Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A1CZX3

Protein Details
Accession A1CZX3    Localization Confidence High Confidence Score 24.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
82-106FDSAPAEVKHRRKRKAKSGDPESLDHydrophilic
109-138CDSAKTKDKGTPKKSKRRPRPPRSLDTHFSBasic
314-335LLEILKRKRRVDRKQSVVTGKVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
90-98KHRRKRKAK
114-131TKDKGTPKKSKRRPRPPR
320-322RKR
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000305  GIY-YIG_endonuc  
IPR035901  GIY-YIG_endonuc_sf  
IPR027520  Slx1  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0033557  C:Slx1-Slx4 complex  
GO:0017108  F:5'-flap endonuclease activity  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006281  P:DNA repair  
KEGG nfi:NFIA_038670  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01541  GIY-YIG  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50164  GIY_YIG  
Amino Acid Sequences MEDIQIEHPRPIPIFYCCYLLRSTVRHASLYIGSTPNPARRLVQHNGVVKGGARRTAAEKLRPWEMLLVVEGFTSRLAALQFDSAPAEVKHRRKRKAKSGDPESLDSNCDSAKTKDKGTPKKSKRRPRPPRSLDTHFSDLHRLLRSTYFSHRPLKIRFFSGDIYQSWKAWYDRVDVRLRSPVKVILDGSCPEIGAHASGNDTRFGGVENAKITYATIQDYIEKAIFLLDDPKDVRCHVCQGQIVPKEELTTVCPQAECHCTCHLLCLSRKFIDAAEEPNQIVPRHGICPACEATVEWPLMMKELSFRSRAKQELLEILKRKRRVDRKQSVVTGKVESSSRRSVSVDLDDRFGQDAEDEFLLDEDWWDGLASESDSDADRRLKTLSKAAPKLETVIEDSECDDAEIL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.3
3 0.33
4 0.3
5 0.32
6 0.3
7 0.32
8 0.32
9 0.3
10 0.36
11 0.39
12 0.4
13 0.39
14 0.38
15 0.37
16 0.35
17 0.34
18 0.31
19 0.24
20 0.23
21 0.27
22 0.31
23 0.33
24 0.32
25 0.31
26 0.3
27 0.35
28 0.42
29 0.43
30 0.47
31 0.48
32 0.52
33 0.52
34 0.5
35 0.43
36 0.38
37 0.39
38 0.33
39 0.29
40 0.24
41 0.24
42 0.28
43 0.36
44 0.4
45 0.41
46 0.44
47 0.44
48 0.48
49 0.47
50 0.44
51 0.38
52 0.32
53 0.26
54 0.21
55 0.18
56 0.13
57 0.12
58 0.11
59 0.09
60 0.08
61 0.07
62 0.06
63 0.06
64 0.06
65 0.07
66 0.08
67 0.1
68 0.1
69 0.11
70 0.12
71 0.1
72 0.12
73 0.12
74 0.18
75 0.24
76 0.33
77 0.43
78 0.51
79 0.61
80 0.69
81 0.79
82 0.83
83 0.86
84 0.86
85 0.87
86 0.87
87 0.85
88 0.8
89 0.72
90 0.64
91 0.54
92 0.45
93 0.34
94 0.26
95 0.18
96 0.15
97 0.15
98 0.15
99 0.23
100 0.24
101 0.27
102 0.32
103 0.42
104 0.51
105 0.58
106 0.66
107 0.68
108 0.77
109 0.84
110 0.89
111 0.91
112 0.92
113 0.94
114 0.93
115 0.94
116 0.92
117 0.91
118 0.89
119 0.85
120 0.79
121 0.74
122 0.68
123 0.58
124 0.5
125 0.44
126 0.37
127 0.33
128 0.3
129 0.24
130 0.2
131 0.21
132 0.23
133 0.23
134 0.27
135 0.29
136 0.32
137 0.39
138 0.42
139 0.45
140 0.48
141 0.53
142 0.49
143 0.46
144 0.43
145 0.38
146 0.35
147 0.31
148 0.29
149 0.21
150 0.25
151 0.22
152 0.21
153 0.19
154 0.2
155 0.18
156 0.17
157 0.18
158 0.18
159 0.2
160 0.26
161 0.31
162 0.29
163 0.3
164 0.36
165 0.36
166 0.32
167 0.29
168 0.27
169 0.22
170 0.23
171 0.22
172 0.16
173 0.17
174 0.16
175 0.17
176 0.13
177 0.12
178 0.1
179 0.1
180 0.08
181 0.06
182 0.06
183 0.04
184 0.05
185 0.07
186 0.07
187 0.08
188 0.07
189 0.07
190 0.07
191 0.08
192 0.09
193 0.08
194 0.09
195 0.09
196 0.1
197 0.1
198 0.1
199 0.09
200 0.08
201 0.08
202 0.07
203 0.08
204 0.08
205 0.09
206 0.09
207 0.1
208 0.09
209 0.08
210 0.07
211 0.06
212 0.06
213 0.05
214 0.09
215 0.08
216 0.1
217 0.11
218 0.13
219 0.13
220 0.14
221 0.16
222 0.13
223 0.18
224 0.18
225 0.22
226 0.22
227 0.24
228 0.31
229 0.34
230 0.35
231 0.31
232 0.29
233 0.25
234 0.25
235 0.23
236 0.18
237 0.17
238 0.16
239 0.16
240 0.15
241 0.15
242 0.18
243 0.23
244 0.21
245 0.21
246 0.21
247 0.22
248 0.22
249 0.26
250 0.26
251 0.25
252 0.28
253 0.31
254 0.34
255 0.32
256 0.33
257 0.29
258 0.27
259 0.26
260 0.24
261 0.23
262 0.22
263 0.23
264 0.22
265 0.24
266 0.26
267 0.21
268 0.2
269 0.17
270 0.15
271 0.16
272 0.19
273 0.18
274 0.17
275 0.21
276 0.22
277 0.2
278 0.18
279 0.17
280 0.16
281 0.19
282 0.18
283 0.13
284 0.13
285 0.12
286 0.13
287 0.13
288 0.1
289 0.09
290 0.14
291 0.17
292 0.21
293 0.22
294 0.27
295 0.32
296 0.35
297 0.35
298 0.33
299 0.33
300 0.38
301 0.42
302 0.45
303 0.46
304 0.51
305 0.55
306 0.57
307 0.6
308 0.61
309 0.67
310 0.7
311 0.75
312 0.77
313 0.8
314 0.83
315 0.86
316 0.82
317 0.76
318 0.68
319 0.6
320 0.49
321 0.42
322 0.36
323 0.31
324 0.31
325 0.32
326 0.31
327 0.3
328 0.31
329 0.3
330 0.32
331 0.38
332 0.38
333 0.33
334 0.35
335 0.33
336 0.32
337 0.32
338 0.27
339 0.19
340 0.13
341 0.13
342 0.12
343 0.12
344 0.11
345 0.09
346 0.1
347 0.1
348 0.09
349 0.08
350 0.06
351 0.06
352 0.06
353 0.06
354 0.06
355 0.06
356 0.07
357 0.08
358 0.08
359 0.08
360 0.09
361 0.1
362 0.11
363 0.15
364 0.18
365 0.18
366 0.19
367 0.22
368 0.27
369 0.3
370 0.38
371 0.43
372 0.49
373 0.54
374 0.57
375 0.58
376 0.54
377 0.53
378 0.46
379 0.4
380 0.33
381 0.31
382 0.27
383 0.24
384 0.23
385 0.21
386 0.18