FuNGI

A0A367L3J5

Protein Details

Accession

A0A367L3J5

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
7-39	GSQNGAPPRIRKKPNPLRPMRKQPRPANPLVAP	Hydrophilic
183-208	APVAKEVNPKRPKKQKEEKIMFNRAP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
13-52	PPRIRKKPNPLRPMRKQPRPANPLVAPAGKAPAPAPAPPK
190-203	NPKRPKKQKEEKIM
473-530	KDKSKAAPAKGTPTPQGKQKPSDAPKKGKSLKRAGSPALSESSGNESSRKKMRKMASP
568-574	PRKKPKL

Subcellular Location(s)

nucl 21, mito 3, cyto 3, cyto_mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MSAPPPGSQNGAPPRIRKKPNPLRPMRKQPRPANPLVAPAGKAPAPAPAPPKSSQKATPPATGSTSIEELRKKYGGWSEPPPQPVNDIPIMLTKKAILNGARYHLMRFYQSKMNEKPIDPTDQDDFVRPVTLHRRDPRQPPPGRLPKVEDLEQQQMDEKEVERMAQIKAEREAQRAIDQAKIAPVAKEVNPKRPKKQKEEKIMFNRAPKTEAAKKESDIRYEEALPWHLEDADGKNIWVGTYVAALSESTVGFMIDGSVFRVVPLEKWYKFTSKPPFQPFTLEEAEAFMNKKMDVGRWVMKDEERKAGQNDLEATRRLLYGRGQMVKTESDTFKAASRLEKLDHDDLDISGDEFQDDDEAPHFERNDDEDTKESKERIRREQLGANLFGDGDEQEVDKELQEQLQEELERQKYGKATKKALIKRDREEIYESDDSAEKPWSSSSDDSSDEEDEESKQDEKKEPDAKDGQVEAKDKSKAAPAKGTPTPQGKQKPSDAPKKGKSLKRAGSPALSESSGNESSRKKMRKMASPAAGSRAGTPLPQANPLRRTKAGGDGEATAGEVSDGAGPRKKPKLADNSRKGSPAVSRASSPNPAQGGGASPAHQSGAGIEPWEILEKIPPDGIAIGDLIKLFHGRVGDRSGQMPKAEWIKLVKQLCDYGPDKRLRRK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.59
2	0.65
3	0.73
4	0.73
5	0.76
6	0.79
7	0.85
8	0.88
9	0.9
10	0.9
11	0.92
12	0.94
13	0.94
14	0.93
15	0.93
16	0.92
17	0.92
18	0.89
19	0.84
20	0.82
21	0.73
22	0.69
23	0.64
24	0.56
25	0.46
26	0.39
27	0.36
28	0.28
29	0.26
30	0.2
31	0.21
32	0.21
33	0.24
34	0.28
35	0.3
36	0.35
37	0.38
38	0.47
39	0.45
40	0.49
41	0.51
42	0.55
43	0.59
44	0.59
45	0.61
46	0.56
47	0.54
48	0.52
49	0.48
50	0.41
51	0.34
52	0.33
53	0.28
54	0.29
55	0.3
56	0.28
57	0.31
58	0.3
59	0.27
60	0.29
61	0.35
62	0.37
63	0.39
64	0.44
65	0.48
66	0.52
67	0.57
68	0.54
69	0.46
70	0.44
71	0.41
72	0.39
73	0.32
74	0.27
75	0.23
76	0.28
77	0.3
78	0.26
79	0.24
80	0.2
81	0.21
82	0.22
83	0.26
84	0.21
85	0.24
86	0.28
87	0.31
88	0.34
89	0.32
90	0.32
91	0.3
92	0.3
93	0.29
94	0.29
95	0.29
96	0.32
97	0.36
98	0.43
99	0.45
100	0.53
101	0.52
102	0.5
103	0.52
104	0.48
105	0.5
106	0.42
107	0.42
108	0.36
109	0.34
110	0.34
111	0.3
112	0.28
113	0.22
114	0.23
115	0.19
116	0.21
117	0.28
118	0.34
119	0.4
120	0.45
121	0.54
122	0.59
123	0.68
124	0.72
125	0.73
126	0.73
127	0.72
128	0.76
129	0.77
130	0.75
131	0.7
132	0.67
133	0.64
134	0.63
135	0.58
136	0.52
137	0.46
138	0.48
139	0.45
140	0.38
141	0.35
142	0.3
143	0.28
144	0.25
145	0.2
146	0.16
147	0.16
148	0.16
149	0.13
150	0.15
151	0.14
152	0.17
153	0.18
154	0.17
155	0.19
156	0.27
157	0.29
158	0.29
159	0.31
160	0.29
161	0.3
162	0.31
163	0.3
164	0.24
165	0.22
166	0.2
167	0.2
168	0.2
169	0.18
170	0.15
171	0.15
172	0.16
173	0.18
174	0.27
175	0.29
176	0.37
177	0.46
178	0.51
179	0.6
180	0.67
181	0.73
182	0.74
183	0.82
184	0.81
185	0.83
186	0.86
187	0.86
188	0.86
189	0.86
190	0.79
191	0.75
192	0.7
193	0.6
194	0.54
195	0.45
196	0.43
197	0.41
198	0.43
199	0.42
200	0.39
201	0.39
202	0.46
203	0.47
204	0.43
205	0.38
206	0.35
207	0.32
208	0.31
209	0.31
210	0.24
211	0.23
212	0.2
213	0.17
214	0.15
215	0.13
216	0.11
217	0.11
218	0.12
219	0.13
220	0.13
221	0.12
222	0.12
223	0.12
224	0.12
225	0.11
226	0.09
227	0.05
228	0.06
229	0.06
230	0.05
231	0.06
232	0.06
233	0.05
234	0.06
235	0.05
236	0.05
237	0.05
238	0.05
239	0.05
240	0.05
241	0.05
242	0.04
243	0.04
244	0.05
245	0.05
246	0.05
247	0.05
248	0.07
249	0.07
250	0.07
251	0.13
252	0.18
253	0.18
254	0.22
255	0.25
256	0.27
257	0.29
258	0.36
259	0.41
260	0.43
261	0.51
262	0.55
263	0.56
264	0.52
265	0.55
266	0.49
267	0.44
268	0.38
269	0.3
270	0.22
271	0.2
272	0.2
273	0.16
274	0.15
275	0.1
276	0.09
277	0.08
278	0.1
279	0.09
280	0.1
281	0.11
282	0.15
283	0.19
284	0.2
285	0.21
286	0.21
287	0.23
288	0.28
289	0.28
290	0.3
291	0.26
292	0.27
293	0.27
294	0.29
295	0.26
296	0.22
297	0.23
298	0.19
299	0.2
300	0.18
301	0.17
302	0.15
303	0.15
304	0.13
305	0.12
306	0.11
307	0.14
308	0.18
309	0.21
310	0.21
311	0.21
312	0.22
313	0.22
314	0.21
315	0.2
316	0.16
317	0.14
318	0.14
319	0.14
320	0.15
321	0.16
322	0.15
323	0.14
324	0.16
325	0.16
326	0.17
327	0.18
328	0.2
329	0.21
330	0.2
331	0.18
332	0.16
333	0.14
334	0.14
335	0.12
336	0.09
337	0.06
338	0.06
339	0.05
340	0.05
341	0.05
342	0.04
343	0.05
344	0.05
345	0.05
346	0.06
347	0.07
348	0.09
349	0.09
350	0.08
351	0.09
352	0.11
353	0.15
354	0.16
355	0.16
356	0.17
357	0.19
358	0.22
359	0.23
360	0.22
361	0.22
362	0.27
363	0.32
364	0.38
365	0.44
366	0.46
367	0.48
368	0.51
369	0.52
370	0.49
371	0.44
372	0.36
373	0.27
374	0.22
375	0.18
376	0.14
377	0.09
378	0.05
379	0.05
380	0.04
381	0.04
382	0.06
383	0.06
384	0.06
385	0.07
386	0.07
387	0.07
388	0.08
389	0.09
390	0.08
391	0.1
392	0.1
393	0.1
394	0.16
395	0.16
396	0.16
397	0.16
398	0.18
399	0.19
400	0.27
401	0.34
402	0.35
403	0.39
404	0.43
405	0.52
406	0.56
407	0.62
408	0.64
409	0.61
410	0.59
411	0.63
412	0.59
413	0.52
414	0.5
415	0.42
416	0.39
417	0.34
418	0.3
419	0.23
420	0.22
421	0.2
422	0.18
423	0.19
424	0.11
425	0.11
426	0.11
427	0.12
428	0.15
429	0.16
430	0.17
431	0.18
432	0.2
433	0.21
434	0.23
435	0.21
436	0.18
437	0.17
438	0.15
439	0.13
440	0.12
441	0.12
442	0.12
443	0.14
444	0.16
445	0.22
446	0.25
447	0.33
448	0.39
449	0.39
450	0.44
451	0.46
452	0.44
453	0.42
454	0.41
455	0.35
456	0.32
457	0.33
458	0.27
459	0.28
460	0.28
461	0.25
462	0.24
463	0.28
464	0.29
465	0.3
466	0.36
467	0.33
468	0.38
469	0.42
470	0.43
471	0.42
472	0.44
473	0.44
474	0.45
475	0.51
476	0.5
477	0.51
478	0.55
479	0.59
480	0.61
481	0.69
482	0.69
483	0.69
484	0.7
485	0.76
486	0.78
487	0.74
488	0.74
489	0.74
490	0.72
491	0.71
492	0.7
493	0.63
494	0.58
495	0.53
496	0.47
497	0.4
498	0.33
499	0.25
500	0.21
501	0.23
502	0.22
503	0.21
504	0.23
505	0.22
506	0.27
507	0.36
508	0.41
509	0.39
510	0.45
511	0.51
512	0.57
513	0.64
514	0.68
515	0.67
516	0.66
517	0.64
518	0.6
519	0.55
520	0.45
521	0.37
522	0.3
523	0.23
524	0.17
525	0.18
526	0.19
527	0.18
528	0.26
529	0.28
530	0.33
531	0.4
532	0.46
533	0.5
534	0.46
535	0.49
536	0.43
537	0.49
538	0.46
539	0.4
540	0.36
541	0.32
542	0.31
543	0.27
544	0.24
545	0.14
546	0.1
547	0.08
548	0.06
549	0.05
550	0.07
551	0.09
552	0.11
553	0.16
554	0.18
555	0.26
556	0.33
557	0.36
558	0.37
559	0.45
560	0.54
561	0.61
562	0.7
563	0.73
564	0.73
565	0.72
566	0.7
567	0.62
568	0.54
569	0.48
570	0.44
571	0.4
572	0.36
573	0.35
574	0.37
575	0.41
576	0.44
577	0.4
578	0.38
579	0.33
580	0.32
581	0.29
582	0.25
583	0.24
584	0.21
585	0.21
586	0.16
587	0.16
588	0.16
589	0.16
590	0.15
591	0.12
592	0.1
593	0.12
594	0.12
595	0.12
596	0.12
597	0.12
598	0.13
599	0.15
600	0.13
601	0.1
602	0.14
603	0.15
604	0.16
605	0.17
606	0.16
607	0.15
608	0.15
609	0.15
610	0.11
611	0.1
612	0.09
613	0.09
614	0.09
615	0.08
616	0.09
617	0.09
618	0.09
619	0.1
620	0.12
621	0.13
622	0.17
623	0.23
624	0.27
625	0.29
626	0.33
627	0.37
628	0.38
629	0.37
630	0.36
631	0.35
632	0.36
633	0.35
634	0.34
635	0.35
636	0.36
637	0.43
638	0.46
639	0.43
640	0.4
641	0.44
642	0.41
643	0.43
644	0.41
645	0.4
646	0.44
647	0.5

A0A367L3J5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer