Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A369HIX8

Protein Details
Accession A0A369HIX8    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
483-504SSAPARPRKKAKAPAKPKQNTAHydrophilic
615-640GEIGRPKTSQDRRKVIKKTQKLDAKLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
486-500PARPRKKAKAPAKPK
Subcellular Location(s) cyto 12, cyto_nucl 11, nucl 8, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR044868  Rpn13/ADRM1_Pru  
IPR038633  Rpn13/ADRM1_Pru_sf  
IPR038108  RPN13_DEUBAD_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR034393  TatSF1-like  
IPR034392  TatSF1-like_RRM1  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF04683  Proteasom_Rpn13  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51917  PRU  
PS50102  RRM  
CDD cd12281  RRM1_TatSF1_like  
Amino Acid Sequences MPVAPIITFKAGQCEIDTTSTPHKVKPQTQAGYIYLYSEDDLVHFCWRKRSDTLEDPQIDLVMVPTDGSFVPYEASQPAAQTNGRIFVLKFASSSQRHLFWMQSKPQSRIGDPSWFSPRDRKIGSIVHRLLQGEEVNVNGELAAVRNPGDRRDDDDEPMEDAEGTRRPQDHPGSGSGGAGPDATGGDVREEGESSREGGADGARAADTAVANLLRSLRNQPGVNQRGDIAYPNLSHLLPTSETVSMADGAYPKLIDTLLDLLPPAVVVLASGSSDFGGKPEPTTEAVAIAKRSLSLDDKRDLLKKVLRSPQFHQALSSLTMALRDGGLPGVADALGFSVENGGYLTDSSMPMGGGQAVKAFVEGVRKAASLPIAKPCPKPITTSLPASAAFIAMEVGFPTNPDDFKDDDRISYSKQDDKFIAVHEDGTEFEFDTELKQWIPMDDESDDTQDNGGDDAKSETEEENQKKRRRSDAENENEKTDSSAPARPRKKAKAPAKPKQNTAVYVTGLPYDATISEIHDLFSRKGGLVAEEIDSKAPRIKLYKDESGNFKGDALVVFFKPESVSMAIMLLDDTDFRYTAHGKGEGRMRVQEADSSYKKVQQEDRTNTETRGEGEIGRPKTSQDRRKVIKKTQKLDAKLADWSDEEDDRFTGMVAPPKAQGPRTVVLRQMFRIFELEEDPASVLEIKEDIREECSKMGVVTNVVLYDQEPEGIVTVKFQDPSAAAMCVEVMGGRPFDGRIVDATFATGQESFRRTGASED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.23
3 0.25
4 0.26
5 0.24
6 0.3
7 0.37
8 0.37
9 0.38
10 0.44
11 0.5
12 0.56
13 0.62
14 0.65
15 0.61
16 0.64
17 0.66
18 0.58
19 0.54
20 0.46
21 0.38
22 0.28
23 0.24
24 0.19
25 0.15
26 0.13
27 0.09
28 0.12
29 0.12
30 0.19
31 0.22
32 0.24
33 0.33
34 0.36
35 0.4
36 0.43
37 0.49
38 0.5
39 0.55
40 0.61
41 0.61
42 0.6
43 0.56
44 0.52
45 0.45
46 0.36
47 0.26
48 0.19
49 0.1
50 0.08
51 0.07
52 0.06
53 0.08
54 0.07
55 0.09
56 0.09
57 0.08
58 0.1
59 0.1
60 0.12
61 0.11
62 0.14
63 0.12
64 0.13
65 0.14
66 0.16
67 0.16
68 0.17
69 0.19
70 0.19
71 0.19
72 0.2
73 0.19
74 0.21
75 0.24
76 0.22
77 0.21
78 0.2
79 0.28
80 0.29
81 0.35
82 0.33
83 0.32
84 0.34
85 0.36
86 0.38
87 0.36
88 0.43
89 0.45
90 0.51
91 0.54
92 0.55
93 0.61
94 0.6
95 0.55
96 0.53
97 0.49
98 0.49
99 0.45
100 0.46
101 0.46
102 0.44
103 0.45
104 0.46
105 0.48
106 0.47
107 0.47
108 0.44
109 0.42
110 0.48
111 0.52
112 0.54
113 0.51
114 0.46
115 0.47
116 0.45
117 0.4
118 0.35
119 0.28
120 0.2
121 0.18
122 0.15
123 0.13
124 0.13
125 0.12
126 0.08
127 0.07
128 0.06
129 0.06
130 0.07
131 0.07
132 0.07
133 0.12
134 0.14
135 0.16
136 0.21
137 0.22
138 0.27
139 0.34
140 0.36
141 0.34
142 0.36
143 0.35
144 0.31
145 0.3
146 0.23
147 0.17
148 0.14
149 0.14
150 0.15
151 0.15
152 0.17
153 0.18
154 0.2
155 0.28
156 0.33
157 0.35
158 0.34
159 0.36
160 0.36
161 0.35
162 0.33
163 0.26
164 0.2
165 0.15
166 0.12
167 0.09
168 0.06
169 0.05
170 0.05
171 0.05
172 0.05
173 0.06
174 0.06
175 0.07
176 0.07
177 0.08
178 0.08
179 0.09
180 0.1
181 0.1
182 0.1
183 0.1
184 0.09
185 0.1
186 0.1
187 0.09
188 0.08
189 0.07
190 0.07
191 0.07
192 0.06
193 0.07
194 0.07
195 0.06
196 0.07
197 0.07
198 0.07
199 0.08
200 0.1
201 0.09
202 0.11
203 0.15
204 0.18
205 0.23
206 0.24
207 0.29
208 0.37
209 0.41
210 0.41
211 0.37
212 0.34
213 0.3
214 0.29
215 0.26
216 0.17
217 0.14
218 0.14
219 0.14
220 0.15
221 0.14
222 0.14
223 0.12
224 0.13
225 0.11
226 0.12
227 0.13
228 0.11
229 0.11
230 0.12
231 0.12
232 0.1
233 0.09
234 0.09
235 0.08
236 0.08
237 0.08
238 0.07
239 0.07
240 0.06
241 0.06
242 0.05
243 0.06
244 0.09
245 0.09
246 0.09
247 0.09
248 0.08
249 0.08
250 0.08
251 0.06
252 0.03
253 0.02
254 0.02
255 0.03
256 0.03
257 0.03
258 0.03
259 0.03
260 0.04
261 0.04
262 0.04
263 0.05
264 0.07
265 0.08
266 0.08
267 0.09
268 0.11
269 0.12
270 0.14
271 0.13
272 0.12
273 0.14
274 0.14
275 0.14
276 0.12
277 0.11
278 0.1
279 0.1
280 0.1
281 0.14
282 0.17
283 0.2
284 0.22
285 0.24
286 0.26
287 0.29
288 0.29
289 0.29
290 0.29
291 0.3
292 0.36
293 0.42
294 0.46
295 0.47
296 0.48
297 0.53
298 0.53
299 0.48
300 0.41
301 0.34
302 0.29
303 0.27
304 0.23
305 0.14
306 0.1
307 0.1
308 0.09
309 0.08
310 0.07
311 0.05
312 0.04
313 0.04
314 0.04
315 0.04
316 0.04
317 0.04
318 0.03
319 0.03
320 0.03
321 0.03
322 0.03
323 0.03
324 0.03
325 0.03
326 0.03
327 0.03
328 0.04
329 0.03
330 0.03
331 0.04
332 0.04
333 0.04
334 0.05
335 0.05
336 0.05
337 0.05
338 0.05
339 0.05
340 0.05
341 0.04
342 0.04
343 0.05
344 0.05
345 0.05
346 0.05
347 0.05
348 0.05
349 0.08
350 0.08
351 0.09
352 0.1
353 0.1
354 0.1
355 0.11
356 0.13
357 0.11
358 0.12
359 0.17
360 0.21
361 0.24
362 0.24
363 0.28
364 0.29
365 0.28
366 0.3
367 0.29
368 0.33
369 0.33
370 0.34
371 0.31
372 0.28
373 0.27
374 0.24
375 0.2
376 0.12
377 0.09
378 0.06
379 0.06
380 0.04
381 0.04
382 0.03
383 0.04
384 0.03
385 0.04
386 0.05
387 0.06
388 0.06
389 0.07
390 0.1
391 0.11
392 0.13
393 0.19
394 0.18
395 0.17
396 0.2
397 0.2
398 0.19
399 0.23
400 0.23
401 0.24
402 0.25
403 0.27
404 0.24
405 0.25
406 0.25
407 0.21
408 0.22
409 0.16
410 0.15
411 0.13
412 0.12
413 0.11
414 0.1
415 0.09
416 0.06
417 0.06
418 0.06
419 0.05
420 0.06
421 0.07
422 0.07
423 0.07
424 0.08
425 0.08
426 0.08
427 0.11
428 0.1
429 0.11
430 0.1
431 0.12
432 0.12
433 0.14
434 0.13
435 0.1
436 0.1
437 0.09
438 0.08
439 0.07
440 0.07
441 0.05
442 0.06
443 0.07
444 0.07
445 0.07
446 0.08
447 0.08
448 0.11
449 0.19
450 0.24
451 0.32
452 0.41
453 0.46
454 0.52
455 0.56
456 0.61
457 0.6
458 0.63
459 0.64
460 0.66
461 0.71
462 0.74
463 0.71
464 0.63
465 0.56
466 0.48
467 0.4
468 0.3
469 0.22
470 0.16
471 0.2
472 0.25
473 0.34
474 0.39
475 0.43
476 0.51
477 0.57
478 0.63
479 0.69
480 0.72
481 0.74
482 0.8
483 0.83
484 0.85
485 0.82
486 0.76
487 0.74
488 0.68
489 0.59
490 0.53
491 0.47
492 0.37
493 0.33
494 0.29
495 0.21
496 0.17
497 0.15
498 0.1
499 0.07
500 0.06
501 0.06
502 0.06
503 0.07
504 0.08
505 0.09
506 0.09
507 0.11
508 0.13
509 0.13
510 0.15
511 0.14
512 0.13
513 0.14
514 0.14
515 0.12
516 0.12
517 0.12
518 0.11
519 0.12
520 0.12
521 0.12
522 0.12
523 0.11
524 0.14
525 0.14
526 0.16
527 0.19
528 0.22
529 0.29
530 0.35
531 0.42
532 0.43
533 0.46
534 0.5
535 0.5
536 0.48
537 0.4
538 0.34
539 0.26
540 0.22
541 0.18
542 0.14
543 0.13
544 0.11
545 0.12
546 0.11
547 0.11
548 0.11
549 0.11
550 0.11
551 0.1
552 0.1
553 0.09
554 0.1
555 0.09
556 0.09
557 0.09
558 0.06
559 0.05
560 0.05
561 0.06
562 0.06
563 0.06
564 0.06
565 0.09
566 0.11
567 0.13
568 0.16
569 0.2
570 0.2
571 0.25
572 0.32
573 0.33
574 0.33
575 0.34
576 0.32
577 0.3
578 0.3
579 0.29
580 0.25
581 0.29
582 0.29
583 0.32
584 0.31
585 0.34
586 0.36
587 0.38
588 0.43
589 0.45
590 0.53
591 0.56
592 0.61
593 0.61
594 0.61
595 0.56
596 0.51
597 0.42
598 0.34
599 0.29
600 0.24
601 0.2
602 0.23
603 0.31
604 0.3
605 0.31
606 0.29
607 0.28
608 0.37
609 0.46
610 0.49
611 0.51
612 0.59
613 0.66
614 0.75
615 0.82
616 0.83
617 0.84
618 0.84
619 0.8
620 0.8
621 0.8
622 0.75
623 0.74
624 0.69
625 0.6
626 0.55
627 0.49
628 0.41
629 0.33
630 0.3
631 0.26
632 0.22
633 0.2
634 0.17
635 0.16
636 0.15
637 0.15
638 0.12
639 0.13
640 0.14
641 0.2
642 0.2
643 0.21
644 0.22
645 0.27
646 0.3
647 0.28
648 0.3
649 0.29
650 0.33
651 0.38
652 0.39
653 0.41
654 0.43
655 0.46
656 0.44
657 0.43
658 0.38
659 0.33
660 0.33
661 0.27
662 0.24
663 0.22
664 0.21
665 0.16
666 0.16
667 0.15
668 0.12
669 0.13
670 0.12
671 0.09
672 0.08
673 0.1
674 0.09
675 0.11
676 0.13
677 0.13
678 0.17
679 0.2
680 0.21
681 0.21
682 0.22
683 0.21
684 0.2
685 0.21
686 0.18
687 0.16
688 0.15
689 0.15
690 0.14
691 0.13
692 0.13
693 0.11
694 0.12
695 0.11
696 0.1
697 0.09
698 0.09
699 0.1
700 0.12
701 0.11
702 0.1
703 0.14
704 0.16
705 0.16
706 0.16
707 0.18
708 0.16
709 0.2
710 0.21
711 0.18
712 0.15
713 0.15
714 0.15
715 0.12
716 0.11
717 0.08
718 0.07
719 0.08
720 0.09
721 0.1
722 0.1
723 0.11
724 0.13
725 0.14
726 0.13
727 0.14
728 0.16
729 0.17
730 0.16
731 0.18
732 0.17
733 0.16
734 0.16
735 0.15
736 0.14
737 0.18
738 0.21
739 0.21
740 0.21
741 0.23