Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A367LSD6

Protein Details
Accession A0A367LSD6    Localization Confidence High Confidence Score 24.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
342-365KTEERPQEPSRKKRKSSNGKVVLHBasic
385-404DDNGIPRRRRRSRTEGTGTSHydrophilic
408-428DAPAAPTKKSRQRKQATNGAAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
352-356RKKRK
392-395RRRR
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011598  bHLH_dom  
IPR036638  HLH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0046983  F:protein dimerization activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF00010  HLH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50888  BHLH  
CDD cd11404  bHLHzip_Mlx_like  
Amino Acid Sequences MAPLPSEASGPSPLLPFGYGIEPPSHDSTCTAPVPAPGTPILSETDNQTLHDFFECLSSNQCNDFSLGEGLNASDAWADLPPSLMGTATSFGSQPVAPIRCTHQYNHQYIFSSPPYYQQPRVCHFDHHLVSPTLLPQYHQTSTLSQSHQTPALPLPLQTSTFSHPHHTPDLAHPLQSPTVSHPNQSSYQLYRHSSQDVPSATAAWPQPMPPTPAPQNPLNTQLPFRVSGQLPGQMRHQNIEEFRADTRRSSNAANHSPTMADWMAGPGSMPSLRKPAAIFDDIKWGSDNTFKPAQNYAPEPPHDPTEVTNLDSLQSMFLDIDYSASNTPCNSPVDEGSALVKTEERPQEPSRKKRKSSNGKVVLHQHVDQADDGNDDDDDDKDNDDNGIPRRRRRSRTEGTGTSSSIDAPAAPTKKSRQRKQATNGAAAKAPRENLTDEQKRENHIKSEQKRRTVIRDGFDSLNKLVPSLRVGTFSKSTTLSVAAQWLDEFVGGNDQLTAQLEKLDPEKARSISAKAEEKHNRRVDSKEATVRDG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.16
3 0.13
4 0.13
5 0.15
6 0.14
7 0.15
8 0.17
9 0.18
10 0.22
11 0.26
12 0.25
13 0.22
14 0.23
15 0.25
16 0.28
17 0.28
18 0.25
19 0.21
20 0.23
21 0.26
22 0.25
23 0.24
24 0.19
25 0.2
26 0.19
27 0.19
28 0.19
29 0.17
30 0.17
31 0.18
32 0.23
33 0.22
34 0.22
35 0.23
36 0.21
37 0.21
38 0.21
39 0.18
40 0.12
41 0.17
42 0.17
43 0.16
44 0.2
45 0.21
46 0.22
47 0.24
48 0.25
49 0.21
50 0.2
51 0.2
52 0.18
53 0.18
54 0.16
55 0.13
56 0.13
57 0.12
58 0.11
59 0.1
60 0.08
61 0.05
62 0.05
63 0.06
64 0.06
65 0.07
66 0.06
67 0.07
68 0.07
69 0.08
70 0.08
71 0.07
72 0.07
73 0.07
74 0.09
75 0.08
76 0.09
77 0.09
78 0.09
79 0.11
80 0.1
81 0.11
82 0.17
83 0.18
84 0.18
85 0.2
86 0.25
87 0.31
88 0.33
89 0.34
90 0.37
91 0.44
92 0.49
93 0.51
94 0.49
95 0.43
96 0.42
97 0.45
98 0.37
99 0.32
100 0.26
101 0.27
102 0.33
103 0.36
104 0.42
105 0.42
106 0.47
107 0.49
108 0.55
109 0.51
110 0.47
111 0.46
112 0.49
113 0.44
114 0.39
115 0.39
116 0.33
117 0.33
118 0.29
119 0.26
120 0.2
121 0.18
122 0.16
123 0.16
124 0.21
125 0.21
126 0.22
127 0.21
128 0.21
129 0.26
130 0.31
131 0.29
132 0.25
133 0.27
134 0.28
135 0.28
136 0.26
137 0.23
138 0.19
139 0.21
140 0.2
141 0.18
142 0.18
143 0.18
144 0.19
145 0.18
146 0.19
147 0.18
148 0.22
149 0.23
150 0.25
151 0.25
152 0.28
153 0.29
154 0.28
155 0.26
156 0.27
157 0.34
158 0.3
159 0.29
160 0.26
161 0.25
162 0.25
163 0.23
164 0.2
165 0.16
166 0.25
167 0.24
168 0.25
169 0.25
170 0.27
171 0.29
172 0.31
173 0.3
174 0.23
175 0.26
176 0.3
177 0.31
178 0.29
179 0.29
180 0.3
181 0.28
182 0.26
183 0.28
184 0.24
185 0.23
186 0.21
187 0.2
188 0.17
189 0.19
190 0.18
191 0.14
192 0.13
193 0.12
194 0.14
195 0.15
196 0.2
197 0.18
198 0.23
199 0.26
200 0.3
201 0.33
202 0.33
203 0.35
204 0.32
205 0.37
206 0.34
207 0.31
208 0.28
209 0.26
210 0.25
211 0.22
212 0.22
213 0.2
214 0.18
215 0.19
216 0.19
217 0.23
218 0.22
219 0.21
220 0.25
221 0.24
222 0.24
223 0.23
224 0.23
225 0.21
226 0.21
227 0.23
228 0.2
229 0.17
230 0.17
231 0.2
232 0.19
233 0.17
234 0.19
235 0.18
236 0.19
237 0.2
238 0.23
239 0.26
240 0.31
241 0.32
242 0.3
243 0.28
244 0.26
245 0.24
246 0.23
247 0.15
248 0.1
249 0.08
250 0.08
251 0.07
252 0.07
253 0.07
254 0.03
255 0.04
256 0.06
257 0.06
258 0.07
259 0.1
260 0.11
261 0.12
262 0.12
263 0.14
264 0.16
265 0.18
266 0.19
267 0.16
268 0.24
269 0.23
270 0.24
271 0.22
272 0.18
273 0.16
274 0.21
275 0.21
276 0.17
277 0.23
278 0.23
279 0.24
280 0.26
281 0.28
282 0.25
283 0.27
284 0.26
285 0.24
286 0.25
287 0.26
288 0.25
289 0.25
290 0.23
291 0.21
292 0.18
293 0.2
294 0.2
295 0.17
296 0.17
297 0.15
298 0.14
299 0.14
300 0.13
301 0.07
302 0.06
303 0.06
304 0.05
305 0.05
306 0.05
307 0.04
308 0.05
309 0.05
310 0.06
311 0.07
312 0.07
313 0.08
314 0.08
315 0.09
316 0.11
317 0.12
318 0.12
319 0.12
320 0.13
321 0.16
322 0.16
323 0.15
324 0.14
325 0.13
326 0.12
327 0.11
328 0.11
329 0.09
330 0.16
331 0.2
332 0.2
333 0.25
334 0.3
335 0.41
336 0.49
337 0.59
338 0.63
339 0.68
340 0.72
341 0.76
342 0.82
343 0.83
344 0.85
345 0.85
346 0.85
347 0.78
348 0.78
349 0.75
350 0.7
351 0.61
352 0.51
353 0.42
354 0.33
355 0.3
356 0.26
357 0.19
358 0.14
359 0.12
360 0.11
361 0.09
362 0.08
363 0.08
364 0.08
365 0.07
366 0.09
367 0.09
368 0.1
369 0.1
370 0.1
371 0.1
372 0.11
373 0.15
374 0.19
375 0.28
376 0.32
377 0.39
378 0.49
379 0.58
380 0.65
381 0.69
382 0.73
383 0.73
384 0.79
385 0.81
386 0.75
387 0.73
388 0.68
389 0.59
390 0.5
391 0.4
392 0.3
393 0.21
394 0.16
395 0.09
396 0.09
397 0.15
398 0.16
399 0.17
400 0.2
401 0.29
402 0.39
403 0.49
404 0.56
405 0.61
406 0.69
407 0.78
408 0.83
409 0.84
410 0.8
411 0.79
412 0.74
413 0.65
414 0.58
415 0.48
416 0.42
417 0.35
418 0.31
419 0.24
420 0.22
421 0.24
422 0.26
423 0.36
424 0.41
425 0.42
426 0.48
427 0.49
428 0.51
429 0.54
430 0.53
431 0.49
432 0.49
433 0.57
434 0.58
435 0.67
436 0.7
437 0.71
438 0.74
439 0.74
440 0.73
441 0.73
442 0.7
443 0.64
444 0.62
445 0.58
446 0.54
447 0.51
448 0.46
449 0.37
450 0.36
451 0.3
452 0.25
453 0.22
454 0.2
455 0.2
456 0.21
457 0.21
458 0.21
459 0.23
460 0.27
461 0.29
462 0.29
463 0.29
464 0.26
465 0.26
466 0.22
467 0.24
468 0.2
469 0.18
470 0.21
471 0.18
472 0.17
473 0.16
474 0.15
475 0.12
476 0.11
477 0.1
478 0.07
479 0.1
480 0.1
481 0.1
482 0.1
483 0.1
484 0.11
485 0.12
486 0.13
487 0.09
488 0.12
489 0.13
490 0.15
491 0.17
492 0.22
493 0.22
494 0.26
495 0.32
496 0.3
497 0.35
498 0.36
499 0.37
500 0.38
501 0.44
502 0.48
503 0.44
504 0.53
505 0.59
506 0.62
507 0.69
508 0.7
509 0.68
510 0.63
511 0.66
512 0.65
513 0.63
514 0.65
515 0.63