Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A369HHS4

Protein Details
Accession A0A369HHS4    Localization Confidence High Confidence Score 18.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
218-243SHDHFKSQRDHRSKRKIDRPHSQEKGBasic
513-546EATPRPQSRSERRAVSKPKKRRQNNTNSAYSRRWHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
226-237RDHRSKRKIDRP
519-534QSRSERRAVSKPKKRR
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00098  zf-CCHC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51257  PROKAR_LIPOPROTEIN  
PS50158  ZF_CCHC  
Amino Acid Sequences MTDSLRDRQAQEPRCYNCGSHGHWAVACPEPTRKTPAGLAAWRSASAGNVKNQSYNSGSKRSKGPIITKYSPPSFASNMGSYPPPPTPPGAHPPSGLYLAHSFPPAFPSGYAQPVLPYHSSPQFAPPATYGLPHYGQPSHLGLPSPLPGHLATSCANLDHRSPRPPFHASFPHSSPSQKLSQVKASPASARQSALPSSIATPATTRLSHPLPPKPPPSHDHFKSQRDHRSKRKIDRPHSQEKGVKSARSGDLEALAADDFLPADRRLPGNSPASGRHDEGNVDAYRPCQSPEKRVDACEANGVRATSVTKTDAKKDGDVISKCIENLESVTTGKEVSPRPVDEADRSIGREQSLSSHSNETGDTAVESVGFDNAVSYTVEASDDHEDGEISSNEDVLSLAPHDAAAVDDKSNSRPVEDHWRPKRRYSDEWDDDTSYAKRLKPRGASRTDDNVDADGDADGDIWDSLDVPRQADRKRRGSAGSRHSSVSSKSSDLNSLEAELLGRPVKHRQVEEATPRPQSRSERRAVSKPKKRRQNNTNSAYSRRW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.63
2 0.62
3 0.54
4 0.53
5 0.51
6 0.47
7 0.47
8 0.45
9 0.44
10 0.42
11 0.43
12 0.38
13 0.36
14 0.33
15 0.27
16 0.31
17 0.33
18 0.35
19 0.41
20 0.4
21 0.37
22 0.39
23 0.43
24 0.44
25 0.45
26 0.46
27 0.43
28 0.42
29 0.39
30 0.37
31 0.3
32 0.24
33 0.26
34 0.27
35 0.28
36 0.32
37 0.33
38 0.36
39 0.36
40 0.38
41 0.36
42 0.4
43 0.39
44 0.43
45 0.45
46 0.46
47 0.52
48 0.53
49 0.55
50 0.54
51 0.57
52 0.56
53 0.63
54 0.64
55 0.64
56 0.66
57 0.62
58 0.58
59 0.52
60 0.48
61 0.41
62 0.39
63 0.37
64 0.31
65 0.28
66 0.27
67 0.26
68 0.22
69 0.23
70 0.21
71 0.2
72 0.2
73 0.22
74 0.24
75 0.29
76 0.37
77 0.39
78 0.39
79 0.38
80 0.38
81 0.37
82 0.36
83 0.3
84 0.23
85 0.2
86 0.2
87 0.2
88 0.19
89 0.17
90 0.15
91 0.18
92 0.17
93 0.15
94 0.13
95 0.17
96 0.18
97 0.21
98 0.21
99 0.18
100 0.18
101 0.19
102 0.22
103 0.19
104 0.17
105 0.19
106 0.22
107 0.24
108 0.22
109 0.26
110 0.28
111 0.27
112 0.27
113 0.24
114 0.23
115 0.22
116 0.23
117 0.19
118 0.18
119 0.19
120 0.18
121 0.2
122 0.17
123 0.18
124 0.2
125 0.21
126 0.19
127 0.19
128 0.18
129 0.16
130 0.17
131 0.19
132 0.16
133 0.14
134 0.14
135 0.12
136 0.14
137 0.13
138 0.14
139 0.12
140 0.14
141 0.14
142 0.13
143 0.14
144 0.13
145 0.16
146 0.21
147 0.24
148 0.3
149 0.32
150 0.35
151 0.4
152 0.44
153 0.42
154 0.42
155 0.47
156 0.44
157 0.47
158 0.46
159 0.43
160 0.39
161 0.39
162 0.34
163 0.29
164 0.29
165 0.3
166 0.32
167 0.32
168 0.38
169 0.39
170 0.4
171 0.38
172 0.36
173 0.32
174 0.31
175 0.31
176 0.25
177 0.23
178 0.22
179 0.21
180 0.2
181 0.19
182 0.16
183 0.13
184 0.13
185 0.15
186 0.14
187 0.12
188 0.12
189 0.13
190 0.15
191 0.14
192 0.14
193 0.16
194 0.18
195 0.23
196 0.28
197 0.33
198 0.36
199 0.41
200 0.48
201 0.48
202 0.5
203 0.48
204 0.51
205 0.53
206 0.5
207 0.55
208 0.55
209 0.57
210 0.61
211 0.64
212 0.66
213 0.66
214 0.72
215 0.72
216 0.76
217 0.78
218 0.81
219 0.83
220 0.83
221 0.82
222 0.84
223 0.81
224 0.8
225 0.75
226 0.71
227 0.66
228 0.57
229 0.58
230 0.51
231 0.44
232 0.34
233 0.36
234 0.32
235 0.29
236 0.28
237 0.19
238 0.17
239 0.16
240 0.15
241 0.1
242 0.08
243 0.06
244 0.05
245 0.04
246 0.03
247 0.03
248 0.05
249 0.05
250 0.06
251 0.08
252 0.08
253 0.1
254 0.12
255 0.16
256 0.17
257 0.19
258 0.2
259 0.21
260 0.25
261 0.26
262 0.25
263 0.21
264 0.19
265 0.18
266 0.17
267 0.19
268 0.14
269 0.13
270 0.12
271 0.12
272 0.14
273 0.14
274 0.15
275 0.18
276 0.2
277 0.26
278 0.32
279 0.39
280 0.38
281 0.39
282 0.41
283 0.35
284 0.34
285 0.33
286 0.27
287 0.2
288 0.2
289 0.19
290 0.15
291 0.13
292 0.14
293 0.08
294 0.09
295 0.11
296 0.15
297 0.17
298 0.21
299 0.27
300 0.27
301 0.27
302 0.28
303 0.3
304 0.32
305 0.32
306 0.3
307 0.26
308 0.24
309 0.23
310 0.21
311 0.17
312 0.1
313 0.1
314 0.09
315 0.09
316 0.09
317 0.09
318 0.09
319 0.09
320 0.09
321 0.13
322 0.13
323 0.16
324 0.19
325 0.2
326 0.23
327 0.25
328 0.26
329 0.23
330 0.25
331 0.22
332 0.2
333 0.21
334 0.2
335 0.18
336 0.17
337 0.15
338 0.13
339 0.15
340 0.17
341 0.18
342 0.18
343 0.19
344 0.19
345 0.19
346 0.19
347 0.16
348 0.13
349 0.11
350 0.09
351 0.07
352 0.07
353 0.06
354 0.06
355 0.05
356 0.05
357 0.04
358 0.04
359 0.04
360 0.04
361 0.05
362 0.05
363 0.05
364 0.05
365 0.05
366 0.06
367 0.06
368 0.08
369 0.1
370 0.1
371 0.1
372 0.1
373 0.1
374 0.1
375 0.12
376 0.1
377 0.09
378 0.09
379 0.09
380 0.09
381 0.09
382 0.08
383 0.05
384 0.06
385 0.05
386 0.06
387 0.05
388 0.05
389 0.05
390 0.05
391 0.06
392 0.08
393 0.08
394 0.08
395 0.1
396 0.11
397 0.14
398 0.19
399 0.18
400 0.17
401 0.17
402 0.2
403 0.3
404 0.38
405 0.46
406 0.52
407 0.62
408 0.64
409 0.71
410 0.77
411 0.73
412 0.73
413 0.71
414 0.72
415 0.69
416 0.71
417 0.67
418 0.59
419 0.52
420 0.47
421 0.39
422 0.31
423 0.28
424 0.26
425 0.29
426 0.33
427 0.4
428 0.47
429 0.55
430 0.61
431 0.64
432 0.67
433 0.66
434 0.7
435 0.64
436 0.57
437 0.48
438 0.4
439 0.33
440 0.27
441 0.21
442 0.12
443 0.1
444 0.07
445 0.06
446 0.05
447 0.05
448 0.05
449 0.05
450 0.05
451 0.05
452 0.06
453 0.12
454 0.13
455 0.14
456 0.19
457 0.25
458 0.32
459 0.41
460 0.5
461 0.53
462 0.57
463 0.61
464 0.62
465 0.66
466 0.69
467 0.7
468 0.69
469 0.63
470 0.6
471 0.57
472 0.53
473 0.46
474 0.42
475 0.35
476 0.28
477 0.29
478 0.3
479 0.32
480 0.31
481 0.3
482 0.25
483 0.23
484 0.22
485 0.18
486 0.17
487 0.12
488 0.14
489 0.14
490 0.14
491 0.15
492 0.23
493 0.31
494 0.36
495 0.38
496 0.42
497 0.47
498 0.55
499 0.62
500 0.63
501 0.6
502 0.62
503 0.62
504 0.58
505 0.58
506 0.59
507 0.59
508 0.6
509 0.63
510 0.64
511 0.7
512 0.77
513 0.81
514 0.83
515 0.83
516 0.85
517 0.88
518 0.89
519 0.92
520 0.93
521 0.93
522 0.93
523 0.93
524 0.9
525 0.9
526 0.85