Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A367ISK1

Protein Details
Accession A0A367ISK1    Localization Confidence Low Confidence Score 7.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
34-53SEELSSMRRQKKKPPVEYATHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cyto 16, cyto_nucl 13.5, nucl 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020472  G-protein_beta_WD-40_rep  
IPR038959  Prp19  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR019775  WD40_repeat_CS  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0000974  C:Prp19 complex  
GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0061630  F:ubiquitin protein ligase activity  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
GO:0070534  P:protein K63-linked ubiquitination  
Pfam View protein in Pfam  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00678  WD_REPEATS_1  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
CDD cd00200  WD40  
Amino Acid Sequences VSAAPATTAAPAQESMEVDGGLPDDVVEKINKTSEELSSMRRQKKKPPVEYATLESIKAYQQTNTIPSLHSARSAGITALDIDATDNLILTGGNDKHVQVYNKAEDKVVVNLAGHTKKITSVQFRGKQQENDVFISASADKHVRVWIPDDKKVYALGHNINAHKHEVTGVHVHPSKDYFVSAGLDAKWSLYDFESAKPVVETFHAQEQGYSSIQFHPDGMILGAGTTDGVVQIWDVKSQKVAAQFEDHAGHVKAIAFSENGYILATASEDNLVKIWDLRKLANTKTFSLDEGYKVNTLKFDHYGQYLAVGGTDVRVLKAKDGSSLATFTDNNATEITGLHWSSLAQTLVSSGLDRTVRFYGTANE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.15
3 0.15
4 0.15
5 0.13
6 0.13
7 0.12
8 0.09
9 0.08
10 0.06
11 0.07
12 0.07
13 0.09
14 0.1
15 0.11
16 0.13
17 0.16
18 0.17
19 0.19
20 0.21
21 0.21
22 0.25
23 0.26
24 0.3
25 0.36
26 0.45
27 0.52
28 0.58
29 0.61
30 0.66
31 0.75
32 0.8
33 0.79
34 0.81
35 0.79
36 0.77
37 0.78
38 0.72
39 0.69
40 0.59
41 0.49
42 0.39
43 0.33
44 0.27
45 0.26
46 0.22
47 0.15
48 0.17
49 0.2
50 0.23
51 0.24
52 0.23
53 0.21
54 0.22
55 0.25
56 0.22
57 0.21
58 0.19
59 0.17
60 0.18
61 0.18
62 0.15
63 0.11
64 0.11
65 0.1
66 0.09
67 0.08
68 0.06
69 0.06
70 0.06
71 0.06
72 0.05
73 0.05
74 0.04
75 0.05
76 0.04
77 0.04
78 0.1
79 0.1
80 0.12
81 0.13
82 0.13
83 0.16
84 0.21
85 0.22
86 0.2
87 0.25
88 0.3
89 0.34
90 0.35
91 0.32
92 0.29
93 0.28
94 0.27
95 0.22
96 0.16
97 0.12
98 0.13
99 0.18
100 0.18
101 0.16
102 0.14
103 0.14
104 0.14
105 0.19
106 0.22
107 0.23
108 0.29
109 0.39
110 0.45
111 0.49
112 0.55
113 0.56
114 0.53
115 0.52
116 0.52
117 0.46
118 0.41
119 0.37
120 0.3
121 0.25
122 0.24
123 0.19
124 0.13
125 0.11
126 0.09
127 0.09
128 0.09
129 0.11
130 0.1
131 0.11
132 0.15
133 0.22
134 0.26
135 0.3
136 0.32
137 0.3
138 0.3
139 0.31
140 0.28
141 0.22
142 0.22
143 0.19
144 0.21
145 0.24
146 0.25
147 0.24
148 0.24
149 0.23
150 0.19
151 0.17
152 0.14
153 0.11
154 0.12
155 0.15
156 0.14
157 0.17
158 0.2
159 0.2
160 0.19
161 0.2
162 0.18
163 0.15
164 0.14
165 0.1
166 0.08
167 0.09
168 0.08
169 0.09
170 0.07
171 0.08
172 0.07
173 0.07
174 0.07
175 0.06
176 0.06
177 0.05
178 0.08
179 0.08
180 0.09
181 0.11
182 0.11
183 0.11
184 0.11
185 0.1
186 0.08
187 0.09
188 0.1
189 0.09
190 0.13
191 0.15
192 0.14
193 0.14
194 0.15
195 0.16
196 0.15
197 0.14
198 0.11
199 0.11
200 0.12
201 0.12
202 0.11
203 0.09
204 0.09
205 0.09
206 0.08
207 0.06
208 0.05
209 0.04
210 0.04
211 0.03
212 0.03
213 0.03
214 0.02
215 0.02
216 0.02
217 0.02
218 0.03
219 0.06
220 0.06
221 0.09
222 0.1
223 0.1
224 0.11
225 0.12
226 0.15
227 0.18
228 0.19
229 0.18
230 0.21
231 0.21
232 0.23
233 0.23
234 0.21
235 0.18
236 0.17
237 0.15
238 0.12
239 0.13
240 0.11
241 0.1
242 0.11
243 0.08
244 0.08
245 0.09
246 0.09
247 0.08
248 0.07
249 0.07
250 0.06
251 0.06
252 0.06
253 0.05
254 0.05
255 0.07
256 0.07
257 0.07
258 0.07
259 0.07
260 0.07
261 0.1
262 0.11
263 0.14
264 0.16
265 0.18
266 0.24
267 0.28
268 0.33
269 0.38
270 0.4
271 0.37
272 0.4
273 0.39
274 0.34
275 0.33
276 0.3
277 0.24
278 0.23
279 0.23
280 0.21
281 0.21
282 0.21
283 0.2
284 0.2
285 0.22
286 0.23
287 0.24
288 0.24
289 0.24
290 0.25
291 0.22
292 0.21
293 0.18
294 0.14
295 0.11
296 0.09
297 0.07
298 0.07
299 0.09
300 0.08
301 0.08
302 0.12
303 0.12
304 0.15
305 0.2
306 0.2
307 0.22
308 0.23
309 0.25
310 0.23
311 0.24
312 0.22
313 0.2
314 0.2
315 0.18
316 0.24
317 0.22
318 0.21
319 0.2
320 0.19
321 0.16
322 0.17
323 0.17
324 0.14
325 0.14
326 0.13
327 0.13
328 0.12
329 0.14
330 0.17
331 0.16
332 0.11
333 0.11
334 0.12
335 0.13
336 0.13
337 0.12
338 0.08
339 0.13
340 0.16
341 0.16
342 0.19
343 0.21
344 0.21
345 0.22