FuNGI

A0A367LD87

Protein Details

Accession

A0A367LD87

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
13-32	KSGKRNSQTTSDKKRAREDD	Hydrophilic
58-92	APESQHYERQVKKEKRKSDRKEKKKRESEHVSDDV	Basic
104-136	LASQLQKDEKQKRKLERKERKGRKAEKAAAQLH	Hydrophilic
192-235	KSIDGKKMDGKKKRSKEEKRREKEEKRQRKRERKEELKRLRDED	Basic
523-549	ATEARTADMRRKNKNGQKSERRTAPEF	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
40-44	KLKKP
68-83	VKKEKRKSDRKEKKKR
113-130	KQKRKLERKERKGRKAEK
197-230	KKMDGKKKRSKEEKRREKEEKRQRKRERKEELKR

Subcellular Location(s)

nucl 20.5, cyto_nucl 11, mito 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR036898 RNA_pol_Rpb7-like_N_sf IPR041178 RPA43_OB IPR045113 Rpb7-like
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0005730 C:nucleolus GO:0003677 F:DNA binding GO:0006352 P:DNA-templated transcription initiation
Pfam	View protein in Pfam PF17875 RPA43_OB
CDD	cd22249 UDM1_RNF168_RNF169-like

Amino Acid Sequences

MTSAKAPEPATPKSGKRNSQTTSDKKRAREDDSAADEERKLKKPKSAAADQLGPAQPAPESQHYERQVKKEKRKSDRKEKKKRESEHVSDDVAVNTVTAVKPELASQLQKDEKQKRKLERKERKGRKAEKAAAQLHMSASDAIHEEQVPDEKQVKLEMMEENNVTGGSQSAIMTEVTNKEDLTSDAVEMPMKSIDGKKMDGKKKRSKEEKRREKEEKRQRKRERKEELKRLRDEDAQQVAAATTNRKESDHDEVVDSVIVESGDQGEAALPSVTAPAADGMDVDKDDAYLSGDVYQPPDTPAEPQFPFFSQTVSLYKPLWPTGWAQPVAEAQHQHLEDLVGKYVPQVRGVLLKYDKVTLGSAPGRRGAAADDEEPTTVVSHNEYAVGFGWITADVELFVPSRGSWMEGIINLQTEGHIGVVCFEKFNASVEAVRLPPSWKWVSLGSVEAEGFDKTASFMTDDNDDAVQKVDSTGFWVDGRGAKVQGKIRFRIRNFDAGTSGGTSYLSLEGTMLDPTQEKELVATEARTADMRRKNKNGQKSERRTAPEFSLTRFGADPASQAQKQALQPVDHWSGL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.6
2	0.62
3	0.64
4	0.7
5	0.67
6	0.7
7	0.75
8	0.75
9	0.76
10	0.78
11	0.77
12	0.74
13	0.8
14	0.78
15	0.75
16	0.72
17	0.67
18	0.66
19	0.66
20	0.64
21	0.56
22	0.51
23	0.45
24	0.44
25	0.45
26	0.44
27	0.46
28	0.46
29	0.51
30	0.57
31	0.63
32	0.65
33	0.66
34	0.66
35	0.65
36	0.66
37	0.6
38	0.59
39	0.53
40	0.45
41	0.36
42	0.28
43	0.22
44	0.19
45	0.23
46	0.21
47	0.27
48	0.3
49	0.39
50	0.45
51	0.53
52	0.56
53	0.6
54	0.65
55	0.69
56	0.76
57	0.77
58	0.82
59	0.85
60	0.9
61	0.91
62	0.92
63	0.93
64	0.93
65	0.95
66	0.95
67	0.96
68	0.95
69	0.92
70	0.91
71	0.9
72	0.87
73	0.84
74	0.77
75	0.67
76	0.58
77	0.51
78	0.4
79	0.31
80	0.22
81	0.13
82	0.09
83	0.09
84	0.08
85	0.08
86	0.09
87	0.08
88	0.09
89	0.1
90	0.14
91	0.15
92	0.17
93	0.18
94	0.25
95	0.3
96	0.34
97	0.43
98	0.49
99	0.56
100	0.63
101	0.7
102	0.73
103	0.79
104	0.85
105	0.87
106	0.88
107	0.9
108	0.91
109	0.94
110	0.94
111	0.94
112	0.92
113	0.92
114	0.91
115	0.88
116	0.84
117	0.83
118	0.75
119	0.68
120	0.59
121	0.5
122	0.4
123	0.32
124	0.24
125	0.15
126	0.12
127	0.09
128	0.1
129	0.09
130	0.1
131	0.1
132	0.09
133	0.1
134	0.14
135	0.13
136	0.14
137	0.17
138	0.16
139	0.17
140	0.18
141	0.18
142	0.15
143	0.16
144	0.17
145	0.16
146	0.18
147	0.18
148	0.16
149	0.16
150	0.15
151	0.12
152	0.08
153	0.07
154	0.05
155	0.05
156	0.05
157	0.05
158	0.06
159	0.07
160	0.07
161	0.09
162	0.1
163	0.11
164	0.11
165	0.11
166	0.11
167	0.11
168	0.11
169	0.13
170	0.12
171	0.11
172	0.11
173	0.11
174	0.12
175	0.11
176	0.11
177	0.08
178	0.07
179	0.08
180	0.1
181	0.14
182	0.15
183	0.18
184	0.24
185	0.33
186	0.42
187	0.49
188	0.57
189	0.63
190	0.7
191	0.78
192	0.82
193	0.84
194	0.87
195	0.89
196	0.91
197	0.9
198	0.9
199	0.91
200	0.89
201	0.89
202	0.89
203	0.89
204	0.88
205	0.91
206	0.92
207	0.93
208	0.93
209	0.93
210	0.93
211	0.92
212	0.92
213	0.92
214	0.92
215	0.89
216	0.83
217	0.76
218	0.68
219	0.62
220	0.54
221	0.5
222	0.42
223	0.33
224	0.29
225	0.25
226	0.22
227	0.19
228	0.17
229	0.11
230	0.09
231	0.12
232	0.12
233	0.13
234	0.15
235	0.16
236	0.24
237	0.25
238	0.24
239	0.22
240	0.22
241	0.21
242	0.2
243	0.16
244	0.08
245	0.06
246	0.05
247	0.04
248	0.04
249	0.04
250	0.04
251	0.03
252	0.03
253	0.03
254	0.03
255	0.04
256	0.04
257	0.03
258	0.03
259	0.04
260	0.04
261	0.03
262	0.03
263	0.03
264	0.03
265	0.03
266	0.03
267	0.04
268	0.04
269	0.04
270	0.04
271	0.04
272	0.04
273	0.04
274	0.04
275	0.05
276	0.04
277	0.05
278	0.06
279	0.07
280	0.07
281	0.09
282	0.09
283	0.08
284	0.09
285	0.1
286	0.09
287	0.11
288	0.12
289	0.16
290	0.16
291	0.16
292	0.17
293	0.17
294	0.19
295	0.17
296	0.16
297	0.11
298	0.13
299	0.14
300	0.14
301	0.15
302	0.13
303	0.15
304	0.16
305	0.16
306	0.14
307	0.14
308	0.15
309	0.19
310	0.24
311	0.22
312	0.21
313	0.21
314	0.22
315	0.23
316	0.22
317	0.17
318	0.12
319	0.16
320	0.16
321	0.15
322	0.14
323	0.12
324	0.13
325	0.13
326	0.13
327	0.08
328	0.08
329	0.1
330	0.15
331	0.15
332	0.13
333	0.13
334	0.13
335	0.18
336	0.18
337	0.22
338	0.18
339	0.2
340	0.2
341	0.2
342	0.2
343	0.16
344	0.16
345	0.11
346	0.15
347	0.17
348	0.19
349	0.19
350	0.2
351	0.19
352	0.19
353	0.19
354	0.15
355	0.14
356	0.14
357	0.13
358	0.13
359	0.13
360	0.13
361	0.13
362	0.12
363	0.09
364	0.08
365	0.07
366	0.07
367	0.07
368	0.07
369	0.08
370	0.08
371	0.08
372	0.08
373	0.09
374	0.07
375	0.06
376	0.07
377	0.06
378	0.06
379	0.05
380	0.05
381	0.05
382	0.05
383	0.06
384	0.06
385	0.06
386	0.06
387	0.06
388	0.07
389	0.07
390	0.08
391	0.08
392	0.08
393	0.09
394	0.09
395	0.11
396	0.1
397	0.1
398	0.09
399	0.08
400	0.07
401	0.06
402	0.06
403	0.05
404	0.05
405	0.05
406	0.06
407	0.09
408	0.09
409	0.09
410	0.09
411	0.1
412	0.1
413	0.12
414	0.12
415	0.11
416	0.12
417	0.13
418	0.16
419	0.15
420	0.17
421	0.16
422	0.16
423	0.16
424	0.21
425	0.22
426	0.2
427	0.22
428	0.21
429	0.22
430	0.22
431	0.23
432	0.17
433	0.17
434	0.16
435	0.14
436	0.14
437	0.11
438	0.1
439	0.08
440	0.07
441	0.06
442	0.07
443	0.07
444	0.07
445	0.08
446	0.1
447	0.12
448	0.12
449	0.13
450	0.13
451	0.12
452	0.12
453	0.12
454	0.11
455	0.09
456	0.09
457	0.08
458	0.08
459	0.11
460	0.11
461	0.12
462	0.12
463	0.12
464	0.13
465	0.16
466	0.19
467	0.17
468	0.19
469	0.21
470	0.26
471	0.33
472	0.38
473	0.41
474	0.46
475	0.53
476	0.6
477	0.59
478	0.63
479	0.6
480	0.62
481	0.58
482	0.54
483	0.47
484	0.38
485	0.38
486	0.3
487	0.25
488	0.16
489	0.14
490	0.11
491	0.1
492	0.1
493	0.09
494	0.07
495	0.07
496	0.08
497	0.08
498	0.09
499	0.08
500	0.08
501	0.09
502	0.1
503	0.14
504	0.13
505	0.12
506	0.12
507	0.14
508	0.16
509	0.17
510	0.16
511	0.15
512	0.15
513	0.16
514	0.18
515	0.18
516	0.24
517	0.31
518	0.39
519	0.46
520	0.55
521	0.65
522	0.72
523	0.81
524	0.83
525	0.84
526	0.87
527	0.88
528	0.89
529	0.87
530	0.85
531	0.78
532	0.72
533	0.67
534	0.66
535	0.58
536	0.52
537	0.51
538	0.44
539	0.42
540	0.38
541	0.33
542	0.26
543	0.25
544	0.23
545	0.21
546	0.28
547	0.26
548	0.27
549	0.28
550	0.31
551	0.33
552	0.38
553	0.38
554	0.33
555	0.34
556	0.4

A0A367LD87

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer