Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A369HH58

Protein Details
Accession A0A369HH58    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
228-249VGTGGKTKRERERKTRQTIDFDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
96-110YGARTRGGRGSRRPR
257-298RTRGGGGGGGGRGGRGGRGGRGDRGGDRGGDRGGRVSVRGGR
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto_nucl 15, cyto 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039764  HABP4/SERBP1  
IPR006861  HABP4_PAIRBP1-bd  
IPR019084  Stm1-like_N  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF09598  Stm1_N  
Amino Acid Sequences MSNVASQNRFAFLGNDSDGEEKPTVPVKSVDKATSRTTKRHVEPQAPLPSALGSGGNRRGGPRGNDGAFRDRGVGSDRNHGRSTDEVPRDGPRGGYGARTRGGRGSRRPREFDDRHPSRAGGHGGSEKQSAQSWGAVDGEAELKDEQAGEAMARSEHKEALAEDGAADEAAEPEDKSVSFDDYMAQLAEKKLALDSGFKLREANEGSKLDKKWANAKALEKDEEDFIVGTGGKTKRERERKTRQTIDFDPRFVEPERTRGGGGGGGGRGGRGGRGGRGDRGGDRGGDRGGRVSVRGGRGGHNHGSADAPINTDDKAAFPSLGSK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.19
3 0.18
4 0.2
5 0.2
6 0.22
7 0.21
8 0.16
9 0.18
10 0.23
11 0.22
12 0.22
13 0.27
14 0.27
15 0.33
16 0.38
17 0.4
18 0.38
19 0.42
20 0.47
21 0.52
22 0.52
23 0.52
24 0.55
25 0.59
26 0.6
27 0.66
28 0.67
29 0.65
30 0.66
31 0.68
32 0.71
33 0.62
34 0.57
35 0.48
36 0.4
37 0.32
38 0.26
39 0.19
40 0.12
41 0.16
42 0.2
43 0.22
44 0.23
45 0.24
46 0.27
47 0.3
48 0.33
49 0.34
50 0.37
51 0.36
52 0.4
53 0.42
54 0.45
55 0.4
56 0.37
57 0.32
58 0.25
59 0.24
60 0.25
61 0.27
62 0.23
63 0.31
64 0.35
65 0.38
66 0.39
67 0.38
68 0.35
69 0.32
70 0.36
71 0.35
72 0.34
73 0.3
74 0.31
75 0.34
76 0.34
77 0.31
78 0.26
79 0.17
80 0.17
81 0.16
82 0.2
83 0.2
84 0.21
85 0.24
86 0.24
87 0.24
88 0.27
89 0.33
90 0.34
91 0.41
92 0.49
93 0.56
94 0.61
95 0.65
96 0.66
97 0.7
98 0.68
99 0.68
100 0.68
101 0.63
102 0.6
103 0.57
104 0.51
105 0.42
106 0.41
107 0.34
108 0.23
109 0.2
110 0.19
111 0.19
112 0.2
113 0.2
114 0.16
115 0.15
116 0.15
117 0.14
118 0.11
119 0.12
120 0.11
121 0.1
122 0.1
123 0.09
124 0.08
125 0.08
126 0.08
127 0.06
128 0.07
129 0.06
130 0.06
131 0.06
132 0.06
133 0.05
134 0.04
135 0.04
136 0.03
137 0.03
138 0.04
139 0.04
140 0.05
141 0.07
142 0.07
143 0.08
144 0.08
145 0.08
146 0.08
147 0.11
148 0.11
149 0.09
150 0.08
151 0.08
152 0.07
153 0.06
154 0.06
155 0.03
156 0.03
157 0.03
158 0.04
159 0.03
160 0.04
161 0.04
162 0.04
163 0.06
164 0.06
165 0.07
166 0.07
167 0.07
168 0.08
169 0.08
170 0.09
171 0.07
172 0.07
173 0.07
174 0.07
175 0.08
176 0.07
177 0.07
178 0.06
179 0.07
180 0.08
181 0.09
182 0.11
183 0.17
184 0.18
185 0.18
186 0.18
187 0.18
188 0.22
189 0.23
190 0.24
191 0.22
192 0.23
193 0.25
194 0.31
195 0.31
196 0.31
197 0.3
198 0.3
199 0.33
200 0.37
201 0.39
202 0.38
203 0.43
204 0.45
205 0.46
206 0.47
207 0.39
208 0.35
209 0.3
210 0.26
211 0.21
212 0.14
213 0.1
214 0.09
215 0.08
216 0.07
217 0.12
218 0.13
219 0.18
220 0.21
221 0.27
222 0.36
223 0.47
224 0.56
225 0.6
226 0.7
227 0.76
228 0.83
229 0.87
230 0.82
231 0.8
232 0.78
233 0.78
234 0.71
235 0.61
236 0.53
237 0.44
238 0.41
239 0.35
240 0.36
241 0.27
242 0.3
243 0.32
244 0.31
245 0.31
246 0.28
247 0.27
248 0.2
249 0.19
250 0.15
251 0.12
252 0.11
253 0.11
254 0.1
255 0.1
256 0.09
257 0.09
258 0.1
259 0.11
260 0.13
261 0.2
262 0.23
263 0.26
264 0.29
265 0.31
266 0.3
267 0.33
268 0.31
269 0.27
270 0.26
271 0.25
272 0.24
273 0.23
274 0.22
275 0.2
276 0.21
277 0.19
278 0.19
279 0.22
280 0.25
281 0.27
282 0.3
283 0.3
284 0.32
285 0.37
286 0.42
287 0.41
288 0.38
289 0.35
290 0.32
291 0.32
292 0.28
293 0.27
294 0.21
295 0.19
296 0.17
297 0.18
298 0.17
299 0.17
300 0.16
301 0.12
302 0.15
303 0.15
304 0.13