Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A1D404

Protein Details
Accession A1D404    Localization Confidence High Confidence Score 17.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-21MAKARTKKRTHVRAQNASAAAHydrophilic
360-401EVKSLDKNWAKKKKEKEERKKQQRENIEKKKQEKAKARAEGKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
223-246KTGISKRIRRLDPKEIRSREKRKS
366-401KNWAKKKKEKEERKKQQRENIEKKKQEKAKARAEGK
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 10, mito 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007109  Brix  
IPR045112  PPAN-like  
Gene Ontology GO:0019843  F:rRNA binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG nfi:NFIA_018480  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04427  Brix  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50833  BRIX  
Amino Acid Sequences MAKARTKKRTHVRAQNASAAAKSSMSKTPKSMVIRVGASQVGSSVSQLVKDVRLMMEPDTAVRLKERKSNRLRDYTTMTGPLGVTHLMLFSKSATGNTNMRLALTPRGPTLHFKVESYSLCRDVEKALKRPRGGGQDHKTPPLLVMNNFNSPNASEDSKVPKRLESLTTTIFQSLFPPINPQATPLSSIRRVMLLNRELTAGSEEEEDSYVLNLRHYAISTKKTGISKRIRRLDPKEIRSREKRKSAVPNLGKLEDAADYLLDPSAAGYTSASETEMDTDAEVEIAESTTKKVLTKRELQRMKSGEKAKAQKANAPEVEKRAVKLVELGPRLKLRLIKVEEGICEGRVMWHDYIKKSEAEVKSLDKNWAKKKKEKEERKKQQRENIEKKKQEKAKARAEGKGGEDDEDEEDVDMDDEDDWLSDDLEDDEEGQAQDNDDEDESMEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.86
2 0.84
3 0.77
4 0.67
5 0.57
6 0.48
7 0.38
8 0.29
9 0.25
10 0.21
11 0.25
12 0.28
13 0.3
14 0.32
15 0.36
16 0.42
17 0.46
18 0.47
19 0.44
20 0.45
21 0.45
22 0.42
23 0.4
24 0.34
25 0.28
26 0.23
27 0.18
28 0.14
29 0.12
30 0.11
31 0.12
32 0.11
33 0.12
34 0.13
35 0.15
36 0.15
37 0.16
38 0.17
39 0.15
40 0.17
41 0.18
42 0.18
43 0.19
44 0.17
45 0.17
46 0.19
47 0.19
48 0.17
49 0.21
50 0.24
51 0.24
52 0.33
53 0.4
54 0.47
55 0.56
56 0.66
57 0.7
58 0.75
59 0.76
60 0.73
61 0.73
62 0.67
63 0.6
64 0.52
65 0.44
66 0.35
67 0.3
68 0.25
69 0.18
70 0.13
71 0.11
72 0.08
73 0.09
74 0.07
75 0.08
76 0.08
77 0.07
78 0.09
79 0.09
80 0.11
81 0.12
82 0.16
83 0.19
84 0.21
85 0.24
86 0.21
87 0.22
88 0.22
89 0.21
90 0.23
91 0.23
92 0.22
93 0.2
94 0.22
95 0.23
96 0.26
97 0.3
98 0.32
99 0.3
100 0.29
101 0.31
102 0.33
103 0.34
104 0.35
105 0.32
106 0.27
107 0.26
108 0.26
109 0.25
110 0.24
111 0.3
112 0.32
113 0.37
114 0.44
115 0.49
116 0.5
117 0.53
118 0.55
119 0.55
120 0.54
121 0.55
122 0.52
123 0.56
124 0.58
125 0.57
126 0.51
127 0.42
128 0.38
129 0.34
130 0.3
131 0.21
132 0.26
133 0.26
134 0.3
135 0.31
136 0.29
137 0.24
138 0.21
139 0.22
140 0.18
141 0.16
142 0.13
143 0.16
144 0.25
145 0.29
146 0.34
147 0.32
148 0.31
149 0.32
150 0.34
151 0.34
152 0.3
153 0.29
154 0.26
155 0.27
156 0.26
157 0.24
158 0.21
159 0.18
160 0.15
161 0.14
162 0.12
163 0.11
164 0.14
165 0.15
166 0.17
167 0.17
168 0.18
169 0.17
170 0.17
171 0.2
172 0.17
173 0.21
174 0.19
175 0.21
176 0.19
177 0.18
178 0.18
179 0.18
180 0.23
181 0.21
182 0.21
183 0.2
184 0.21
185 0.19
186 0.19
187 0.18
188 0.11
189 0.08
190 0.08
191 0.07
192 0.07
193 0.07
194 0.07
195 0.06
196 0.06
197 0.07
198 0.07
199 0.07
200 0.07
201 0.07
202 0.08
203 0.08
204 0.11
205 0.12
206 0.15
207 0.16
208 0.17
209 0.2
210 0.24
211 0.26
212 0.33
213 0.4
214 0.46
215 0.53
216 0.61
217 0.62
218 0.66
219 0.7
220 0.72
221 0.71
222 0.7
223 0.71
224 0.67
225 0.7
226 0.72
227 0.74
228 0.71
229 0.7
230 0.66
231 0.64
232 0.69
233 0.68
234 0.68
235 0.64
236 0.62
237 0.56
238 0.53
239 0.45
240 0.35
241 0.29
242 0.19
243 0.15
244 0.09
245 0.06
246 0.05
247 0.05
248 0.05
249 0.04
250 0.03
251 0.03
252 0.04
253 0.04
254 0.04
255 0.03
256 0.04
257 0.05
258 0.06
259 0.06
260 0.06
261 0.06
262 0.07
263 0.08
264 0.07
265 0.07
266 0.07
267 0.06
268 0.06
269 0.06
270 0.04
271 0.04
272 0.04
273 0.04
274 0.04
275 0.05
276 0.07
277 0.08
278 0.1
279 0.14
280 0.22
281 0.28
282 0.37
283 0.45
284 0.55
285 0.61
286 0.62
287 0.66
288 0.64
289 0.61
290 0.59
291 0.56
292 0.51
293 0.52
294 0.57
295 0.55
296 0.57
297 0.55
298 0.51
299 0.5
300 0.52
301 0.48
302 0.46
303 0.42
304 0.39
305 0.43
306 0.4
307 0.36
308 0.32
309 0.28
310 0.23
311 0.26
312 0.26
313 0.28
314 0.31
315 0.31
316 0.3
317 0.32
318 0.33
319 0.31
320 0.3
321 0.25
322 0.31
323 0.34
324 0.34
325 0.36
326 0.37
327 0.35
328 0.35
329 0.33
330 0.24
331 0.2
332 0.16
333 0.14
334 0.14
335 0.18
336 0.15
337 0.2
338 0.24
339 0.26
340 0.31
341 0.31
342 0.3
343 0.27
344 0.35
345 0.31
346 0.3
347 0.31
348 0.31
349 0.35
350 0.37
351 0.43
352 0.4
353 0.47
354 0.54
355 0.61
356 0.64
357 0.66
358 0.74
359 0.78
360 0.83
361 0.86
362 0.87
363 0.89
364 0.93
365 0.96
366 0.96
367 0.94
368 0.92
369 0.92
370 0.91
371 0.91
372 0.91
373 0.9
374 0.88
375 0.85
376 0.86
377 0.83
378 0.81
379 0.81
380 0.79
381 0.79
382 0.8
383 0.79
384 0.75
385 0.71
386 0.65
387 0.58
388 0.55
389 0.45
390 0.37
391 0.33
392 0.29
393 0.26
394 0.22
395 0.19
396 0.12
397 0.12
398 0.11
399 0.1
400 0.08
401 0.07
402 0.06
403 0.06
404 0.06
405 0.06
406 0.07
407 0.07
408 0.07
409 0.07
410 0.08
411 0.08
412 0.09
413 0.09
414 0.09
415 0.09
416 0.11
417 0.11
418 0.12
419 0.11
420 0.11
421 0.12
422 0.11
423 0.13
424 0.12
425 0.12