0.05
100 0.04
101 0.05
102 0.05
103 0.05
104 0.07
105 0.09
106 0.09
107 0.1
108 0.1
109 0.09
110 0.09
111 0.09
112 0.09
113 0.08
114 0.07
115 0.07
116 0.07
117 0.07
118 0.07
119 0.07
120 0.05
121 0.06
122 0.09
123 0.11
124 0.1
125 0.12
126 0.14
127 0.15
128 0.15
129 0.16
130 0.14
131 0.16
132 0.19
133 0.19
134 0.18
135 0.22
136 0.31
137 0.31
138 0.3
139 0.28
140 0.26
141 0.24
142 0.28
143 0.23
144 0.15
145 0.14
146 0.14
147 0.14
148 0.13
149 0.13
150 0.09
151 0.08
152 0.07
153 0.07
154 0.05
155 0.04
156 0.04
157 0.04
158 0.04
159 0.04
160 0.03
161 0.04
162 0.04
163 0.11
164 0.11
165 0.12
166 0.16
167 0.17
168 0.2
169 0.2
170 0.22
171 0.16
172 0.22
173 0.23
174 0.2
175 0.19
176 0.17
177 0.16
178 0.15
179 0.13
180 0.06
181 0.05
182 0.05
183 0.04
184 0.03
185 0.03
186 0.03
187 0.04
188 0.03
189 0.03
190 0.03
191 0.03
192 0.03
193 0.02
194 0.03
195 0.04
196 0.05
197 0.08
198 0.09
199 0.11
200 0.13
201 0.14
202 0.19
203 0.22
204 0.3
205 0.34
206 0.37
207 0.39
208 0.38
209 0.38
210 0.33
211 0.32
212 0.26
213 0.21
214 0.18
215 0.17
216 0.17
217 0.16
218 0.15
219 0.12
220 0.09
221 0.1
222 0.15
223 0.19
224 0.21
225 0.25
226 0.29
227 0.33
228 0.36
229 0.43
230 0.43
231 0.44
232 0.48
233 0.48
234 0.46
235 0.43
236 0.41
237 0.32
238 0.28
239 0.22
240 0.16
241 0.12
242 0.11
243 0.11
244 0.1
245 0.09
246 0.09
247 0.09
248 0.11
249 0.18
250 0.17
251 0.17
252 0.17
253 0.17
254 0.18
255 0.17
256 0.17
257 0.12
258 0.13
259 0.13
260 0.2
261 0.21
262 0.2
263 0.2
264 0.17
265 0.17
266 0.17
267 0.16
268 0.09
269 0.13
270 0.13
271 0.13
272 0.13
273 0.11
274 0.1
275 0.1
276 0.09
277 0.06
278 0.06
279 0.06
280 0.06
281 0.06
282 0.05
283 0.05
284 0.05
285 0.05
286 0.05
287 0.05
288 0.06
289 0.06
290 0.1
291 0.13
292 0.15
293 0.14
294 0.17
295 0.19
296 0.26
297 0.3
298 0.33
299 0.35
300 0.34
301 0.34
302 0.34
303 0.33
304 0.28
305 0.23
306 0.2
307 0.16
308 0.15
309 0.15
310 0.12
311 0.13
312 0.15
313 0.14
314 0.12
315 0.14
316 0.16
317 0.17
318 0.18
319 0.18
320 0.14
321 0.14
322 0.13
323 0.12
324 0.1
325 0.09
326 0.08
327 0.06
328 0.06
329 0.07
330 0.06
331 0.06
332 0.08
333 0.1
334 0.11
335 0.13
336 0.16
337 0.18
338 0.19
339 0.22
340 0.21
341 0.19
342 0.19
343 0.2
344 0.21
345 0.24
346 0.26
347 0.26
348 0.28
349 0.32
350 0.37
351 0.4
352 0.41
353 0.4
354 0.4
355 0.42
356 0.39
357 0.37
358 0.31
359 0.26
360 0.19
361 0.15
362 0.11
363 0.07
364 0.07
365 0.04
366 0.05
367 0.05
368 0.05
369 0.05
370 0.05
371 0.05
372 0.06
373 0.09
374 0.08
375 0.08
376 0.08
377 0.09
378 0.09
379 0.09
380 0.09
381 0.06
382 0.05
383 0.05
384 0.05
385 0.04
386 0.04
387 0.04
388 0.04
389 0.06
390 0.1
391 0.18
392 0.21
393 0.29
394 0.35
395 0.43
396 0.53
397 0.63
398 0.7
399 0.75
400 0.83
401 0.87
402 0.92
403 0.93
404 0.93
405 0.93
406 0.93
407 0.93
408 0.93
409 0.93
410 0.93
411 0.96