Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A369HC20

Protein Details
Accession A0A369HC20    Localization Confidence High Confidence Score 22.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-26MTTAKNQSAMKGKRKRQRSDDDVEDAHydrophilic
43-65QEADTDRKPKKARVDEKRSLFVRHydrophilic
732-762AETTKQILIARKKQMRKKKASARGRQGKVGVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
572-591RDDKEVKEKERERKLKGKGI
705-716RRRGGKANRRGK
741-759ARKKQMRKKKASARGRQGK
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 12.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034808  Nop4p_RRM3  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12676  RRM3_Nop4p  
Amino Acid Sequences MTTAKNQSAMKGKRKRQRSDDDVEDAVALALQDQDQLATVQDQEADTDRKPKKARVDEKRSLFVRSLPPSATNESLADFFAQHFPVKHAVVVLDHNTKESRGYGFVTLADAEDAAEAKKSLDKTTWDGKCIRVDVAEPRHRKTTTGGNNDPLTKSGGKPEDRKPSNKLIIRNLPWSIKTSEQLSRLFMSFGKVKFADLPNTNGKLKGFGFVTIRGRKNAEKALESVNGKVIDGRPLAVDWAVDKETWERQKDGGNAEKGDLEEEEEEEEEEEEEEEEDDDDDDDDDDDEAESVDDTVKKPKRDAEVDADLENFFKNHMQNLEDDSESDSEKSADDVDAVRGKTSRPQMTDNSSTVFIRNLPFTTTDEQLKSFFAHFGRIRYARVVMNKVTEKPAGTGFVCFILESDAKECIKRCPRPSGMSTTGSKPSLLVDENADPSGMYTLEGRLLQVVQAVNKEQASTLAETSLSKRREKDKRRLYLLSEGAIGRSSPLFGLLSQAEVQMRQASSVQRKKMVQANPSLHLSLTRLAIRNIPRNVGSKELKEHARKAIVGFAQDVKKGLRQPLSQEEKARDDKEVKEKERERKLKGKGIVRQAKIVFESNQGSKVPESSGAGKSRGYGFIEYTSHRWALMGLRYLNGLQLEGDDGRKQRLIAEFAIENARVVQRRRAVEDRSLAKAKTHAQQPQSRSNETVAASDDTAGEVGRRRGGKANRRGKGQGEDGSGAEPGTDEAETTKQILIARKKQMRKKKASARGRQGKVGVATT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.81
2 0.85
3 0.85
4 0.87
5 0.85
6 0.83
7 0.81
8 0.78
9 0.69
10 0.59
11 0.49
12 0.38
13 0.29
14 0.2
15 0.12
16 0.07
17 0.06
18 0.06
19 0.07
20 0.06
21 0.07
22 0.07
23 0.07
24 0.08
25 0.09
26 0.09
27 0.09
28 0.11
29 0.11
30 0.12
31 0.16
32 0.18
33 0.19
34 0.29
35 0.31
36 0.39
37 0.44
38 0.49
39 0.55
40 0.63
41 0.72
42 0.73
43 0.8
44 0.81
45 0.84
46 0.85
47 0.76
48 0.69
49 0.6
50 0.55
51 0.53
52 0.49
53 0.46
54 0.39
55 0.4
56 0.41
57 0.44
58 0.39
59 0.32
60 0.28
61 0.25
62 0.24
63 0.22
64 0.18
65 0.14
66 0.13
67 0.15
68 0.16
69 0.16
70 0.16
71 0.19
72 0.23
73 0.23
74 0.22
75 0.19
76 0.19
77 0.19
78 0.22
79 0.24
80 0.25
81 0.25
82 0.27
83 0.26
84 0.26
85 0.25
86 0.24
87 0.21
88 0.17
89 0.19
90 0.19
91 0.19
92 0.19
93 0.19
94 0.17
95 0.15
96 0.12
97 0.09
98 0.08
99 0.07
100 0.07
101 0.06
102 0.07
103 0.06
104 0.07
105 0.11
106 0.13
107 0.14
108 0.18
109 0.21
110 0.26
111 0.36
112 0.38
113 0.39
114 0.4
115 0.41
116 0.43
117 0.41
118 0.36
119 0.27
120 0.27
121 0.32
122 0.39
123 0.45
124 0.44
125 0.46
126 0.51
127 0.51
128 0.5
129 0.45
130 0.45
131 0.46
132 0.52
133 0.52
134 0.51
135 0.54
136 0.55
137 0.52
138 0.42
139 0.36
140 0.28
141 0.25
142 0.27
143 0.32
144 0.35
145 0.41
146 0.48
147 0.55
148 0.59
149 0.63
150 0.61
151 0.63
152 0.67
153 0.65
154 0.63
155 0.61
156 0.65
157 0.64
158 0.63
159 0.57
160 0.51
161 0.47
162 0.44
163 0.38
164 0.31
165 0.3
166 0.29
167 0.31
168 0.32
169 0.32
170 0.31
171 0.3
172 0.27
173 0.26
174 0.22
175 0.21
176 0.22
177 0.2
178 0.23
179 0.21
180 0.21
181 0.26
182 0.28
183 0.31
184 0.28
185 0.33
186 0.35
187 0.39
188 0.38
189 0.35
190 0.32
191 0.29
192 0.27
193 0.26
194 0.19
195 0.18
196 0.2
197 0.23
198 0.31
199 0.35
200 0.37
201 0.36
202 0.39
203 0.39
204 0.42
205 0.43
206 0.38
207 0.32
208 0.32
209 0.34
210 0.36
211 0.35
212 0.3
213 0.28
214 0.25
215 0.22
216 0.22
217 0.19
218 0.18
219 0.17
220 0.17
221 0.13
222 0.13
223 0.14
224 0.11
225 0.11
226 0.07
227 0.09
228 0.1
229 0.09
230 0.1
231 0.12
232 0.18
233 0.24
234 0.26
235 0.25
236 0.26
237 0.31
238 0.34
239 0.37
240 0.37
241 0.35
242 0.33
243 0.32
244 0.31
245 0.26
246 0.23
247 0.18
248 0.12
249 0.09
250 0.09
251 0.09
252 0.08
253 0.08
254 0.07
255 0.07
256 0.06
257 0.06
258 0.06
259 0.05
260 0.05
261 0.05
262 0.05
263 0.05
264 0.05
265 0.05
266 0.05
267 0.05
268 0.05
269 0.05
270 0.05
271 0.05
272 0.05
273 0.05
274 0.05
275 0.05
276 0.04
277 0.04
278 0.04
279 0.04
280 0.05
281 0.06
282 0.07
283 0.16
284 0.21
285 0.22
286 0.24
287 0.29
288 0.34
289 0.37
290 0.4
291 0.39
292 0.4
293 0.4
294 0.39
295 0.35
296 0.28
297 0.25
298 0.2
299 0.13
300 0.07
301 0.08
302 0.08
303 0.1
304 0.11
305 0.12
306 0.13
307 0.16
308 0.18
309 0.15
310 0.15
311 0.15
312 0.14
313 0.13
314 0.13
315 0.09
316 0.08
317 0.08
318 0.08
319 0.07
320 0.06
321 0.06
322 0.07
323 0.08
324 0.12
325 0.12
326 0.12
327 0.12
328 0.12
329 0.17
330 0.23
331 0.25
332 0.24
333 0.28
334 0.31
335 0.37
336 0.4
337 0.36
338 0.31
339 0.28
340 0.25
341 0.22
342 0.19
343 0.14
344 0.11
345 0.11
346 0.1
347 0.1
348 0.11
349 0.13
350 0.15
351 0.16
352 0.17
353 0.17
354 0.17
355 0.17
356 0.16
357 0.14
358 0.12
359 0.13
360 0.11
361 0.16
362 0.16
363 0.17
364 0.22
365 0.22
366 0.22
367 0.21
368 0.23
369 0.19
370 0.22
371 0.23
372 0.19
373 0.22
374 0.23
375 0.23
376 0.24
377 0.22
378 0.19
379 0.17
380 0.17
381 0.14
382 0.13
383 0.12
384 0.1
385 0.1
386 0.09
387 0.08
388 0.07
389 0.08
390 0.08
391 0.08
392 0.09
393 0.1
394 0.11
395 0.12
396 0.13
397 0.19
398 0.27
399 0.33
400 0.36
401 0.42
402 0.47
403 0.5
404 0.53
405 0.53
406 0.49
407 0.46
408 0.44
409 0.38
410 0.37
411 0.32
412 0.29
413 0.21
414 0.17
415 0.15
416 0.14
417 0.12
418 0.11
419 0.12
420 0.13
421 0.13
422 0.12
423 0.1
424 0.09
425 0.09
426 0.07
427 0.05
428 0.05
429 0.05
430 0.07
431 0.07
432 0.07
433 0.06
434 0.06
435 0.06
436 0.08
437 0.08
438 0.08
439 0.09
440 0.1
441 0.11
442 0.11
443 0.11
444 0.08
445 0.09
446 0.1
447 0.1
448 0.1
449 0.09
450 0.09
451 0.1
452 0.13
453 0.19
454 0.2
455 0.22
456 0.26
457 0.35
458 0.45
459 0.54
460 0.62
461 0.65
462 0.71
463 0.75
464 0.74
465 0.69
466 0.67
467 0.59
468 0.49
469 0.41
470 0.32
471 0.25
472 0.22
473 0.18
474 0.1
475 0.08
476 0.07
477 0.05
478 0.06
479 0.06
480 0.06
481 0.09
482 0.08
483 0.09
484 0.09
485 0.11
486 0.1
487 0.09
488 0.1
489 0.1
490 0.1
491 0.09
492 0.12
493 0.17
494 0.26
495 0.33
496 0.35
497 0.38
498 0.39
499 0.43
500 0.48
501 0.48
502 0.43
503 0.46
504 0.47
505 0.44
506 0.45
507 0.41
508 0.34
509 0.28
510 0.25
511 0.18
512 0.16
513 0.17
514 0.16
515 0.16
516 0.22
517 0.27
518 0.33
519 0.33
520 0.33
521 0.32
522 0.36
523 0.37
524 0.39
525 0.37
526 0.31
527 0.34
528 0.37
529 0.42
530 0.42
531 0.44
532 0.42
533 0.42
534 0.4
535 0.36
536 0.37
537 0.31
538 0.27
539 0.25
540 0.25
541 0.24
542 0.23
543 0.24
544 0.19
545 0.21
546 0.24
547 0.28
548 0.29
549 0.29
550 0.34
551 0.43
552 0.5
553 0.5
554 0.51
555 0.5
556 0.5
557 0.54
558 0.49
559 0.43
560 0.39
561 0.42
562 0.47
563 0.52
564 0.5
565 0.54
566 0.61
567 0.67
568 0.73
569 0.75
570 0.72
571 0.72
572 0.76
573 0.74
574 0.74
575 0.73
576 0.69
577 0.72
578 0.74
579 0.66
580 0.65
581 0.58
582 0.53
583 0.47
584 0.43
585 0.34
586 0.29
587 0.31
588 0.26
589 0.28
590 0.26
591 0.25
592 0.22
593 0.21
594 0.18
595 0.16
596 0.17
597 0.19
598 0.24
599 0.25
600 0.26
601 0.25
602 0.26
603 0.26
604 0.27
605 0.25
606 0.21
607 0.19
608 0.21
609 0.24
610 0.24
611 0.25
612 0.25
613 0.23
614 0.22
615 0.2
616 0.18
617 0.2
618 0.22
619 0.25
620 0.22
621 0.23
622 0.24
623 0.24
624 0.24
625 0.2
626 0.15
627 0.09
628 0.09
629 0.11
630 0.11
631 0.12
632 0.14
633 0.16
634 0.18
635 0.2
636 0.19
637 0.21
638 0.25
639 0.27
640 0.25
641 0.27
642 0.25
643 0.25
644 0.28
645 0.24
646 0.19
647 0.17
648 0.21
649 0.21
650 0.23
651 0.29
652 0.33
653 0.37
654 0.44
655 0.49
656 0.49
657 0.52
658 0.58
659 0.55
660 0.55
661 0.56
662 0.49
663 0.44
664 0.44
665 0.43
666 0.42
667 0.45
668 0.45
669 0.49
670 0.56
671 0.61
672 0.66
673 0.67
674 0.62
675 0.57
676 0.52
677 0.48
678 0.41
679 0.37
680 0.29
681 0.26
682 0.23
683 0.21
684 0.19
685 0.14
686 0.13
687 0.11
688 0.1
689 0.12
690 0.14
691 0.19
692 0.21
693 0.23
694 0.32
695 0.42
696 0.51
697 0.57
698 0.66
699 0.66
700 0.71
701 0.73
702 0.7
703 0.68
704 0.64
705 0.6
706 0.54
707 0.5
708 0.44
709 0.4
710 0.34
711 0.27
712 0.19
713 0.13
714 0.09
715 0.08
716 0.08
717 0.07
718 0.09
719 0.11
720 0.12
721 0.14
722 0.14
723 0.15
724 0.19
725 0.28
726 0.35
727 0.42
728 0.52
729 0.59
730 0.68
731 0.76
732 0.83
733 0.86
734 0.86
735 0.88
736 0.89
737 0.9
738 0.92
739 0.93
740 0.93
741 0.93
742 0.87
743 0.83
744 0.75
745 0.7