Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A369HDX8

Protein Details
Accession A0A369HDX8    Localization Confidence Low Confidence Score 8.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
305-334KTQAEIKKTLARKRKRRREKEKDGKQVDETBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
311-327KKTLARKRKRRREKEKD
Subcellular Location(s) cyto 12.5, cyto_nucl 7.5, mito 7, extr 2, E.R. 2, nucl 1.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020472  G-protein_beta_WD-40_rep  
IPR010920  LSM_dom_sf  
IPR047575  Sm  
IPR001163  Sm_dom_euk/arc  
IPR007148  SSU_processome_Utp12  
IPR016654  U6_snRNA_Lsm2  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR019775  WD40_repeat_CS  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF01423  LSM  
PF04003  Utp12  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS52002  SM  
PS00678  WD_REPEATS_1  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
CDD cd01725  LSm2  
cd00200  WD40  
Amino Acid Sequences MVKSYLKYEHAKSFGVVVTGTSNIVWTSTDRTGAGQAVVAANGQVLCWDIKKGELLGSWRDERCAAPVTVVAQSKTDKDVFAVGYGDGSIRLWDSKISTVIVNFNGHKSAVTKLAFDKSGVRLASGSKDTDIIIWDLVAEVGLYKLRGHKDEVTGLHFVEPDQHANDEEGSRAMVRDGGAASEGFLLTSGKDSLIKLWDLSSRHCVETHIAQTNGECWALGMSPDFSGCVTAGNDGEMKVWSLDVDALMANTRGVDASPTARYLSDRGTLHRQSKDRATEVVFHPQRDYFAVHGSEKGVDIWRIKTQAEIKKTLARKRKRRREKEKDGKQVDETMTDVNGGEDGTNADIGDIFVQYVIVRTGGKVRSVDWAVSGAQKDVRLLVATTNNQLEYYSIPLKDKDDAKKNQVIPDYARTLSVELPGHRTDIRSLALSSDDKMLASSANGSTKIWNVKTQACIRTFDCGYSLCCAFLPGDKVVVVGTKSGELQLFDVASSSLVDSVQAHEGAIWSLHVHPDGRSVVTGSADKSAKFWDFKIVQEEILGTKRTRPRLKVVQSRMLKVSDDILNLRFSPDARLLAVSLLDNTVKVFFVDTLKLYLNLYGHKLPVLSMDISYDSKLIVTTSADKNIRIWGLDFGDCHKALFGHQDSILQVAFVPHNSDGNGHHFFSSSKDRTIRYWDGDKFEQIQRLDGHHGEVWAMAISKSGNFVVSAGHDKCIRVWEESDEQIFLEEEREKELEELYESTLTKSLEKEEPDMEGDSGELGAASKQTTETLMAGERIQEALEMGMADLNLLREYEEAKVSDAKAPPPQRNAVFVALGNITAEEHVMSVLQRIKASALHDALLVLPFATVPILFTFLEIFARRSMNMSLTCRILFFMIKTHHKQIVASRTMRTMMEKIRTNLRVALRRQKDEMGVNMAALKVVGMQIRDRSVREYVDADWEREEEETAEKRAKKRAFVHVAFFKTLIDHEVTVELKNDIQLRGTLKSVDQYLNIKLDDISVVEEIKYPHLSSVKNVFIRGSVVRYVHLPAASVDTQLLEDATRRAQRAKPR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.31
3 0.25
4 0.18
5 0.16
6 0.16
7 0.16
8 0.11
9 0.11
10 0.09
11 0.1
12 0.1
13 0.1
14 0.15
15 0.16
16 0.19
17 0.18
18 0.2
19 0.22
20 0.22
21 0.21
22 0.16
23 0.15
24 0.14
25 0.14
26 0.12
27 0.1
28 0.09
29 0.08
30 0.07
31 0.06
32 0.07
33 0.08
34 0.09
35 0.11
36 0.11
37 0.12
38 0.15
39 0.16
40 0.18
41 0.2
42 0.23
43 0.27
44 0.33
45 0.37
46 0.35
47 0.36
48 0.34
49 0.32
50 0.32
51 0.31
52 0.25
53 0.2
54 0.21
55 0.22
56 0.26
57 0.28
58 0.24
59 0.22
60 0.24
61 0.25
62 0.28
63 0.27
64 0.21
65 0.2
66 0.24
67 0.22
68 0.21
69 0.2
70 0.15
71 0.14
72 0.14
73 0.13
74 0.09
75 0.08
76 0.07
77 0.08
78 0.09
79 0.09
80 0.11
81 0.13
82 0.15
83 0.17
84 0.18
85 0.18
86 0.19
87 0.23
88 0.24
89 0.26
90 0.24
91 0.25
92 0.25
93 0.23
94 0.22
95 0.2
96 0.2
97 0.23
98 0.22
99 0.23
100 0.25
101 0.3
102 0.3
103 0.3
104 0.31
105 0.27
106 0.32
107 0.3
108 0.26
109 0.22
110 0.24
111 0.28
112 0.26
113 0.24
114 0.19
115 0.2
116 0.19
117 0.19
118 0.19
119 0.14
120 0.12
121 0.1
122 0.09
123 0.08
124 0.08
125 0.07
126 0.05
127 0.04
128 0.04
129 0.06
130 0.06
131 0.07
132 0.13
133 0.17
134 0.2
135 0.24
136 0.28
137 0.32
138 0.38
139 0.39
140 0.37
141 0.35
142 0.33
143 0.3
144 0.25
145 0.21
146 0.2
147 0.2
148 0.19
149 0.19
150 0.19
151 0.19
152 0.2
153 0.22
154 0.16
155 0.15
156 0.13
157 0.12
158 0.11
159 0.11
160 0.1
161 0.09
162 0.09
163 0.1
164 0.1
165 0.09
166 0.1
167 0.1
168 0.1
169 0.09
170 0.09
171 0.06
172 0.07
173 0.06
174 0.06
175 0.08
176 0.08
177 0.08
178 0.09
179 0.1
180 0.12
181 0.15
182 0.16
183 0.15
184 0.16
185 0.2
186 0.2
187 0.24
188 0.28
189 0.28
190 0.29
191 0.29
192 0.28
193 0.27
194 0.32
195 0.35
196 0.33
197 0.3
198 0.3
199 0.29
200 0.29
201 0.27
202 0.2
203 0.14
204 0.08
205 0.08
206 0.08
207 0.08
208 0.08
209 0.07
210 0.08
211 0.08
212 0.08
213 0.07
214 0.08
215 0.07
216 0.08
217 0.08
218 0.09
219 0.09
220 0.1
221 0.1
222 0.1
223 0.11
224 0.09
225 0.09
226 0.08
227 0.08
228 0.07
229 0.07
230 0.07
231 0.06
232 0.06
233 0.06
234 0.06
235 0.06
236 0.07
237 0.06
238 0.05
239 0.06
240 0.05
241 0.05
242 0.06
243 0.07
244 0.09
245 0.11
246 0.12
247 0.13
248 0.13
249 0.14
250 0.15
251 0.17
252 0.2
253 0.2
254 0.24
255 0.31
256 0.37
257 0.42
258 0.48
259 0.48
260 0.46
261 0.53
262 0.54
263 0.48
264 0.45
265 0.41
266 0.4
267 0.39
268 0.45
269 0.4
270 0.35
271 0.34
272 0.32
273 0.31
274 0.27
275 0.26
276 0.16
277 0.18
278 0.2
279 0.19
280 0.19
281 0.19
282 0.18
283 0.16
284 0.16
285 0.14
286 0.14
287 0.15
288 0.17
289 0.19
290 0.2
291 0.2
292 0.23
293 0.3
294 0.34
295 0.37
296 0.39
297 0.38
298 0.44
299 0.51
300 0.54
301 0.56
302 0.59
303 0.66
304 0.73
305 0.82
306 0.85
307 0.9
308 0.93
309 0.95
310 0.96
311 0.96
312 0.95
313 0.95
314 0.89
315 0.81
316 0.71
317 0.66
318 0.55
319 0.44
320 0.35
321 0.24
322 0.19
323 0.16
324 0.14
325 0.08
326 0.07
327 0.06
328 0.05
329 0.04
330 0.05
331 0.05
332 0.05
333 0.05
334 0.04
335 0.04
336 0.05
337 0.05
338 0.04
339 0.04
340 0.04
341 0.04
342 0.04
343 0.04
344 0.05
345 0.05
346 0.05
347 0.06
348 0.11
349 0.13
350 0.15
351 0.15
352 0.15
353 0.2
354 0.21
355 0.21
356 0.16
357 0.16
358 0.15
359 0.17
360 0.16
361 0.12
362 0.12
363 0.13
364 0.12
365 0.11
366 0.11
367 0.09
368 0.09
369 0.1
370 0.13
371 0.14
372 0.16
373 0.16
374 0.16
375 0.15
376 0.15
377 0.13
378 0.09
379 0.13
380 0.14
381 0.14
382 0.15
383 0.16
384 0.17
385 0.21
386 0.26
387 0.29
388 0.36
389 0.39
390 0.44
391 0.5
392 0.51
393 0.52
394 0.48
395 0.43
396 0.37
397 0.37
398 0.35
399 0.28
400 0.26
401 0.21
402 0.2
403 0.18
404 0.19
405 0.16
406 0.13
407 0.17
408 0.17
409 0.18
410 0.17
411 0.18
412 0.15
413 0.15
414 0.16
415 0.13
416 0.13
417 0.11
418 0.13
419 0.13
420 0.13
421 0.12
422 0.11
423 0.1
424 0.1
425 0.09
426 0.07
427 0.07
428 0.07
429 0.07
430 0.08
431 0.09
432 0.09
433 0.1
434 0.12
435 0.17
436 0.16
437 0.18
438 0.2
439 0.22
440 0.28
441 0.33
442 0.36
443 0.33
444 0.35
445 0.32
446 0.34
447 0.31
448 0.26
449 0.21
450 0.16
451 0.16
452 0.15
453 0.15
454 0.1
455 0.09
456 0.1
457 0.09
458 0.09
459 0.11
460 0.09
461 0.1
462 0.09
463 0.09
464 0.09
465 0.1
466 0.08
467 0.06
468 0.06
469 0.06
470 0.06
471 0.07
472 0.07
473 0.07
474 0.07
475 0.07
476 0.07
477 0.06
478 0.06
479 0.05
480 0.05
481 0.05
482 0.04
483 0.04
484 0.04
485 0.04
486 0.04
487 0.05
488 0.06
489 0.06
490 0.06
491 0.06
492 0.06
493 0.06
494 0.06
495 0.04
496 0.04
497 0.04
498 0.05
499 0.06
500 0.06
501 0.06
502 0.09
503 0.1
504 0.09
505 0.09
506 0.09
507 0.09
508 0.1
509 0.1
510 0.08
511 0.11
512 0.12
513 0.12
514 0.12
515 0.13
516 0.14
517 0.14
518 0.14
519 0.17
520 0.18
521 0.19
522 0.23
523 0.21
524 0.19
525 0.18
526 0.19
527 0.13
528 0.14
529 0.14
530 0.1
531 0.15
532 0.2
533 0.28
534 0.32
535 0.34
536 0.4
537 0.48
538 0.57
539 0.61
540 0.62
541 0.63
542 0.61
543 0.6
544 0.55
545 0.46
546 0.37
547 0.28
548 0.25
549 0.17
550 0.15
551 0.14
552 0.13
553 0.13
554 0.13
555 0.13
556 0.11
557 0.09
558 0.11
559 0.11
560 0.11
561 0.1
562 0.1
563 0.1
564 0.1
565 0.1
566 0.07
567 0.06
568 0.06
569 0.05
570 0.05
571 0.05
572 0.05
573 0.05
574 0.05
575 0.05
576 0.05
577 0.07
578 0.08
579 0.08
580 0.1
581 0.1
582 0.11
583 0.1
584 0.11
585 0.1
586 0.11
587 0.13
588 0.12
589 0.12
590 0.12
591 0.11
592 0.1
593 0.11
594 0.11
595 0.09
596 0.08
597 0.09
598 0.1
599 0.11
600 0.11
601 0.09
602 0.07
603 0.07
604 0.07
605 0.06
606 0.05
607 0.06
608 0.1
609 0.12
610 0.18
611 0.18
612 0.18
613 0.19
614 0.21
615 0.2
616 0.16
617 0.15
618 0.12
619 0.14
620 0.14
621 0.14
622 0.14
623 0.17
624 0.17
625 0.16
626 0.13
627 0.11
628 0.11
629 0.18
630 0.16
631 0.14
632 0.15
633 0.16
634 0.16
635 0.17
636 0.16
637 0.09
638 0.08
639 0.07
640 0.07
641 0.07
642 0.09
643 0.08
644 0.09
645 0.09
646 0.1
647 0.1
648 0.16
649 0.18
650 0.17
651 0.17
652 0.16
653 0.17
654 0.2
655 0.27
656 0.24
657 0.25
658 0.28
659 0.29
660 0.31
661 0.39
662 0.39
663 0.34
664 0.4
665 0.38
666 0.41
667 0.41
668 0.4
669 0.37
670 0.35
671 0.36
672 0.29
673 0.29
674 0.25
675 0.26
676 0.27
677 0.24
678 0.23
679 0.18
680 0.18
681 0.15
682 0.13
683 0.11
684 0.08
685 0.08
686 0.06
687 0.06
688 0.06
689 0.06
690 0.07
691 0.07
692 0.07
693 0.06
694 0.06
695 0.07
696 0.08
697 0.14
698 0.14
699 0.15
700 0.16
701 0.16
702 0.17
703 0.21
704 0.21
705 0.17
706 0.18
707 0.21
708 0.23
709 0.25
710 0.25
711 0.2
712 0.18
713 0.17
714 0.16
715 0.11
716 0.1
717 0.1
718 0.1
719 0.12
720 0.12
721 0.12
722 0.13
723 0.13
724 0.11
725 0.11
726 0.11
727 0.1
728 0.12
729 0.12
730 0.13
731 0.15
732 0.15
733 0.14
734 0.14
735 0.17
736 0.19
737 0.2
738 0.22
739 0.2
740 0.21
741 0.22
742 0.22
743 0.18
744 0.14
745 0.12
746 0.09
747 0.08
748 0.06
749 0.04
750 0.03
751 0.04
752 0.04
753 0.04
754 0.05
755 0.05
756 0.06
757 0.07
758 0.08
759 0.08
760 0.09
761 0.1
762 0.11
763 0.1
764 0.11
765 0.1
766 0.09
767 0.09
768 0.08
769 0.07
770 0.06
771 0.06
772 0.05
773 0.04
774 0.05
775 0.04
776 0.05
777 0.05
778 0.05
779 0.05
780 0.05
781 0.06
782 0.05
783 0.07
784 0.09
785 0.1
786 0.1
787 0.12
788 0.15
789 0.16
790 0.21
791 0.22
792 0.23
793 0.29
794 0.36
795 0.39
796 0.42
797 0.47
798 0.43
799 0.45
800 0.45
801 0.39
802 0.34
803 0.28
804 0.26
805 0.2
806 0.18
807 0.14
808 0.1
809 0.08
810 0.07
811 0.07
812 0.04
813 0.04
814 0.04
815 0.05
816 0.05
817 0.09
818 0.13
819 0.14
820 0.14
821 0.15
822 0.16
823 0.18
824 0.2
825 0.22
826 0.19
827 0.17
828 0.17
829 0.17
830 0.17
831 0.15
832 0.13
833 0.07
834 0.05
835 0.05
836 0.05
837 0.05
838 0.04
839 0.05
840 0.05
841 0.08
842 0.08
843 0.08
844 0.09
845 0.09
846 0.13
847 0.13
848 0.14
849 0.14
850 0.16
851 0.16
852 0.17
853 0.19
854 0.2
855 0.24
856 0.27
857 0.27
858 0.28
859 0.28
860 0.26
861 0.25
862 0.22
863 0.18
864 0.14
865 0.19
866 0.23
867 0.31
868 0.36
869 0.41
870 0.44
871 0.43
872 0.45
873 0.46
874 0.49
875 0.49
876 0.46
877 0.43
878 0.41
879 0.42
880 0.4
881 0.36
882 0.32
883 0.31
884 0.36
885 0.4
886 0.4
887 0.47
888 0.49
889 0.47
890 0.48
891 0.49
892 0.5
893 0.51
894 0.59
895 0.57
896 0.6
897 0.61
898 0.58
899 0.55
900 0.51
901 0.48
902 0.43
903 0.36
904 0.31
905 0.29
906 0.25
907 0.2
908 0.15
909 0.12
910 0.06
911 0.08
912 0.09
913 0.09
914 0.12
915 0.15
916 0.2
917 0.23
918 0.24
919 0.26
920 0.27
921 0.28
922 0.28
923 0.27
924 0.24
925 0.31
926 0.32
927 0.3
928 0.28
929 0.26
930 0.25
931 0.23
932 0.22
933 0.13
934 0.17
935 0.19
936 0.21
937 0.28
938 0.32
939 0.36
940 0.44
941 0.48
942 0.51
943 0.55
944 0.62
945 0.66
946 0.64
947 0.69
948 0.68
949 0.68
950 0.6
951 0.53
952 0.42
953 0.33
954 0.3
955 0.24
956 0.18
957 0.14
958 0.14
959 0.17
960 0.18
961 0.17
962 0.18
963 0.16
964 0.14
965 0.18
966 0.2
967 0.17
968 0.17
969 0.2
970 0.22
971 0.24
972 0.25
973 0.23
974 0.21
975 0.24
976 0.27
977 0.25
978 0.25
979 0.26
980 0.29
981 0.31
982 0.3
983 0.27
984 0.23
985 0.22
986 0.19
987 0.16
988 0.14
989 0.11
990 0.12
991 0.12
992 0.14
993 0.14
994 0.18
995 0.19
996 0.17
997 0.21
998 0.25
999 0.26
1000 0.29
1001 0.36
1002 0.41
1003 0.41
1004 0.41
1005 0.37
1006 0.34
1007 0.37
1008 0.34
1009 0.29
1010 0.26
1011 0.24
1012 0.24
1013 0.26
1014 0.27
1015 0.27
1016 0.25
1017 0.21
1018 0.17
1019 0.23
1020 0.22
1021 0.21
1022 0.19
1023 0.16
1024 0.16
1025 0.15
1026 0.14
1027 0.09
1028 0.1
1029 0.12
1030 0.19
1031 0.23
1032 0.25
1033 0.31