Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A1D3D9

Protein Details
Accession A1D3D9    Localization Confidence High Confidence Score 25.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
17-38GMNPAHRSKHRHVRRGNTVSNSHydrophilic
109-131SASETDSKKKKKQNRNNPSSMAEHydrophilic
266-289DGAGGKKSKGKGKRPSRRDSDATEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
116-128KKKKKQNRNNPSS
130-136AEPRARA
269-283GGKKSKGKGKRPSRR
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009072  Histone-fold  
IPR003195  TFIID_TAF13  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0046982  F:protein heterodimerization activity  
GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
GO:0006366  P:transcription by RNA polymerase II  
KEGG nfi:NFIA_016250  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02269  TFIID-18kDa  
CDD cd07978  TAF13  
Amino Acid Sequences MADHSDNSSDRLGSPAGMNPAHRSKHRHVRRGNTVSNSAAPHTSSSRERSSRPQQGTPKPSVPARFGSSGHVPSEFAPPWPFNPQETALIRSGYIPAFKPKVPAAQEDSASETDSKKKKKQNRNNPSSMAEPRARAARHKGQMNFASELRLLLLAYGDPSPHPSFPSEPLPETVRVLDEIVTDFVLEMCHNAAQYASYSRRQKIKVDDFRFALRRDPNKLGRVQELLRMERELKEARKAFDQNDDQVGNLKDAGKKGLEELGEGADGAGGKKSKGKGKRPSRRDSDATEDTVLKKRKL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.18
3 0.21
4 0.22
5 0.23
6 0.27
7 0.34
8 0.38
9 0.42
10 0.46
11 0.5
12 0.6
13 0.69
14 0.72
15 0.74
16 0.79
17 0.85
18 0.86
19 0.84
20 0.79
21 0.73
22 0.65
23 0.6
24 0.51
25 0.42
26 0.34
27 0.27
28 0.24
29 0.22
30 0.24
31 0.25
32 0.29
33 0.35
34 0.38
35 0.41
36 0.48
37 0.56
38 0.61
39 0.62
40 0.66
41 0.67
42 0.73
43 0.76
44 0.74
45 0.67
46 0.61
47 0.6
48 0.55
49 0.49
50 0.44
51 0.41
52 0.37
53 0.34
54 0.35
55 0.35
56 0.33
57 0.3
58 0.26
59 0.22
60 0.21
61 0.26
62 0.22
63 0.19
64 0.19
65 0.19
66 0.21
67 0.26
68 0.26
69 0.21
70 0.24
71 0.24
72 0.28
73 0.29
74 0.3
75 0.26
76 0.25
77 0.24
78 0.21
79 0.2
80 0.15
81 0.14
82 0.12
83 0.16
84 0.19
85 0.19
86 0.21
87 0.21
88 0.27
89 0.27
90 0.29
91 0.3
92 0.3
93 0.31
94 0.29
95 0.3
96 0.24
97 0.23
98 0.2
99 0.15
100 0.2
101 0.26
102 0.32
103 0.36
104 0.45
105 0.54
106 0.65
107 0.74
108 0.78
109 0.83
110 0.86
111 0.85
112 0.8
113 0.73
114 0.66
115 0.58
116 0.51
117 0.42
118 0.33
119 0.28
120 0.29
121 0.26
122 0.24
123 0.28
124 0.32
125 0.35
126 0.4
127 0.41
128 0.42
129 0.45
130 0.45
131 0.4
132 0.32
133 0.28
134 0.22
135 0.2
136 0.14
137 0.11
138 0.07
139 0.05
140 0.05
141 0.03
142 0.04
143 0.05
144 0.04
145 0.04
146 0.09
147 0.1
148 0.1
149 0.11
150 0.12
151 0.14
152 0.17
153 0.23
154 0.21
155 0.2
156 0.22
157 0.24
158 0.23
159 0.22
160 0.19
161 0.14
162 0.12
163 0.12
164 0.1
165 0.08
166 0.08
167 0.07
168 0.07
169 0.06
170 0.06
171 0.05
172 0.05
173 0.05
174 0.04
175 0.05
176 0.05
177 0.05
178 0.05
179 0.05
180 0.05
181 0.06
182 0.11
183 0.14
184 0.2
185 0.25
186 0.3
187 0.37
188 0.39
189 0.43
190 0.49
191 0.56
192 0.6
193 0.6
194 0.61
195 0.56
196 0.6
197 0.58
198 0.49
199 0.45
200 0.42
201 0.42
202 0.44
203 0.5
204 0.5
205 0.52
206 0.55
207 0.52
208 0.48
209 0.47
210 0.42
211 0.4
212 0.38
213 0.35
214 0.32
215 0.31
216 0.29
217 0.26
218 0.3
219 0.3
220 0.28
221 0.35
222 0.37
223 0.37
224 0.43
225 0.44
226 0.41
227 0.45
228 0.46
229 0.4
230 0.42
231 0.4
232 0.33
233 0.35
234 0.34
235 0.25
236 0.22
237 0.22
238 0.19
239 0.2
240 0.23
241 0.19
242 0.18
243 0.19
244 0.22
245 0.19
246 0.17
247 0.17
248 0.15
249 0.14
250 0.13
251 0.12
252 0.08
253 0.08
254 0.08
255 0.1
256 0.09
257 0.1
258 0.16
259 0.21
260 0.29
261 0.39
262 0.49
263 0.56
264 0.67
265 0.78
266 0.82
267 0.87
268 0.87
269 0.86
270 0.82
271 0.78
272 0.76
273 0.7
274 0.64
275 0.57
276 0.51
277 0.46
278 0.49