Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A1DBJ7

Protein Details
Accession A1DBJ7    Localization Confidence Low Confidence Score 5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
229-248NNDKEPKKKGSGPSNACKYKHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) extr 17, mito 5, cyto 2.5, cyto_nucl 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004898  Pectate_lyase_PlyH/PlyE-like  
IPR012334  Pectin_lyas_fold  
IPR011050  Pectin_lyase_fold/virulence  
Gene Ontology GO:0005576  C:extracellular region  
GO:0030570  F:pectate lyase activity  
GO:0071555  P:cell wall organization  
GO:0000272  P:polysaccharide catabolic process  
KEGG nfi:NFIA_098670  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF03211  Pectate_lyase  
Amino Acid Sequences MYQPLLLLPLLLTSAFATPHDPTTHQALDKRASFPIPSSKGSVTYSSPKSVSGTFDGGLKTYGRGVKCSGQKEGGDKDAVFILEDGATLKNAIIGADQIEGVHCKGSCTIQNVWWTDVCEDALSLKGSGSGTHRIIGGGARNADDKVIQHNSGGKVTIQDFTVQNFGKLYRACGNCSKQFKRTVEISGVKASSGKSLVGINSNYGDTATISGCASSVKEICVEYEGTDNNDKEPKKKGSGPSNACKYKEPLSKC
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.08
2 0.08
3 0.09
4 0.11
5 0.12
6 0.17
7 0.19
8 0.19
9 0.21
10 0.27
11 0.31
12 0.31
13 0.34
14 0.35
15 0.39
16 0.41
17 0.41
18 0.36
19 0.34
20 0.31
21 0.31
22 0.36
23 0.34
24 0.33
25 0.34
26 0.33
27 0.34
28 0.36
29 0.35
30 0.29
31 0.33
32 0.34
33 0.33
34 0.32
35 0.3
36 0.3
37 0.29
38 0.28
39 0.23
40 0.22
41 0.19
42 0.21
43 0.2
44 0.18
45 0.18
46 0.15
47 0.12
48 0.14
49 0.18
50 0.16
51 0.18
52 0.21
53 0.26
54 0.32
55 0.35
56 0.34
57 0.34
58 0.35
59 0.38
60 0.38
61 0.34
62 0.29
63 0.26
64 0.23
65 0.2
66 0.19
67 0.14
68 0.11
69 0.09
70 0.06
71 0.07
72 0.07
73 0.06
74 0.06
75 0.06
76 0.05
77 0.06
78 0.06
79 0.06
80 0.05
81 0.05
82 0.05
83 0.06
84 0.06
85 0.05
86 0.05
87 0.06
88 0.06
89 0.07
90 0.06
91 0.06
92 0.07
93 0.09
94 0.12
95 0.15
96 0.16
97 0.19
98 0.24
99 0.25
100 0.25
101 0.24
102 0.23
103 0.19
104 0.18
105 0.14
106 0.09
107 0.07
108 0.06
109 0.07
110 0.06
111 0.06
112 0.05
113 0.06
114 0.06
115 0.07
116 0.1
117 0.12
118 0.13
119 0.13
120 0.13
121 0.12
122 0.12
123 0.12
124 0.12
125 0.09
126 0.09
127 0.09
128 0.1
129 0.1
130 0.1
131 0.1
132 0.08
133 0.12
134 0.14
135 0.13
136 0.14
137 0.18
138 0.19
139 0.19
140 0.19
141 0.14
142 0.13
143 0.14
144 0.15
145 0.11
146 0.12
147 0.12
148 0.13
149 0.18
150 0.16
151 0.16
152 0.15
153 0.15
154 0.17
155 0.17
156 0.19
157 0.21
158 0.23
159 0.26
160 0.33
161 0.38
162 0.42
163 0.51
164 0.52
165 0.5
166 0.57
167 0.56
168 0.53
169 0.51
170 0.47
171 0.45
172 0.45
173 0.42
174 0.37
175 0.35
176 0.3
177 0.28
178 0.25
179 0.19
180 0.16
181 0.13
182 0.1
183 0.12
184 0.13
185 0.16
186 0.16
187 0.15
188 0.16
189 0.16
190 0.15
191 0.13
192 0.12
193 0.08
194 0.1
195 0.08
196 0.08
197 0.08
198 0.08
199 0.08
200 0.08
201 0.08
202 0.1
203 0.11
204 0.1
205 0.12
206 0.12
207 0.13
208 0.15
209 0.15
210 0.13
211 0.16
212 0.16
213 0.19
214 0.24
215 0.24
216 0.25
217 0.32
218 0.32
219 0.32
220 0.39
221 0.42
222 0.44
223 0.51
224 0.57
225 0.6
226 0.7
227 0.75
228 0.77
229 0.8
230 0.8
231 0.75
232 0.7
233 0.64
234 0.63