Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A1D8C4

Protein Details
Accession A1D8C4    Localization Confidence High Confidence Score 18.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
24-49VSAPEPPSKKALRKAKKKVAEPTADPHydrophilic
255-281GEEESGKRRKSKKHRQRRVWVNQLLGRBasic
324-353ESTGDRPQRSHPEKPKRNNKPEYSRYAKETHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
30-41PSKKALRKAKKK
260-272GKRRKSKKHRQRR
Subcellular Location(s) cyto_nucl 14.5, cyto 14, nucl 13
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0030684  C:preribosome  
GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG nfi:NFIA_071390  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MAGLGEGSQKKRKLTDVPEIEIDVSAPEPPSKKALRKAKKKVAEPTADPTTKQEAAVPSTKQEDEAPKKRSDHGIWIGNLAFSVTKDDLRKFLTSNCTFADTTITRIHLPKGQEKFGKAQNKGFAYIDLANEKAVKEAVGLSEQLLAGRRVLIKDAKSFDGRPKKSEDDSAATATKPPSKRIFVGNLGFDATKEVVEEHFGQCGTVAHVHVATFQDSGKCKGYAWVEFEDLAAAEAAVKGFVMVDEDEEDDEGSGEEESGKRRKSKKHRQRRVWVNQLLGRRMRMEFAEDATTRYKKRFGKDGEGKKKDESVITEVEDGPLELESTGDRPQRSHPEKPKRNNKPEYSRYAKETVQKLSGAIVEPQGKKITFD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.53
2 0.59
3 0.59
4 0.6
5 0.58
6 0.56
7 0.5
8 0.4
9 0.33
10 0.23
11 0.15
12 0.12
13 0.11
14 0.13
15 0.14
16 0.16
17 0.23
18 0.3
19 0.37
20 0.46
21 0.56
22 0.63
23 0.72
24 0.81
25 0.85
26 0.87
27 0.87
28 0.87
29 0.86
30 0.83
31 0.76
32 0.73
33 0.72
34 0.64
35 0.56
36 0.5
37 0.46
38 0.4
39 0.36
40 0.32
41 0.26
42 0.3
43 0.35
44 0.32
45 0.28
46 0.31
47 0.31
48 0.28
49 0.29
50 0.35
51 0.39
52 0.47
53 0.49
54 0.51
55 0.53
56 0.56
57 0.59
58 0.52
59 0.52
60 0.5
61 0.52
62 0.47
63 0.47
64 0.43
65 0.35
66 0.31
67 0.23
68 0.15
69 0.08
70 0.12
71 0.11
72 0.14
73 0.18
74 0.19
75 0.22
76 0.25
77 0.26
78 0.23
79 0.28
80 0.34
81 0.33
82 0.34
83 0.32
84 0.33
85 0.31
86 0.3
87 0.31
88 0.21
89 0.23
90 0.23
91 0.23
92 0.21
93 0.23
94 0.24
95 0.22
96 0.25
97 0.29
98 0.31
99 0.36
100 0.38
101 0.39
102 0.42
103 0.46
104 0.51
105 0.46
106 0.46
107 0.46
108 0.44
109 0.44
110 0.39
111 0.32
112 0.27
113 0.26
114 0.22
115 0.17
116 0.15
117 0.14
118 0.14
119 0.13
120 0.1
121 0.09
122 0.07
123 0.06
124 0.07
125 0.07
126 0.07
127 0.07
128 0.07
129 0.08
130 0.08
131 0.08
132 0.09
133 0.09
134 0.08
135 0.09
136 0.1
137 0.09
138 0.11
139 0.14
140 0.15
141 0.19
142 0.21
143 0.23
144 0.24
145 0.25
146 0.32
147 0.39
148 0.38
149 0.36
150 0.39
151 0.41
152 0.4
153 0.42
154 0.37
155 0.31
156 0.31
157 0.31
158 0.27
159 0.23
160 0.23
161 0.2
162 0.23
163 0.19
164 0.22
165 0.24
166 0.26
167 0.27
168 0.29
169 0.32
170 0.32
171 0.33
172 0.29
173 0.25
174 0.23
175 0.21
176 0.17
177 0.14
178 0.09
179 0.07
180 0.06
181 0.06
182 0.05
183 0.08
184 0.09
185 0.09
186 0.09
187 0.09
188 0.09
189 0.09
190 0.09
191 0.08
192 0.08
193 0.08
194 0.07
195 0.07
196 0.07
197 0.08
198 0.09
199 0.08
200 0.08
201 0.08
202 0.11
203 0.12
204 0.15
205 0.16
206 0.16
207 0.15
208 0.19
209 0.22
210 0.21
211 0.23
212 0.22
213 0.21
214 0.21
215 0.21
216 0.16
217 0.13
218 0.1
219 0.07
220 0.04
221 0.04
222 0.04
223 0.04
224 0.03
225 0.03
226 0.03
227 0.03
228 0.03
229 0.04
230 0.04
231 0.05
232 0.06
233 0.06
234 0.07
235 0.07
236 0.07
237 0.06
238 0.06
239 0.05
240 0.05
241 0.04
242 0.04
243 0.05
244 0.06
245 0.11
246 0.16
247 0.2
248 0.27
249 0.34
250 0.45
251 0.55
252 0.66
253 0.73
254 0.79
255 0.87
256 0.9
257 0.94
258 0.95
259 0.94
260 0.93
261 0.87
262 0.82
263 0.76
264 0.7
265 0.66
266 0.57
267 0.48
268 0.4
269 0.35
270 0.3
271 0.26
272 0.25
273 0.2
274 0.2
275 0.24
276 0.21
277 0.23
278 0.27
279 0.3
280 0.28
281 0.29
282 0.35
283 0.35
284 0.4
285 0.48
286 0.49
287 0.56
288 0.65
289 0.74
290 0.77
291 0.77
292 0.75
293 0.67
294 0.65
295 0.56
296 0.49
297 0.42
298 0.35
299 0.32
300 0.31
301 0.31
302 0.27
303 0.25
304 0.22
305 0.17
306 0.13
307 0.1
308 0.08
309 0.06
310 0.06
311 0.06
312 0.08
313 0.14
314 0.18
315 0.18
316 0.2
317 0.28
318 0.39
319 0.45
320 0.53
321 0.59
322 0.66
323 0.76
324 0.85
325 0.89
326 0.89
327 0.93
328 0.93
329 0.93
330 0.92
331 0.91
332 0.9
333 0.87
334 0.81
335 0.76
336 0.7
337 0.65
338 0.62
339 0.59
340 0.55
341 0.5
342 0.46
343 0.4
344 0.37
345 0.35
346 0.29
347 0.24
348 0.25
349 0.29
350 0.29
351 0.33
352 0.35