Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A1DDX4

Protein Details
Accession A1DDX4    Localization Confidence Low Confidence Score 9.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
143-162GEEGSKKKKRTEKNVDMDKLBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
136-153KSKRAAGGEEGSKKKKRT
Subcellular Location(s) cyto 18.5, cyto_nucl 13.333, nucl 7, mito_nucl 4.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027353  NET_dom  
IPR016665  Sas5/TAF14  
IPR038704  YEAST_sf  
IPR005033  YEATS  
Gene Ontology GO:0031011  C:Ino80 complex  
GO:0016514  C:SWI/SNF complex  
GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0005674  C:transcription factor TFIIF complex  
GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
GO:0006338  P:chromatin remodeling  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG nfi:NFIA_075100  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF17035  BET  
PF03366  YEATS  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51037  YEATS  
CDD cd16905  YEATS_Taf14_like  
Amino Acid Sequences MLTLALAYSRNKDSGVEGFPLRSWSIEIYLVNEHGEQVPANVFDKVTYTLHPSFGDRAVQTFKNPPFRISEEGWGEFDLQIGLTAADKEHFLTHDLNFAQPRYESKHVITFKNPKPALLALLRESGPVPGDENGVKSKRAAGGEEGSKKKKRTEKNVDMDKLADGLQRLGEDDLLQVVQMVHDHKAPDSYTKNDVEQGEFHVDLYTLPDNLIKMLWDFTQEKGAL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.26
3 0.25
4 0.24
5 0.24
6 0.24
7 0.26
8 0.23
9 0.18
10 0.16
11 0.14
12 0.15
13 0.17
14 0.16
15 0.17
16 0.18
17 0.18
18 0.18
19 0.16
20 0.15
21 0.13
22 0.13
23 0.1
24 0.1
25 0.11
26 0.11
27 0.12
28 0.12
29 0.11
30 0.1
31 0.12
32 0.14
33 0.14
34 0.14
35 0.19
36 0.2
37 0.22
38 0.22
39 0.22
40 0.21
41 0.22
42 0.24
43 0.18
44 0.19
45 0.22
46 0.22
47 0.23
48 0.28
49 0.32
50 0.39
51 0.39
52 0.38
53 0.39
54 0.41
55 0.44
56 0.38
57 0.39
58 0.33
59 0.33
60 0.33
61 0.28
62 0.25
63 0.2
64 0.17
65 0.11
66 0.07
67 0.06
68 0.05
69 0.05
70 0.04
71 0.04
72 0.04
73 0.05
74 0.05
75 0.05
76 0.06
77 0.06
78 0.08
79 0.1
80 0.1
81 0.14
82 0.14
83 0.15
84 0.16
85 0.15
86 0.14
87 0.13
88 0.15
89 0.17
90 0.19
91 0.19
92 0.2
93 0.28
94 0.3
95 0.32
96 0.36
97 0.39
98 0.4
99 0.48
100 0.46
101 0.39
102 0.38
103 0.36
104 0.33
105 0.26
106 0.23
107 0.15
108 0.17
109 0.17
110 0.15
111 0.15
112 0.12
113 0.1
114 0.09
115 0.08
116 0.07
117 0.08
118 0.08
119 0.1
120 0.14
121 0.14
122 0.15
123 0.14
124 0.15
125 0.18
126 0.18
127 0.18
128 0.16
129 0.2
130 0.25
131 0.33
132 0.35
133 0.38
134 0.43
135 0.44
136 0.48
137 0.52
138 0.56
139 0.59
140 0.66
141 0.7
142 0.75
143 0.83
144 0.78
145 0.7
146 0.62
147 0.51
148 0.41
149 0.31
150 0.21
151 0.12
152 0.1
153 0.1
154 0.09
155 0.1
156 0.09
157 0.09
158 0.08
159 0.07
160 0.07
161 0.07
162 0.06
163 0.06
164 0.05
165 0.05
166 0.07
167 0.08
168 0.09
169 0.11
170 0.12
171 0.12
172 0.15
173 0.16
174 0.21
175 0.24
176 0.27
177 0.31
178 0.32
179 0.33
180 0.35
181 0.36
182 0.31
183 0.28
184 0.28
185 0.28
186 0.25
187 0.24
188 0.2
189 0.18
190 0.16
191 0.19
192 0.16
193 0.11
194 0.12
195 0.13
196 0.13
197 0.13
198 0.14
199 0.1
200 0.1
201 0.12
202 0.12
203 0.16
204 0.17
205 0.18