Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A1DDY3

Protein Details
Accession A1DDY3    Localization Confidence High Confidence Score 21.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
226-250NNEARVFNPEKKKRKREGYEEGDYTHydrophilic
363-392LQRLQEKESSKRKKERRKENEKKRKEIIRMBasic
694-717MEAKGRKKMKAAQRLEKLRKKSALHydrophilic
732-757AIAKLMSKAVKKKPKQQVKLVVAKGAHydrophilic
775-794VDSRMKKDIRAQKRLAKKKKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
7-14HGKGRLDK
19-20AK
236-241KKKRKR
371-388SSKRKKERRKENEKKRKE
485-486KK
665-715KPQRPITKAAAAAIKEKLRAINARPIKKVMEAKGRKKMKAAQRLEKLRKKS
738-794SKAVKKKPKQQVKLVVAKGANRGISGRPRGVKGKYKIVDSRMKKDIRAQKRLAKKKK
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 11.5, mito 6, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002877  RNA_MeTrfase_FtsJ_dom  
IPR015507  rRNA-MeTfrase_E  
IPR012920  rRNA_MeTfrase_SPB1-like_C  
IPR024576  rRNA_MeTfrase_Spb1_DUF3381  
IPR029063  SAM-dependent_MTases_sf  
IPR028589  SPB1-like  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0030687  C:preribosome, large subunit precursor  
GO:0070039  F:rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase activity  
GO:0008650  F:rRNA (uridine-2'-O-)-methyltransferase activity  
GO:0000466  P:maturation of 5.8S rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000463  P:maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
KEGG nfi:NFIA_075190  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF11861  DUF3381  
PF01728  FtsJ  
PF07780  Spb1_C  
Amino Acid Sequences MAIQKKHGKGRLDKWYRLAKEKGYRARAAFKLIQLNKKYGFLEKSKVLLDLCAAPGSWCQVAAECMPTQSIIIGVDLAPIKPIPRVITFQSDITTEKCRATIRQHLKHWKADTVLHDGAPNVGTAWVQDAFSQAELVLQSMKLATEFLVEGGTFVTKVFRSKDYNPLLWVFKQLFTSVEATKPPSSRNVSAEIFVVCRGFKAPKRIDPKFLDPKHVFAELTDATPNNEARVFNPEKKKRKREGYEEGDYTQFKEIPVTEFINTTDPIAILGTYNKLSFEQSPGGDLALATLNRLEETTDEIRTCCEDLKILGKKEFRNLLRWRLKVREKFGLVVKKGQAKTDEPEEVAEVAPMDEELAIQEELQRLQEKESSKRKKERRKENEKKRKEIIRMQMHMTTPMDIGMEQLGPGGEDATFSLKRVERDGARDVIASGKVAEIESDSEDDQTGSDDESDDEGDQLERELDSLYEQYQERREDRDSKVRAKKARKDYEADEWDGFSDSDKEDDEESEEDGASQAVVKPAPPKSGTLSSKAAMFFDQDIFQGLGDVDDVEDDDSAIEMQEDDKSAKRGSVLEKQAPKDAKKKAQATEVFSDSEPEEPDDPRKKNGQLDIDIITAEAMALAQQMATGEKKSQDIVDDGFNRYTFRDVDGLPEWFLDDENKHSKPQRPITKAAAAAIKEKLRAINARPIKKVMEAKGRKKMKAAQRLEKLRKKSALLADDEALSERDKSQAIAKLMSKAVKKKPKQQVKLVVAKGANRGISGRPRGVKGKYKIVDSRMKKDIRAQKRLAKKKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.74
2 0.77
3 0.74
4 0.73
5 0.7
6 0.68
7 0.69
8 0.73
9 0.75
10 0.72
11 0.73
12 0.69
13 0.72
14 0.65
15 0.63
16 0.58
17 0.54
18 0.57
19 0.57
20 0.62
21 0.57
22 0.6
23 0.55
24 0.54
25 0.51
26 0.47
27 0.47
28 0.42
29 0.46
30 0.43
31 0.44
32 0.41
33 0.42
34 0.35
35 0.29
36 0.26
37 0.23
38 0.21
39 0.18
40 0.16
41 0.15
42 0.16
43 0.18
44 0.16
45 0.13
46 0.12
47 0.12
48 0.15
49 0.15
50 0.18
51 0.15
52 0.15
53 0.15
54 0.15
55 0.14
56 0.12
57 0.11
58 0.08
59 0.07
60 0.08
61 0.07
62 0.1
63 0.11
64 0.11
65 0.11
66 0.11
67 0.12
68 0.13
69 0.16
70 0.16
71 0.19
72 0.23
73 0.26
74 0.33
75 0.34
76 0.34
77 0.33
78 0.3
79 0.29
80 0.27
81 0.29
82 0.23
83 0.22
84 0.24
85 0.25
86 0.28
87 0.34
88 0.42
89 0.48
90 0.55
91 0.64
92 0.72
93 0.76
94 0.79
95 0.75
96 0.69
97 0.61
98 0.57
99 0.51
100 0.48
101 0.44
102 0.36
103 0.33
104 0.28
105 0.27
106 0.22
107 0.18
108 0.1
109 0.08
110 0.07
111 0.07
112 0.1
113 0.09
114 0.09
115 0.09
116 0.11
117 0.11
118 0.11
119 0.12
120 0.08
121 0.09
122 0.09
123 0.09
124 0.08
125 0.07
126 0.07
127 0.07
128 0.08
129 0.06
130 0.07
131 0.06
132 0.07
133 0.07
134 0.07
135 0.07
136 0.07
137 0.07
138 0.07
139 0.07
140 0.06
141 0.06
142 0.08
143 0.08
144 0.12
145 0.15
146 0.19
147 0.26
148 0.3
149 0.4
150 0.44
151 0.45
152 0.45
153 0.45
154 0.44
155 0.38
156 0.4
157 0.32
158 0.27
159 0.26
160 0.24
161 0.21
162 0.19
163 0.22
164 0.18
165 0.19
166 0.18
167 0.22
168 0.25
169 0.26
170 0.25
171 0.29
172 0.34
173 0.35
174 0.36
175 0.38
176 0.35
177 0.35
178 0.34
179 0.28
180 0.22
181 0.19
182 0.17
183 0.11
184 0.1
185 0.11
186 0.16
187 0.19
188 0.29
189 0.34
190 0.42
191 0.51
192 0.55
193 0.61
194 0.61
195 0.66
196 0.67
197 0.63
198 0.64
199 0.56
200 0.56
201 0.51
202 0.46
203 0.36
204 0.25
205 0.29
206 0.2
207 0.2
208 0.18
209 0.15
210 0.14
211 0.17
212 0.17
213 0.13
214 0.15
215 0.14
216 0.13
217 0.22
218 0.26
219 0.31
220 0.42
221 0.5
222 0.59
223 0.69
224 0.78
225 0.79
226 0.85
227 0.86
228 0.85
229 0.86
230 0.83
231 0.8
232 0.72
233 0.65
234 0.57
235 0.48
236 0.4
237 0.31
238 0.24
239 0.16
240 0.15
241 0.14
242 0.14
243 0.17
244 0.17
245 0.16
246 0.16
247 0.17
248 0.18
249 0.17
250 0.15
251 0.12
252 0.1
253 0.09
254 0.09
255 0.08
256 0.06
257 0.06
258 0.08
259 0.08
260 0.08
261 0.08
262 0.09
263 0.11
264 0.11
265 0.14
266 0.15
267 0.14
268 0.16
269 0.15
270 0.15
271 0.13
272 0.12
273 0.09
274 0.09
275 0.08
276 0.07
277 0.07
278 0.07
279 0.07
280 0.08
281 0.07
282 0.05
283 0.11
284 0.13
285 0.14
286 0.14
287 0.14
288 0.15
289 0.16
290 0.16
291 0.11
292 0.1
293 0.09
294 0.1
295 0.18
296 0.23
297 0.24
298 0.28
299 0.32
300 0.33
301 0.38
302 0.44
303 0.38
304 0.41
305 0.43
306 0.49
307 0.52
308 0.54
309 0.53
310 0.54
311 0.61
312 0.59
313 0.6
314 0.57
315 0.5
316 0.5
317 0.52
318 0.51
319 0.44
320 0.42
321 0.4
322 0.4
323 0.39
324 0.38
325 0.35
326 0.29
327 0.31
328 0.3
329 0.28
330 0.21
331 0.21
332 0.19
333 0.17
334 0.14
335 0.12
336 0.07
337 0.05
338 0.05
339 0.04
340 0.04
341 0.03
342 0.03
343 0.03
344 0.04
345 0.04
346 0.04
347 0.06
348 0.07
349 0.07
350 0.08
351 0.1
352 0.09
353 0.1
354 0.14
355 0.16
356 0.24
357 0.34
358 0.43
359 0.49
360 0.58
361 0.67
362 0.73
363 0.81
364 0.84
365 0.84
366 0.86
367 0.9
368 0.92
369 0.94
370 0.91
371 0.88
372 0.84
373 0.8
374 0.75
375 0.72
376 0.7
377 0.68
378 0.62
379 0.58
380 0.54
381 0.46
382 0.42
383 0.34
384 0.25
385 0.15
386 0.13
387 0.11
388 0.07
389 0.07
390 0.05
391 0.05
392 0.04
393 0.04
394 0.04
395 0.04
396 0.04
397 0.04
398 0.03
399 0.03
400 0.03
401 0.07
402 0.07
403 0.08
404 0.11
405 0.13
406 0.14
407 0.16
408 0.2
409 0.18
410 0.22
411 0.25
412 0.23
413 0.21
414 0.21
415 0.19
416 0.17
417 0.15
418 0.11
419 0.08
420 0.06
421 0.06
422 0.06
423 0.06
424 0.04
425 0.05
426 0.06
427 0.07
428 0.07
429 0.07
430 0.07
431 0.07
432 0.07
433 0.06
434 0.06
435 0.05
436 0.05
437 0.05
438 0.06
439 0.06
440 0.07
441 0.06
442 0.06
443 0.06
444 0.06
445 0.05
446 0.05
447 0.05
448 0.04
449 0.04
450 0.05
451 0.04
452 0.05
453 0.06
454 0.06
455 0.09
456 0.09
457 0.11
458 0.16
459 0.19
460 0.2
461 0.23
462 0.27
463 0.31
464 0.36
465 0.43
466 0.44
467 0.51
468 0.58
469 0.61
470 0.65
471 0.68
472 0.72
473 0.73
474 0.78
475 0.72
476 0.68
477 0.65
478 0.67
479 0.61
480 0.55
481 0.44
482 0.34
483 0.3
484 0.27
485 0.23
486 0.13
487 0.11
488 0.08
489 0.09
490 0.09
491 0.09
492 0.09
493 0.09
494 0.11
495 0.1
496 0.1
497 0.1
498 0.09
499 0.08
500 0.08
501 0.07
502 0.05
503 0.05
504 0.05
505 0.06
506 0.06
507 0.07
508 0.12
509 0.14
510 0.18
511 0.18
512 0.19
513 0.23
514 0.32
515 0.33
516 0.33
517 0.34
518 0.31
519 0.33
520 0.31
521 0.27
522 0.18
523 0.18
524 0.14
525 0.13
526 0.13
527 0.1
528 0.11
529 0.11
530 0.1
531 0.09
532 0.08
533 0.06
534 0.06
535 0.06
536 0.04
537 0.04
538 0.04
539 0.04
540 0.04
541 0.04
542 0.04
543 0.04
544 0.04
545 0.04
546 0.04
547 0.03
548 0.04
549 0.05
550 0.06
551 0.08
552 0.1
553 0.12
554 0.13
555 0.13
556 0.14
557 0.17
558 0.22
559 0.29
560 0.34
561 0.4
562 0.45
563 0.47
564 0.52
565 0.53
566 0.53
567 0.52
568 0.53
569 0.55
570 0.57
571 0.62
572 0.59
573 0.63
574 0.64
575 0.61
576 0.58
577 0.51
578 0.44
579 0.37
580 0.35
581 0.27
582 0.23
583 0.18
584 0.16
585 0.15
586 0.15
587 0.24
588 0.3
589 0.32
590 0.35
591 0.4
592 0.42
593 0.46
594 0.51
595 0.5
596 0.44
597 0.45
598 0.43
599 0.37
600 0.33
601 0.27
602 0.2
603 0.12
604 0.09
605 0.05
606 0.03
607 0.03
608 0.03
609 0.03
610 0.03
611 0.03
612 0.04
613 0.06
614 0.07
615 0.08
616 0.1
617 0.12
618 0.13
619 0.14
620 0.15
621 0.15
622 0.16
623 0.17
624 0.22
625 0.23
626 0.25
627 0.26
628 0.25
629 0.24
630 0.23
631 0.23
632 0.17
633 0.17
634 0.17
635 0.16
636 0.21
637 0.23
638 0.24
639 0.21
640 0.2
641 0.19
642 0.15
643 0.16
644 0.13
645 0.12
646 0.17
647 0.24
648 0.25
649 0.3
650 0.36
651 0.44
652 0.51
653 0.6
654 0.64
655 0.63
656 0.68
657 0.69
658 0.7
659 0.63
660 0.57
661 0.52
662 0.42
663 0.39
664 0.39
665 0.34
666 0.28
667 0.29
668 0.27
669 0.27
670 0.31
671 0.32
672 0.37
673 0.43
674 0.49
675 0.51
676 0.52
677 0.49
678 0.51
679 0.54
680 0.52
681 0.54
682 0.57
683 0.63
684 0.7
685 0.76
686 0.71
687 0.7
688 0.7
689 0.69
690 0.7
691 0.71
692 0.71
693 0.74
694 0.83
695 0.87
696 0.87
697 0.83
698 0.82
699 0.78
700 0.71
701 0.69
702 0.66
703 0.61
704 0.58
705 0.54
706 0.46
707 0.41
708 0.38
709 0.31
710 0.24
711 0.19
712 0.15
713 0.12
714 0.13
715 0.13
716 0.14
717 0.19
718 0.25
719 0.27
720 0.31
721 0.33
722 0.35
723 0.39
724 0.43
725 0.44
726 0.46
727 0.53
728 0.58
729 0.64
730 0.69
731 0.77
732 0.82
733 0.85
734 0.86
735 0.87
736 0.86
737 0.88
738 0.8
739 0.76
740 0.68
741 0.62
742 0.57
743 0.5
744 0.41
745 0.32
746 0.32
747 0.31
748 0.37
749 0.4
750 0.42
751 0.43
752 0.47
753 0.54
754 0.59
755 0.63
756 0.61
757 0.65
758 0.62
759 0.65
760 0.67
761 0.68
762 0.7
763 0.67
764 0.68
765 0.67
766 0.66
767 0.61
768 0.64
769 0.67
770 0.67
771 0.7
772 0.7
773 0.7
774 0.78