Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A367LDA6

Protein Details
Accession A0A367LDA6    Localization Confidence Low Confidence Score 9.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-21MTSPTGNTRKKKNLPSCLSSSHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 15.5, mito 10, cyto_nucl 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010920  LSM_dom_sf  
IPR034110  LSMD1_Sm  
IPR001163  Sm_dom_euk/arc  
Gene Ontology GO:0031417  C:NatC complex  
Pfam View protein in Pfam  
PF01423  LSM  
CDD cd06168  LSMD1  
Amino Acid Sequences MTSPTGNTRKKKNLPSCLSSSQQTKVLDGLAMDHGDARAYLTSLLNKNLRITTTDGRLFWGAFKCTDANQNIVLSHTYEYRKASGADPLSLEHSLRMDVAAARYLGLVVVPGEHIVRMELEQFVSQMRQKPPSRLPESGQETMST
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.81
2 0.81
3 0.79
4 0.74
5 0.69
6 0.63
7 0.57
8 0.49
9 0.47
10 0.41
11 0.34
12 0.29
13 0.26
14 0.21
15 0.17
16 0.16
17 0.12
18 0.11
19 0.1
20 0.09
21 0.09
22 0.08
23 0.08
24 0.07
25 0.05
26 0.06
27 0.07
28 0.08
29 0.12
30 0.14
31 0.19
32 0.2
33 0.2
34 0.22
35 0.22
36 0.21
37 0.19
38 0.23
39 0.21
40 0.25
41 0.26
42 0.24
43 0.25
44 0.25
45 0.22
46 0.2
47 0.19
48 0.15
49 0.13
50 0.14
51 0.13
52 0.14
53 0.19
54 0.17
55 0.16
56 0.16
57 0.16
58 0.14
59 0.14
60 0.14
61 0.1
62 0.09
63 0.11
64 0.11
65 0.12
66 0.13
67 0.14
68 0.15
69 0.15
70 0.15
71 0.17
72 0.18
73 0.17
74 0.16
75 0.16
76 0.17
77 0.16
78 0.15
79 0.1
80 0.1
81 0.09
82 0.08
83 0.08
84 0.06
85 0.06
86 0.07
87 0.08
88 0.08
89 0.08
90 0.08
91 0.07
92 0.07
93 0.05
94 0.05
95 0.03
96 0.04
97 0.04
98 0.05
99 0.05
100 0.05
101 0.05
102 0.05
103 0.06
104 0.07
105 0.08
106 0.08
107 0.09
108 0.09
109 0.1
110 0.1
111 0.13
112 0.16
113 0.22
114 0.26
115 0.35
116 0.38
117 0.46
118 0.53
119 0.61
120 0.64
121 0.61
122 0.61
123 0.62
124 0.65
125 0.61