Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A1CZB8

Protein Details
Accession A1CZB8    Localization Confidence High Confidence Score 17.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
335-354GTPIRRKKRKGALTNPSAYSHydrophilic
449-472KTSAQAKRKGAKAKRGKNGNEAIGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
339-344RRKKRK
454-466AKRKGAKAKRGKN
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 12, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007307  Ltv1  
Gene Ontology GO:0042274  P:ribosomal small subunit biogenesis  
KEGG nfi:NFIA_036600  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04180  LTV  
Amino Acid Sequences MPPRKQWIDKKNATTYQLFHRSQNDPLIHDPEADDRVLHPVSGPSLPISEGKKRSKNLSDLSSEFGSDSVRQNEGEAANYGIYFDDTKYDYMQHLRELGTGGGESYFVEATSKGKSKAKGMKLEDALKQQMTLDDTRSEFGASSVYGSEYTSDLRSTTSSYSRKPTYQDQQDVPDAIAGFKPDMDPRLREVLEALEDEEYVDPDDEEDVFGKLTNHAEELDPGEWEDTLFDEEDEDDGWESDATEKAPVQMNTTEAKADHGGVPLPPKSDDQEPGELPSHDAPAPDMDPEEQGWMREFAKFKKDAKVKAAPAAPPSIVPSEQRSTLASTIFTVGGTPIRRKKRKGALTNPSAYSMTSSALARTEGHRLLDDRFDRIEALYALDEEGEEYDDNMSMVSGMTGMTGMTGMTGISTASSQAPSLIDANGREVAPRHNFNEVMDDFLAGWDDKTSAQAKRKGAKAKRGKNGNEAIGIKMLEEIRQGLGPARVPGKVSGRA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.7
2 0.63
3 0.62
4 0.63
5 0.57
6 0.51
7 0.52
8 0.5
9 0.51
10 0.56
11 0.48
12 0.42
13 0.45
14 0.46
15 0.39
16 0.37
17 0.33
18 0.29
19 0.29
20 0.25
21 0.2
22 0.16
23 0.21
24 0.2
25 0.19
26 0.15
27 0.15
28 0.17
29 0.18
30 0.18
31 0.13
32 0.14
33 0.15
34 0.19
35 0.23
36 0.28
37 0.36
38 0.45
39 0.52
40 0.55
41 0.63
42 0.66
43 0.69
44 0.67
45 0.65
46 0.62
47 0.56
48 0.57
49 0.49
50 0.41
51 0.33
52 0.26
53 0.21
54 0.17
55 0.21
56 0.19
57 0.19
58 0.19
59 0.2
60 0.24
61 0.23
62 0.22
63 0.18
64 0.16
65 0.15
66 0.15
67 0.14
68 0.1
69 0.1
70 0.09
71 0.08
72 0.1
73 0.11
74 0.13
75 0.14
76 0.15
77 0.17
78 0.21
79 0.22
80 0.21
81 0.23
82 0.22
83 0.22
84 0.22
85 0.19
86 0.15
87 0.13
88 0.11
89 0.08
90 0.08
91 0.07
92 0.07
93 0.07
94 0.06
95 0.06
96 0.07
97 0.08
98 0.13
99 0.17
100 0.19
101 0.24
102 0.27
103 0.35
104 0.44
105 0.5
106 0.54
107 0.55
108 0.6
109 0.6
110 0.63
111 0.58
112 0.54
113 0.49
114 0.4
115 0.35
116 0.28
117 0.24
118 0.22
119 0.2
120 0.17
121 0.17
122 0.17
123 0.18
124 0.18
125 0.16
126 0.13
127 0.11
128 0.1
129 0.07
130 0.08
131 0.07
132 0.08
133 0.07
134 0.07
135 0.08
136 0.08
137 0.09
138 0.09
139 0.09
140 0.09
141 0.09
142 0.1
143 0.11
144 0.13
145 0.2
146 0.23
147 0.26
148 0.32
149 0.35
150 0.37
151 0.39
152 0.44
153 0.47
154 0.52
155 0.55
156 0.5
157 0.51
158 0.5
159 0.47
160 0.38
161 0.3
162 0.21
163 0.16
164 0.13
165 0.1
166 0.08
167 0.07
168 0.08
169 0.08
170 0.11
171 0.13
172 0.14
173 0.17
174 0.23
175 0.22
176 0.21
177 0.21
178 0.19
179 0.18
180 0.16
181 0.14
182 0.08
183 0.08
184 0.08
185 0.08
186 0.07
187 0.06
188 0.06
189 0.05
190 0.05
191 0.05
192 0.05
193 0.05
194 0.06
195 0.05
196 0.05
197 0.06
198 0.06
199 0.07
200 0.08
201 0.08
202 0.08
203 0.08
204 0.09
205 0.09
206 0.11
207 0.1
208 0.09
209 0.08
210 0.08
211 0.07
212 0.07
213 0.06
214 0.04
215 0.05
216 0.05
217 0.05
218 0.05
219 0.05
220 0.05
221 0.05
222 0.05
223 0.04
224 0.04
225 0.05
226 0.04
227 0.04
228 0.05
229 0.05
230 0.05
231 0.06
232 0.06
233 0.07
234 0.11
235 0.12
236 0.13
237 0.13
238 0.15
239 0.15
240 0.16
241 0.14
242 0.11
243 0.12
244 0.1
245 0.1
246 0.09
247 0.09
248 0.09
249 0.09
250 0.12
251 0.11
252 0.12
253 0.12
254 0.12
255 0.14
256 0.16
257 0.18
258 0.19
259 0.21
260 0.21
261 0.22
262 0.23
263 0.21
264 0.2
265 0.17
266 0.16
267 0.13
268 0.13
269 0.1
270 0.1
271 0.11
272 0.09
273 0.09
274 0.08
275 0.08
276 0.08
277 0.11
278 0.09
279 0.09
280 0.1
281 0.11
282 0.11
283 0.14
284 0.16
285 0.16
286 0.23
287 0.27
288 0.29
289 0.36
290 0.42
291 0.43
292 0.48
293 0.53
294 0.49
295 0.5
296 0.51
297 0.43
298 0.39
299 0.37
300 0.3
301 0.22
302 0.22
303 0.18
304 0.15
305 0.15
306 0.18
307 0.18
308 0.19
309 0.19
310 0.18
311 0.19
312 0.19
313 0.18
314 0.14
315 0.13
316 0.13
317 0.12
318 0.11
319 0.08
320 0.08
321 0.11
322 0.13
323 0.18
324 0.25
325 0.36
326 0.43
327 0.47
328 0.56
329 0.63
330 0.71
331 0.75
332 0.78
333 0.78
334 0.79
335 0.81
336 0.72
337 0.64
338 0.54
339 0.43
340 0.34
341 0.25
342 0.17
343 0.13
344 0.12
345 0.1
346 0.11
347 0.12
348 0.11
349 0.12
350 0.17
351 0.17
352 0.17
353 0.18
354 0.19
355 0.2
356 0.27
357 0.27
358 0.24
359 0.23
360 0.23
361 0.22
362 0.2
363 0.21
364 0.13
365 0.14
366 0.11
367 0.1
368 0.1
369 0.09
370 0.09
371 0.07
372 0.07
373 0.06
374 0.06
375 0.06
376 0.07
377 0.07
378 0.07
379 0.06
380 0.06
381 0.05
382 0.04
383 0.04
384 0.04
385 0.03
386 0.03
387 0.04
388 0.03
389 0.03
390 0.03
391 0.03
392 0.03
393 0.03
394 0.03
395 0.03
396 0.03
397 0.03
398 0.04
399 0.04
400 0.05
401 0.07
402 0.07
403 0.07
404 0.09
405 0.09
406 0.1
407 0.12
408 0.12
409 0.13
410 0.13
411 0.16
412 0.17
413 0.17
414 0.16
415 0.17
416 0.23
417 0.28
418 0.32
419 0.31
420 0.34
421 0.34
422 0.34
423 0.41
424 0.34
425 0.31
426 0.27
427 0.25
428 0.2
429 0.19
430 0.2
431 0.12
432 0.12
433 0.08
434 0.09
435 0.08
436 0.12
437 0.17
438 0.22
439 0.31
440 0.37
441 0.45
442 0.52
443 0.59
444 0.66
445 0.7
446 0.74
447 0.77
448 0.8
449 0.82
450 0.84
451 0.82
452 0.81
453 0.8
454 0.74
455 0.7
456 0.61
457 0.53
458 0.46
459 0.41
460 0.31
461 0.27
462 0.23
463 0.17
464 0.17
465 0.16
466 0.15
467 0.16
468 0.16
469 0.16
470 0.19
471 0.2
472 0.23
473 0.24
474 0.24
475 0.25
476 0.3