FuNGI

A0A369H662

Protein Details

Accession

A0A369H662

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
3-42	APPPGSQNGAPPRNRKKPNPLRPMRKQPRPANPPVAPPRK	Hydrophilic
177-202	APVAKEVNPKRPKKQKEEKVMFNRAP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
13-50	PPRNRKKPNPLRPMRKQPRPANPPVAPPRKAPPKSSQK
184-196	NPKRPKKQKEEKV
473-531	KDKSKAAASKGTPTPQSKQKPSDAPKKGKSLKRAGSPALSESSGNESSRKKMRKTAAPA
568-579	PRKKPKLADSRK
661-667	KRLRRRK

Subcellular Location(s)

nucl 21, mito 3, cyto 3, cyto_mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MSAPPPGSQNGAPPRNRKKPNPLRPMRKQPRPANPPVAPPRKAPPKSSQKATPPATGAPGIEELRKKYGGWSEPAPQPVSDIPIMLTKKSIINGARYHLMRFYQSKMNDKPVDPTDQDAFARPVTLHRRDPRQPPPGRLPKVEDPEQEQIDEKEVERLAQAKAEREAQRAIDQAKIAPVAKEVNPKRPKKQKEEKVMFNRAPKTEAAKKESDIRYEEALPWHLEDADGKNIWVGTYVAALSESTVGFMIDKSVFRVVPIEKWYKFTSKPPFQPFTIDEAEAFMNRKMDVGRWVMKDEERKAGQNDLEATRRLLYGRGQMVKTESDTFKAASRLEKLDHDDLDISGDEFQDDDEAPHFERNDDEDTKESKERIRREQLGANLFGDGDEQEVDKELQEQLQEELERQKYGKATKKALIKRDREEIYESDDSAEKPWSSSSDDSSDEEQEEGKQDDKKESDDKKESDTKDGQAGAKDKSKAAASKGTPTPQSKQKPSDAPKKGKSLKRAGSPALSESSGNESSRKKMRKTAAPAAGSRAGTPLPQANPLRRTKAGGDGEATAGDVSDGAGPRKKPKLADSRKGSPAVSRAGSPNPTQGGGASPSYQSGGVIEPWEILEKIPPDGIAISDLIKPFHGRVGDRPEQMPKAEWIQLVKQLCDYGPDKRLRRRK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.66
2	0.73
3	0.81
4	0.81
5	0.82
6	0.85
7	0.89
8	0.9
9	0.91
10	0.91
11	0.93
12	0.95
13	0.94
14	0.94
15	0.93
16	0.92
17	0.92
18	0.9
19	0.89
20	0.87
21	0.8
22	0.8
23	0.8
24	0.79
25	0.71
26	0.66
27	0.67
28	0.68
29	0.68
30	0.64
31	0.64
32	0.66
33	0.72
34	0.75
35	0.74
36	0.72
37	0.78
38	0.76
39	0.71
40	0.63
41	0.56
42	0.52
43	0.45
44	0.36
45	0.28
46	0.27
47	0.23
48	0.25
49	0.27
50	0.27
51	0.3
52	0.31
53	0.29
54	0.3
55	0.37
56	0.36
57	0.38
58	0.39
59	0.41
60	0.45
61	0.49
62	0.45
63	0.37
64	0.35
65	0.31
66	0.31
67	0.24
68	0.2
69	0.17
70	0.22
71	0.23
72	0.2
73	0.2
74	0.18
75	0.2
76	0.21
77	0.26
78	0.22
79	0.27
80	0.3
81	0.33
82	0.38
83	0.36
84	0.37
85	0.34
86	0.33
87	0.31
88	0.31
89	0.32
90	0.33
91	0.37
92	0.44
93	0.45
94	0.53
95	0.53
96	0.51
97	0.53
98	0.48
99	0.51
100	0.43
101	0.42
102	0.35
103	0.33
104	0.33
105	0.29
106	0.27
107	0.21
108	0.21
109	0.17
110	0.22
111	0.28
112	0.33
113	0.39
114	0.44
115	0.53
116	0.59
117	0.69
118	0.71
119	0.73
120	0.73
121	0.72
122	0.76
123	0.78
124	0.76
125	0.7
126	0.68
127	0.66
128	0.67
129	0.65
130	0.57
131	0.53
132	0.54
133	0.51
134	0.44
135	0.37
136	0.3
137	0.28
138	0.26
139	0.2
140	0.18
141	0.17
142	0.17
143	0.16
144	0.18
145	0.15
146	0.18
147	0.19
148	0.17
149	0.2
150	0.27
151	0.29
152	0.29
153	0.31
154	0.29
155	0.3
156	0.31
157	0.3
158	0.25
159	0.23
160	0.21
161	0.2
162	0.2
163	0.18
164	0.15
165	0.15
166	0.16
167	0.18
168	0.27
169	0.29
170	0.37
171	0.46
172	0.52
173	0.6
174	0.67
175	0.73
176	0.74
177	0.82
178	0.81
179	0.83
180	0.86
181	0.86
182	0.86
183	0.86
184	0.79
185	0.75
186	0.71
187	0.6
188	0.54
189	0.45
190	0.43
191	0.42
192	0.44
193	0.42
194	0.39
195	0.39
196	0.46
197	0.47
198	0.44
199	0.39
200	0.35
201	0.32
202	0.31
203	0.32
204	0.24
205	0.24
206	0.2
207	0.18
208	0.16
209	0.13
210	0.11
211	0.12
212	0.12
213	0.14
214	0.13
215	0.13
216	0.12
217	0.12
218	0.12
219	0.11
220	0.09
221	0.05
222	0.06
223	0.06
224	0.05
225	0.06
226	0.06
227	0.05
228	0.06
229	0.05
230	0.05
231	0.05
232	0.05
233	0.05
234	0.05
235	0.07
236	0.07
237	0.07
238	0.09
239	0.11
240	0.1
241	0.1
242	0.14
243	0.13
244	0.16
245	0.21
246	0.26
247	0.25
248	0.29
249	0.31
250	0.31
251	0.33
252	0.37
253	0.42
254	0.44
255	0.51
256	0.55
257	0.56
258	0.53
259	0.55
260	0.49
261	0.44
262	0.38
263	0.3
264	0.23
265	0.21
266	0.2
267	0.17
268	0.16
269	0.11
270	0.09
271	0.09
272	0.1
273	0.09
274	0.09
275	0.13
276	0.16
277	0.2
278	0.2
279	0.22
280	0.22
281	0.25
282	0.3
283	0.28
284	0.3
285	0.26
286	0.27
287	0.28
288	0.29
289	0.27
290	0.23
291	0.23
292	0.19
293	0.2
294	0.18
295	0.18
296	0.15
297	0.15
298	0.14
299	0.12
300	0.11
301	0.15
302	0.19
303	0.21
304	0.21
305	0.21
306	0.22
307	0.22
308	0.22
309	0.2
310	0.16
311	0.14
312	0.15
313	0.15
314	0.15
315	0.16
316	0.15
317	0.14
318	0.16
319	0.16
320	0.17
321	0.18
322	0.2
323	0.2
324	0.2
325	0.18
326	0.16
327	0.14
328	0.14
329	0.12
330	0.08
331	0.06
332	0.06
333	0.05
334	0.05
335	0.05
336	0.04
337	0.05
338	0.05
339	0.05
340	0.06
341	0.07
342	0.09
343	0.09
344	0.08
345	0.09
346	0.11
347	0.15
348	0.15
349	0.16
350	0.17
351	0.19
352	0.22
353	0.23
354	0.22
355	0.22
356	0.27
357	0.31
358	0.37
359	0.44
360	0.45
361	0.47
362	0.51
363	0.51
364	0.48
365	0.44
366	0.35
367	0.27
368	0.22
369	0.18
370	0.14
371	0.08
372	0.05
373	0.04
374	0.04
375	0.04
376	0.05
377	0.06
378	0.05
379	0.07
380	0.07
381	0.07
382	0.08
383	0.08
384	0.08
385	0.1
386	0.1
387	0.1
388	0.16
389	0.16
390	0.16
391	0.16
392	0.17
393	0.19
394	0.26
395	0.34
396	0.34
397	0.38
398	0.43
399	0.51
400	0.55
401	0.61
402	0.63
403	0.61
404	0.59
405	0.62
406	0.59
407	0.52
408	0.5
409	0.41
410	0.39
411	0.33
412	0.3
413	0.23
414	0.22
415	0.2
416	0.17
417	0.18
418	0.11
419	0.11
420	0.11
421	0.12
422	0.15
423	0.15
424	0.17
425	0.18
426	0.2
427	0.22
428	0.23
429	0.22
430	0.19
431	0.18
432	0.15
433	0.13
434	0.14
435	0.12
436	0.13
437	0.16
438	0.16
439	0.21
440	0.22
441	0.25
442	0.32
443	0.36
444	0.42
445	0.46
446	0.46
447	0.48
448	0.54
449	0.52
450	0.5
451	0.48
452	0.41
453	0.38
454	0.39
455	0.34
456	0.31
457	0.32
458	0.28
459	0.31
460	0.3
461	0.27
462	0.26
463	0.28
464	0.26
465	0.27
466	0.31
467	0.27
468	0.34
469	0.37
470	0.39
471	0.42
472	0.43
473	0.46
474	0.47
475	0.54
476	0.54
477	0.56
478	0.59
479	0.63
480	0.68
481	0.73
482	0.73
483	0.74
484	0.73
485	0.77
486	0.79
487	0.75
488	0.75
489	0.75
490	0.72
491	0.71
492	0.7
493	0.63
494	0.58
495	0.53
496	0.47
497	0.4
498	0.33
499	0.25
500	0.21
501	0.23
502	0.22
503	0.21
504	0.23
505	0.22
506	0.27
507	0.36
508	0.42
509	0.4
510	0.46
511	0.54
512	0.59
513	0.66
514	0.7
515	0.7
516	0.67
517	0.65
518	0.62
519	0.58
520	0.48
521	0.39
522	0.31
523	0.23
524	0.19
525	0.2
526	0.2
527	0.16
528	0.24
529	0.28
530	0.33
531	0.4
532	0.46
533	0.5
534	0.46
535	0.49
536	0.43
537	0.49
538	0.46
539	0.4
540	0.36
541	0.32
542	0.31
543	0.27
544	0.24
545	0.14
546	0.1
547	0.08
548	0.06
549	0.05
550	0.07
551	0.09
552	0.11
553	0.16
554	0.18
555	0.26
556	0.33
557	0.36
558	0.37
559	0.46
560	0.54
561	0.61
562	0.69
563	0.7
564	0.72
565	0.74
566	0.73
567	0.64
568	0.57
569	0.51
570	0.47
571	0.39
572	0.33
573	0.31
574	0.34
575	0.36
576	0.34
577	0.35
578	0.31
579	0.3
580	0.28
581	0.24
582	0.22
583	0.21
584	0.22
585	0.17
586	0.16
587	0.16
588	0.17
589	0.16
590	0.13
591	0.11
592	0.11
593	0.11
594	0.12
595	0.11
596	0.11
597	0.11
598	0.14
599	0.13
600	0.11
601	0.15
602	0.15
603	0.16
604	0.17
605	0.16
606	0.15
607	0.15
608	0.15
609	0.12
610	0.12
611	0.12
612	0.14
613	0.15
614	0.15
615	0.16
616	0.17
617	0.16
618	0.2
619	0.22
620	0.22
621	0.29
622	0.38
623	0.44
624	0.46
625	0.49
626	0.52
627	0.51
628	0.51
629	0.46
630	0.4
631	0.38
632	0.38
633	0.37
634	0.34
635	0.35
636	0.39
637	0.39
638	0.37
639	0.33
640	0.31
641	0.28
642	0.3
643	0.29
644	0.29
645	0.35
646	0.43
647	0.5

A0A369H662

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer