Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A367IJX3

Protein Details
Accession A0A367IJX3    Localization Confidence Low Confidence Score 8.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
259-282QDRSIPTKQCRTCKNKFHSSCLYKHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 13, cyto_nucl 10, mito 5, cyto 5, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039795  LTN1/Rkr1  
IPR039804  RING-CH-C4HC3_LTN1  
IPR001841  Znf_RING  
IPR011016  Znf_RING-CH  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0005829  C:cytosol  
GO:1990112  C:RQC complex  
GO:0043023  F:ribosomal large subunit binding  
GO:0061630  F:ubiquitin protein ligase activity  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0016567  P:protein ubiquitination  
GO:0072344  P:rescue of stalled ribosome  
GO:1990116  P:ribosome-associated ubiquitin-dependent protein catabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF13639  zf-RING_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50089  ZF_RING_2  
PS51292  ZF_RING_CH  
CDD cd16491  RING-CH-C4HC3_LTN1  
Amino Acid Sequences QALHETLGYLLTWMLMFDHFTDITFKLKQEYTAQLKEKEAVSHLMAVLCKILSVGQQQGSKPFDLSPWSVIEYDIDGFDATLEMSFIILASHLYYRALTHIPSLVRLWWIDCKHRQLTIAIENYTEKHFSQQLINNEMELVNRPDIKTQLEDNEDNEFTVKTSKAANEVTATYRVDEQNMQIAIKLPSNFPLRQIDVEGVQKVGVNDKQWRGWMFAVTAVIGSQNGNIVDALTVFKRNVNLHFNGVEDCTICYSIISVQDRSIPTKQCRTCKNKFHSSCLYKWFRSSNSASCPLCRTVF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.07
2 0.06
3 0.07
4 0.08
5 0.12
6 0.11
7 0.12
8 0.15
9 0.15
10 0.19
11 0.2
12 0.2
13 0.21
14 0.22
15 0.25
16 0.27
17 0.35
18 0.39
19 0.45
20 0.5
21 0.48
22 0.49
23 0.49
24 0.46
25 0.39
26 0.33
27 0.28
28 0.24
29 0.23
30 0.22
31 0.21
32 0.19
33 0.17
34 0.16
35 0.12
36 0.1
37 0.08
38 0.08
39 0.08
40 0.11
41 0.15
42 0.19
43 0.23
44 0.24
45 0.3
46 0.31
47 0.3
48 0.28
49 0.24
50 0.21
51 0.22
52 0.23
53 0.19
54 0.18
55 0.2
56 0.19
57 0.18
58 0.17
59 0.14
60 0.13
61 0.11
62 0.09
63 0.07
64 0.07
65 0.07
66 0.06
67 0.05
68 0.04
69 0.04
70 0.03
71 0.03
72 0.03
73 0.03
74 0.03
75 0.03
76 0.03
77 0.04
78 0.05
79 0.05
80 0.06
81 0.06
82 0.06
83 0.09
84 0.1
85 0.09
86 0.1
87 0.13
88 0.13
89 0.14
90 0.15
91 0.13
92 0.13
93 0.13
94 0.14
95 0.17
96 0.19
97 0.24
98 0.28
99 0.33
100 0.34
101 0.36
102 0.35
103 0.3
104 0.32
105 0.32
106 0.31
107 0.25
108 0.23
109 0.22
110 0.22
111 0.22
112 0.19
113 0.13
114 0.12
115 0.13
116 0.14
117 0.18
118 0.22
119 0.25
120 0.27
121 0.27
122 0.24
123 0.23
124 0.22
125 0.17
126 0.14
127 0.11
128 0.09
129 0.1
130 0.1
131 0.11
132 0.12
133 0.13
134 0.13
135 0.13
136 0.15
137 0.17
138 0.18
139 0.18
140 0.2
141 0.18
142 0.17
143 0.16
144 0.12
145 0.09
146 0.11
147 0.09
148 0.07
149 0.09
150 0.09
151 0.12
152 0.13
153 0.13
154 0.13
155 0.14
156 0.15
157 0.16
158 0.15
159 0.13
160 0.15
161 0.14
162 0.14
163 0.14
164 0.12
165 0.15
166 0.15
167 0.14
168 0.12
169 0.14
170 0.14
171 0.16
172 0.16
173 0.12
174 0.17
175 0.21
176 0.21
177 0.22
178 0.25
179 0.24
180 0.24
181 0.25
182 0.21
183 0.19
184 0.21
185 0.18
186 0.14
187 0.13
188 0.13
189 0.12
190 0.15
191 0.14
192 0.15
193 0.2
194 0.23
195 0.24
196 0.26
197 0.28
198 0.27
199 0.26
200 0.24
201 0.19
202 0.18
203 0.17
204 0.14
205 0.12
206 0.09
207 0.08
208 0.07
209 0.06
210 0.05
211 0.06
212 0.06
213 0.07
214 0.07
215 0.07
216 0.06
217 0.07
218 0.08
219 0.07
220 0.09
221 0.09
222 0.11
223 0.15
224 0.18
225 0.23
226 0.27
227 0.28
228 0.3
229 0.31
230 0.3
231 0.27
232 0.26
233 0.21
234 0.16
235 0.14
236 0.12
237 0.12
238 0.11
239 0.1
240 0.09
241 0.11
242 0.17
243 0.2
244 0.19
245 0.19
246 0.25
247 0.27
248 0.31
249 0.35
250 0.36
251 0.4
252 0.49
253 0.56
254 0.59
255 0.67
256 0.71
257 0.75
258 0.78
259 0.8
260 0.81
261 0.79
262 0.79
263 0.8
264 0.78
265 0.74
266 0.73
267 0.72
268 0.64
269 0.64
270 0.62
271 0.54
272 0.55
273 0.55
274 0.53
275 0.53
276 0.59
277 0.55
278 0.52
279 0.53