FuNGI

A0A367KNA7

Protein Details

Accession

A0A367KNA7

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
6-25	MSKYDKSRVRTAPPRPRLMN	Hydrophilic
548-572	TKEFLMSFRKRIKKNPRNREIVTAL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
440-457	KKTPTKVKKEAVSRPIGR
556-564	RKRIKKNPR

Subcellular Location(s)

nucl 27

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MSIYNMSKYDKSRVRTAPPRPRLMNGRPIPPRGQPPVQPTQTYPAPSYDEFQLLSSEKQGQHHLMDFKTNKKVDFKTFTPPVKLHRKEPDRVPYRQYIQQLQQQQQQQQQQQQQNGKAPASQTGSSSEVQPPTSHGPKTGADTSLIAPMGGATRNKQMLFKKRTKQIYLAKEDTRELKEQEQRPWILEDIEGQNNFTGTLEGGQRSDYMLFVLAENGFKVVPVDRWYKFQPKRNFKTLSIEEAEEQLKKQQKHESQRWMMLERRRGSSENAAEDTGPRHKFKVVDNGEKSGNRSDGETAKQDSDIDDLDFDDDFQDDEEGTGDHEAEDEDIKDSKERVKKEFKDFKMNGGDDYDLEDLENEIKLSTEGKQMRKLVRDLEKNQDYDSDDDKDPYASSADEVASDDEEKKSDEEGKDKSTPTLPKKKQVSASSSSSKLFMPKKTPTKVKKEAVSRPIGRPESPMTNRKKESSPNPMGSPLHKPTSPPQNSHSPSHRASSPIAVDQNRKRKSEDVATDNNKHRKVSAAVPDDDLITEQEVIETLRGRKMTTKEFLMSFRKRIKKNPRNREIVTALLKKVARHSASDDPNTHMLELKPELHKAH

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.64
2	0.69
3	0.76
4	0.77
5	0.79
6	0.84
7	0.78
8	0.78
9	0.77
10	0.75
11	0.75
12	0.69
13	0.7
14	0.67
15	0.69
16	0.66
17	0.63
18	0.64
19	0.61
20	0.61
21	0.58
22	0.59
23	0.64
24	0.65
25	0.6
26	0.55
27	0.54
28	0.52
29	0.49
30	0.43
31	0.36
32	0.36
33	0.35
34	0.35
35	0.31
36	0.28
37	0.25
38	0.24
39	0.24
40	0.2
41	0.2
42	0.2
43	0.24
44	0.25
45	0.27
46	0.31
47	0.31
48	0.32
49	0.37
50	0.39
51	0.33
52	0.4
53	0.42
54	0.44
55	0.5
56	0.49
57	0.47
58	0.5
59	0.54
60	0.53
61	0.57
62	0.52
63	0.53
64	0.59
65	0.61
66	0.59
67	0.56
68	0.56
69	0.6
70	0.61
71	0.6
72	0.62
73	0.65
74	0.66
75	0.72
76	0.74
77	0.7
78	0.71
79	0.69
80	0.66
81	0.64
82	0.63
83	0.59
84	0.55
85	0.55
86	0.57
87	0.59
88	0.56
89	0.58
90	0.58
91	0.58
92	0.58
93	0.6
94	0.6
95	0.6
96	0.64
97	0.63
98	0.66
99	0.67
100	0.65
101	0.64
102	0.62
103	0.54
104	0.47
105	0.41
106	0.39
107	0.36
108	0.31
109	0.25
110	0.24
111	0.26
112	0.25
113	0.26
114	0.25
115	0.22
116	0.23
117	0.22
118	0.23
119	0.27
120	0.31
121	0.29
122	0.26
123	0.28
124	0.29
125	0.34
126	0.33
127	0.27
128	0.23
129	0.24
130	0.23
131	0.23
132	0.21
133	0.15
134	0.11
135	0.11
136	0.11
137	0.12
138	0.12
139	0.11
140	0.16
141	0.2
142	0.21
143	0.26
144	0.32
145	0.41
146	0.49
147	0.56
148	0.6
149	0.65
150	0.72
151	0.71
152	0.72
153	0.7
154	0.71
155	0.7
156	0.68
157	0.62
158	0.56
159	0.54
160	0.5
161	0.44
162	0.38
163	0.32
164	0.33
165	0.39
166	0.42
167	0.46
168	0.48
169	0.45
170	0.44
171	0.43
172	0.36
173	0.29
174	0.24
175	0.21
176	0.19
177	0.22
178	0.2
179	0.18
180	0.17
181	0.17
182	0.16
183	0.13
184	0.09
185	0.05
186	0.07
187	0.08
188	0.09
189	0.09
190	0.1
191	0.09
192	0.1
193	0.1
194	0.08
195	0.07
196	0.07
197	0.07
198	0.07
199	0.08
200	0.08
201	0.07
202	0.07
203	0.07
204	0.06
205	0.06
206	0.06
207	0.06
208	0.08
209	0.11
210	0.17
211	0.17
212	0.22
213	0.26
214	0.36
215	0.42
216	0.49
217	0.56
218	0.61
219	0.67
220	0.72
221	0.73
222	0.64
223	0.67
224	0.6
225	0.55
226	0.47
227	0.41
228	0.32
229	0.3
230	0.29
231	0.2
232	0.18
233	0.17
234	0.21
235	0.21
236	0.25
237	0.31
238	0.38
239	0.47
240	0.56
241	0.6
242	0.58
243	0.62
244	0.61
245	0.56
246	0.53
247	0.49
248	0.48
249	0.41
250	0.4
251	0.38
252	0.36
253	0.36
254	0.37
255	0.35
256	0.3
257	0.29
258	0.26
259	0.23
260	0.22
261	0.21
262	0.21
263	0.2
264	0.18
265	0.18
266	0.19
267	0.22
268	0.24
269	0.33
270	0.32
271	0.39
272	0.4
273	0.41
274	0.42
275	0.4
276	0.39
277	0.31
278	0.26
279	0.17
280	0.16
281	0.16
282	0.16
283	0.17
284	0.18
285	0.17
286	0.16
287	0.16
288	0.15
289	0.13
290	0.12
291	0.1
292	0.08
293	0.06
294	0.06
295	0.07
296	0.06
297	0.06
298	0.05
299	0.04
300	0.04
301	0.04
302	0.04
303	0.04
304	0.04
305	0.04
306	0.04
307	0.04
308	0.04
309	0.04
310	0.04
311	0.04
312	0.04
313	0.04
314	0.05
315	0.05
316	0.06
317	0.07
318	0.07
319	0.08
320	0.09
321	0.15
322	0.2
323	0.23
324	0.29
325	0.38
326	0.44
327	0.54
328	0.63
329	0.6
330	0.66
331	0.63
332	0.63
333	0.6
334	0.54
335	0.44
336	0.36
337	0.32
338	0.22
339	0.24
340	0.18
341	0.1
342	0.09
343	0.08
344	0.07
345	0.07
346	0.07
347	0.05
348	0.04
349	0.05
350	0.05
351	0.06
352	0.07
353	0.14
354	0.2
355	0.23
356	0.29
357	0.34
358	0.38
359	0.41
360	0.41
361	0.41
362	0.44
363	0.5
364	0.48
365	0.52
366	0.52
367	0.49
368	0.48
369	0.43
370	0.36
371	0.31
372	0.3
373	0.24
374	0.21
375	0.21
376	0.21
377	0.19
378	0.17
379	0.14
380	0.12
381	0.08
382	0.08
383	0.08
384	0.08
385	0.08
386	0.09
387	0.08
388	0.08
389	0.09
390	0.1
391	0.09
392	0.09
393	0.1
394	0.1
395	0.11
396	0.16
397	0.17
398	0.21
399	0.24
400	0.29
401	0.32
402	0.32
403	0.33
404	0.33
405	0.39
406	0.44
407	0.52
408	0.5
409	0.56
410	0.61
411	0.65
412	0.68
413	0.66
414	0.63
415	0.58
416	0.6
417	0.56
418	0.52
419	0.46
420	0.39
421	0.34
422	0.34
423	0.33
424	0.31
425	0.33
426	0.4
427	0.49
428	0.55
429	0.65
430	0.66
431	0.71
432	0.76
433	0.76
434	0.75
435	0.75
436	0.76
437	0.74
438	0.75
439	0.69
440	0.64
441	0.66
442	0.61
443	0.53
444	0.48
445	0.44
446	0.45
447	0.46
448	0.5
449	0.49
450	0.55
451	0.58
452	0.58
453	0.59
454	0.58
455	0.6
456	0.63
457	0.63
458	0.59
459	0.58
460	0.59
461	0.55
462	0.5
463	0.49
464	0.44
465	0.39
466	0.35
467	0.36
468	0.38
469	0.47
470	0.49
471	0.45
472	0.45
473	0.51
474	0.54
475	0.58
476	0.58
477	0.54
478	0.51
479	0.51
480	0.49
481	0.41
482	0.39
483	0.38
484	0.34
485	0.32
486	0.36
487	0.35
488	0.42
489	0.48
490	0.57
491	0.57
492	0.56
493	0.55
494	0.53
495	0.56
496	0.57
497	0.57
498	0.54
499	0.58
500	0.64
501	0.68
502	0.73
503	0.74
504	0.66
505	0.59
506	0.52
507	0.48
508	0.44
509	0.45
510	0.46
511	0.44
512	0.43
513	0.45
514	0.44
515	0.39
516	0.35
517	0.28
518	0.18
519	0.13
520	0.11
521	0.09
522	0.08
523	0.08
524	0.09
525	0.09
526	0.12
527	0.13
528	0.18
529	0.18
530	0.2
531	0.26
532	0.32
533	0.39
534	0.41
535	0.44
536	0.43
537	0.45
538	0.51
539	0.54
540	0.53
541	0.54
542	0.58
543	0.62
544	0.63
545	0.71
546	0.76
547	0.77
548	0.82
549	0.85
550	0.85
551	0.85
552	0.84
553	0.82
554	0.74
555	0.72
556	0.7
557	0.64
558	0.55
559	0.52
560	0.5
561	0.43
562	0.45
563	0.46
564	0.39
565	0.37
566	0.42
567	0.46
568	0.52
569	0.58
570	0.53
571	0.5
572	0.52
573	0.5
574	0.44
575	0.38
576	0.3
577	0.29
578	0.31
579	0.32
580	0.31

A0A367KNA7

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer